İçeriğe atla

Hayalet soy

İhtiyozorların filogenisi. Kalın yatay çizgiler ilgili zamana ve taksonlara ait fosil kayıtlarının varlığını ifade etmektedir. İnce çizgiler hayalet soyları temsil eder.

Hayalet soy, herhangi bir bilinen fosil kanıtı olmayan ancak fosil kayıtlarındaki veya genomik kanıtlardaki boşluklar nedeniyle var olduğu çıkarımı yapılabilen, bir türün soy hattında yer alan varsayımsal atadır.[1][2] Bir hayalet soyun belirlenmesi süreci, varsayılan soyun (hayalet soyun) varlığından önce ve sonra yaşamış canlıların fosil kanıtlarına ve filogenetik analize dayalı olarak organizmalar arasındaki ilişkilerin tahmin edilmesine dayanır.[3] Hayalet soylar, fosil kayıtlarında görülmeyen bir çeşitlilik olduğunu varsayar ve fosil kayıtlarının sonuçta ne sağlayacağına dair tahminlerde bulunmayı sağlar. Bu hipotezler yeni fosiller ortaya çıkarılarak veya filogenetik analizler yapılarak test edilebilir.[4]

Hayalet soylar ve Lazarus taksonları birbiriyle ilişkili kavramlardır çünkü her ikisi de fosil kayıtlarındaki boşluklardan kaynaklanmaktadır.[2] Hayalet soy, bir taksonun fosil kayıtlarında yeniden ortaya çıkan veya ortaya çıkmayan herhangi bir boşluktur ancak Lazarus taksonu ise bir türün, fosil kayıtlarındaki yokluğu sebebiyle soyunun tükendiğinin zannedildiği fakat sonradan ortaya çıktığı bir tür hayalet soydur.[2] Lazarus taksonlarının örnekleri arasında ünlü Coelacanth'ların yanı sıra Filipin çıplak sırtlı meyve yarasası da yer alır.[5]

İsim

1992'de bir makalede şöyle deniyordu: "Bu ek varlıklar, filogenetik ağaçların iç dallanma yapısı sebebiyle meydana geldiği tahmin edilen taksonlardır [gruplardır]. Bunlara hayalet soylar diyorum çünkü fosil kayıtlarında görünmezler."[6] Fosil kayıtlarına ve Darwin'in evrim teorisine dayanılarak oluşturulan filogenetik ağaçlar, sıklıkla, fosilleri bulunmamasına rağmen benzer fenotiplere sahip türlerin var olabileceğine dair bir ipucu verir.[7]

Belirtmek gerekir ki hayalet soylar ve hayalet taksonlar aynı şeyler değildir. Bir hayalet soy, torun ve ata arasında doğrudan ancak keşfedilmemiş bir bağlantıdır oysa bir hayalet taksonun birçok birbirinden ayrılmış torunları vardır.[3]

Örnekler

Sert vücut parçalarına sahip hayvanların fosil kayıtlarındaki boşluklarından bir seçki. Diğer önemli örnekler: Chronoperates ve Protanguilla

Soyu tükenmiş organizmalara geriye dönüp bakıldığında, fosil kayıtlarında boşluklar bulunan bazı organizma gruplarının (veya soylarının) olduğu görülür. Bu organizmalar veya türler birbirleriyle yakın akraba olabilir ancak fosil kayıtlarında veya tortu yataklarında kökenlerine dair ışık tutabilecek hiçbir iz yoktur. Biyologlar fosil kayıtlarındaki sıralı stratigrafik birimleri inceleyerek hayalet soyların varlığı sonucunu çıkarabilirler.[8] Fosillerin, kayıtlarında hangi soyların eksik olduğunu belirlemek için kladogramları ve aralık çizgileri çıkarılabilir.[8] Klasik bir örnek, akciğerli balıklarla ve ilkel tetrapodlarla akraba olan bir balık türü olan Coelacanth'tır. Görünen o ki Coelacanthlar da son 80 milyon yıldır var ama herhangi fosil bırakmayı başaramamışlar. Coelacanth'ların günümüzde yaşayan akrabaları volkanik adaların çevresindeki nispeten derin sularda yaşar ve buradaki tortullar 80 milyon yıldan yaşlıdır ve haliyle bundan önce yaşamış olan ataları bulunabiliyor. Ancak 80 milyon yıl önce kıtalar şimdiki konumlarına oldukça yakındı ve haliyle okyanus dibindeki tortulların yükselip erozyonla aşınarak fosil kanıtlarını açığa çıkarması oldukça zordur. Bu da, daha genç fosillerin neden bulunamadığını açıklıyor.[2] Bir başka hayalet soy örneği de averostran teropodlardır ancak Tachiraptor'un keşfiyle bu soyun bilinmezliği önemli ölçüde azalmıştır.[9]

Süre ve çeşitlilik

Farklı fosiller arasındaki süre ölçülebilir ve bir türün evrimsel geçmişi hakkında bilgi edinmek için kullanılabilir. 1998'de yürütülen bir çalışma, bir türün çeşitliliği ile hayalet soyunun varlığını sürdürdüğü süre arasında bir ilişki olduğunu gösterdi. Buna göre, hayalet soyun kısa olması bir türün daha çeşitli olacağını gösterir.[10]

Genetik kanıt

Genetik kanıtlar, modern bonobolar ve şempanzeler, allopolipoit kurbağalar, poliploid partenogenetik kerevitler, çeşitli bitkiler ve insanlar dahil olmak üzere birçok türde hayalet popülasyonların varlığını ortaya çıkardı.[11][12][13] 29 Nisan 2019 tarihinde Nature dergisinde yayınlanan ve 69 modern bonobo ve şempanzenin genomlarını karşılaştıran bir çalışma, antik bonobolardan ve bir arkaik büyük insansı soyundan modern bonobolara %9 ila %4,2 aralığında bir gen akışının gerçekleştiğini ortaya çıkardı ve bu da araştırmacıların hayalet popülasyonun genomunun %4,8'ini yeniden yapılandırmasına olanak tanıdı.[11] Avrupalıların atalarına ilişkin önceki modeller, Avrupa popülasyonlarının iki antik popülasyondan geldiğini öne sürüyordu ancak 17 Eylül 2014 tarihinde yayınlanan bir başka Nature makalesine göre, genetik kanıtlar artık üçüncü bir "hayalet popülasyonun" yani Antik Kuzey Avrasyalıların da Avrupa atalarına genetik katkıda bulunduğunu gösteriyor.[13]

Ayrıca bakınız

Kaynakça

  1. ^ Lorente-Galdos B, Lao O, Serra-Vidal G, Santpere G, Kuderna LF, Arauna LR, ve diğerleri. (April 2019). "Whole-genome sequence analysis of a Pan African set of samples reveals archaic gene flow from an extinct basal population of modern humans into sub-Saharan populations". Genome Biology. 20 (1). s. 77. doi:10.1186/s13059-019-1684-5Özgürce erişilebilir. PMC 6485163 $2. PMID 31023378. 
  2. ^ a b c d Wedel, Matt (May 2010). "Ghost lineages". University of California Museum of Paleontology. 4 Aralık 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 4 Kasım 2019. 
  3. ^ a b Norell MA (January 1993). "Tree-Based Approaches to Understanding History; Comments on Ranks, Rules and the Quality of the Fossil Record" (PDF). American Journal of Science. 293 (A). ss. 407-417. Bibcode:1993AmJS..293..407N. doi:10.2475/ajs.293.a.407. 28 Mart 2016 tarihinde kaynağından arşivlendi (PDF). Erişim tarihi: 4 Ocak 2024. 
  4. ^ Dingus L, Rowe T (1998). The Mistaken Extinction: Dinosaur Evolution and the Origin of Birds. New York: W. H. Freeman. 
  5. ^ Gentle, Louise. "Meet the Lazarus creatures – six species we thought were extinct, but aren't". The Conversation (İngilizce). 4 Aralık 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 4 Aralık 2019. 
  6. ^ Norell MA (1992). Novacek MJ, Wheeler QD (Ed.). Taxic Origin and Temporal Diversity: The Effect of Phylogeny, in Extinction and Phylogeny. Columbia University Press, New York. ss. 89-118. 
  7. ^ Norell MA, Novacek MJ (March 1992). "The fossil record and evolution: comparing cladistic and paleontologic evidence for vertebrate history". Science. 255 (5052). ss. 1690-3. Bibcode:1992Sci...255.1690N. doi:10.1126/science.255.5052.1690. PMID 17749423. 
  8. ^ a b Wills MA (October 2007). "Fossil ghost ranges are most common in some of the oldest and some of the youngest strata". Proceedings. Biological Sciences. 274 (1624). ss. 2421-7. doi:10.1098/rspb.2007.0357. PMC 2274967 $2. PMID 17652067. 
  9. ^ Langer MC, Rincón AD, Ramezani J, Solórzano A, Rauhut OW (October 2014). "New dinosaur (Theropoda, stem-Averostra) from the earliest Jurassic of the La Quinta formation, Venezuelan Andes". Royal Society Open Science. 1 (2). Royal Society. s. 140184. Bibcode:2014RSOS....140184L. doi:10.1098/rsos.140184. PMC 4448901 $2. PMID 26064540. 
  10. ^ Sidor CA, Hopson JA (1998). "Ghost lineages and "mammalness": assessing the temporal pattern of character acquisition in the Synapsida". Paleobiology. 24 (2). ss. 254-273. doi:10.1666/0094-8373(1998)024[0254:GLAATT]2.3.CO;2. 
  11. ^ a b Kuhlwilm M, Han S, Sousa VC, Excoffier L, Marques-Bonet T (June 2019). "Ancient admixture from an extinct ape lineage into bonobos". Nature Ecology & Evolution. 3 (6). ss. 957-965. doi:10.1038/s41559-019-0881-7. PMID 31036897. 
  12. ^ Unmack PJ, Adams M, Bylemans J, Hardy CM, Hammer MP, Georges A (March 2019). "Perspectives on the clonal persistence of presumed 'ghost' genomes in unisexual or allopolyploid taxa arising via hybridization". Scientific Reports. 9 (1). s. 4730. Bibcode:2019NatSR...9.4730U. doi:10.1038/s41598-019-40865-3. PMC 6426837 $2. PMID 30894575. 
  13. ^ a b "New Branch Added to European Family Tree". Harvard Medical School. 11 Aralık 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 11 Aralık 2019. 

İlgili Araştırma Makaleleri

Biyolojik sınıflandırmada alt tür, bir türün dağılım alanı içinde farklı bölümlenmelerde yaşayan ve birbirlerinden morfolojik özelliklerinin farklılıkları ile ayrılan iki ya da daha fazla popülasyondan her biri için kullanılan terimdir. Tek bir alt tür kendi başına tanınamaz: Bir türün ya hiç alt türü yoktur ya da soyu tükenmiş dahi olsa en az iki alt türü olabilir. Bilimsel literatürde alt tür için subsp. ya da ssp. kısaltması kullanılır.

<span class="mw-page-title-main">Kuş</span> kanatlı, iki ayaklı, sıcakkanlı, yumurtlayan ve tüylü omurgalı hayvanlar

Kuş; tüyleri, dişsiz gagaları, yumurtladıkları sert kabuklu yumurtalar yoluyla üreyen, yüksek metabolizma hızına sahip, dört odacıklı kalpleri ve hafif ama güçlü bir iskelet yapısına sahip, Aves sınıfını oluşturan sıcakkanlı omurgalı hayvanlar grubudur. Tüm dünyada yaygın olarak yaşayan kuşların boyutları arı sinek kuşunda 5 cm ila deve kuşunda 2,75 m arasında değişir. On bin kadar yaşayan kuş türü bulunur ve bunların yarısından fazlasını ötücü kuşlar oluşturur. Kuşların türlere göre farklılık gösteren kanatları vardır ve kanatsız olduğu bilinen tek grup kivi kuşu ve soyları tükenmiş olan moa ile fil kuşudur. Ön ayakların evrimleşerek kanatlara dönüşmesi kuşlara uçma yeteneği sağlamış ancak daha sonra yine evrimin devam etmesiyle penguenler, deve kuşları ve adalarda endemik olan bazı türler uçma yeteneğini kaybetmişlerdir. Kuşların sindirim ve solunum sistemleri de uçma yeteneğine uyum sağlamıştır. Özellikle deniz kuşları ve bazı su kuşları gibi kuşlar ayrıca evrimleşerek yüzme yeteneği de kazanmıştır.

Biyolojide taksonomi , ortak özelliklere dayalı olarak biyolojik organizma gruplarını adlandırma, tanımlama (sınırlandırma) ve sınıflandırma bilimsel çalışmasıdır. Organizmalar taksonlar halinde gruplandırılır ve bu gruplara taksonomik bir seviye verilir; belirli bir seviyedeki gruplar daha yüksek rütbeli daha kapsayıcı bir grup oluşturmak için toplanabilir, böylece taksonomik bir hiyerarşi oluşturulur. Modern kullanımdaki başlıca sıralamalar üst âlem, âlem, şube, sınıf, takım, familya, cins ve türdür. İsveçli botanikçi Carl Linnaeus, organizmaları kategorize etmek için Linnaean taksonomisi olarak bilinen sıralı bir sistem ve organizmaları adlandırmak için ikili adlandırma geliştirdiği için mevcut taksonomi sisteminin kurucusu olarak kabul edilir.

Biyolojide filogenetik çeşitli organizma grupları arasındaki evrimsel ilişkinin araştırmasıdır. Bu ilişkiler filogeni olarak adlandırılır. Filogenetik terimi Yunanca kökenlidir, "kabile, ırk" anlamına gelen file veya filon (φυλή/φῦλον) ve doğumla ilişkili anlamındaki genetikos (γενετικός) terimlerinden türetilmiştir. Organizmaların sınıflandırması ve adlandırması olan taksonomi, filogenetikten büyük miktarda etkilenmiştir ama yöntemsel ve mantıksal olarak farklıdır. Bu iki saha, "kladizm" veya "kladistik" olarak bilinen filogenetik sistematik bilim dalında örtüşürler. Filogenetik sistematikte taksonları birbirinden ayırt etmek için sadece filogenetik ağaçlar kullanılır. Evrimsel hayat ağacının araştırılması için filogenetik analiz yöntemleri vazgeçilmez hâle gelmiştir.

<i>Homo</i> i̇nsan ve yakın akrabalarını içeren insansı cinsi

Homo, modern insanı ve yakın akrabalarını içeren insansı cinsine verilen ad. Cinsin üyeleri genelde "insan" adıyla birlikte anılır. En erken üyesi, en eski kalıntıları 2.3 milyon yıl öncesine tarihlenen Homo habilis olup modern insan dışındaki yaşayan son türü olan Homo neanderthalensis'in (Neandertal) yaklaşık 40.000 yıl öncesine kadar yaşadığı düşünülmektedir. Homo floresiensis türünün ise 50.000 yıl öncesine kadar var olduğu düşünülüyor. Homo, Paranthropus cinsi ile birlikte, muhtemelen Australopithecus africanus ile kardeştir ve kendisi de Pan soyundan, şempanzelerden ayrılmıştır.

Dünyadaki yaşamın evrimsel tarihi, fosil ya da günümüz yaşayan canlı organizmaların evrildiği süreçlerin izlerini takip eder. Yaşamın evrimsel tarihi, yeryüzünde yaşamın kökeninden, günümüzden yaklaşık 4,5 milyar yıl önceki bir tarihten, günümüze kadar uzanmaktadır. Günümüz tüm canlı türleri arasındaki benzerlikler, bilinen tüm canlı türlerin, evrim süreçleri içinde giderek birbirlerinden ayrıldığı ortak bir ataya sahip olduklarına işaret etmektedir.

Kladogenez, bir türün iki farklı türe evrilerek klad oluşturduğu evrimsel ayrılma olayı.

<span class="mw-page-title-main">Klad</span> ortak bir atadan ve tüm torunlardan oluşan grup

Klad ya da monofiletik grup, ortak ataları ile onun soyundan gelenlerin oluşturduğu bir organizma grubudur. Taksonomi literatüründe Latince cladus terimi de sıklıkla kullanılır.

<span class="mw-page-title-main">Dış grup (kladistik)</span>

Kladistik ya da filogenetikte, bir dış grup incelenen organizma grubu içindeki evrimsel ilişkileri belirlerken daha uzaktan ilişkili olan ve referans grubu olarak kullanılan organizmalar grubudur. Dış grup, iç grup için bir karşılaştırma noktası olarak kullanılır ve özel olarak da filogeninin kökünün olmasını sağlar. Özellik değişikliğinin yönü yalnızca kökü olan bir filogeni sayesinde belirlenebildiği için dış grubun seçimi bir filogeni içinde özelliklerin evrimini anlayabilmek için gereklidir.

<span class="mw-page-title-main">Maniraptora</span> dinozor kladı

Maniraptora, kuşlara Ornithomimus velox'tan daha yakın akraba olan kuş olmayan dinozorları ve kuşları içeren bir coelurosaurian dinozor grubudur. Avialae, Deinonychosauria, Oviraptorosauria ve Therizinosauria ana alt gruplarını içerir. Ornitholestes ve Alvarezsauroidea da sıklıkla klada dahil edilir. Bir sonraki en yakın kardeş grup olan Ornithomimosauria ve Maniraptora, Maniraptoriformes grubunu oluşturur. Maniraptoranların ilk fosil kayıtları Jura Dönemi'nde ortaya çıkmış olup günümüzde yaşayan kuşlar olarak hayatta kaldıkları kabul edilir.

<span class="mw-page-title-main">Paraves</span> kuşlarla oviraptorosaurlardan daha yakın akraba olan tüm dinozorlar

Paraves, Geç Jura Devri'nde ortaya çıkan yaygın bir teropod dinozor grubudur. Soyu tükenmiş dromaeosauridler, troodontidler, anchiornithidler ve scansoriopterygidlere ek olarak grup, aralarında on binden fazla canlı kuş türü olan avialanları da içerir. Paraves'in ilkel üyeleri, bazı türlerde yürürken yerden tutulan ayağın ikinci basamağında büyütülmüş bir pençe bulundurmaları ile iyi bilinir.

<span class="mw-page-title-main">Sauropsida</span> dört üyeli omurgalılar grubu

Sauropsida, büyük ölçüde Reptilia sınıfına eşdeğer olan bir amniyot grubudur. Sauropsida, memelileri içeren amniyotların kladı olan Synapsida'nın kardeş taksonudur. Erken sinapsidler tarihsel olarak "memeli benzeri sürüngenler" olarak anılsa da, tüm sinapsidler, herhangi bir modern sürüngenden çok memelilerle daha yakından ilişkilidir. Sauropsidler ise memelilerden çok modern sürüngenlerle daha yakından ilişkili tüm amniyotları içerir. Buna, Linnaean taksonomisinde başlangıçta ayrı bir sınıf olarak adlandırılmasına rağmen, şu anda arkosauriyen sürüngenlerinin bir alt grubu olarak tanınan Aves (kuşlar) dahildir.

<span class="mw-page-title-main">Megalosauroidea</span>

Megalosauroidea, Orta Jura'dan Geç Kretase dönemine kadar yaşayan tetanuran theropod dinozorlarının bir üst ailesidir. Gruptaki tüm taksonlar, tip tür Megalosaurus bucklandii ile Allosaurus fragilis veya Passer domesticus'tan daha yakın bir ortak ataya sahiptir. Grubun üyeleri arasında Spinosaurus, Megalosaurus ve Torvosaurus bulunur.

<span class="mw-page-title-main">Monofili</span>

Bir organizma grubu için kladistikte, monofili, klad olmanın koşuludur - yani, yalnızca ortak bir atadan ve onun tüm soyundan oluşan bir grup taksondur. Monofiletik gruplar tipik olarak, daldaki organizmaları diğer organizmalardan ayıran ortak türetilmiş özellikler (sinapomorfiler) ile karakterize edilir. Eşdeğer bir terim holofilidir.

<span class="mw-page-title-main">Otapomorfi</span>

Filogenetikte otapomorfi yalnızca belirli bir taksona özgü, türemiş karakter olarak bilinen ayırt edici bir özelliktir. Yani yalnızca bir taksonda bulunur ve diğerlerinde ya da dış grup taksonlarında ve hatta en yakından ilişkili diğer taksonlarda ya da genel olarak başka bir kladda bulunmaz. Dolayısıyla tek bir takson ile ilişkili bir apomorfi olarak kabul edilebilir.

<span class="mw-page-title-main">Taç grup</span>

Filogenetikte taç grup bir türler topluluğudur ve o topluluğun yaşayan üyeleri, topluluğun en son ortak atası ile birlikte en son ortak atanın soyundan gelen tüm türler bu topluluğu oluşturur. Dolayısıyla, bir tür ile birlikte onun soyundan gelen tüm yaşayan ve soyu tükenmiş türleri de içine alan bir grup olarak bir klad tanımlama yöntemidir. Örneğin, tüm günümüz kuşlarının en son ortak atası ile birlikte onun soyundan gelen tüm yaşayan ve soyu tükenmiş türleri de içine alan Neornithes bir taç grup olarak tanımlanabilir.

<span class="mw-page-title-main">Parafili (filogenetik)</span>

Taksonomide eğer bir grup en son ortak atası ve soyundan gelenlerin tamamını içeriyor ama genellikle bir ya da iki monofiletik alt grubu kapsamıyorsa bu grup dışarıda bırakılan alt gruplara nazaran parafiletik olarak adlandırılır. Parafiletik bir grup bir klad ya da ortak ata ile birlikte soyundan gelen tüm türlerin yer aldığı bir tür grubu olan monofiletik bir grup olamaz. Parafiletik grubun bir ya da daha fazla üyesi, dışarıda bırakılan grup ya da gruplara, parafiletik gruptan daha yakın akrabadır. Terim filogenetikte ve dilbilimde yaygın olarak kullanılır. Parafiletik gruplar sinapomorfiler ve simplesiomorfilerin birleşimi ile tanımlanırlar.

<i>Nesophontes</i>

Nesophontes, Eulipotyphla memeli takımı içinde sınıflandırılan soyu tükenmiş monotipik Nesophontidae familyasında yer alan tek cinstir. Bu cins içinde sınıflandırılan hayvanlar yaklaşık 5 ila 15 cm. uzunluğunda, ince uzun bir baş ile burna sahip, uzun kuyruklu, böcekçil küçük memelilerdi. Jamaika haricinde Büyük Antiller, Küba, Hispanyola, Porto Riko, Amerika Birleşik Devletleri Virjin Adaları ve Cayman Adalarına endemiktiler.

<span class="mw-page-title-main">Laurasiatheria</span> memeli üst takımı

Laurasiatheria, Eulipotyphla takımı ile Scrotifera kladını içeren bir plasentalı memeliler üst takımıdır. Kardeş grubu Euarchontoglires ile birlikte Boreoeutheria magna takımını oluşturur. Laurasiatheria taksonu içinde sınıflandırılan hayvanların benzer gen dizilimlerine dayanarak keşfedildi. Grubu birleştirmek için ortak anatomik özellikler henüz ortaya konmadı. Laurasiatheria kladı DNA dizilim analizleri ve retrotranspozon varlık/yokluk verilerine göre temellendirildi. Üst takım, Pangea bölünmeye başladıktan sonra Gondvana'dan ayrılan Lavrasya süperkıtasında ortaya çıktı. En son ortak atasının yaklaşık olarak 76 ila 90 milyon yıl önce soyunun ayrıldığı varsayılmaktadır.

<span class="mw-page-title-main">Son evrensel ortak ata</span> Mevcut tüm yaşamın en son ortak atası

Son evrensel ortak ata, şu anda Dünya üzerinde yaşayan tüm organizmaların ortak bir atayı paylaştığı en son popülasyondur ve Dünya üzerindeki tüm mevcut yaşamın en yakın ortak atasıdır. Bu mevcut yaşama tüm hücresel organizmalar dahildir; virüslerin kökenleri belirsizdir ancak aynı genetik kodu paylaşırlar. SEOA muhtemelen çeşitli virüsleri de barındırıyordu. SEOA, Dünya üzerindeki ilk yaşam değildir fakat var olan tüm canlıların atalarının en son biçimidir.