İçeriğe atla

Viridiplantae

Viridiplantae
Biyolojik sınıflandırma Bu sınıflandırmayı düzenle
Âlem:Plantae
Alt âlem:Viridiplantae
Cavalier-Smith, 1981[1]
Altgruplar
  • Embryophyta
Sinonimler
  • Plantae, Copeland, 1938, 1956[2][3]
  • Euchlorophyta Whittaker, 1969[4]
  • Chlorophyta sensu van den Hoek & Jahns, 1978[5]
  • Chlorobionta Jeffrey 1982, yenidendz. Bremer 1985, yeniden dz. Lewis and McCourt 2004
  • Chlorobiota Kendrick and Crane 1997
  • Chloroplastida Adl vd., 2005
  • Viridiplantae Cavalier-Smith 1981[6]
  • Phyta Barkley 1939 emed. Holt & Uidica 2007
  • Cormophyta Endlicher, 1836
  • Cormobionta Rothmaler, 1948
  • Euplanta Barkley, 1949
  • Telomobionta Takhtajan, 1964
  • Embryobionta Cronquist vd., 1966
  • Metaphyta Whittaker, 1969

Viridiplantae (Latince: yeşil bitkiler), yaklaşık 450.000-500.000 tür içeren ve hem karasal hem de sucul ekosistemlerde önemli roller oynayan ökaryotik canlılar grubudur.[6][7] Öncelikle sucul olan yeşil algler ve içlerinden çıkan kara bitkilerinden oluşurlar.[8][9][10] Yeşil algler, geleneksel sınıflandırmada kara bitkilerini içermez ve bu da yeşil algleri parafiletik bir grup yapar. Kara bitkilerinin yeşil alglerin içinden çıktığının anlaşılmasından bu yana, bazı yazarlar bitkileri de yeşil alglere atıyorlar.[11][12][13][14][15] Hücre duvarlarında selüloz bulunan hücrelere ve klorofil a ve b içeren ve fikobilin içermeyen siyanobakterilerle endosimbiyozdan türetilen birincil kloroplastlara sahiptirler.

Filogeni ve sınıflandırma

Viridiplantae'nin basitleştirilmiş filogenisi, Leliaert vd. 2012.[16]

  • Chlorophyta
  • Ana klorofitler
  • Ulvophyceae
  • Cladophorales
  • Dasycladales
  • Bryopsidales
  • Trentepohliales
  • Ulvales - Ulotrichales
  • Oltmannsiellopsidales
  • Chlorophyceae
  • Oedogoniales
  • Chaetophorales
  • Chaetopeltidales
  • Chlamydomonadales
  • Sphaeropleales
  • Trebouxiophyceae
  • Chlorellales
  • Oocystaceae
  • Microthamniales
  • Trebouxiales
  • Prasiola klad
  • Chlorodendrophyceae
  • Pedinophyceae:[17]:* Prasinofitler (parafiletik grup)
  • Pyramimonadales
  • Mamiellophyceae
  • Pycnococcaceae
  • Nefroselmidophyceae
  • Prasinococcales
  • Palmofililer
  • Klebsormidiophyceae
  • Phragmoplastophyta
  • Mesostigmatophyceae
  • Chlorokybophyceae
  • Charophyceae
  • Zygnematophyceae
  • Coleochaetophyceae
  • Embryophyta (kara bitkileri)

Kladogram

Aşağıda, temel olarak moleküler verilere dayanan ve yeşil alg ilişkilerini gösteren bir uzlaşmalı soy ağacı bulunmaktadır.[16][17][18][19][13][20][21][22][23][24][25]

Viridiplantae
Prasinodermatophyta

Palmophyllophyceae (prasinophyte clade VI)

Prasinodermatophyceae

Chlorophyta
Prasinophytina

Mamiellophyceae (prasinophyte clade II)

Pyramimonadophyceae (prasinophyte clade I)

Chlorophytina

Nephroselmidophyceae (prasinophyte clade III)

Picocystophyceae (prasinophyte clade VIIC)

Pycnococcaceae (prasinophyte clade V)

Chloropicophyceae (prasinophyte clade VIIA & VIIB)

Tetraphytina

Pedinophyceae

Chlorodendrophyceae (prasinophyte clade IV)

Trebouxiophyceae

Ulvophyceae

Chlorophyceae

Streptophyta
Chlorokybophytina

Mesostigmatophyceae

Spirotaenia

Chlorokybophyceae

Klebsormidiophyceae

Phragmoplastophyta

Charophyceae (Su yosunları & misk otları)

Coleochaetophyceae

Zygnematophyceae

Embryophytes (kara bitkileri)

yeşil alg

Kaynakça

  1. ^ Ruggiero; ve diğerleri. (2015), "Higher Level Classification of All Living Organisms", PLoS ONE, 10 (4), s. e0119248, doi:10.1371/journal.pone.0119248, PMC 4418965 $2, PMID 25923521 
  2. ^ Copeland HF (1938). "The kingdoms of organisms". Quart. Rev. Biol. 13 (4). ss. 383-420. doi:10.1086/394568. 
  3. ^ Copeland HF (1956). The Classification of Lower Organisms. Palo Alto: Pacific Books. s. 6. 
  4. ^ Whittaker RH (January 1969). "New concepts of kingdoms or organisms. Evolutionary relations are better represented by new classifications than by the traditional two kingdoms" (PDF). Science. 163 (3863). ss. 150-60. CiteSeerX 10.1.1.403.5430 $2. doi:10.1126/science.163.3863.150. PMID 5762760. 17 Kasım 2017 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 31 Ocak 2015. 
  5. ^ van den Hoek C, Jahns HM (1978). Einführung in die Phykologie (Almanca). Stuttgart: Georg Thieme Verlag. ISBN 9783135511016. 17 Nisan 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Nisan 2021. 
  6. ^ a b Cavalier-Smith T (1981). "Eukaryote kingdoms: seven or nine?". Bio Systems. 14 (3–4). ss. 461-81. doi:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID 7337818.  Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "CavalierSmith1981" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: )
  7. ^ "One thousand plant transcriptomes and the phylogenomics of green plants". Nature. 574 (7780): 679-685. October 2019. doi:10.1038/s41586-019-1693-2. PMC 6872490 $2. PMID 31645766. 
  8. ^ "Gain and loss of elongation factor genes in green algae". BMC Evolutionary Biology. 9: 39. February 2009. doi:10.1186/1471-2148-9-39. PMC 2652445 $2. PMID 19216746. 
  9. ^ Function and evolution of the vacuolar compartment in green algae and land plants (Viridiplantae). International Review of Cytology. 264. 2007. ss. 1-24. doi:10.1016/S0074-7696(07)64001-7. ISBN 9780123742636. PMID 17964920. 
  10. ^ "EEF2 analysis challenges the monophyly of Archaeplastida and Chromalveolata". PLOS ONE. 3 (7): e2621. July 2008. doi:10.1371/journal.pone.0002621. PMC 2440802 $2. PMID 18612431. 
  11. ^ "Plants". Current Biology. 21 (11): R417-22. June 2011. doi:10.1016/j.cub.2011.04.021. PMID 21640897. 
  12. ^ "Charophycean Green Algae Home Page". www.life.umd.edu. 10 Aralık 2000 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Şubat 2018. 
  13. ^ a b "From algae to angiosperms-inferring the phylogeny of green plants (Viridiplantae) from 360 plastid genomes". BMC Evolutionary Biology. 14: 23. February 2014. doi:10.1186/1471-2148-14-23. PMC 3933183 $2. PMID 24533922.  Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "Ruhfel_2014" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: )
  14. ^ "The Evolutionary Origin of a Terrestrial Flora". Current Biology. 25 (19): R899-910. October 2015. doi:10.1016/j.cub.2015.08.029. PMID 26439353. 
  15. ^ "Estimating the timing of early eukaryotic diversification with multigene molecular clocks". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108 (33): 13624-9. August 2011. doi:10.1073/pnas.1110633108. PMC 3158185 $2. PMID 21810989. 
  16. ^ a b "Phylogeny and molecular evolution of the green algae" (PDF). Critical Reviews in Plant Sciences. 31: 1-46. 2012. doi:10.1080/07352689.2011.615705. 17 Nisan 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi (PDF). Erişim tarihi: 17 Nisan 2021.  Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "Leliaert_2012" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: )
  17. ^ a b "Nested in the Chlorellales or independent class? Phylogeny and classification of the Pedinophyceae (Viridiplantae) revealed by molecular phylogenetic analyses of complete nuclear and plastid-encoded rRNA operons". Protist. 163 (5): 778-805. September 2012. doi:10.1016/j.protis.2011.11.004. PMID 22192529. 
  18. ^ "Green algae and the origin of land plants". American Journal of Botany. 91 (10): 1535-56. October 2004. doi:10.3732/ajb.91.10.1535. PMID 21652308. 21 Haziran 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Nisan 2021. 
  19. ^ "Origin of land plants revisited in the light of sequence contamination and missing data". Current Biology. 22 (15): R593-4. August 2012. doi:10.1016/j.cub.2012.06.013. PMID 22877776. 
  20. ^ "Chloroplast phylogenomic analyses reveal the deepest-branching lineage of the Chlorophyta, Palmophyllophyceae class. nov". Scientific Reports. 6: 25367. May 2016. doi:10.1038/srep25367. PMC 4860620 $2. PMID 27157793. 
  21. ^ "The revised classification of eukaryotes". The Journal of Eukaryotic Microbiology. 59 (5): 429-93. September 2012. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872 $2. PMID 23020233. 
  22. ^ "Early photosynthetic eukaryotes inhabited low-salinity habitats". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114 (37): E7737-E7745. September 2017. doi:10.1073/pnas.1620089114. PMC 5603991 $2. PMID 28808007. 
  23. ^ "Plastid phylogenomic analysis of green plants: A billion years of evolutionary history". American Journal of Botany. 105 (3): 291-301. March 2018. doi:10.1002/ajb2.1048. PMID 29603143. 
  24. ^ "From cyanobacteria and algae to land plants: The RpaB/Ycf27 regulatory network in transition". Perspectives in Phycology. 5 (1): 13-25. 1 Haziran 2018. doi:10.1127/pip/2018/0078. 
  25. ^ Linzhou Li (22 Haziran 2020). "The genome of Prasinoderma coloniale unveils the existence of a third phylum within green plants". Nature Ecology & Evolution. 4 (9): 1220-1231. doi:10.1038/s41559-020-1221-7. 24 Temmuz 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Nisan 2021. 

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">Bitki</span> ökaryotik, ağaçlar, çiçekler, otlar, yosunlar ve benzeri organizmaları içinde bulunduran çok büyük bir canlılar alemi

Bitkiler, ağırlıklı olarak fotosentetik ökaryot canlılardır. Tarihsel olarak bitkiler alemi, algler ve mantarlar da dahil olmak üzere hayvan olmayan tüm canlıları kapsarken, günümüzde mevcut tüm tanımlamalar prokaryotları, mantarları ve bazı algleri hariç tutar. Tanımlamalardan birine göre: Çiçekli bitkiler, kozalaklı bitkiler ve diğer açık tohumlular, eğrelti otları ve benzerleri, boynuz otları, ciğer otları, kara yosunları ve yeşil algler hep birlikte Viridiplantae adı verilen kladı oluştururlar. Buna kırmızı ve esmer algler dahil değildir.

<span class="mw-page-title-main">Siyanobakteri</span> enerjilerini fotosentez yolu ile elde eden bir bakteri türü

Siyanobakteriler (Cyanobacteria), besinini fotosentez yolu ile elde eden bir bakteri dalıdır. Adı, bakterinin renginden gelir. Denizdeki azot çevriminin önemli bir bileşeni ve okyanusun pek çok yerinde özbesilenendir. Ayrıca, karada da bulunmaktadır.

<span class="mw-page-title-main">Archaeplastida</span>

Archaeplastida, kırmızı algler (Rhodophyta), yeşil algler ve kara bitkilerini ve glokofitler gibi bazı küçük grupları içeren önemli bir ökaryot grubudur. Archaeplastida'nın tüm soyları, fotosentetik olmayan ökaryotrofik bir kamçılı olan Rhodophyta'nın kardeş taksonu Rhodelphidia dışında fotoototrofiktir. Archaeplastida üyeleri, iki zarla çevrili kloroplastlara sahiptir, bu özellikleri bu canlıların bir siyanobakteri ile beslenerek endosimbiyoz olayı yoluyla doğrudan elde edildiğini düşündürür. Amoeboid Paulinella chromatophora'nın yanı sıra kloroplastlara sahip diğer tüm gruplar, ikincil olarak kırmızı veya yeşil alglerden elde edildiklerini düşündüren üç veya dört zarla çevrili kloroplastlara sahiptir. Kırmızı ve yeşil alglerin aksine, glokofitler hiçbir zaman ikincil endosimbiyoz olaylarına dahil olmamıştır.

<span class="mw-page-title-main">Scrotifera</span> memeli kladı

Scrotifera, 5 farklı memeli takımını ve onların ortak atalarını içeren bir plasental memeli grubudur.Bunlar: Chiroptera, Carnivora, Pholidota, Perissodactyla ve Cetartiodactyla(geleneksel sınıflandırmada Artiodactyla ve Cetacea)takımlarını içerir. Scrotifera, Eulipotyphla'nın dışında kalan bir gruptur ve birlikte Laurasiatheria'yı oluştururlar. Scrotifera'nın son ortak atasının 73.1 ila 85.5 milyon yıl önce yaşadığı düşünülüyor.

<span class="mw-page-title-main">Unikonta</span>

Amorphea veya Unikonta, Amoebozoa ve Obazoa'yı içeren taksonomik bir grupdur. Bu sınıfın üyelerinin taksonomik yakınlıkları ilk olarak 2002 yılında Thomas Cavalier-Smith tarafından açıklanmıştır.

<span class="mw-page-title-main">Opisthokont</span>

Opisthokontlar, hem hayvan hem de mantar alemlerini içeren geniş bir ökaryot grubudur. Daha önce "Fungi / Metazoa grubu" olarak adlandırılan opisthokontlar, genellikle bir sınıf olarak tanınır. Opisthokontlar, Apusomonadida ve Breviata ile birlikte daha büyük Obazoa kladını oluşturur.

<span class="mw-page-title-main">Holozoa</span>

Holozoa, hayvanları ve en yakın tek hücreli akrabalarını içeren ancak mantarları hariç tutan bir canlı grubudur. Holozoa ayrıca tunik cinsi Distaplia için kullanılan eski bir isimdir.

<span class="mw-page-title-main">Filozoa</span>

Filozoa, Opisthokonta içindeki monofiletik bir gruptur. Bunlar hayvanları ve onların en yakın tek hücreli akrabalarını içerir.

<span class="mw-page-title-main">Filasterea</span>

Filasterea, Ministeria ve Capsaspora'yı içeren önerilen bir bazal Filozoan kladıdır. Choanoflagellatea ve Hayvanların grubu olan Choanozoa'nın kardeş grubudur. İlk 2008'de olarak Shalchian-Tabrizi ve diğerleri tarafından, düzinelerce gen ile filogenomik bir analize dayanarak önerilmiştir. Filasterea'nın Opisthokonta'da Metazoa ve Choanoflagellata'dan oluşan klanın kardeş grubu olduğu bulundu; bu bulgu, ek, daha fazla takson açısından zengin, filogenetik analizlerle daha da doğrulandı.

<span class="mw-page-title-main">Lepidosauria</span> kertenkeleler, yılanlar ve tuataralar

Lepidosauria, üst üste binen pullara sahip sürüngenlerdir. Üst takımda, Squamata (pullular) ve Rhynchocephalia takımları bulunur. Monofiletik bir gruptur ve bu nedenle ortak bir atadan gelen tüm torunları barındırır. Squamata, yılanları, kertenkeleleri ve Amphisbaenia'yı içerir. Rhynchocephalia 220-100 milyon yıl önce yaygın ve çeşitli bir gruptu; bununla birlikte, şimdi sadece Yeni Zelanda'ya özgü tek bir tuatara türünü içeren Sphenodon cinsi ile temsil edilmektedir. Lepidosauria, Aves (kuşlar) ve Crocodilia'yı (timsahlar) içeren Archosauria'nın kardeş taksonudur. Kertenkeleler ve yılanlar, lepidozorların tür bakımından en zengin grubudur ve toplamda 9.000'den fazla tür içerir. Kertenkeleler, tuataralar ve yılanlar arasında birçok göze çarpan ayırt edici morfolojik farklılıklar vardır.

<span class="mw-page-title-main">Holomycota</span>

Holomycota veya Nucletmycea, Holozoa'nın kardeş grubu olan temel bir Opisthokont klanıdır. Cristidiscoidea ve mantar (fungi) aleminden oluşur. Holomycota'nın en eski soyu olarak nükleeriidlerin, tek hücreli serbest yaşayan fagotrofik amiplerin konumu, hayvanların ve mantarların bağımsız olarak ortak bir tek hücreli atadan karmaşık çok hücreliliği edindiğini ve ozmotrofik yaşam tarzının daha sonra ortaya çıktığını göstermektedir. bu ökaryotik soyun ayrışmasında. Opisthosporidians, aphelidleri, Microsporidia ve Cryptomycota, üç endoparazit grubunu içeren yakın zamanda önerilen bir taksonomik gruptur.

UTC klad yeşil algler grubudur. Ulvophyceae, Trebouxiophyceae ve Chlorophyceae alglerini içerir.

<span class="mw-page-title-main">Parafili (filogenetik)</span>

Taksonomide eğer bir grup en son ortak atası ve soyundan gelenlerin tamamını içeriyor ama genellikle bir ya da iki monofiletik alt grubu kapsamıyorsa bu grup dışarıda bırakılan alt gruplara nazaran parafiletik olarak adlandırılır. Parafiletik bir grup bir klad ya da ortak ata ile birlikte soyundan gelen tüm türlerin yer aldığı bir tür grubu olan monofiletik bir grup olamaz. Parafiletik grubun bir ya da daha fazla üyesi, dışarıda bırakılan grup ya da gruplara, parafiletik gruptan daha yakın akrabadır. Terim filogenetikte ve dilbilimde yaygın olarak kullanılır. Parafiletik gruplar sinapomorfiler ve simplesiomorfilerin birleşimi ile tanımlanırlar.

<span class="mw-page-title-main">SAR</span>

SAR veya Harosa; Stramenopiles, Alveolata ve Rhizaria'dan oluşan ve Bikonta kladına bağlı bir kladdır. SAR ismi Stramenopiles, Alveolata, Rhizarianın kısaltmasıdır.

<span class="mw-page-title-main">Roger Stanier</span>

Roger Yate Stanier, modern mikrobiyolojinin gelişiminde etkili olan Kanadalı mikrobiyolog. Delft Okulu'nun bir üyesi ve C.B. van Niel'in eski öğrencisi olarak, mavi-yeşil alglerin siyanobakteriler olarak sınıflandırılması da dahil olmak üzere bakteri taksonomisine önemli katkılarda bulunmuştur. 1957'de arkadaşları ile birlikte otuz yılda beş baskıda yayınlanan önemli bir mikrobiyoloji ders kitabı olan The Microbial World'ü yazdı. Berkeley'deki California Üniversitesi'nde 24 yıl çalıştı, burada profesör ünvanını aldı ve Bakteriyoloji Bölümü başkanı olarak görev yaptı. 1971'de Pasteur Enstitüsü'ne geçti. Kariyeri boyunca Leeuwenhoek Madalyası da dahil olmak üzere birçok ödül aldı. Kraliyet Derneği Üyesi, Ulusal Bilimler Akademisi Yabancı Üyesi ve Légion d'Honneur sahibidir.

<span class="mw-page-title-main">Lophotrochozoa</span>

Lophotrochozoa, Spiralia'daki bir protostom hayvan sınıfıdır. Taksonu moleküler kanıtlara dayalı olarak monofiletik bir grup olarak kurulmuştur. Sınıf: annelidler, yumuşakçalar, bryozoanlar, brachiopodlar ve platyhelminthes gibi hayvanları içerir.

<span class="mw-page-title-main">Excavata</span>

Excavata, Ökaryot üst alemine ait eski bir tek hücreli organizma üst grubudur. İlk olarak 1999'da Simpson ve Patterson tarafından önerilmiş ve 2002'de Thomas Cavalier-Smith tarafından resmi bir takson olarak tanıtılmıştır. Çeşitli serbest yaşayan ve simbiyotik formlar içerir ve Giardia ve Trichomonas gibi bazı önemli insan parazitlerini de içinde barındırır. Daha önce artık modası geçmiş Protista krallığına dahil olduğu düşünülüyordu. Kamçılı yapılarına göre sınıflandırıldılar ve en temel kamçılı soy olarak kabul edildiler.

<span class="mw-page-title-main">Chromista</span>

Chromista, Plastit adı verilen fotosentetik organellerinde benzer özellikleri paylaşan tek ve çok hücreli ökaryotik türlerden oluşan, görünüşte polifilik ileri sürülen biyolojik bir alemdir. Bazı algler, diyatomlar, oomycetes ve protozoanlar gibi plastidleri klorofil içeren tüm protistayı içerir. Üyeleri muhtemelen son ökaryotik ortak atadan ayrı evrimsel gruplar olarak bağımsız olarak ortaya çıktı. O atada zaten kırmızı alg kökenli kloroplastlara sahip olduğu varsayıldığından, fotosentetik olmayan formlar, fotosentez yapabilen atalardan evrimleşmiştir. Plastidleri dört zarla çevrilidir ve tek bir endosimbiyoz olayıyla kırmızı bir algden elde edildiğine inanılır.

Charophyta; charophytes olarak da adlandırılan bir tatlı su yeşil alg grubudur. Bazen bir bölüm olarak ele alınır ancak aynı zamanda bir süper bölüm veya sıralanmamış bir klad olarak da gösterilmektedir. Karasal bitkiler Charophyta'dan, muhtemelen karasal tek hücreli charophyte'lerden kardeş grup olarak Zygnematophyceae sınıfıyla birlikte ortaya çıktı.

<span class="mw-page-title-main">Streptophyta</span>

Streptophyta, bir bitki kladıdır. Kladın bileşenleri bilim adamları arasında önemli ölçüde değişkenlik gösterse de burada kullanılan tanım, kara bitkilerini ve Chlorophyta hariç tüm yeşil algleri kapsar.