Sapporo, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğünün merkezi ve bölgenin en büyük şehridir.
Kobe, Japonya'nın Hyōgo prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir Kansai bölgesinde, Osaka Körfezi'nin kuzeyinde Osaka'nın 30 km batısında yer almaktadır. 1868 yılı itibarıyla ticari anlamda batıya açılan ilk Japon şehirlerden biridir. Kobe yaklaşık 1,5 milyon nüfusu ile Japonya'nın altıncı büyük şehri olup Osaka ve Kyoto ile birlikte Keihanshin metropol alanını oluşturmaktadır. Bu kozmopolit liman kenti, 100'den fazla ülkeden gelen yaklaşık 45.000 yabancı kişiye ev sahipliği yapmaktadır.
Fukuşima, Japonya'nın Fukuşima prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Şehir prefektörlüğün kuzeyinde Nakadōri bölgesinde, başkent Tokyo'nun yaklaşık 250 km güneyinde ve Abukuma Nehri'nin yakınında yer almaktadır. Yüzölçümü 746.43 km² olan şehrin nüfusu 1 Mayıs 2011 tarihi itibarı ile 290,064'tür.
Fukuoka, Japonya'nın Fukuoka prefektörlüğünün merkezi ve Kyūshū bölgesinin en büyük şehridir.
Niigata Japonya'nın Niigata prefektörlüğünin merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 726,09 km² olan şehrin nüfusu 31 Ocak 2012 tarihi itibarı ile nüfusu 804.193'tür.
Ōtsu, Japonya'nın Shiga prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 464.10 km² olan şehrin nüfusu 1 Kasım 2012 itibarı ile 341,684'tür.
Naha, Japonya'nın Okinawa prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir Okinawa Adası'nın güney kısmında Doğu Çin Denizi kıyısında yer almaktadır. Yüzölçümü 38,99 km² olan şehrin nüfusu Kasım 2012 tarihi itibarı ile 321.467'dir.
Yujno-Sahalinsk, Rusya'nın Sahalin Oblastı'nın merkezi olan şehirdir. Şehrin nüfusu 2010 itibarı ile 181.728'dir. Şehir Sahalin Adası'nın güneyinde yer almaktadır.
Yokosuka, Japonya'nın Kanagawa prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir, prefektörlüğün güneydoğusunda, Miura Yarımadası'nın ortasında ve Tokyo ve Sagami körfezlerinin arasında yer almaktadır. Yüzölçümü 100.7 km² olan şehrin nüfusu 1 Haziran 2012 itibarı ile 414,960'tır.
Nagaoka, Japonya'nın Niigata prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Yüzölçümü 890.91 km² olan şehrin nüfusu 1 Kasım 2013 itibarı ile 281,217'dir.
Japonya'nın şehirleri, Japonya'nın yerel idari bölümlerinden biridir. Şehirler, kasaba ve köyler ile birlikte belediye düzeyinde idari bölümlerdir ancak ilçelere bağlı değildirler. Şehirler diğer idari bölümler gibi 1947 Yerel Özerklik Kanunu ile tanımlanırlar.
Kure, Japonya'nın Hiroşima prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir Seto İç Denizi kıyısında Hiroşima'nın 20 km güneydoğusunda yer almaktadır. Yüzölçümü 352,80 km² olan şehrin nüfusu 1 Mayıs 2015 tarihi itibarı ile 228.030'dur.
Yamato, Japonya'nın Kanagawa prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir prefektörlüğün kuzey orta kesiminde yer almaktadır. Yüzölçümü 27.06 km² olan şehrin nüfusu 1 Temmuz 2012 tarihi itibarı ile 230,709'dur.
Japonya'nın hükûmet kararnamesi ile belirlenmiş şehirleri veya belirlenmiş şehir , Japonya'da Yerel Özerklik Kanunu'nun 252. maddesinin 19. paragrafına göre Japonya Bakanlar Kurulu tarafından verilen bir yasal idari statüye sahip şehirlerdir.
Sasebo, Japonya'nın Nagasaki prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Yüzölçümü 426.47 km² olan şehrin nüfusu 1 Ekim 2011 tarihi itibarı ile 259,800'dür.
Japonya'nın çekirdek şehirleri, Japonya'da Yerel Özerklik Kanunu'nun 252. maddesinin 22. paragrafına göre merkezi hükûmet tarafından belirlenen bir şehir düzeyidir.
Japonya'nın belediyeleri, Japonya'nın üçüncü düzey idari bölümleridir. Belediyeler 1947 Yerel Özerklik Kanunu ile tanımlanırlar.
Japonya'nın ilçeleri, Japonya'nın idari bölümlerinden biridir. İlçelerin tarihi antik dönemlere kadar uzanmaktadır ve başlangıçta kōri olarak adlandırılmaktaydı. 1878-1921 yılları arasında prefektörlük ile belediyeler arasında idari işleve sahip bölümlerdi. Günümüzde ilçelerin siyasi veya idari bir işlevi bulunmamakta olup başta adresleme sistemi ile ilgili coğrafi bölgelerin tespiti ve yakın kasaba ve köylerin gruplandırılması için kullanılmaktadır. Şehirler ilçelerden bağımsız olup doğrudan prefektörlüklere bağlıdır.
Hiratsuka, Japonya'nın Kanagawa prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir prefektörlüğün güney orta kesiminde yer almaktadır. Yüzölçümü 67.83 km² olan şehrin nüfusu 1 Haziran 2012 itibarı ile 259,698'dir. Hiratsuka 1 Nisan 1932 tarihinde kurulmuştur.
Chigasaki, Japonya'nın Kanagawa prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir prefektörlüğün güney orta kısmında Sagami Nehri'nin doğu kıyısında yer almaktadır. Yüzölçümü 35.71 km² olan şehrin nüfusu 1 Haziran 2012 tarihi itibarı ile 236,177'dir. Chigasaki 1 Ekim 1947 tarihinde kurulmuştur.