İçeriğe atla

Temel çoğalma sayısı

COVID-19 pandemisi ile ilgili olarak temel çoğalma sayısından ve vaka ölüm oranından bahseden video (yaklaşık 4 dk)

Epidemiyolojide, temel çoğalma sayısı veya temel üreme sayısı (bazen temel üreme oranı olarak da adlandırılır), ,[1] tüm bireylerin enfeksiyona duyarlı olduğu bir popülasyonda, bir vaka tarafından doğrudan oluşturulan beklenen vaka sayısı olarak düşünülebilir.[2] Tanım, başka hiçbir bireyin enfekte olmadığı veya aşılanmadığı (doğal olarak veya aşılama yoluyla) durumu açıklar. Avustralya Sağlık Bakanlığı'nınki gibi bazı tanımlar, "hastalığın bulaşmasına kasıtlı herhangi bir müdahalenin" olmadığı durumu da tanıma ekler.[3] Temel çoğalma sayısı, etkili çoğaltma numarası ile karıştırılmamalıdır. (veya ), Etkili çoğaltma numarası, popülasyonun mevcut durumunda oluşan ve enfekte olmamış durumda olması gerekmeyen vakaların sayısıdır. Ayrıca şunu not etmek önemlidir: boyutsuz bir sayıdır ve zaman birimi,[4] veya zamanın iki katına çıkması gibi birimlere sahip olan bir oran değildir.[5]

çevresel koşullar ve enfekte popülasyonun davranışı gibi diğer faktörlerden de etkilendiği için bir patojen için biyolojik bir sabit değildir. Ayrıca değerler genellikle matematiksel modellerden tahmin edilir ve tahmin edilen değerler kullanılan modele ve diğer parametrelerin değerlerine bağlıdır. Bu nedenle, literatürde verilen değerler yalnızca verilen bağlamda anlamlıdır ve eski değerlerin kullanılmaması veya farklı modellere göre değerlerin karşılaştırılmaması önerilir.[6] tek başına bir enfeksiyonun popülasyonda ne kadar hızlı yayıldığına dair bir tahmin vermez.

'ın en önemli kullanımları, ortaya çıkan bulaşıcı bir hastalığın bir popülasyona yayılıp yayılamayacağını ve bir hastalığı ortadan kaldırmak için aşılama yoluyla nüfusun ne kadarının aşılanması gerektiğini belirlemede kullanılmasıdır. Yaygın olarak kullanılan enfeksiyon modellerinde, olması, enfeksiyonun popülasyonda yayılmaya başlayabileceğine, ancak yayılmayacağına işaret eder. Genellikle değeri ne kadar büyükse salgını kontrol etmek de o kadar zordur. Basit modellerde, enfeksiyonun sürekli yayılmasını önlemek için etkili bir şekilde aşılanması gereken (enfeksiyona duyarlı olmayan) nüfus oranının daha büyük olması gerekir. .[7] Tersine, endemik dengede enfeksiyona duyarlı kalan popülasyonun oranı olur.

Tarihçe

Temel üreme kavramının kökleri, Ronald Ross, Alfred Lotka ve diğerlerinin[8] çalışmaları aracılığıyla izlenebilir, ancak epidemiyolojideki ilk modern uygulaması, 1952'de George MacDonald tarafından sıtma konusunda yapılmıştır.[9]

başka bir kişiden enfekte olan ortalama kişi sayısıdır. Örneğin, Ebola'da değeri 2'dir, yani ortalama olarak, Ebola olan 1 kişi bunu diğer 2 kişiye aktaracaktır.

Bazı Bulaşıcı Hastalıkların Değerleri

Hastalık Bulaşma Şekli Değeri
KızamıkAerosol 12–18 [10]
SuçiçeğiAerosol 10–12 [11]
KabakulakSolunum damlacıkları 10–12 [12]
Çocuk felciFekal-oral yol 5–7 []
KızamıkçıkSolunum damlacıkları 5–7 []
BoğmacaSolunum damlacıkları 5,5 [13]
Çiçek hastalığıSolunum damlacıkları 3,5–6 [14]
HIV / AIDSVücut sıvısı 2–5 []
SARSSolunum damlacıkları 0,19–1,08 [15]
SARS-CoV-2 / COVID-19Solunum damlacıkları
(Aerosol iletimi
inceleme altında)
2–6 [16][17]
Nezle, soğuk algınlığıSolunum damlacıkları 2–3 [18]
DifteriTükürük1,7–4,3 [19]
Grip
(1918 İspanyol gribi)
Solunum damlacıkları 1,4–2,8 [20]
Ebola
(2014 Ebola salgını )
Vücut sıvısı 1,5–1,9 [21]
Grip
(2009 domuz gribi salgını)
Solunum damlacıkları 1,4–1,6 [2]
Grip
(mevsimsel suşlar)
Solunum damlacıkları 0,9–2,1 [22]
MERSSolunum damlacıkları 0,3–0,8 [23]

Kaynakça

  1. ^ Vaccinology : an essential guide. Chichester, West Sussex: Wiley Blackwell. 2015. s. 310. ISBN 978-1-118-63652-7. OCLC 881386962. 
  2. ^ a b Fraser (19 Haziran 2009). "Pandemic Potential of a Strain of Influenza A (H1N1): Early Findings". Science. 324 (5934): 1557-1561. doi:10.1126/science.1176062. ISSN 0036-8075. PMC 3735127 $2. PMID 19433588. 
  3. ^ "The reproduction number". Using Mathematical Models to Assess Responses to an Outbreak of an Emerged Viral Respiratory Disease. National Centre for Epidemiology and Population Health. Nisan 2006. ISBN 1-74186-357-0. 1 Şubat 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 1 Şubat 2020. 
  4. ^ "Notes On R0" (PDF). Stanford University. 12 Eylül 2014 tarihinde kaynağından arşivlendi (PDF). 
  5. ^ "Why 'Exponential Growth' Is So Scary For The COVID-19 Coronavirus". Forbes (İngilizce). 17 Mart 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 19 Mart 2020. 
  6. ^ Delamater (Ocak 2019). "Complexity of the Basic Reproduction Number (R 0 )". Emerging Infectious Diseases. 25 (1): 1-4. doi:10.3201/eid2501.171901. ISSN 1080-6040. PMC 6302597 $2. PMID 30560777. 
  7. ^ Fine (1 Nisan 2011). ""Herd Immunity": A Rough Guide". Clinical Infectious Diseases (İngilizce). 52 (7): 911-916. doi:10.1093/cid/cir007. ISSN 1058-4838. PMID 21427399. 5 Ağustos 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 11 Ağustos 2020. 
  8. ^ Smith (5 Nisan 2012). "Ross, Macdonald, and a Theory for the Dynamics and Control of Mosquito-Transmitted Pathogens". PLOS Pathogens. 8 (4): e1002588. doi:10.1371/journal.ppat.1002588. ISSN 1553-7366. PMC 3320609 $2. PMID 22496640. 
  9. ^ Macdonald (Eylül 1952). "The analysis of equilibrium in malaria". Tropical Diseases Bulletin. 49 (9): 813-829. ISSN 0041-3240. PMID 12995455. 
  10. ^ Guerra (1 Aralık 2017). "The basic reproduction number (R0) of measles: a systematic review". The Lancet Infectious Diseases (İngilizce). 17 (12): e420-e428. doi:10.1016/S1473-3099(17)30307-9. ISSN 1473-3099. PMID 28757186. 10 Nisan 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Mart 2020. 
  11. ^ Health Care Worker Information (PDF). 26 Mart 2020 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Mart 2020. 
  12. ^ Australian government Department of Health 18 Ağustos 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi. Mumps Laboratory Case Definition (LCD)
  13. ^ "Incidence and reproduction numbers of pertussis: estimates from serological and social contact data in five European countries". PLOS Med. 7 (6): e1000291. 2010. doi:10.1371/journal.pmed.1000291. PMC 2889930 $2. PMID 20585374. 
  14. ^ Gani (Aralık 2001). "Transmission potential of smallpox in contemporary populations". Nature (İngilizce). 414 (6865): 748-751. doi:10.1038/414748a. ISSN 1476-4687. PMID 11742399. 10 Haziran 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Mart 2020. 
  15. ^ "Model parameters and outbreak control for SARS". Emerg Infect Dis. 10 (7): 1258‐1263. 2004. doi:10.3201/eid1007.030647. 
  16. ^ "High Contagiousness and Rapid Spread of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2". Emerging Infectious Diseases. 26 (7): 1470-1477. Nisan 2020. doi:10.3201/eid2607.200282. PMC 7323562 $2. PMID 32255761. 
  17. ^ "Novel Corona virus - Information for Clinicians" (PDF). Australian Government - Department of Heathl. 6 Temmuz 2020. 2 Nisan 2020 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 11 Ağustos 2020. 
  18. ^ "Magic formula that will determine whether Ebola is beaten". The Telegraph. Telegraph.Co.Uk. 7 Kasım 2014 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 30 Mart 2020. 
  19. ^ Truelove (2019). "Clinical and Epidemiological Aspects of Diphtheria: A Systematic Review and Pooled Analysis". Clinical Infectious Diseases (İngilizce). doi:10.1093/cid/ciz808. PMID 31425581. 
  20. ^ Ferguson NM (2006). "Strategies for mitigating an influenza pandemic". Nature. 442 (7101): 448-452. doi:10.1038/nature04795. PMC 7095311 $2. PMID 16642006. 
  21. ^ Khan (24 Şubat 2015). "Estimating the basic reproductive ratio for the Ebola outbreak in Liberia and Sierra Leone". Infectious Diseases of Poverty. 4: 13. doi:10.1186/s40249-015-0043-3. ISSN 2049-9957. PMC 4347917 $2. PMID 25737782. 
  22. ^ Coburn BJ (2009). "Modeling influenza epidemics and pandemics: insights into the future of swine flu (H1N1)". BMC Medicine. 7. doi:10.1186/1741-7015-7-30. PMC 2715422 $2. PMID 19545404. 
  23. ^ Kucharski (2015). "The role of superspreading in Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) transmission". Eurosurveillance. 20 (26): 14-8. doi:10.2807/1560-7917.ES2015.20.25.21167. PMID 26132768. 

Konuyla ilgili yayınlar

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">Ekoloji</span> Organizmaların ve çevrelerinin incelenmesi

Ekoloji ya da doğa bilimi, canlıların hem kendi aralarında hem de fiziksel çevreleri ile olan ilişkileri inceleyen bilim dalıdır. Ekoloji canlıları birey, popülasyon, komünite, ekosistem ve biyosfer düzeylerinde inceler. Ekoloji çok yakından ilişkili olduğu biyocoğrafya, evrimsel biyoloji, genetik, etoloji ve doğa tarihi dallarıyla örtüşür. Ekoloji, biyoloji biliminin bir dalıdır.

<span class="mw-page-title-main">Antibiyotik</span> bakteriyel enfeksiyonların tedavisinde ve önlenmesinde kullanılan ilaç

Antibiyotik, bakterilere karşı aktif olan bir tür antimikrobiyal maddedir. Bakteriyel enfeksiyonlarla savaşmak için en önemli antibakteriyel ajan türüdür ve antibiyotik ilaçlar bu tür enfeksiyonların tedavisinde ve önlenmesinde yaygın olarak kullanılmaktadır. Bakterileri öldürebilir ya da büyümelerini engelleyebilirler. Sınırlı sayıda antibiyotik de antiprotozoal aktiviteye sahiptir. Antibiyotikler soğuk algınlığı veya gribe neden olan virüsler gibi virüslere karşı etkili değildir; virüslerin büyümesini engelleyen ilaçlar antibiyotik yerine antiviral ilaçlar veya antiviraller olarak adlandırılır. Mantarlara karşı da etkili değildirler; mantarların büyümesini engelleyen ilaçlara antifungal ilaçlar denir.

<i>Legionella</i>

Legionella, lejyoner hastalığına sebep olan bakterilerin yer aldığı bakteri cinsidir. Legionellaceae familyası sadece Legionella cinsinden ibarettir ve bu cinse ait bugüne kadar bildirilmiş 62 tür bulunmaktadır. En iyi bilinen türü olan Legionella pneumophila, gram negatif, kokobasil formunda, optimum üreme sıcaklığı 20-42 °C olan bir bakteridir. Ribozomal RNA analizi çalışmaları Legionellaceae familyasının Gamma Proteobacteria şubesine dahil olduğunu göstermiştir.

<span class="mw-page-title-main">İshal</span> gevşek veya sıvı bağırsak hareketleri

İshal veya diyare, bir günde en az üç kez gevşek, sıvı veya sulu bağırsak hareketlerinin olması durumudur. Genellikle birkaç gün sürer ve sıvı kaybı nedeniyle dehidrasyona neden olabilir. Dehidrasyon belirtileri genellikle cildin normal gerginliğini kaybetmesi ve sinirli davranışlarla başlar. Bu durum daha şiddetli hale geldikçe idrara çıkmada azalma, cilt renginde kayıp, hızlı kalp atışı ve yanıt vermede azalmaya kadar ilerleyebilir. Sadece anne sütüyle beslenen bebeklerde gevşek ancak sulu olmayan dışkı normaldir.

Rickettsia helvetica, Dermacentor reticulatus ve diğer kenelerde bulunan bir bakteri türüdür. İnsanlar için patojen olduğundan şüphelenilmektedir ancak kesin olarak ispatlanamamıştır. İlk olarak 1979'da İsviçre'de Ixodes ricinus türü kenelerde keşfedilmiştir, 1993'te ilk defa izole edilmiştir. Başlangıçta R. helvetica'nın insanlar ve hayvanlar için zararsız olduğu düşünülmesine rağmen, bazı vaka bildirimleri insanlarda nonspesifik bir ateşle seyreden bir hastalığa neden olduğunu göstermektedir. 2010 yılındaki bir vaka raporunda ise kene kaynaklı bir R. helvetica menenjiti bildirilmektedir.

<span class="mw-page-title-main">Cinsel yolla bulaşan hastalık</span> insan cinsel davranışı yoluyla bulaşan enfeksiyon

Cinsel yolla bulaşan hastalık (CYBH) veya cinsel yolla bulaşan enfeksiyon (CYBE), daha eski adıyla zührevi hastalık, özellikle vajinal seks olmak üzere anal seks, oral seks, bazen de sürtünme yoluyla cinsel ilişkiyle bulaşabilen enfeksiyonların genel adıdır. CYBE'ler genellikle başlangıçta semptomlara neden olmadığından başkalarına bulaştırma riskleri fazladır. İngilizce literatürde Cinsel yolla bulaşan enfeksiyon terimi, semptomatik hastalığı olmayan vakaları da kapsadığından cinsel yolla bulaşan hastalık veya zührevi hastalık terimlerinin yerine tercih edilmektedir. CYBE'lerin belirti ve bulguları olarak vajinal akıntı, penis akıntısı, cinsel organların üzerinde veya çevresinde ülserler ve pelvik ağrı sayılabilir. Bazı CYBE'ler kısırlığa neden olabilmektedir.

<span class="mw-page-title-main">İdrar yolu enfeksiyonu</span> i̇drar yolunun bir kısmını etkileyen enfeksiyon

İdrar yolu enfeksiyonu (İYE), idrar yolunun bir bölümünü etkileyen bir enfeksiyondur. Alt idrar yollarını etkilediğinde mesane enfeksiyonu (sistit), üst idrar yollarını etkilediğinde ise böbrek enfeksiyonu (piyelonefrit) olarak bilinir. Alt idrar yolu enfeksiyonu belirtileri arasında idrar yaparken ağrı, sık idrara çıkma ve mesanenin boş olmasına rağmen idrar yapma ihtiyacı hissetme yer alır. Böbrek enfeksiyonu semptomları arasında genellikle alt İYE belirtilerine ek olarak ateş ve ağrı yer alır. Nadiren idrar kanlı görünebilir. Çok yaşlılarda ve çok gençlerde belirtiler belirsiz veya spesifik olmayabilir.

<span class="mw-page-title-main">Ateş (tıp)</span> vücut sıcaklığının yükselmesi ile karakterize olan yaygın tıbbi belirti

Ateş veya pireksi insanlarda, organizmanın enfeksiyona karşı savunma mekanizmasının bir belirtisidir ve vücut sıcaklığının hipotalamustaki sıcaklık set noktasının artması nedeniyle normal aralığı aşmasıyla ortaya çıkar. Normal sıcaklık için üzerinde mutabık kalınmış tek bir üst sınır yoktur: Kaynaklar insanlarda 37,2 ve 38,3 °C aralığında değerler kullanmaktadır. Set noktasındaki artış, artan kas kasılmalarını tetikler ve soğuk veya üşüme hissine neden olur. Bu durum, daha fazla ısı üretimine ve ısıyı koruma çabalarına yol açar. Set noktası sıcaklığı normale döndüğünde, kişi sıcak hisseder, kızarır ve terleme başlayabilir. Nadir olarak, ateş ateşli nöbeti tetikleyebilir, bu durum özellikle küçük çocuklarda daha yaygındır. Ateşler genellikle 41 ila 42 °C aralığını geçmez.

İnsan bulaşıcı hastalıkları, vaka ölüm oranları (CFR), yani bir hastalığa yakalanan ve bu hastalıktan ölen kişilerin oranı ile karakterize edilebilir. Bu oran, asemptomatik ve teşhis edilmemiş enfeksiyonlar da dahil olmak üzere, hastalığa neden olan bir etken tarafından enfekte edilen ve hastalıktan ölen kişilerin tahmini oranı olan enfeksiyon ölüm oranı (IFR) ile karıştırılmamalıdır. IFR, CFR'den daha yüksek olamaz ve genellikle çok daha düşüktür, ancak hesaplanması da çok daha zordur. Bu veriler en iyi şekilde tedavi edilen hastalara dayanmaktadır ve aksi belirtilmedikçe izole vakaları veya küçük salgınları hariç tutmaktadır.

Enterococcus hirae, Enterococcus'ün bir türüdür. Tip suşu NCDO 1258'dir. Genç tavuklar ile endokarditte görülen büyüme depresyonunda, insanlarda ise sepsiste rol oynar.

<i>Campylobacter jejuni</i>

Campylobacter jejuni ( ) Avrupa ve Amerika Birleşik Devletleri'nde gıda zehirlenmesinin en yaygın nedenlerinden biridir. Vakaların büyük çoğunluğu, tanınan salgınların bir parçası olarak değil, izole olaylar olarak ortaya çıkar. Gıda Kaynaklı Hastalıklar Aktif Gözetim Ağı (FoodNet) aracılığıyla aktif gözetim, ABD'de her 100.000 kişi için her yıl yaklaşık 20 vakanın teşhis edildiğini gösterirken, daha pek çok vaka teşhis edilmemiş veya bildirilmemiştir. CDC, her yıl toplam 1,5 milyon enfeksiyon tahmin etmektedir. Avrupa Gıda Güvenliği Otoritesi 2018'de 246.571 vaka bildirdi ve Avrupa Birliği'nde yılda yaklaşık dokuz milyon insanda kampilobakteriyoz vakası tahmin etti.

1957-1958 Asya gribi pandemisi, güney Çin'deki Guizhou'da ortaya çıkan küresel bir influenza A virüsü alt tipi H2N2 salgınıydı. 1957-1958 pandemisinin neden olduğu ölüm sayısının dünya çapında 1 ila 4 milyon arasında olduğu tahmin ediliyor ve bu da salgını tarihin en ölümcül pandemilerinden biri yapıyor. On yıl sonrasında, yeniden sınıflandırılan H3N2 virali, Hong Kong grip pandemisine (1968–1969) neden oldu.

<span class="mw-page-title-main">Köpek koronavirüsü</span>

Köpek koronavirüsüü, Alphacoronavirus 1 türünün bir üyesi olan viral zarflı, tek sarmallı bir RNA virüsüdür. Köpeklerde dünya çapında oldukça bulaşıcı bir bağırsak hastalığına neden olur. Enfekte eden virüs, konakçı hücresine APN reseptörüne bağlanarak girer. 1971 yılında Almanya'da bekçi köpeklerinde görülen bir salgın sırasında keşfedilmiştir. Virüs, Alphacoronavirus cinsinin ve Tegacovirus alt cinsinin bir üyesidir.

Melioidoz, Burkholderia pseudomallei adı verilen gram negatif bir bakterinin neden olduğu bulaşıcı bir enfeksiyon hastalığıdır. B. pseudomallei'ye maruz kalan çoğu insan genellikle hiçbir semptom göstermez ancak semptom gösterenlerde ateş ve cilt değişiklikleri gibi hafif belirtilerden şiddetli zatürre, apseler ve septik şok gibi ölüme neden olabilecek belirtiler ve semptomlar görülebilir. Melioidoz hastalarının yaklaşık %10'u iki aydan uzun süren "kronik melioidoz" olarak adlandırılan semptomlar geliştirir.

<span class="mw-page-title-main">Aspergillus ustus</span>

.

Epidemiyolojide, vaka ölüm oranı (CFR) - veya daha doğrusu vaka ölüm riski - belirli bir hastalık teşhisi konulan ve sonunda bu hastalıktan ölen kişilerin oranıdır. Bir hastalığın ölüm oranından farkı, hastalığın başlangıcı ile ölüm arasındaki süreyi hesaba katmamasıdır. Genellikle yüzde olarak ifade edilir. Hastalık ölümcüllüğünün bir ölçüsünü temsil eder ve farklı tedavilerle oran değişebilir. Vaka ölüm oranı genellikle akut enfeksiyonlar gibi ayrı, sınırlı süreli durumlar için kullanılır.

Bronşiyolit, akciğerlerdeki küçük hava yollarının iltihaplanmasıdır. Akut bronşiyolit, genellikle iki yaşından küçük çocukları etkileyen viral bir enfeksiyondan kaynaklanır. Semptomlar ateş, öksürük, burun akıntısı, hırıltılı solunum ve solunum problemlerini içerebilir. Daha ciddi vakalar, burun kanadı, homurdanma veya nefes alırken kaburgalar arasındaki derinin çekilmesi ile ilişkilendirilebilir. Çocuk düzgün beslenememişse, dehidrasyon belirtileri mevcut olabilir.

<span class="mw-page-title-main">Sürü bağışıklığı</span> bir nüfusun yeterli bir kısmı bağışıklık kazandığında (aşılama veya önceki enfeksiyonlar yoluyla) ortaya çıkan bulaşıcı hastalıktan korunma durumu

Sürü bağışıklığı, yalnızca bulaşıcı hastalıklar için geçerli olan bir dolaylı koruma şeklidir. Bir popülasyonun yeterli bir yüzdesi, önceki enfeksiyonlar veya aşılama yoluyla bir enfeksiyona karşı bağışıklık kazandığında ortaya çıkar ve böylece bağışıklığı olmayan bireyler için enfeksiyon olasılığını azaltır.

Kan dolaşımı enfeksiyonları, enfeksiyonlar bakteriyelolduğunda bakteriyemileri ve enfeksiyonlar mantar olduğunda fungemileri içeren septisemi, kan'da oluşan enfeksiyonlardır. Kan normalde steril bir ortamdır bu nedenle kandaki mikrop'ların bulunması daima anormal bir durumdur. Kan dolaşımı enfeksiyonu, konakçının bakterilere verdiği tepki olan sepsis'ten farklıdır.

<span class="mw-page-title-main">Üst solunum yolu enfeksiyonu</span> burun, sinüsler, yutak veya gırtlak dahil olmak üzere akut bir enfeksiyonun neden olduğu hastalık

Üst solunum yolu enfeksiyonu (ÜSYE), burun, sinüsler, farenks, larenks veya trakea dahil olmak üzere üst solunum yollarını tutan akut bir enfeksiyonun neden olduğu bir hastalıktır. Bu genellikle burun tıkanıklığı, boğaz ağrısı, bademcik iltihabı, farenjit, larenjit, sinüzit, orta kulak iltihabı ve soğuk algınlığını içerir.  Enfeksiyonların çoğu doğası gereği viraldir ve diğer durumlarda neden bakteriyeldir. ÜSYE'ler mantar veya helmintik kaynaklı da olabilir, ancak bunlar daha az yaygındır.