RAD51

RAD51
Uygun yapılar PDB Ortolog araması: PDBe RCSB PDB kimlik kodlarının listesi 1N0W, 1B22
Tanımlayıcılar
Başka adlar	RAD51
Dış kimlikler	OMIM: 179617 MGI: 97890 HomoloGene: 2155 GeneCards: RAD51
Gen yerleşimi (İnsan) Krom. 15. Kromozom (insan)[1] Bant 15q15.1 Başlangıç 40,694,774 bç[1] Bitiş 40,732,340 bç[1]
RNA ekspresyonu deseni Daha çok ekspresyon verisi başvurusu
Gen ontolojisi Moleküler işlevi • nucleotide binding • DNA binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • DNA strand exchange activity • DNA polymerase binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein bağlanması • four-way junction DNA binding • identical protein binding • endodeoxyribonuclease activity • ATP binding • single-stranded DNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity • chromatin binding • enzyme binding Hücresel bileşeni • sitoplazma • site of double-strand break • PML body • Hücre iskeleti • Nükleoplazma • microtubule organizing center • nuclear chromosome • mitochondrial matrix • Çekirdekçik • mitokondri • perinuclear region of cytoplasm • Kromatin • hücre çekirdeği • Sitozol • GO:0009327 protein-containing complex • condensed chromosome • condensed nuclear chromosome • lateral element • kromozom Biyolojik süreci • strand invasion • GO:1903211 mitotic recombination-dependent replication fork processing • reciprocal meiotic recombination • DNA recombination • regulation of double-strand break repair via homologous recombination • DNA metabolic process • positive regulation of DNA ligation • cellular response to camptothecin • double-strand break repair via homologous recombination • cellular response to ionizing radiation • mitotic recombination • protein homooligomerization • GO:0100026 DNA onarımı • DNA unwinding involved in DNA replication • cellular response to DNA damage stimulus • interstrand cross-link repair • DNA recombinase assembly • negative regulation of G0 to G1 transition • telomere maintenance via recombination • telomere maintenance via telomere lengthening • replication fork processing • GO:0007126 Mayoz bölünme • GO:0051178 chromosome organization involved in meiotic cell cycle Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
Türler	İnsan	Fare
Entrez	5888	19361
Ensembl	ENSG00000051180	n/a
UniProt	Q06609	Q08297
RefSeq (mRNA)	NM_001164269 NM_001164270 NM_002875 NM_133487	NM_011234
RefSeq (protein)	NP_001157741 NP_001157742 NP_002866 NP_597994	NP_035364
Yerleşim (UCSC)	Krom. 15: 40.69 – 40.73 Mb	n/a
PubMed araması	[2]	[3]
Vikiveri
İnsan'ı Gör/Düzenle Fare'yi Gör/Düzenle

PDB: 1PZN​ koordinatlarına göre çizilmiş bir Rad51 yedilisi.[4]
RAD51 homolog (RecA homolog, E. coli) (S. cerevisiae)
Tanımlayıcılar
Sembol	RAD51
OMIM	179617
PDB	1b22 PDB: 1n0w​
Diğer bilgiler

RAD51, bir insan genidir, bu genin ürünü olan ve aynı isme sahip olan protein DNA çift iplikçikli kesiklerini tamir eder. Bu protein RAD51 protein ailesinin üyelerinden biridir. RAD51 protein ailesi üyeleri bakteriyel RecA ve maya Rad51 ile homologdur. Protein, mayadan insana kadar çoğu ökaryotta korunmuştur.

Bu genin iki alternatif uçbirleştirme varyantı bulunmaktadır, bunlar farklı proteinler kodlar. Ayrıca, alternatif poliA sinyallari kullanan transkriptler de mevcuttur.

İnsanda, RAD51 homolog rekombinasyonda önemli bir rol oynayan, 339 amino asit uzunluğunda bir proteindir. Çift iplikçikli DNA kırıklarının tamiri sırasında bir kalıp iplikçik, birbiriyle eşleşmiş homolog DNA iplikçiklerini işgal eder, ATP-ye bağımlı olan bu süreç sonucunda bir iplikçik yer değiştirme reaksiyonu meydana gelir. RAD51 bu süreç sırasında homolog bölgelerin aranması ve iplikçiklerin eşleşmesinde rol oynar.

DNA metabolizmasında yer alan diğer proteinlerden farklı olarak RecA/Rad51 ailesinin üyeleri DNA üzerinde sarmal şekilli bir nükleoprotein filaman oluştururlar.^[5]

Bu protein tek iplikçikli DNA'ya bağlanan proteine (Replication protein A; RPA) ve RAD52 ile etkileşir.

Rad51 proteini ayrıca BRCA1 ve BRCA2 proteinleri ile de etkileşir. BRCA2, Rad51'in hem hücre içindeki lokalizasyonunu, hem de onun DNA'ya bağlanma yeteneğini düzenler. BRCA2'nin kaybı sonucu bu kontrollerin çalışmaması, genomik bozukluklar ve tümörigeneze yol açabilecek önemli bir olay olduğu düşünülmektedir. Bu etkileşimlerin hücrenin DNA hasarına tepkisinde önemli rol oynadığı düşünülmektedir.^[6]

Rad51 geni kromozom 15'te bulunur, bu gendeki bazı değişikliklerin göğüs kanseri olma riskini artırdığı bulunmuştur. Göğüs kanseri yatkınlık proteini BRCA2, homolog rekombinasyon yoluyla DNA tamirinde RAD51'in işlevini kontrol eder.^[7]

Memelilerde yedi recA-benzeri gen tespit edilmiştir: Rad51, Rad51L1/B, Rad51L2/C, Rad51L3/D, XRCC2, XRCC3 ve DMC1/Lim15.^[8] Tüm bu proteinler, mayoza özgü olan DMC1 hariç, memelilerde gelişme için gereklidir.

Rad51'in BRE,^[9] RAD54B,^[10] Ataxia telangiectasia mutated,^[11] BRCC3,^[9] BARD1,^[9] BRCA2,^{[7][9][12][13][14][15][16][17][18][19][20][21][22]} UBE2I,^[23][24] Abl gene,^[11] BRCA1,^{[9][21][25][26]} ATRX,^[10][27] RAD52,^[11] DMC1,^[28] P53^[9][29][30] ve Bloom syndrome protein.^[31] ile etkileştiği gösterilmiştir.

• 
  1b22: RAD51 (N-uç bölgesi)
• 
  1n0w: BRC tekrar kompleksinde RAD51-BRCA2 kristal yapısı