İçeriğe atla

PubMed

PubMed Central ile karıştırılmamalıdır.
PubMed
İletişim
Araştırma merkeziUlusal Tıp Kütüphanesi (NLM)
Yayın tarihiOcak 1996 (28 yıl önce) (1996-01)
Erişim
İnternet sitesipubmed.ncbi.nlm.nih.gov

PubMed, öncelikle yaşam bilimleri ve biyomedikal konulardaki referans ve özetlerin MEDLINE veritabanına erişen ücretsiz bir arama motorudur. Ulusal Sağlık Enstitülerindeki Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Tıp Kütüphanesi (NLM), Entrez bilgi erişim sisteminin bir parçası olarak veritabanını korumaktadır.[1]

1971'den 1997'ye kadar MEDLINE veri tabanına çevrimiçi erişim, öncelikle üniversite kütüphaneleri gibi kurumsal tesisler aracılığıyla sağlanmıştır.[2] İlk olarak Ocak 1996'da yayınlanan PubMed, özel, ücretsiz, ev ve ofis tabanlı MEDLINE arama dönemini başlattı.[3] PubMed sistemi Haziran 1997'den itibaren halka ücretsiz olarak sunulmuştur.[2]

İçerik

MEDLINE'a ek olarak, PubMed aşağıdakilere erişim sağlar:

  • Index Medicus'un basılı versiyonundan 1951 ve öncesine ait daha eski referanslar
  • Science, BMJ ve Annals of Surgery gibi Index Medicus ve MEDLINE'da indekslenmeden önce bazı dergilere yapılan atıflar
  • Medical Subject Headings (MeSH) ile indekslenmeden ve MEDLINE'a eklenmeden önce bir makale için kayıtlara çok yeni girişler
  • NLM kayıtlarının tam metnine ve diğer alt kümelerine ulaşılabilen bir kitap koleksiyonu[4]
  • PMC atıfları
  • NCBI Kitaplığı

Birçok PubMed kaydı, bazıları PubMed Central[5] ve Europe PubMed Central[6] gibi yerel ayna sitelerde ücretsiz olarak bulunan tam metin makalelere bağlantılar içerir.

MEDLINE'da indekslenen ve PubMed aracılığıyla ulaşılabilen dergiler hakkında bilgi NLM Kataloğu'nda bulunmaktadır.[7]

23 Mayıs 2023 itibarıyla PubMed'de 1966'ya, seçmeli olarak 1865 yılına ve çok seçmeli olarak 1809'a kadar uzanan 35 milyondan fazla alıntı ve özet bulunmaktadır. Aynı tarih itibarıyla, PubMed kayıtlarının 24,6 milyonu özetleriyle birlikte listelenmiştir ve 26,8 milyon kaydın tam metin sürümlerine bağlantıları vardır (bunlardan 10,9 milyon makale ücretsiz olarak tam metin olarak mevcuttur).[8] Son 10 yılda (31 Aralık 2019'da sona eriyor), her yıl ortalama yaklaşık bir milyon yeni kayıt eklenmiştir.

2016 yılında NLM indeksleme sistemini değiştirerek yayıncıların PubMed indeksli makalelerdeki yazım hatalarını ve yanlışları doğrudan düzeltebilmelerini sağlamıştır.[9]

PubMed'in yağmacı dergilerde yayınlanan bazı makaleleri içerdiği bildirilmiştir. Veritabanına dahil edilecek dergilerin seçiminde MEDLINE ve PubMed politikaları biraz farklıdır. PubMed Central'da dergilerin indekslenmesine yönelik kriter ve prosedürlerdeki zayıflıklar, yağmacı dergilerdeki yayınların PubMed'e sızmasına izin verebilir.[10] Ulusal Tıp Kütüphanesi, araştırma fon sağlayıcılarının kamu erişim politikalarını desteklemek için bireysel dergi makalelerinin PMC'ye dahil edilebileceğini ve dergiler ve yayıncılarla ilgili titiz politikaların NLM literatür veritabanlarının bütünlüğünü sağladığını söylemiştir.[11]

Özellikler

İnternet sitesi tasarımı

Ekim 2009'da yeni bir PubMed arayüzü başlatılmış ve bu tür hızlı, Google benzeri arama formülasyonlarının kullanımı teşvik edilmiştir; bunlar aynı zamanda 'telegram' aramaları olarak da tanımlanmıştır.[12] Varsayılan olarak sonuçlar en sona göre sıralanır, ancak bu en iyi eşleşme, yayın tarihi, ilk yazar, son yazar, dergi veya başlık olarak değiştirilebilir.[13]

PubMed internet sitesi tasarımı ve alan adı Ocak 2020'de güncellendi ve 15 Mayıs 2020'de güncellenmiş ve yeni özelliklerle varsayılan hale geldi.[14] Siteyi sıklıkla kullanan birçok araştırmacıdan eleştirel bir tepki geldi.[15]

El bilgisayarları/cep telefonları için PubMed

PubMed/MEDLINE'a, örneğin NLM tarafından oluşturulan "PICO" seçeneği (odaklanmış klinik sorular için) kullanılarak el cihazları üzerinden erişilebilir.[16] Mobil uyumlu, basitleştirilmiş bir PubMed sürümüne erişim sağlayan bir "PubMed Mobile" seçeneği de mevcuttur.[17]

Arama

Standart arama

PubMed'de basit aramalar, PubMed'in arama penceresine bir konunun temel yönleri girilerek gerçekleştirilebilir.

PubMed bu ilk arama formülasyonunu tercüme eder ve otomatik olarak alan adlarını, ilgili MeSH (Tıbbi Konu Başlıkları) terimlerini, eş anlamlıları, Boole operatörlerini ekler ve ortaya çıkan terimleri uygun şekilde 'yuvalar', özellikle metin kelimelerini ve MeSH terimlerini rutin olarak birleştirerek (OR operatörünü kullanarak) arama formülasyonunu önemli ölçüde geliştirir.[]

PubMed eğitiminde verilen örnekler[18] bu otomatik sürecin nasıl çalıştığını göstermektedir:

Causes Sleep Walking is translated as ("etiology"[Subheading] OR "etiology"[All Fields] OR "causes"[All Fields] OR "causality"[MeSH Terms] OR "causality"[All Fields]) AND ("somnambulism"[MeSH Terms] OR "somnambulism"[All Fields] OR ("sleep"[All Fields] AND "walking"[All Fields]) OR "sleep walking"[All Fields])

Aynı şekilde

soft Attack Aspirin Prevention is translated as ("myocardial infarction"[MeSH Terms] OR ("myocardial"[All Fields] AND "infarction"[All Fields]) OR "myocardial infarction"[All Fields] OR ("heart"[All Fields] AND "attack"[All Fields]) OR "heart attack"[All Fields]) AND ("aspirin"[MeSH Terms] OR "aspirin"[All Fields]) AND ("prevention and control"[Subheading] OR ("prevention"[All Fields] AND "control"[All Fields]) OR "prevention and control"[All Fields] OR "prevention"[All Fields])

Kapsamlı arama

PubMed'de en iyi aramaları yapabilmek için, temel bileşeni olan MEDLINE'ı ve özellikle MEDLINE makalelerini indekslemek için kullanılan MeSH (Medical Subject Headings) kontrollü kelime dağarcığını anlamak gerekir. Ayrıca karmaşık arama stratejileri, alan adlarının (etiketlerin) kullanımı, limitlerin ve diğer özelliklerin doğru kullanımı gerekebilir; referans kütüphanecileri ve arama uzmanları arama hizmetleri sunmaktadır.[19][20]

PubMed'in arama penceresinde arama, yalnızca henüz bir MeSH başlığı oluşturulmamış kesin konuların veya yeni müdahalelerin yanı sıra ticari ilaç markalarının ve özel isimlerin aranması için önerilir. Uygun bir başlık olmadığında veya tanımlayıcı kısmi bir yönü temsil ettiğinde de kullanışlıdır. MeSH eş anlamlılar sözlüğü kullanılarak yapılan arama daha doğrudur ve daha az alakasız sonuç verecektir. Buna ek olarak, yazım, tekil/çoğul veya kısaltma farklılıklarının dikkate alınması gereken serbest metin aramasının dezavantajını ortadan kaldırır. Diğer taraftan, henüz tanımlayıcıların atanmadığı veri tabanına daha yeni dahil edilmiş makaleler bulunamayacaktır. Bu nedenle, kapsamlı bir aramayı garanti altına almak için, kontrollü dil başlıkları ve serbest metin terimlerinin bir kombinasyonu kullanılmalıdır.[21]

Dergi makalesi parametreleri

Bir dergi makalesi indekslendiğinde, çok sayıda makale parametresi çıkarılır ve yapılandırılmış bilgi olarak saklanır. Bu parametreler şunlardır: makale türü (MeSH terimleri, örneğin "Klinik Araştırma"), ikincil tanımlayıcılar (MeSH terimleri), dil, derginin ülkesi veya yayın tarihi (e-yayın tarihi, basılı dergi yayın tarihi).

Yayın türü: Klinik sorgular/sistematik incelemeler

Yayın türü parametresi, çeşitli klinik araştırma türlerinin raporları da dahil olmak üzere yayın türüne göre arama yapılmasını sağlar.[22]

İkincil ID

Temmuz 2005'ten bu yana MEDLINE makale indeksleme süreci, makale özetinden tanımlayıcıları çıkarmakta ve bunları İkincil Tanımlayıcı (SI) adı verilen bir alana yerleştirmektedir. İkincil tanımlayıcı alanı, moleküler dizi verileri, gen ifadesi veya kimyasal bileşikler ve klinik çalışma kimliklerinin çeşitli veritabanlarına erişim numaralarını saklamak içindir. Klinik çalışmalar için PubMed, en büyük iki çalışma kaydı için çalışma kimliklerini çıkarır: ClinicalTrials.gov (NCT tanımlayıcı) ve Uluslararası Standart Randomize Kontrollü Deneme Numarası Kaydı (IRCTN tanımlayıcı).[23]

Ayrıca bakınız

Özellikle ilgili olduğu düşünülen bir referans işaretlenebilir ve "ilgili makaleler" tanımlanabilir. İlgili ise, birkaç çalışma seçilebilir ve 'İlgili verileri bul' seçeneği kullanılarak hepsiyle ilgili makaleler oluşturulabilir (PubMed veya diğer NCBI Entrez veritabanlarından herhangi birinde). İlgili makaleler daha sonra "ilişkililik" sırasına göre listelenir. Bu ilgili makale listelerini oluşturmak için PubMed, güçlü bir kelime ağırlıklı algoritma kullanarak her bir alıntının başlığındaki ve özetindeki kelimelerin yanı sıra atanan MeSH başlıklarını karşılaştırır.[24] 'İlgili makaleler' işlevinin o kadar hassas olduğuna karar verilmiştir ki bir makalenin yazarları tam bir arama yerine kullanılabileceğini önermiştir.[25]

MeSH ile eşleştirme

PubMed otomatik olarak MeSH terimlerine ve alt başlıklarına bağlantı verir. Örnekler şunlar olabilir: "ağız kokusu" "halitosis"e, "kalp krizi" "miyokard enfarktüs"e, "meme kanseri" "meme neoplazmları"na bağlanır (ve aramaya dahil edilir). Uygun olduğunda, bu MeSH terimleri otomatik olarak "genişletilir", yani daha spesifik terimler eklenir. "Hemşirelik" gibi terimler otomatik olarak "Hemşirelik [MeSH]" veya "Hemşirelik [Alt Başlık]" ile ilişkilendirilir. Bu özellik Otomatik Terim Eşleme olarak adlandırılır ve varsayılan olarak serbest metin aramasında devreye girer, ancak tam ifade aramasında (yani arama sorgusunu çift tırnak içine alarak) devreye girmez.[26] Bu özellik PubMed aramalarını daha hassas hale getirir ve tıbbi terminolojinin çeşitliliğini telafi ederek yanlış negatif (cevapsız) isabetleri önler.[26]

PubMed, aşağıdaki durumlarda terimin otomatik eşlemesini uygulamaz: alıntılanan ifadeyi yazarak (örn., "böbrek allogrefti"), yıldız işaretinde kesildiğinde (örn., böbrek allogrefti*) ve alan etiketleriyle bakıldığında (örn., Kanser [ti]).[21]

My NCBI

PubMed isteğe bağlı "My NCBI" tesisi (ücretsiz kayıt ile) aşağıdakiler için araçlar sağlar

  • aramaları kaydetme
  • arama sonuçlarını filtreleme
  • e-posta ile gönderilen otomatik güncellemeleri ayarlama
  • PubMed aramasının bir parçası olarak alınan referans setlerini kaydetme
  • görüntüleme biçimlerini yapılandırma veya arama terimlerini vurgulama

ve çok çeşitli diğer seçenekler.[27] "My NCBI" alanına web erişimi olan herhangi bir bilgisayardan erişilebilir. "My NCBI"ın daha önceki bir versiyonu "PubMed Cubby" olarak adlandırılıyordu.[28]

LinkOut

LinkOut, tam metin yerel dergi varlıklarını birbirine bağlayan ve kullanıma sunan bir NLM tesisidir.[29] Danimarka'daki Aalborg Üniversitesinden Seattle'daki ZymoGenetics'e kadar yaklaşık 3.200 site (çoğunlukla akademik kurumlar) bu NLM tesisine katılmaktadır (Mart 2010 itibarıyla).[30] Bu kurumlardaki kullanıcılar PubMed arama sonucu içinde kurumlarının logosunu görürler (eğer dergi o kurumda tutuluyorsa) ve tam metne erişebilirler. Link out, 2019 Yazında yapılacak büyük platform güncellemesinden itibaren Outside Tool ile birleştiriliyor.[31]

PubMed Commons

2016 yılında PubMed, makale yazarlarının PubMed tarafından indekslenen makaleler hakkında yorum yapmalarına izin verdi. Bu özellik başlangıçta pilot modda test edilmiş (2013'ten beri) ve 2016'da kalıcı hale getirilmiştir.[32] Şubat 2018'de, PubMed Commons "kullanımın minimum düzeyde kalması" nedeniyle durduruldu.[33][34]

askMEDLINE

askMEDLINE, NLM tarafından geliştirilen MEDLINE/PubMed için serbest metin, doğal dil sorgulama aracıdır ve el bilgisayarları için de uygundur.[35]

PubMed tanımlayıcısı

PMID (PubMed tanımlayıcısı veya PubMed benzersiz tanımlayıcısı),[36] her PubMed kaydına atanan, 1'den başlayan benzersiz bir tam sayı değeridir. PMID, ücretsiz erişimli PubMed Central'da yayınlanan tüm çalışmaların tanımlayıcısı olan PMCID (PubMed Central tanımlayıcısı) ile aynı değildir.[37]

Bir yayına PMID veya PMCID atanması, okuyucuya içeriğin türü veya kalitesi hakkında hiçbir şey söylemez. PMID'ler, hakemli makalelerin yanı sıra editöre mektuplara, editoryal görüşlere, köşe yazılarına ve editörün dergiye dahil etmeyi seçtiği diğer tüm yazılara atanır. Kimlik numarasının varlığı, makalelerin sahtekarlık, yetersizlik veya suistimal nedeniyle geri çekilmediğinin de kanıtı değildir. Orijinal makalelerde yapılan düzeltmelerle ilgili duyuruya bir PMID atanabilir.

PubMed arama penceresine girilen her numara varsayılan olarak bir PMID gibi değerlendirilir. Bu nedenle, PubMed'deki herhangi bir referans PMID kullanılarak bulunabilir.

Alternatif arayüzler

MEDLINE, PubMed üzerinden erişilebilen veri tabanlarından biridir. Birçok şirket kendi platformları üzerinden MEDLINE'a erişim sağlamaktadır.

Ulusal Tıp Kütüphanesi MEDLINE bilgilerini Embase, Ovid, Dialog, EBSCO, Knowledge Finder ve diğer birçok ticari, ticari olmayan ve akademik sağlayıcılar gibi bir dizi özel satıcıya kiralamaktadır.[38] Ekim 2008 itibarıyla, 200'den fazlası Amerika Birleşik Devletleri dışındaki sağlayıcılara olmak üzere 500'den fazla lisans verilmiştir. MEDLINE verilerini kullanma lisansları ücretsiz olduğundan, NLM aslında bu seçeneği sunan çok az sayıdaki büyük, profesyonelce düzenlenmiş veri tabanlarından biri olan PubMed'e çok çeşitli alternatif arayüzler ve 3. taraf eklemeler için ücretsiz bir test alanı sağlamaktadır.[39]

Lu, kurulum veya kayıt gerektirmeyen, dört kategoride gruplandırılmış 28 güncel ve ücretsiz Web tabanlı PubMed sürümünün bir örneğini tanımlamaktadır:[39]

  1. Arama sonuçlarının sıralanması, örneğin: eTBLAST; MedlineRanker;[40] MiSearch;[41]
  2. Sonuçları konulara, yazarlara, dergilere vb. göre kümeleme, örneğin: Anne O'Tate;[42] ClusterMed;[43]
  3. Anlambilim ve görselleştirmenin geliştirilmesi, örneğin: EBIMed;[44] MedEvi.[45]
  4. Geliştirilmiş arama arayüzü ve erişim deneyimi, örneğin askMEDLINE[46][47] BabelMeSH;[48] ve PubCrawler.[49]

Bu ve diğer alternatiflerin çoğu esasen NLM/PubMed'den lisans altında kiralanan PubMed/MEDLINE verilerine dayandığından, "PubMed türevleri" terimi önerilmiştir.[39] Yaklaşık 90 GB'lık orijinal PubMed Veri Setlerini depolamaya gerek kalmadan, Eric Sayers'in "The E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More" adlı kitabında açıklandığı gibi eutils-application program arayüzünü kullanarak herkes PubMed uygulamaları yazabilir.[50] PMID numaralarını girdi olarak alan çeşitli atıf formatı oluşturucuları, eutils-application program arayüzünü kullanan web uygulamalarına örnektir. Örnek web sayfaları arasında Citation Generator - Mick Schroeder, Pubmed Citation Generator - Ultrasound of the Week, PMID2cite ve Cite this for me bulunmaktadır.

PubMed'in veri madenciliği

PubMed'de veri madenciliği yapmak için alternatif yöntemler Matlab, Python veya R gibi programlama ortamlarını kullanır. Bu durumlarda, PubMed sorguları kod satırları olarak yazılır ve PubMed'e iletilir ve yanıt daha sonra doğrudan programlama ortamında işlenir. Kod, hastalık, yıl, organlar vb. gibi farklı anahtar kelimelerle sistematik olarak sorgulama yapmak için otomatikleştirilebilir.

PubMed tarafından erişilebilen veriler, MEDOC gibi resmi olmayan bir araç kullanılarak yerel olarak yansıtılabilir.[51]

Milyonlarca PubMed kaydı, Unpaywall gibi açık erişimle ilgili çeşitli açık veri veri kümelerini artırmaktadır. Unpaywall Journals gibi veri analiz araçları, kütüphaneler tarafından büyük anlaşma iptallerine yardımcı olmak için kullanılır: kütüphaneler, PubMed Central gibi açık arşivler aracılığıyla anında açık erişimle sunulan materyallere abonelikten kaçınabilir.

Kaynakça

  1. ^ "PubMed". 13 Aralık 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  2. ^ a b Lindberg DA (2000). "Internet access to the National Library of Medicine" (PDF). Effective Clinical Practice. 3 (5): 256-60. PMID 11185333. 2 Kasım 2013 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. 
  3. ^ "PubMed Celebrates its 10th Anniversary". Technical Bulletin. United States National Library of Medicine. 5 Ekim 2006. 23 Nisan 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 22 Mart 2011. 
  4. ^ "PubMed: MEDLINE Retrieval on the World Wide Web". Fact Sheet. United States National Library of Medicine. 7 Haziran 2002. 1 Eylül 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 22 Mart 2011. 
  5. ^ Roberts RJ (January 2001). "PubMed Central: The GenBank of the published literature". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 98 (2): 381-2. Bibcode:2001PNAS...98..381R. doi:10.1073/pnas.98.2.381. PMC 33354 $2. PMID 11209037. 
  6. ^ McEntyre JR, Ananiadou S, Andrews S, Black WJ, Boulderstone R, Buttery P, Chaplin D, Chevuru S, Cobley N, Coleman LA, Davey P, Gupta B, Haji-Gholam L, Hawkins C, Horne A, Hubbard SJ, Kim JH, Lewin I, Lyte V, MacIntyre R, Mansoor S, Mason L, McNaught J, Newbold E, Nobata C, Ong E, Pillai S, Rebholz-Schuhmann D, Rosie H, Rowbotham R, Rupp CJ, Stoehr P, Vaughan P (January 2011). "UKPMC: a full text article resource for the life sciences". Nucleic Acids Research. 39 (Database issue): D58-65. doi:10.1093/nar/gkq1063. PMC 3013671 $2. PMID 21062818. 
  7. ^ "NLM Catalogue: Journals referenced in the NCBI Databases". NCBI. 2011. 13 Ekim 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  8. ^ "PubMed". PubMed (İngilizce). 6 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 5 Ocak 2023.  The search query "1800:2100[dp]" retrieves all results whose date of publication is between 1800 and 2100 inclusive.
  9. ^ "MEDLINE/PubMed Production Improvements Underway". NLM Technical Bulletin (411): e1. July–August 2016. 29 Mart 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  10. ^ Manca A, Moher D, Cugusi L, Dvir Z, Deriu F (September 2018). "How predatory journals leak into PubMed". CMAJ. 190 (35): E1042-E1045. doi:10.1503/cmaj.180154. PMC 6148641 $2. PMID 30181150. 
  11. ^ Topper, Lauren; Marill, Jennifer; Kelly, Christopher; Funk, Kathryn (11 Mart 2019). "Rigorous policies ensure integrity of NLM literature databases". CMAJ. 191 (10): E289. doi:10.1503/cmaj.71602. ISSN 1488-2329. PMC 6411471 $2. PMID 30858186. 
  12. ^ Clarke J, Wentz R (September 2000). "Pragmatic approach is effective in evidence based health care". BMJ. 321 (7260): 566-7. doi:10.1136/bmj.321.7260.566/a. PMC 1118450 $2. PMID 10968827. 
  13. ^ Fatehi F, Gray LC, Wootton R (January 2014). "How to improve your PubMed/MEDLINE searches: 2. display settings, complex search queries and topic searching". Journal of Telemedicine and Telecare. 20 (1): 44-55. doi:10.1177/1357633X13517067. PMID 24352897. 
  14. ^ Trawick, Bart (21 Ocak 2020). "A New and Improved PubMed®". NLM Musings From the Mezzanine. 7 Ekim 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  15. ^ Price, Michael (22 Mayıs 2020). "They redesigned PubMed, a beloved website. It hasn't gone over well". Science. 21 Mayıs 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  16. ^ "PubMed via handhelds (PICO)". Technical Bulletin. United States National Library of Medicine. 2004. 30 Mayıs 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  17. ^ "PubMed Mobile Beta". Technical Bulletin. United States National Library of Medicine. 2011. 11 Nisan 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  18. ^ "Simple Subject Search with Quiz". NCBI. 2010. 11 Mayıs 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  19. ^ Jadad AR, McQuay HJ (July 1993). "Searching the literature. Be systematic in your searching". BMJ. 307 (6895): 66. doi:10.1136/bmj.307.6895.66-a. PMC 1678459 $2. PMID 8343701. 
  20. ^ Allison JJ, Kiefe CI, Weissman NW, Carter J, Centor RM (Bahar 1999). "The art and science of searching MEDLINE to answer clinical questions. Finding the right number of articles". International Journal of Technology Assessment in Health Care. 15 (2): 281-96. doi:10.1017/S0266462399015214. PMID 10507188. 19 Şubat 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  21. ^ a b Campos-Asensio C (2018). "Cómo elaborar una estrategia de búsqueda bibliográfica". Enfermería Intensiva (İspanyolca). 29 (4): 182-186. doi:10.1016/j.enfi.2018.09.001. PMID 30291015. 
  22. ^ Clinical Queries Filter Terms explained. NCBI. 2010. 29 Kasım 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  23. ^ Huser V, Cimino JJ (June 2013). "Evaluating adherence to the International Committee of Medical Journal Editors' policy of mandatory, timely clinical trial registration". Journal of the American Medical Informatics Association. 20 (e1): e169-74. doi:10.1136/amiajnl-2012-001501. PMC 3715364 $2. PMID 23396544. 
  24. ^ "Computation of Related Articles explained". NCBI. 18 Aralık 2008 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  25. ^ Chang AA, Heskett KM, Davidson TM (February 2006). "Searching the literature using medical subject headings versus text word with PubMed". The Laryngoscope. 116 (2): 336-40. doi:10.1097/01.mlg.0000195371.72887.a2. PMID 16467730. 2 Nisan 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  26. ^ a b Fatehi F, Gray LC, Wootton R (March 2014). "How to improve your PubMed/MEDLINE searches: 3. advanced searching, MeSH and My NCBI". Journal of Telemedicine and Telecare. 20 (2): 102-12. doi:10.1177/1357633X13519036. PMID 24614997. 
  27. ^ "My NCBI Help". My NCBI explained. NCBI. 13 Aralık 2010. 26 Temmuz 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  28. ^ "PubMed Cubby". Technical Bulletin. United States National Library of Medicine. 2000. 20 Şubat 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  29. ^ "LinkOut Overview". NCBI. 2010. 10 Eylül 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  30. ^ "LinkOut Participants 2011". NCBI. 2011. 14 Ekim 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  31. ^ "An Updated PubMed is on its Way". 16 Mayıs 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  32. ^ PubMed Commons Team (17 Aralık 2015). "Commenting on PubMed: A Successful Pilot". 25 Ekim 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 29 Temmuz 2016. 
  33. ^ "PubMed Commons to be Discontinued". NCBI Insights (İngilizce). 1 Şubat 2018. 28 Ağustos 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 2 Şubat 2018. 
  34. ^ "PubMed shuts down its comments feature, PubMed Commons". Retraction Watch. 2 Şubat 2018. 28 Haziran 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 2 Şubat 2018. 
  35. ^ "askMedline". NCBI. 2005. 17 Temmuz 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  36. ^ "Search Field Descriptions and Tags". National Center for Biotechnology Information. 11 Temmuz 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Temmuz 2013. 
  37. ^ Keener, Molly. "PMID vs. PMCID: What's the difference?" (PDF). University of Chicago. 6 Temmuz 2014 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 19 Ocak 2014. 
  38. ^ "Leasing journal citations from PubMed/Medline". NLM. 2011. 9 Temmuz 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  39. ^ a b c Lu Z (2011). "PubMed and beyond: a survey of web tools for searching biomedical literature". Database. 2011: baq036. doi:10.1093/database/baq036. PMC 3025693 $2. PMID 21245076. 
  40. ^ Fontaine JF, Barbosa-Silva A, Schaefer M, Huska MR, Muro EM, Andrade-Navarro MA (July 2009). "MedlineRanker: flexible ranking of biomedical literature". Nucleic Acids Research. 37 (Web Server issue): W141-6. doi:10.1093/nar/gkp353. PMC 2703945 $2. PMID 19429696. 
  41. ^ States DJ, Ade AS, Wright ZC, Bookvich AV, Athey BD (April 2009). "MiSearch adaptive pubMed search tool". Bioinformatics. 25 (7): 974-6. doi:10.1093/bioinformatics/btn033. PMC 2660869 $2. PMID 18326507. 
  42. ^ Smalheiser NR, Zhou W, Torvik VI (February 2008). "Anne O'Tate: A tool to support user-driven summarization, drill-down and browsing of PubMed search results". Journal of Biomedical Discovery and Collaboration. 3: 2. doi:10.1186/1747-5333-3-2. PMC 2276193 $2. PMID 18279519. 
  43. ^ "ClusterMed". Vivisimo Clustering Engine. 2011. 11 Ağustos 2011 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 3 Temmuz 2011. 
  44. ^ Rebholz-Schuhmann D, Kirsch H, Arregui M, Gaudan S, Riethoven M, Stoehr P (January 2007). "EBIMed--text crunching to gather facts for proteins from Medline". Bioinformatics. 23 (2): e237-44. doi:10.1093/bioinformatics/btl302. PMID 17237098. 
  45. ^ Kim JJ, Pezik P, Rebholz-Schuhmann D (June 2008). "MedEvi: retrieving textual evidence of relations between biomedical concepts from Medline". Bioinformatics. 24 (11): 1410-2. doi:10.1093/bioinformatics/btn117. PMC 2387223 $2. PMID 18400773. 
  46. ^ Fontelo P, Liu F, Ackerman M, Schardt CM, Keitz SA (2006). "askMEDLINE: a report on a year-long experience". AMIA ... Annual Symposium Proceedings. AMIA Symposium. 2006: 923. PMC 1839379 $2. PMID 17238542. 
  47. ^ Fontelo P, Liu F, Ackerman M (2005). "MeSH Speller + askMEDLINE: auto-completes MeSH terms then searches MEDLINE/PubMed via free-text, natural language queries". AMIA ... Annual Symposium Proceedings. AMIA Symposium. 2005: 957. PMC 1513542 $2. PMID 16779244. 
  48. ^ Fontelo P, Liu F, Leon S, Anne A, Ackerman M (2007). "PICO Linguist and BabelMeSH: development and partial evaluation of evidence-based multilanguage search tools for MEDLINE/PubMed". Studies in Health Technology and Informatics. 129 (Pt 1): 817-21. PMID 17911830. 18 Ekim 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  49. ^ Hokamp K, Wolfe KH (July 2004). "PubCrawler: keeping up comfortably with PubMed and GenBank". Nucleic Acids Research. 32 (Web Server issue): W16-9. doi:10.1093/nar/gkh453. PMC 441591 $2. PMID 15215341. 
  50. ^ Eric Sayers, PhD (24 Ekim 2018). The E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More. NCBI. 23 Haziran 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Ekim 2023. 
  51. ^ GitHub'da PubMed

Dış bağlantılar

Vikiveri özelliği:

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">National Center for Biotechnology Information</span> ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi veritabanı kolu

National Center for Biotechnology Information (NCBI) United States National Library of Medicine (NLM) ve National Institutes of Health'ın bir bölümü. NCBI 1988 yılında Bethesda'da kurulumuştur.

MedlinePlus, Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Tıp Kütüphanesi tarafından üretilen çevrimiçi bir bilgi hizmetidir. Hizmet, İngilizce ve İspanyolca dillerinde seçilmiş tüketici sağlık bilgileri ve ek dillerde belirli içerik sağlar. Site, Ulusal Tıp Kütüphanesi (NLM), Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH), diğer ABD devlet kurumları ve sağlıkla ilgili kuruluşlardan gelen bilgileri bir araya getirmektedir. Ayrıca mobil cihazlarda görüntülenmek üzere optimize edilmiş, İngilizce ve İspanyolca dillerinde bir site de bulunmaktadır. 2015 yılında dünyanın dört bir yanından yaklaşık 400 milyon kişi MedlinePlus'ı kullanmıştır. Hizmet NLM tarafından finanse edilmektedir ve kullanıcılar için ücretsizdir.

<span class="mw-page-title-main">Medical Subject Headings</span>

Medical Subject Headings veya MeSH, İngilizce tıbbi ve biyolojik makalelerin indekslenmesi için kullanılan bir kontrollu vokabülerdir. ABD Millî Sağlık Kütüphanesi National Library of Medicine (NLM) tarafından yaratılmıştır ve başlıca MEDLINE/PubMed makale veritabanı ve NLM'in kitaplarının sınıflandırılması için kullanılır. MeSH internet üzerinden incelenebilir veya indirilebilir.

MEDLINE, 1950 yılına kadar uzanan gazete ve dergi makalelerine yapılmış atıflara ait bir bibliyografik veri tabanıdır. Veritabanı, klinik tıp ve biyomedikal araştırmalarına ait 4,600’den fazla uluslararası yayını içermekte olup, aynı zamanda diş hekimliği, hemşirelik, kimya, farmakoloji, biyoloji, fizik, beslenme, sağlık teslimat, psikiyatri, psikoloji, çevre sağlığı, sosyal bilimler ve eğitim konularını da kapsar. Medline veritabanı, kayıtlardan oluşan koleksiyonu tarama özelliğine sahip olmanın yanı sıra, 13 milyon’dan daha fazla atıfı içerdiği için de etkili bir biçimde tarama yapmak önemlidir.

<span class="mw-page-title-main">PubMed Central</span> serbestçe erişilebilen biyomedikal dergi makaleleri deposu

PubMed Central (PMC), biyomedikal ve yaşam bilimleri dergilerinde yayınlanan açık erişimli tam metin bilimsel makaleleri arşivleyen ücretsiz bir dijital depodur. Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) tarafından geliştirilen başlıca araştırma veri tabanlarından biri olan PubMed Central, bir belge deposundan daha fazlasıdır. PMC'ye yapılan başvurular, her makale için XML yapılandırılmış verileri zenginleştiren gelişmiş metaveriler, tıbbi ontoloji ve benzersiz tanımlayıcılar için indekslenir ve biçimlendirilir. PMC'deki içerik diğer NCBI veritabanlarına bağlanabilir ve Entrez arama ve erişim sistemleri aracılığıyla erişilebilir, bu da halkın biyomedikal bilgisini keşfetme, okuma ve geliştirme yeteneğini daha da geliştirir.

<span class="mw-page-title-main">Hepatit</span> Karaciğer inflamasyonu

Hepatit, karaciğer hücrelerinde inflamasyon ile karakterize tıbbi durumdur. İsim Yunanca hepar (ἧπαρ); hepat- (ἡπατ-), karaciğer kökünden ve sonek -itis, "inflamasyon" 'dan türemiştir (c. 1727) Karaciğerdeki inflamasyon zamanla kendini sınırlayabilir ya da fibrozis ve siroza ilerleyebilir.

Gen Ontolojisi ya da GO, gen ve gen ürünü vasıflarının bütün türler kapsamında temsilini birleştirmek için büyük bir biyoenformatik girişimidir. Proje özellikle şunları hedeflemektedir:

  1. Gen ve gen ürünü vasıflarına dair sahip olduğu denetli söz dağarcığının sürdürülmesi ve geliştirilmesi;
  2. Gen ve gen ürünlerinin notlaması, not verilerinin özümsenmesi ve dağıtılması;
  3. Projenin sağladığı verinin bütün boyutlarına kolayca erişilmesi için ve deneysel verilerin GO kullanarak işlevsel yorumlanabilmesi için araçlar sağlanması.

Open Medicine, Nisan 2007'de Canadian Medical Association Journal'daki eski editörler tarafından kuruldu. Sorumlu müdür Anita Palepu, yayıncı ise John Willinsky idi. Dergi Kasım 2014'te yayınlanmayı bıraktı, nedenlerinden ise editörlerin sınırlı maddi kaynak olduğunu belirtmesiydi. Dergi, Index Medicus/MEDLINE/PubMed'de yer aldı. Bütün içerik PubMed Central'de arşivlendi.

<i>BMC Cancer</i>

BMC Kanser, kanser ve onkoloji üstüne orijinal araştırmaları yayımlayan hakemli açık erişimli bir tıbbi dergidir. 2001 yılında kurulmuştur ve BioMed Central tarafından yayımlanmaktadır.

Solunum Araştırması, BioMed Central tarafından yayınlanan akran denetimli bir açık erişim dergisidir. klinik ve temel araştırma dahil olmak üzere tüm solunum sistemi hastalıklarını kapsar. Dergi, araştırma makalelleri, eleştiriler ve editöre mektuplar yayınlamaktadır.

Isis, Chicago Press tarafından yayınlanan üç aylık akran denetimli bir akademik dergidir. Bilim tarihi, tıp tarihi ve teknoloji tarihinin yanı sıra kültürel etkilerini de kapsar. Orijinal araştırma makaleleri ve kapsamlı kitap derlemeleri ve derleme yazıları içerir. Ayrıca, belirli bir konuya ayrılmış bölümler açık erişimde her sayıda yayınlanmaktadır. Bu bölümler Odak bölümü, Bakış açısı bölümü ve İkinci Bakış bölümünden oluşur.

The Journal of Nuclear Medicine, Nükleer ve Moleküler Görüntüleme Topluluğu tarafından aylık olarak yayınlanan nükleer tıbbın tüm yönleriyle ilgili araştırmaları kapsayan aylık akran denetimli bir tıbbi dergidir.

<span class="mw-page-title-main">FOXP2</span>

Forkhead box protein P2 (FOXP2), insanlarda, CAGH44, SPCH1 veya TNRC10 olarak da bilinen FOXP2 geni tarafından kodlanan, konuşma ve dilin düzgün gelişimi için gerekli olan bir proteindir. FOXP2 bir transkripsiyon faktörüdür, yani düzenleyici bir proteini kodlar. Gen, genellikle iletişimde bir rol oynadığı birçok omurgalı ile paylaşılır.

Dalton Transactions, inorganik, biyoinorganik ve organometalik bileşiklerin kimyasının tüm yönleri hakkında orijinal (birincil) araştırma ve inceleme makaleleri yayınlayan, hakemli bir bilimsel dergidir. Royal Society of Chemistry tarafından haftalık olarak yayınlanmaktadır. Dergi, modern atom teorisi üzerine yaptığı çalışmalarla tanınan İngiliz kimyager John Dalton'un adını aldı. Yazarlar, makaleleri açık erişim olarak yayınlamayı seçebilirler. Editör Andrew Shore'dur. Dalton Transactions, 2006 yılında Thomson Scientific'ten In-cites tarafından "yükselen yıldız" olarak adlandırıldı.

Soft Matter, yumuşak madde bilimini kapsayan hakemli bilimsel bir dergidir. Royal Society of Chemistry tarafından yayınlanmakıadır ve baş editörlüğünü Darrin Pochan üstlenmektedir.

<span class="mw-page-title-main">Diyabetik nefropati</span>

Diyabetik böbrek hastalığı olarak da bilinen diyabetik nefropati, diabetes mellituslu kişilerde meydana gelen kronik böbrek fonksiyonu kaybıdır. Diyabetik nefropati, küresel olarak kronik böbrek hastalığının (KBH) ve son evre böbrek hastalığının önde gelen nedenleridir. İdrara sızan protein üçlüsü, hipertansiyonla birlikte kan basıncının yükselmesi ve ardından böbrek fonksiyonlarının düşmesi, birçok KBH formunda ortak olarak görülür. Glomerüllerin hasar görmesi nedeniyle idrardaki protein kaybı büyük olabilir ve nefrotik sendrom olarak adlandırılan genel vücut şişmesi (ödem) ile sonuçlanan düşük serum albüminine neden olabilir. Diyabetik nefropati genellikle yıllar içinde yavaş ilerler.

<span class="mw-page-title-main">ACER3</span>

Alkalin seramidaz 3, insanların 11. kromozomunda yer alan ACER3 geni tarafından kodlanan bir seramidaz enzimidir.

<i>The BMJ</i> hakemli tıp dergisi

The BMJ, tamamı Britanya Tabipler Birliğine (BMA) ait olan BMJ Group tarafından yayımlanan haftalık hakemli bir tıp dergisidir. The BMJ, BMA'dan editoryal özgürlüğe sahiptir. Dünyanın en eski genel tıp dergilerinden biridir. Önceleri British Medical Journal olarak adlandırılan derginin adı 1988 yılında resmi olarak BMJ olarak kısaltılmış, 2014 yılında ise The BMJ olarak değiştirilmiştir. Dergi, Brtianya Tabipler Birliğinin (BMA) bir alt kuruluşu olan BMJ Publishing Group Ltd tarafından yayımlanmaktadır. The BMJ'nin şu anki baş editörü, Ocak 2022'de atanan Kamran Abbasi'dir.

Bu makale, akademik bir ortamda akademik dergi, kurumsal depolar, arşivler veya diğer bilimsel ve diğer makale koleksiyonlarındaki makaleleri bulmak ve bunlara erişmek için yararlı olan önemli veri tabanlarının ve arama motorlarının temsili bir listesini içerir. Veri tabanları ve arama motorları, kapsam ve erişim nitelikleri açısından önemli ölçüde farklılık gösterir. Kullanıcıların, özellikle sistematik incelemeler veya meta-analizlerde olduğu gibi sistematik olarak kayıt arayanlar olmak üzere, veri tabanlarının ve arama motorlarının niteliklerini ve sınırlamalarını dikkate almaları gerekir. Bu karmaşık belge erişim sistemleri için veri tabanı ve arama motoru arasındaki ayrım belirsiz olduğundan, ayrıca aşağıdaki makalelere bakılabilir:

<span class="mw-page-title-main">Biyolojik veritabanı</span> biyolojik bilgi veritabanı

Biyolojik veritabanları, bilimsel deneylerden, yayınlanmış literatürden, yüksek verimli deney teknolojisinden ve hesaplamalı analizlerden toplanan biyolojik bilimler kütüphaneleridir. Genomik, proteomik, metabolomik, mikroarray gen ifadesi ve filogenetik gibi araştırma alanlarından bilgiler içerirler. Biyolojik veritabanlarında yer alan bilgiler arasında gen fonksiyonu, yapısı, lokalizasyonu, mutasyonların klinik etkilerinin yanı sıra biyolojik dizilerin ve yapıların benzerlikleri yer almaktadır.


Bu sayfa, bu Vikipedi makalesine dayanmaktadır.
Metin, CC BY-SA 4.0 lisansı altında mevcuttur; ek koşullar uygulanabilir.
Görseller, videolar ve sesler kendi lisansları altında mevcuttur.