
Hylidae, Anura takımına bağlı bir hayvan familyasıdır.

Rosaceae (gülgiller), Rosales takımına bağlı bir bitki familyasıdır.

Vasabi , Turpgiller familyasına üye bir bitkidir. Japon turpu olarak da isimlendirilmesine karşın, bu familyanın turp türüne ait değildir. Kökü, içerdiği yoğun ve kuvvetli tat ve acı yüzünden yemeklerde çeşni olarak kullanılır. Acılığı, acı biberlerdeki kapsaisinin dilde neden olduğu acıdan daha çok, hardalın burun ve solunum yollarında yarattığı acı hissine yakındır. Japonya'daki vadi nehir yataklarında doğal olarak yetişir. Wasabi Japonica'dan başka, Wasabi Koreana ve Wasabi Tetsuigi türleri de vardır. Yiyecek piyasasında genellikle iki kültivarı, Wasabi Japonica 'Drauma' ve 'Mazuma' bulunur; ancak tüm çeşitliliği bu ikisiyle sınırlı değildir.

Malta eriği diğer adıyla Yenidünya veya Eriobotrya japonica, Eriobotrya cinsine bağlı Çin'e özgü bir bitki türüdür. Japonya'da biwa olarak bilinir ve 1000 yıldan fazla bir süredir yetiştirilir. Subtropikal bölgelerden yumuşak iklimli bölgeler boyunca yayılım ve dağılım gösterir.

Lonicera (Hanımeli), Caprifoliaceae familyasına ait, çalı ve/veya sarmaşık grubundan bir bitkidir. Yaklaşık 180 türü vardır, bunun 100 kadarı Çin'dedir. Avrupa ve Kuzey Amerika'da 20şer türü vardır. En çok bilinen türleri Lonicera periclymenum, Lonicera japonica ve Lonicera sempervirens dir.

Bıldırcın, sülüngiller (Phasianidae) familyasının Coturnix, Anurophasis, Perdicula, Ophrysia cinsinden küçük yapılı kuş türlerinin ortak adıdır. Yeni dünya bıldırcınları ve üç parmaklı bıldırcınlar ise yakın olarak ilgili olmamalarına karşın görünüm ve davranış benzerlikleri sebebi ile bu şekilde adlandırılmışlardır.

Kuzey Pasifik gerçek balinası (Eubalaena japonica), Büyük Okyanus'un kuzeyinde yaşayan çok büyük bir balina türüdür.

Katsura ağacı, Cercidiphyllaceae familyasından bir bitki türüdür.

Torilis japonica, Apiaceae familyasından orta ila uzun boylu, yıllık veya iki yıllık bir bitki türüdür.

Saccharina japonica Saccharina cinsine bağlı bir algae türüdür.

Dicyema japonicum, Dicyema cinsine bağlı bir hayvan türüdür.
Meta japonica, Meta cinsine bağlı bir örümcek türüdür.
Micaria japonica, Micaria cinsine bağlı bir örümcek türüdür.

Ribes japonicum, Ribes cinsine bağlı bir bitki türüdür.
Lasioglossum japonicum, Lasioglossum cinsine bağlı bir hayvan türüdür.

Phyllonorycter, Gracillariidae familyasına bağlı bir hayvan cinsidir.
Andrena japonica, Andrena cinsine bağlı bir hayvan türüdür.

Spiraea japonica, Spiraea cinsine bağlı bir bitki türüdür.
Achillea japonica, Achillea cinsine bağlı bir bitki türüdür.
Berberis japonica, Berberis cinsine bağlı bir bitki türüdür.