
Sapporo, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğünün merkezi ve bölgenin en büyük şehridir.

Saitama, Japonya'nın Saitama prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir 1 Mayıs 2001 tarihinde Urawa, Omiya ve Yono şehirlerinin birleşmesiyle kurulmuş olup 1 Nisan 2003 tarihinde belirlenmiş şehir statüsü almıştır. 2005'te de Iwatsuki şehri Saitama ile birleşti. Şehir Büyük Tokyo Metropolü'nün bir parçası olup birçok sakini Tokyo'ya iş için gidip gelmektedir. Yüzölçümü 217.43 km2 olan şehrin nüfusu 1 Şubat 2016 tarihi itibarı ile 1.266.656'dır.

Kobe, Japonya'nın Hyōgo prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir Kansai bölgesinde, Osaka Körfezi'nin kuzeyinde Osaka'nın 30 km batısında yer almaktadır. 1868 yılı itibarıyla ticari anlamda batıya açılan ilk Japon şehirlerden biridir. Kobe yaklaşık 1,5 milyon nüfusu ile Japonya'nın altıncı büyük şehri olup Osaka ve Kyoto ile birlikte Keihanshin metropol alanını oluşturmaktadır. Bu kozmopolit liman kenti, 100'den fazla ülkeden gelen yaklaşık 45.000 yabancı kişiye ev sahipliği yapmaktadır.

Okayama, Japonya'nın Okayama prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 789.92 km² olan şehrin nüfusu Ekim 2014 tarihi itibarı ile 714,583'tür.

Nara, Japonya'nın Nara prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir, prefektörlüğün kuzeyinde yer almaktadır. Yüzölçümü 276,84 km² olan şehrin nüfusu 1 Ocak 2010 itibarı ile 368.636'dır. Şehirdeki sekiz tapınak, mabet ve kalıntı olan Tōdai-ji, Saidai-ji, Kōfuku-ji, Kasuga-taisha, Gangō-ji, Yakushi-ji, Tōshōdai-ji ve Heijō Sarayı, Kasugayama Ormanı ile birlikte UNESCO Dünya Mirası olan "Antik Nara'nın Tarihi Anıtları"'nı oluşturmaktadır.

Niigata Japonya'nın Niigata prefektörlüğünin merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 726,09 km² olan şehrin nüfusu 31 Ocak 2012 tarihi itibarı ile nüfusu 804.193'tür.

Kumamoto, Japonya'nın Kumamoto prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 389.53 km² olan şehrin nüfusu 1 Mart 2010 tarihi itibarı ile 731,286'dır. Kumamoto 1 Nisan 1889 yılında kurulmuş olup 1 Nisan 2012 yılında belirlenmiş şehir statüsü almıştır.

Utsunomiya, Japonya'nın Tochigi prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 416,85 km² olan şehrin nüfusu Şubat 2016 tarihi itibarı ile 519.461'dir.

Toyama, Japonya'nın Toyama prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 1.241,85 km² olan şehrin nüfusu 31 Mayıs 2011 tarihi itibarı ile 417.324'tür.

Asahikawa, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Kamikawa alt prefektörlüğünün merkezi ve Hokkaidō'nun ikinci büyük şehridir. Yüzölçümü 747.6 km² olan şehrin nüfusu 30 Temmuz 2011 tarihi itibarı ile 352.105'tir.

Nagano, Japonya'nın Nagano prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir, prefektörlüğün kuzeyinde Chikuma ve Sai nehirlerinin birleştiği noktada yer almaktadır. Yüzölçümü 834,85 km² olan şehrin nüfusu 1 Nisan 2011 itibarı ile 387.146'dır.

Mito, Japonya'nın Ibaraki prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 217,32 km² olan şehrin nüfusu Eylül 2015 tarihi itibarıyla 270.953'tür.

Yamagata, Japonya'nın Yamagata prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 381,34 km² olan şehrin nüfusu Kasım 2013 itibarı ile 254.146'dır.

Miyazaki, Japonya'nın Miyazaki prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir 1 Nisan 1924 tarihinde kurulmuştur. Yüzölçümü 286,96 km² olan şehrin nüfusu Kasım 2010 itibarı ile 399.834'tür.

Kushiro, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Kushiro alt prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Yüzölçümü 1362,75 km² olan şehrin nüfusu 31 Ağustos 2011 itibarı ile 183.757'dir. Kushiro, Doğu Hokkaido'nun en büyük şehridir.

Akita, Japonya'nın Akita prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Yüzölçümü 905,67 km² olan şehrin nüfusu 1 Ekim 2015 tarihi itibarı ile 316.808'dir.

Kagoshima, Japonya'nın Kagoşima prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Yüzölçümü 547,05 km² olan şehrin nüfusu 1 Ocak 2010 itibarı ile 605.855'tir. Şehir resmî olarak 1 Nisan 1889 yılında kurulmuştur.

Kitami, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Ohotsk alt prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Yüzölçümü 1,427.56 km² olan şehrin nüfusu 1 Mart 2012 itibarı ile 124,789'dur.

Muroran, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Iburi alt prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Yüzölçümü 80.65 km² olan şehrin nüfusu 29 Şubat 2012 tarihi itibarı ile 93,716'dır.

Tokachi alt prefektörlüğü, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı bir alt prefektörlüktür. Yüzölçümü 10,831.24 km² olan alt prefektörlüğün nüfusu Mart 2009 tarihi itibarı ile 354,147'dir. Merkezi Obihiro şehridir.