
Shiretoko Millî Parkı, Japonya'nın Hokkaidō Adası'nın kuzeydoğu ucundaki Shiretoko Yarımadası'nda bulunan bir millî parktır. Shiroteko, Aynu dilinde "yerin çıktığı yer" anlamına gelen "sir etok" sözcüğünden türemiştir.

Japonya'daki millî parklar listesi, Japonya'da bulunan millî parkları içerir.

Fuji-Hakone-Izu Millî Parkı, Japonya'nın Yamanashi, Shizuoka ve Kanagawa prefektörlükleri ile Tokyo metropolünün batısında bulunan bir millî parktır. Park, Fuji Dağı, Beş Fuji Gölü, Hakone, Izu Yarımadası ve Izu Adaları'ndan oluşmaktadır. Fuji-Hakone-Izu Millî Parkı, 1,227 km²'lik bir alanı kapsamaktadır. Tokyo'ya olan yakınlığı ve ulaşım kolaylığı nedeniyle Japonya'nın en çok ziyaret edilen milli parkıdır.

Oze Millî Parkı, Japonya'nın Fukuşima, Tochigi, Gunma ve Niigata prefektörlüklerinde bulunan bir millî parktır. Park, 372 km²'lik bir alanı kapsamaktadır ve ülkenin 29. millî parkıdır.

Daisetsuzan Millî Parkı, Japonya'nın Hokkaidō Adası'nın kuzeyinde bulunan bir millî parktır. Park, Kamikawa ve Tokachi alt prefektörlüklerinde yer almakta olup Japonya'nın en büyük millî parkıdır. Daisetsuzan Millî Parkı, 2,267.64 km²'lik bir alanı kapsamaktadır ve yaklaşık olarak Kanagawa prefektörlüğü ile aynı büyüklüktedir. Daisetsuzan Millî Parkı, 4 Aralık 1934 tarihinde kuruldu.

Nara Ulusal Müzesi, Japonya'nın Nara kentinde bulunan bir sanat müzesidir. Müze, 1889 yılında Meiji döneminde İmparatorluk Nara Müzesi adıyla inşa edilmiş olup 1952'de günümüz adını almıştır ve Nara Parkı'nda yer almaktadır.

Towada-Hachimantai Millî Parkı, Japonya'nın Tōhoku bölgesinin kuzeyinde bulunan bir millî parktır. 1 Şubat 1936 tarihinde kurulmuş olup 854 km²'lik alana sahiptir ve Akita, Aomori ve Iwate prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Rishiri-Rebun-Sarobetsu Millî Parkı, Japonya'nın Hokkaidō bölgesinin kuzeyinde bulunan bir millî parktır. 30 Eylül 1974 tarihinde kurulmuş olup 212,22 km²'lik alana sahiptir ve Rishiri ve Rebun adaları ile Wakkanai ve Horonobe kıyılarını kapsamaktadır.

Shikotsu-Tōya Millî Parkı, Japonya'nın Hokkaidō bölgesinin batısında bulunan bir millî parktır. 16 Mayıs 1949 tarihinde kurulmuş olup 993,02 km²'lik alana sahiptir.

Kushiro-shitsugen Millî Parkı (Japonca: , Japonya'nın Hokkaidō bölgesinin doğusunda bulunan bir millî parktır. 31 Temmuz 1987 tarihinde kurulmuş olup 268,61 km²'lik alana sahiptir.

Bandai-Asahi Millî Parkı, Japonya'nın Tōhoku bölgesinin ortasında bulunan bir millî parktır. 5 Eylül 1950 tarihinde kurulmuş olup 1.870,41 km²'lik alanı ile Japonya'nın üçüncü büyük millî parkıdır ve Fukuşima, Niigata, Yamagata prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.
Güney Japon Alpleri Millî Parkı, Japonya'nın Chūbu bölgesinin ortasında bulunan bir millî parktır. 1 Haziran 1964 tarihinde kurulmuş olup 357,52 km²'lik alana sahiptir ve Nagano, Şizuoka ve Yamanashi prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Chūbu-Sangaku Millî Parkı, Japonya'nın Chūbu bölgesinin ortasında bulunan bir millî parktır. 4 Aralık 1934 tarihinde kurulmuş olup 1.743,23 km²'lik alana sahiptir ve Gifu, Nagano, Niigata ve Toyama prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Ise-Shima Millî Parkı, Japonya'nın Mie prefektörlüğünde bulunan bir millî parktır. 20 Kasım 1946 tarihinde kurulmuş olup 555,49 km²'lik alana sahiptir.

Setonaikai Millî Parkı, Japonya'nın Seto İç Denizi çevresinde bulunan bir millî parktır. 16 Mart 1934 tarihinde kurulmuş olup 669,34 km²'lik alana sahiptir.

Ashizuri-Uwakai Millî Parkı, Japonya'nın Shikoku bölgesinde bulunan bir millî parktır. 10 Kasım 1972 tarihinde kurulmuş olup 111,66 km²'lik alana sahiptir ve Ehime ve Kōchi prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Iriomote-Ishigaki Millî Parkı, Japonya'nın Okinawa prefektörlüğünde bulunan bir millî parktır. 15 Mayıs 1972 tarihinde kurulmuş olup 205,69 km²'lik alana sahiptir ve Doğu Çin Denizi'ndeki Yaeyama Adaları içerisinde yer almaktadır.

Amami Guntō Millî Parkı, Japonya'nın Kagoshima prefektörlüğünde bulunan bir millî parktır. 7 Mart 2017 tarihinde kurulmuş olup 752,63 km²'lik alana sahiptir ve Amami Adaları içerisinde yer almaktadır.

Aso-Kujū Millî Parkı, Japonya'nın Kyūshū bölgesinde bulunan bir millî parktır. 4 Aralık 1934 tarihinde kurulmuş olup 726,78 km²'lik alana sahiptir ve Kumamoto ve Ōita prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Yakushima Millî Parkı, Japonya'nın Kagoshima prefektörlüğünde bulunan bir millî parktır. 16 Mart 2012 tarihinde Kirishima-Yaku Millî Parkı'nın ikiye ayrılması sonucu kurulmuş olup 325,53 km²'lik alana sahiptir ve Yakushima ve Ōsumi Adaları'nın bir kısmında yer almaktadır.