İçeriğe atla

Nick Patterson

Nick Patterson
DoğumNicholas James Patterson
09 Haziran 1947(1947-06-09)
EğitimUniversity of Cambridge
Kariyeri
DalıGenetik
Çalıştığı kurumlarBroad Institute
Doktora
danışmanı
John G. Thompson

Nicholas James Patterson (9 Haziran 1947 doğumlu)[1] Broad Institute'da kadrolu bilim insanı olarak çalışan ve hesaplamalı genomik alanına önemli katkıları olan bir matematikçidir.[2][3] Çalışmaları Nature, Science ve Nature Genetics gibi bilimsel dergilerde yayımlandı.[4][5] Araştırmaları, erken dönem insan göçlerinin daha iyi anlaşılmasını sağladı.[6][7] Kendisi, 2010 yılında Neandertal genomunun dizilimini çıkaran bilim insanları arasında yer almaktadır.[8] Bu çalışmayı, 2014 yılında Altay Dağları'nda bulunan, çok daha yüksek kalitede bir Neandertal genomunun dizilenmesi takip etmiştir.[9] Bu çalışmalar, arkaik ve modern insanlar arasındaki melezleşmeye ilişkin bazı beklenmedik gerçekleri ortaya çıkartmıştır.

Biyografi

Patterson, Londra'nın merkezindeki Bayswater bölgesinde tek çocuklu bir ailede yetişti.[10] Lisans ve doktora derecelerini matematik alanında Cambridge Üniversitesi'nden aldı.[3] Doktora danışmanı John G. Thompson'du.[11] Başlangıçta İngiliz kod kırma kurumu GCHQ ve Princeton'daki İletişim Araştırmaları Merkezi için çalıştı.[12]

Bu kriptoloji odaklı dönemin ardından finans şirketi Renaissance Technologies'de çalıştı.[13]

2001 yılında Patterson, Whitehead Enstitüsü MIT'deki Genom Araştırma Merkezi'ne katıldı. İnsan genetiği çalışmalarına geçmeden önce kansere uygulanan gen ekspresyonu verileri üzerinde kısaca çalıştı.[3]

2012 yılında Patterson, şu anda popülasyon genetikçileri tarafından yaygın olarak kullanılan, C ile yazılmış bir yazılım paketi olan ADMIXTOOLS'u geliştirdi.[14]

Satranç

Nick Patterson aynı zamanda bir genç satranç dehası kabul edilmektedir.[2] 1969'da İrlanda Satranç Şampiyonasını kazandı. 1970 yılında Siegen Satranç Olimpiyatları'nda İrlanda adına üst sıralarda oynadığı uzun bir maçta, o zamanlar dünyanın en iyi 10 oyuncusundan biri olan Danimarkalı büyükusta Bent Larsen ile oynadı ve 93 hamleden sonra berabere kalmayı başardı.[1]

Kaynakça

  1. ^ a b "Nicholas J Patterson". chessgames.com. 26 Aralık 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Ocak 2024. 
  2. ^ a b Chen, Ingfei (12 Aralık 2006). "Nick Patterson: A Cold War Cryptologist Takes a Crack at Deciphering DNA's Deep Secrets". The New York Times. 7 Ocak 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Ocak 2024. 
  3. ^ a b c "Nick Patterson". Broad Institute. April 2012. 7 Ocak 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Ocak 2024. 
  4. ^ "Nick Patterson". scholar.google.com. 7 Ocak 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Ocak 2024. 
  5. ^ "Nick Patterson". ScienceMag.org. 7 Ocak 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 6 Temmuz 2020. 
  6. ^ Skoglund, Pontus; Thompson, Jessica C.; Prendergast, Mary E.; Mittnik, Alissa; Sirak, Kendra; Hajdinjak, Mateja; Salie, Tasneem; Rohland, Nadin; Mallick, Swapan; Peltzer, Alexander; Heinze (2017). "Reconstructing Prehistoric African Population Structure". Cell. 171 (1): 59-71.e21. doi:10.1016/j.cell.2017.08.049. PMC 5679310 $2. PMID 28938123. 28 Temmuz 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Ocak 2024. 
  7. ^ Sankararaman, S.; Patterson, N.; Li, H.; Pääbo, S.; Reich, D; Akey, J.M. (2012). "The Date of Interbreeding between Neandertals and Modern Humans". PLOS Genetics. 8 (10): e1002947. arXiv:1208.2238 $2. doi:10.1371/journal.pgen.1002947. PMC 3464203 $2. PMID 23055938. 
  8. ^ "Draft full sequence of Neanderthal Genome". Science. 328 (5979): 710-22. 7 Mayıs 2010. doi:10.1126/science.1188021. PMC 5100745 $2. PMID 20448178. 
  9. ^ Prüfer, K.; Racimo, F.; Patterson, N.; Jay, F.; Sankararaman, S.; Sawyer, S.; ve diğerleri. (2014) [Online 2013]. "The complete genome sequence of a Neanderthal from the Altai Mountains". Nature. 505 (7481): 43-49. doi:10.1038/nature12886. PMC 4031459 $2. PMID 24352235. 
  10. ^ Chapter 8; The Man Who Solved the Market by Gregory Zuckerman
  11. ^ "Nicholas Patterson - the Mathematics Genealogy Project". 16 Ekim 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Ocak 2024. 
  12. ^ "The Man Who Breaks Codes". Radcliffe Magazine. 30 Ocak 2017. 1 Temmuz 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  13. ^ Mayer, Jane (19 Mart 2017). "The Reclusive Hedge-Fund Tycoon Behind the Trump Presidency". The New Yorker. 30 Mayıs 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Ocak 2024. 
  14. ^ "Ancient admixture in human history". Genetics. 192 (3): 1065-93. November 2012. doi:10.1534/genetics.112.145037. PMC 3522152 $2. PMID 22960212. 

Dış bağlantılar

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">Neandertal</span> Avrasyada yaşamış ve soyu tükenmiş insan türü veya alt türü

Neandertal ya da Neandertal insanı, günümüzden yaklaşık 250 bin ila 40 bin yıl önce yaşamış insan türüdür. İkili adlandırmada ismi "Homo neanderthalensis"dir. Fosilleri muhafaza etmeye müsait kireç taşı mağaralarda yaşadıkları için haklarında en fazla bilgi sahibi olunan ve bunun bir sonucu olarak modern kültürde tipik "mağara adamı" kalıbını yaratan tarih öncesi insan türüdür.

<span class="mw-page-title-main">DNA dizileme</span> moleküler biyolojide bir teknik

DNA dizilemesi, bir DNA molekülündeki nükleotit bazlarının sırasının belirlenmesidir.

<span class="mw-page-title-main">Svante Pääbo</span> İsveçli genetikçi ve bilim insanı

Svante Pääbo, İsveçli biyolog, genetikçi ve bilim insanı. Evrimsel antropoloji alanında uzmanlaşan Pääbo, paleogenetiğin kurucularından birisidir ve Neandertal genomu üzerinde yoğun bir şekilde çalışmıştır. 2022'de "soyu tükenmiş homininlerin genomları ve insan evrimi ile ilgili keşifleri" nedeniyle Nobel Tıp Ödülü'ne layık görüldü.

<span class="mw-page-title-main">Eutheria</span> memeli kladı

Eutheria, keselilere göre etenelilerle daha yakından ilişkili olan tüm doğurgan memelileri (Theria) kapsayan bir kladdır.

<span class="mw-page-title-main">İnsan genomu</span>

İnsan genomu Homo sapiens'in genomudur. 23 kromozom çifti üzerinde bulunur, bunlardan 22 çifti otozomal kromozomdur, kalan çift ise cinsiyeti belirler. Haploit insan genomu toplam 3 milyar DNA baz çiftinden biraz fazla uzunluktadır. İnsan Genom Projesi ile elde edilen ökromatik insan genom referans dizisi biyomedikal bilimlerde kullanılmaktadır.

<span class="mw-page-title-main">Frederick Sanger</span>

Frederick Sanger, İngiliz biyokimyager. 1958 ve 1980 yıllarında 2 kez Nobel Kimya Ödülü kazanmıştır. 1958 yılında "proteinlerin, özellikle de insülinin yapısı üzerine çalışmaları için" Nobel Kimya Ödülü kazanmıştır ve bu ödülü aynı kategoride 2 kez kazanan tek kişidir. 1980 yılında da "nükleik asitlerdeki baz dizilerinin belirlenmesiyle ilgili katkıları nedeniyle" Walter Gilbert ile birlikte bu ödülü kazanmıştır. Aynı yıl ayrıca Paul Berg, "nükleik asitlerin, özellikle de rekombinant DNA'nın biyokimyası üzerine temel çalışmaları için" ödülü kazanan diğer isim olmuştur.

<span class="mw-page-title-main">Kleine Feldhofer Mağarası</span>

Kleine Feldhofer Grotte, batı Almanya'daki Neandertal Vadisi'nde yer alan bir karstik kireç taşı mağarası ve paleoantropolojik bir sitedir. Ağustos 1856'da Neanderthal tipi örnek mağaradan çıkarıldı. Madenciler bir kafatası ve bir dizi kemiği Neanderthal etiketli olarak ortaya çıkardı. Kemikler en az üç farklı kişiye aitti.

<span class="mw-page-title-main">Denisova Mağarası</span>

Denisova Mağarası, Rusya, Sibirya'daki Altay Dağları'nda bulunan bir mağaradır. Mağara büyük paleoarkeolojik ve paleontolojik öneme sahiptir. Denisova insanının kemik parçaları ve yaklaşık GÖ 40.000'e tarihlenen kalıntılar mağarada bulunmuştur. Mağarada 32.000 yıllık bir tarih öncesi at türü de keşfedilmiştir.

Bencil genetik unsurlar, organizmanın uygunluğu üzerinde olumlu veya bir olumsuz etki olmasa bile, genomdaki diğer genler pahasına kendi aktarımlarını artırabilen genetik bölümlerdir. Genomlar, geleneksel olarak, organizmanın ortama uygunluğunu iyileştirmek için birlikte hareket eden, birbirine bağlı birimler olarak görülmüştür. Bununla birlikte, genler kendi aktarımları üzerinde bir miktar kontrole sahip olduğunda, kurallar değişebilir ve bu nedenle, tüm sosyal gruplar gibi, genomlar da kendi bölümleri tarafından bencil davranışlara karşı zayıftır.

<span class="mw-page-title-main">Genom düzenleme</span>

Genom düzenleme veya genom mühendisliği veya gen düzenleme, DNA'nın canlı bir organizmanın genomuna eklendiği, silindiği, modifiye edildiği veya yer değiştirildiği bir tür genetik mühendisliğidir. Genetik materyali bir konakçı genomuna rastgele yerleştiren erken genetik mühendislik tekniklerinden farklı olarak, genom düzenleme, eklemeleri bölgeye özel konumları hedefleyerek başarır.

<span class="mw-page-title-main">Sauria</span> diapsid kladı

Sauria, arkozorların ve lepidosaurların en son ortak atalarını ve tüm soyundan gelenleri içeren bir sürüngen kladıdır. Kaplumbağaların Sauria içinde bulunduğunu varsayarsak, grup diapsidlerin taç grubu veya genel olarak sürüngenler olarak düşünülebilir. Son genomik çalışmalar ve fosil kayıtlarındaki kapsamlı araştırmalar ile kaplumbağaların daha önce düşünüldüğü gibi Saurian öncesi parareptillerle değil, arkozorlarla yakından ilişkili olduğu öne sürülüyor. Sauria, tüm modern sürüngenleri ve çeşitli soyu tükenmiş grupları içerir. Sauria, sürüngenlere memelilerden daha yakın akraba olan çeşitli kök sürüngenleri de içeren Sauropsida grubu içinde yer alır.

<span class="mw-page-title-main">Neandertal 1</span> tanımlanan ilk neandertal fosili

Feldhofer 1 veya Neandertal 1, Ağustos 1856'da Neander Vadisi'ndeki Kleine Feldhofer Grotte adlı bir Alman mağarasında bulunan Homo neanderthalensis türünün 40.000 yıllık tip örnek fosilinin bilimsel adıdır. Düsseldorf'un doğusunda. 1864'te fosilin açıklaması ilk kez bilimsel bir dergide yayınlandı ve resmi olarak adlandırıldı.

Arkeogenetikte, Erken Avrupalı Çiftçileri (EEF), İlk Avrupalı Çiftçiler (FEF), Neolitik Avrupalı Çiftçiler veya Eski Ege Çiftçileri (ANF) terimleri, Neolitik dönemde Avrupa'da yaşamış çiftçilerinden gelen genetik insan soyunun adıdır.

<span class="mw-page-title-main">Vindija Mağarası</span>

Vindija Mağarası, Hırvatistan'ın kuzeyindeki Donja Voća belediyesinde bulunan ve Neandertaller ve modern insanlarla ilişkili bir arkeolojik sit alanıdır. Bu bölgede ortaya çıkarılan Neandertallerden üçü, Neandertal genom projesinin ilk taslak dizisi için birincil kaynaklar olarak seçildi.

<span class="mw-page-title-main">Peștera cu Oase</span>

Peştera cu Oase, Romanya'nın güneybatısındaki Caraș-Severin ilindeki Anina şehri yakınlarında bulunan ve 37.000 ila 42.000 yıl önce yaşadıkları kabul edilen en eski Avrupa erken modern insanlarından (EEMH) bazılarının yaşadığı 12 karstik galeri ve odadan oluşan bir mağara sistemdir.

Ust'-Ishim adamı, batı Sibirya'da, günümüzden 45.000 yıl önce yaşayan, ilk modern insanlardan birinin kalıntılarına verilen isimdir. Fosil, en eski modern insan genomu olan genomunun bu şekilde deşifre edilmesine izin veren bozulmamış DNA'ya sahip olması bakımından dikkat çekicidir.

<span class="mw-page-title-main">Mezmaiskaya Mağarası</span>

Mezmaiskaya Mağarası, Güney Rusya'daki Adıge Cumhuriyeti'nde, Kafkas Dağları sistemindeki Kuzey Kafkasya'nın kuzeybatı eteklerinde yer alan Sukhoi Kurdzhips'in sağ kıyısına bakan tarih öncesi bir mağara sistemidir.

<span class="mw-page-title-main">Modern insanın yakın zamanlı Afrika kökeni</span>

Paleoantropolojide, "Afrika'dan Çıkış" teorisi, yeni tek köken hipotezi, yer değiştirme hipotezi veya yakın zamanlı Afrika kökeni modeli olarak da adlandırılan modern insanın yakın zamanlı Afrika kökeni, anatomik olarak modern insanların, coğrafi kökeni ve ilk göçlerinin bilim dünyasında yaygın kabul gören modelidir. Homo erectus ve daha sonra da Homo neanderthalensis'in, kısaca homininlerin Afrika dışına ilk yayılışlarının izini süren bir modeldir.

<span class="mw-page-title-main">Erken dönem insan göçleri</span>

Erken dönem insan göçleri, arkaik ve modern insanların kıtalar arasındaki en eski göçleri ve yayılmalarıdır. Yaklaşık 2 milyon yıl önce başladığına inanılmaktadır. Homo Erectus'un Afrika dışına yaptığı erken açılımlarla başlamıştır. Bu ilk göçü, yaklaşık 500.000 yıl önce yaşayan ve modern insanın yanı sıra Denisovalılar ve Neandertallerin muhtemel atası olan H. heidelbergensis de dahil olmak üzere diğer arkaik insanlar izledi. Erken hominidler muhtemelen şimdi batmış olan kara köprülerini kullanmışlardı.

Endojen viral element, viral olmayan bir organizmanın germ hattında varlığını sürdüren, bir virüsten gelen DNA sekansıdır. EVE'ler, viral genomun tamamı (provirus) veya bir kısmı olabilir. Bir viral DNA sekansı, hayata tutanabilir bir organizmayı meydana getirecek germ hücresinin genomuna entegre olur. Bu yeni yerleşmiş viral element, konakçı türde bir alel olarak bir nesilden bir sonrakine aktarılabilir ve hatta fiksasyona tabi olabilir.