İçeriğe atla

Natalie Ahn

Natalie G. Ahn
EğitimWashington Üniversitesi, Seattle (B.S., 1979)
Kaliforniya Üniversitesi, Berkeley (Ph.D., 1985)
Resmî siteResmi Site
Kariyeri
DalıKimya
Biyokimya
Çalıştığı kurumlarKolorado Boulder Üniversitesi (1992– )
Kolorado Üniversitesi Sağlık Bilimleri Merkezi, Denver (2003– )
Howard Hughes Tıp Enstitüsü (1994–2014 )
Doktora
danışmanı		Judith P. Klinman
Diğer akademik danışmanlarEdwin Krebs
Christoph de Haën

Natalie G. Ahn, Boulder'daki Colorado Üniversitesi'nde kimya ve biyokimya profesörü. Araştırmaları, fosforilasyon ve kanserlerde uzmanlaşarak hücre sinyalleme mekanizmalarını anlamaya odaklanmıştır.[1] Ahn'ın çalışması, genetik kodu ve genetiğin yaşam süreçlerini nasıl etkilediğini anlamak için "klasik kimya" araçlarını kullanmaktadır.[2] 2003 yılından günümüze Boulder'daki Colorado Üniversitesi'nde profesör olarak görev yapmakta ve burada Seçkin Profesör konumundadır.[3] 1994 ve 2014 yılları arasında Howard Hughes Tıp Enstitüsü araştırmacı olarak çalışmıştır.[4] 2018 yılında ise Ulusal Bilimler Akademisi'nde Amerikan Sanat ve Bilim Akademisi üyeliğine seçilmiştir.[5][6]

Biyografi

Ahn, 1979'da Seattle, Washington Üniversitesi'nden kimya alanında lisans derecesini aldı.[7] Lyle Jensen'in laboratuvarında X-ışını kristalografisine odaklanan araştırmalar yaptı.[7] Bu araştırmaya katılımı, X-ışını kristalografisi ile hesaplama teknikleri kullanarak protein katlanmasının daha iyi anlaşılmasına ve proteinlerin 3 boyutlu yapısının görselleştirilmesine yardımcı olmuştur.[8] Ahn ayrıca protein hidrodinamiğini araştıran proteinlerin sulu ortamlarına göre hareketlerinin, içinde asılı kalabilecekleri veya çözülebilecekleri bir araştırma görevlisi olarak David Teller'ın laboratuvarında çalışmıştır.[7][9]

1985 yılında Berkeley'deki California Üniversitesi'nde kimya alanında doktorasını aldı.[10] Judith Klinman ile birlikte burada enzimoloji eğitimi aldı.[7]

Ahn'ın doktora sonrası ilk işi, Christoph de Haen ile Washington Üniversitesi'nde hormon reseptör bağlanmasını incelemekti.[7] Daha sonra Edwin Krebs'in laboratuvarına taşındı ve burada sinyal iletiminde kariyerine başladı.[7] Bu laboratuvarda, "MAP kinazlarını ve MAP kinaz kinazlarını ilk tanımlayanlardan biri" olmuştur.[7] 1992'de Colorado Boulder Üniversitesi'nde çalışmaya başladı[11] ve 1993 yılında genç bilim adamlarının çalışmalarını finanse eden Searle Scholars Programının bir parçası oldu.[12] Tek bir hücre tipindeki proteinleri tanımlamak için WM Keck Vakfı'ndan burs kazanan sekiz proje işbirlikçisinden biriydi.[13] 2012 yılında Colorado Üniversitesi'nde Kolej Ayrım Profesörü seçildi.[11] 2014 yılında Savunma İleri Araştırma Projeleri Ajansı (DARPA) tarafından desteklenen bir biyokimyasal proje olan Subselüler Pan-Omics for Advanced Rapid Threat Assessment (SPARTA) ekibinin bir parçası oldu.[14]

2015 yazında daha önce konsey üyesi olduğu Amerikan Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Derneği (ASBMB) başkanlığına seçildi.[7] Berkeley'deki California Üniversitesi'nde doktora öğrencisiyken ASBMB'nin yıllık toplantısına katılmaya başladı ve bu toplantılardan birinde ilk halka açık araştırma konuşmasını yaptı.[7]

Uzmanlık Alanları

Mevcut araştırmaları

Ahn şu anda Colorado Üniversitesi'nde çalışmakta ve hücre sinyalizasyonu, bilgi ve proteomik ve moleküler biyofizik üzerine araştırmalar yürütmektedir.[7] Araştırmasının belirli konuları şunları içerir:

  • Proteomik ve Sinyal İletimi:
    • Laboratuvarın amacı, düzenleme ve hücre sinyalleşmesinden sorumlu yeni mekanizmaları araştırmaktır.[7] Bunu yapmak için Ahn, bir hücrenin sinyal yollarına tepkisini daha iyi anlamak için biyokimyasal ve hücresel yaklaşımlarla birlikte protein profili oluşturmak için kütle spektrometrisini kullanır.
    • Buna ek olarak, Ahn protein kinazların iç hareketlerini araştırmakta, özellikle onların bağlanma protein dinamiklerini ve katalitik fonksiyonlarını incelimektedir.
    • "Melanomda aktive olan ve kanser ilerlemesini ve hücre davranışını etkileyen sinyal yollarını" inceleyerek kanserin gelişimini inceliyor.[3]
  • Wnt5A sinyali:
    • Wnt5A, embriyonik vücut ekseni oluşumunu kontrol etmekten sorumludur ve melanomlarda yüksek seviyelerde bulunabilir ve bu da hücre istilasına neden olur. Ahn ve laboratuvarı, membran retraksiyonunu tetikleyerek yönlü hücre hareketlerine yardımcı olan "Wnt5a reseptör-aktin-miyosin-polarite (WRAMP) yapısını" keşfetti. Ahn, organel proteomiklerini kullanarak WRAMP yapısını belirleyebildi.[3]
  • B-Raf sinyalizasyonu:
    • Melanom hücrelerinin yarısında B-Raf proteini, hücre transformasyonu, istila ve metastazdan sorumlu olan bir yanlış anlamlı mutasyon (V600E mutasyonu) içerir. Ahn, fosfoproteinlerin profilini çıkarmak için fosfopeptidleri keşfetmek ve saymak için negatif öncü iyon kütle spektrometrisini kullanır. Ahn, bu yöntemle çok sayıda farklı protein tanımladı ve bu bilgilerle kanser tedavisinde kullanılan hücre mekanizmalarının protein-protein sinyalleşmesinden nasıl etkilendiğini inceledi.[3]
  • Proteomik Teknolojileri:
    • Ahn'ın laboratuvarında, her MS dizisinde 8.000'den fazla proteini tanımlamak için çok boyutlu sıvı kromatografisi-MS/MS kullanıyor. Ahn'ın amacı, atama proteinlerinde bu 2-D-LC-MS/MS tekniklerinde daha doğru ve hassas olmaktır.[3]
  • Protein Kinaz Dinamiği:
    • Ahn'ın laboratuvarında, enerji dalgalanmalarının meydana geldiği kinazların içindeki protein hareketlerini keşfetmek ve daha iyi anlamak için hidrojen değişim kütle spektrometrisini (HX-MS) kullanıyor. Ahn'ın amacı, farklı protein dinamiklerinin belirli enzimlerdeki, özellikle de protein kinazdaki katalitik aktiviteyi nasıl düzenleyebildiğini anlamaktır. Ahn, aktivite ve protein dinamikleri arasındaki açık bağlantı nedeniyle ideal bir model sağlayan ERK2 MAP kinazlarına odaklanan araştırmalar yürütmektedir.[12]

Bilimsel Yayınları

  • Couts, KL, Anderson, EM, Gross, MM, Sullivan, K. ve Ahn, NG (2012) Melanom hücrelerinde Onkojenik B-Raf sinyali, kombinatoryal fonksiyonlara sahip bir mikroRNA ağını kontrol eder. Onkogen, Basında.
  • Wang, D., Zhang, Z., O'Loughlin, E., Lee, T., Houel, S., O'Carroll, D., Tarahovsky, A., Ahn, NG ve Yi, R. (2012) Argonaute proteinlerinin memeli gelişiminde kantitatif işlevleri.  Genes Dev., Baskıda.
  • Luo, Y., Ellis, LZ, Dallaglio, K., Takeda, M., Robinson, WA, Robinson, S., Lewis, KD, McCarter, MD, Gonzalez, R., Norris, DA, Roop, DR, Ahn, NG ve Fujita, M. (2012) İnsan melanom tümörlerinden yan popülasyon hücreleri, çeşitli kemorezistans mekanizmalarını ortaya koymaktadır. J. Yatırım. Dermatol., Basında.
  • Yen, CY, Houel, S., Ahn, NG ve Old, WM (2011)  Proteom çapında bir spektral kitaplık kullanarak spektrumdan spektruma arama.  Mol. Hücre. Proteomik Baskıda,  10, M111.007666.
  • Oyeyemi, OA, Sours, KM, Lee, T., Kohen, A., Resing, KA, Ahn, NG ve Klinman, JP (2011)  25 °C'de mezofilik ve termofilik dihidrofolat redüktaz için karşılaştırmalı hidrojen-döteryum değişimi: Tanımlama mezofilik proteinde gelişmiş esnekliğe sahip tek bir aktif bölge bölgesinin.  Biyokimya  50, 8251-8260.
  • Meyer-Arendt, K., Old, WM, Houel, S., Renganathan, K., Eichelberger, B., Resing, KA ve Ahn, NG (2011) IsoformResolver: Protein çıkarımı için peptit merkezli bir algoritma.  J Proteome Res. 10, 3060-3075.
  • Sours, KM ve Ahn, NG (2010) MAP kinazlarının hidrojen değişim kütle spektrometrisi ile analizi. “MAP Kinaz Signaling Protocols”, R. Seger, Ed.,  Methods in Molecular Biology,  661, 239-255.
  • Ring, AY, Sours, KM, Lee, T. ve Ahn, NG (2010) ERK1 ve ERK2 arasındaki yapısal hareketlilikte farklı aktivasyona bağlı değişiklikler.  Uluslararası J. Kütle Spektrometresi,  302, 101-109 .
  • Houel, S., Abernathy, R., Renganathan, K., Meyer-Arendt, K., Ahn, NG ve Old, WM (2010) Büyük ölçekli proteomik çalışmalarda kimera MS/MS spektrumlarının peptit tanımlaması üzerindeki etkisinin ölçülmesi.  J. Proteom Araş. 9, 4152-4160 .
  • Oyeyemi, O., Sours, KM, Lee, T., Resing, KA, Ahn, NG ve Klinman, JP (2010) Bir termofilik dihidrofolat redüktazda protein hareketlerinin sıcaklığa bağımlılığı ve katalitik verimlilikle ilişkisi.  Proc. Natl. Acad. Bilim, ABD. 107:10074-10079.
  • Kabuyama, Y., Litman, ES, Templeton, P., Metzner. SI, Witze, ES, Argast, GM, Langer, SJ, Polvinen, K., Shellman, Y, Chan, D., Shabb, JB, Fitzpatrick, JE, Resing, KA, Sousa, MC ve Ahn, NG (2009) ) Bir metionin kurtarma enzimi olarak melanom ay ışıklarında Rho'ya bağlı sinyalleşmenin bir aracısı.  Mol. Hücre. Proteomik. 8(10):2308-2320.
  • “Yazarın Seçimi” makalesi olarak vurgulanmıştır.
  • Argast, GM, Croy, CH, Couts, KL, Zhang, Z., Litman, ES, Chan, DC ve Ahn, NG (2009) Melanom hücrelerinde B-Raf sinyali ile pleksin B1'in çapraz regülasyonu.  Onkogen  28(30):2697-2709 .
  • Old, WM, Shabb, JS, Houel, S., Wang, H., Couts, KH, Yen, CY., Litman, ES, Croy, CH, Meyer-Arendt, K., Miranda, JG, Brown, RA, Witze, ES, Schweppe, RE, Resing, KA ve Ahn, NG (2009) Fonksiyonel proteomik, melanomda B-Raf sinyali ile fosforilasyon hedeflerini tanımlar.  Moleküler Hücre,  34(1):115-131.
  • Yen, C.-Y., Meyer-Arendt, K., Eichelberger, B., Houel, S., Old, WM, Knight, RD, Ahn, NG, Hunter, LE ve Resing, KA (2008) A teorik Proteinlerin büyük ölçekli tanımlanmasında spektrumdan spektruma arama için MS/MS kütüphanesi.  Mol. Hücresel Proteomik,  8(4):857-869.
  • Gehrke, AS, Sun, S., Kurgan, L., Ahn, N., Resing, K., Kafadar, K. ve Cios, K. (2008) Peptidlerin Gaz Faz Kimyasının Analizi için Geliştirilmiş Makine Öğrenimi Yöntemi.  BMC Biyoinformatik,  9:515.
  • Levin-Salomon, V.,  Kogan, K.,  Ahn, NG .,  Livnah, O. ve  Engelberg, D  (2008). MAP kinazların ERK ailesinin kendinden aktif (MEK'ten bağımsız) varyantlarının izolasyonu.  J. Biol. Kimya 283:34500-34510.
  • Sours, KM, Kwok, SC, Rachidi, T., Lee, T., Ring, A., Hoofnagle, AN, Resing, KA ve Ahn, NG (2008) Hidrojen değişim kütle spektrometrisi, konformasyonel hareketlilikte aktivasyon kaynaklı değişiklikleri ortaya koymaktadır. p38a MAP kinazı.  J. Mol. Biol.,  379(5):1075-1093.
  • Witze, ES, Litman, ES, Argast, GM, Moon, RT ve Ahn, NG (2008) Wnt5A yapışma reseptörlerinin polarize yeniden dağıtılmasıyla hücre polaritesinin ve yönlü hareketin kontrolü. Bilim,  320(5874):365-369.
  • Witze, ES, Old, WM, Resing, KA ve Ahn, NG (2007) Protein translasyon sonrası modifikasyonların kütle spektrometrisi ile haritalanması.  Nat. Yöntemler,  4, 798-806 .
  • Ahn, NG, Shabb JS, Old, WM ve Resing, KA (2007) Kütle spektrometrisi ile derinlemesine proteomik profil oluşturma.  ACS Kimyasal Biyoloji,  2:39-52.
  • Sun, S., Meyer-Arendt, K., Eichelberger, B., Brown, R., Yen, CY, Old, WM, Pierce, K., Cios, K., Ahn, NG ve Resing, KA (2007) ) Spektral yoğunluk tahmini ve fragman iyonlarının tam açıklaması kullanılarak peptit MS/MS atamalarının geliştirilmiş doğrulaması.  Mol. Hücre. Proteomik,  6,1-17.
  • Shi, Z., Resing, KA ve Ahn, NG (2006) Protein kinazların allosterik kontrolü için ağlar.  Kör. Op. Yapı. Biol. 16, 686-692
  • Emrick, MA, Lee, T., Starkey, P., Mumby, MC, Resing, KA ve Ahn, NG (2006) ERK2'deki kapı bekçisi kalıntısı, molekül içi bağlantı yolu  yoluyla otomatik aktivasyonu kontrol eder. Proc. Natl. Acad. bilim ABD,  103, 18101-18106.
  • Schweppe, RE, Cheung, TH ve Ahn, NG (2006) ERK5 ve ERK1 / 2 sinyalinin global gen ekspresyonu analizi, ERK5 aracılı tepkilerde HIF-1'in rolünü ortaya koymaktadır.  J. Biol. Chem.,  281(30):20993-21003.
  • Roberts EC, Hammond, K., Yin, H., Traish, AM, Resing, KA ve Ahn, NG (2006) Fonksiyonel proteomik ile MAP kinaz yolu için G2/M hedeflerinin belirlenmesi.  Proteomik,  6(16):4541-53.
  • Ma, Z., Izumi, H., Kanai, M., Kabuyama, Y., Ahn, NG ve Fukasawa, K.  (2006) Mortalin, p53'ün sentrozomal lokalizasyonunu modüle ederek sentrozom çoğaltmasını kontrol eder. Onkogen,  25(39):5377-90.
  • Kabuyama, Y., Langer, SJ, Polvinen, K., Homma, Y., Resing, KA ve Ahn, NG (2006) Fonksiyonel proteomik, protein tirozin fosfataz 1B'yi RhoA sinyalinin bir hedefi olarak tanımlar.  Mol. Hücre. Proteomik. 5(8):1359-67.
  • Lee, T., Croy, CH, Resing, KA ve Ahn, NG (2006) Proteinlerde hidrojen değişim ölçümleri. "Handbook of Hydrogen Transfer" (Schowen, RL, Klinman, JP, eds), Wiley VHC, Ekim 2006, Bölüm 14, sayfa 1361-1392'de. .
  • Ruth, MC, Old, WM, Emrick, MA, Meyer-Arendt, K., Aveline-Wolf, LD, Pierce, KG, Mendoza, AM, Sevinsky, JR, Hamady, M., Knight, RD, Resing, KA ve Ahn, NG (2006) İnsan kronik miyeloid lösemi hücrelerinden membran proteinlerinin analizi: Çok boyutlu LC-MS/MS için ekstraksiyon yöntemlerinin karşılaştırılması.  J. Proteome Res, 5(3):709-719.
  • Yen, CY, Russell, S., Mendoza, AM, Meyer-Arendt, K., Sun, SJ, Cios, KJ, Ahn, NG ve Resing, KA (2006) azaltılmış karmaşıklık: MS/MS spektrumlarının veri madenciliğinden proteaz bölünmesi ve SCX elüsyon kuralları.  Anal. Chem.,  78:1071-1084.
  • Lee, T., Hoofnagle, AN, Resing, KA ve Ahn, NG (2006) Elektrosprey iyonizasyon kütle spektrometrisi ile ölçülen protein hidrojen değişimi. "Cell Biology: A Laboratory Handbook", Üçüncü Baskı, JE Celis, Ed., Elsevier Science. cilt 4: 443-449.
  • Lee, T., Hoofnagle, AN, Resing, KA ve Ahn, NG (2005) Bir ATP analoğu tarafından hidrojen değişim solvent koruması, aktivasyon üzerine ERK2'de konformasyonel değişiklikleri ortaya çıkarır.  J. Mol. Biol. 353:600-612.
  • Old, WM, Meyer-Arendt, K., Aveline-Wolf, K., Pierce, KG, Mendoza, A., Sevinsky, JR, Resing, KA ve Ahn, NG (2005) Ölçme için etiketsiz yöntemlerin karşılaştırılması av tüfeği proteomikleri ile insan proteinleri.  Mol. Hücre. Proteomik, 4:1487-1502.
  • Kabuyama, Y., Resing, KA ve Ahn, NG (2004) Proteomiklerin sinyalleşme ağlarına uygulanması.  Genetik ve Gelişimde Güncel Görüşler,  14(5):492-8 .
  • Liang, ZX, Tsigos, I., Lee,T., Bouriotis, V., Resing, KA, Ahn, NG ve Klinman JP(2004) Termofilik homologuna göre psikrofilik alkol dehidrojenazda artan yerel esnekliğin kanıtı.  Biyokimya  43(46)::14676-83.
  • Resing, KA, Meyer-Arendt, K., Mendoza, AM, Aveline-Wolf, LD, Jonscher, KR, Pierce, KG, Old, WM, Cheung, HT, Russell, S., Wattawa, JL, Goehle, GR, Knight, RD ve Ahn, NG (2004) Av tüfeği proteomikleri ile insan proteinlerinin tanımlanmasında tekrarlanabilirlik ve duyarlılığın geliştirilmesi.  Anal. Chem.,  76:3556-68 .
  • Liang, Z.-X., Lee, T., Resing, KA, Ahn, NG ve Klinman, JP (2004) Termal aktive protein hareketliliği ve termofilik alkol dehidrojenazda kataliz ile korelasyonu.  Proc. Natl. Acad. bilim ABD,  101:9556-61 .
  • Kabuyama, Y., Polvinen, K., Resing, KA ve Ahn, NG (2004) Sinyalleme hedeflerinin tanımlanması için iki boyutlu elektroforez. "Sinyal İletim Protokolleri"nde, RC Dickson, MD Mendenhall, Eds.  Mol'deki Yöntemler. Biol. 284:37-49.
  • Lee, T., Hoofnagle AN, Kabuyama, Y., Stroud, J., Min, X., Goldsmith, EJ, Chen, L., Resing, KA ve Ahn, NG (2004) MAP kinazlarındaki yerleştirme bölgesi etkileşimleri ortaya çıktı hidrojen değişim kütle spektrometrisi ile.  Moleküler Hücre,  14:43-55
  • Sevinsky JR, Whalen, AM ve Ahn, NG (2004) ERK, MafB/Kreisler aracılığıyla megakaryosit geni GPIIb/CD41'i indükler. Mol. Hücre. Biol.,  24(10):4534-45
  • Hoofnagle AN, Resing, KA ve Ahn, NG (2004) Döteryum değişimi/kütle spektrometrisi için pratik yöntemler. "MAP kinaz protokolleri"nde, R. Seger, Ed.,  Meth. Mol. Biol. 250, 283-298 .
  • Hoofnagle AN, Stoner, JW, Lee, T., Eaton, SS ve Ahn, NG (2004) ERK2'deki yapı ve dinamiklerdeki fosforilasyona bağlı değişiklikler, sahaya yönelik dönüş etiketlemesi ve elektron paramanyetik rezonansı ile tespit edildi. Biyofizik Dergisi,  86(1 Bölüm 1):395-403
  • Haydon, CE, Eyers, PA, Wolf, LA, Resing, KA, Maller, JL ve Ahn, NG (2003)  Xenopus laevis  Aurora A üzerinde yeni fosforilasyon bölgelerinin belirlenmesi ve IMAC ile fosfopeptid zenginleştirmesinin analizi. Mol. Hücre. Proteomik,  2(10):1055-1067 .
  • Bernard, K., Litman, E., Fitzpatrick, J., Shellman, Y., Argast, G., Polvinen, K., Everett, A., Fukasawa, K., Norris, D., Ahn, NG ve Resing, KA (2003) Melanom ilerlemesinin fonksiyonel proteomik analizi.  Kanser Araş. 63:6716-6725.
  • Schweppe, RE, Melton AA, Brodsky, KS, Aveline, LD, Resing, KA, Ahn, NG ve Gutierrez-Hartmann, A. (2003) Bazal transkripsiyona bağlanan fonksiyonel hipofiz Ets faktörü olarak GABP'nin saflaştırılması ve kütle spektrometrik tanımlaması prolaktin promotörünün elemanı. J. Biol. Chem,  278:16863-72 .
  • Schweppe RE, Resing, KA ve Ahn, NG (2003) Kütle spektrometrisi ile translasyon sonrası modifikasyonların karakterizasyonu. Hesaplar Kimya. Araş.  36, 453-61.
  • Hoofnagle AN, Resing, KA ve Ahn, NG (2003) Hidrojen değişim kütle spektrometrisi ile protein analizi.  Anne. Rev. Biyofiz. biyomol. Yapı.  32, 1-25 .
  • Aurandt, J., Vikis, HG, Gutkind, JS, Ahn, N. ve Guan, KL (2002) Semaforin reseptörü pleksin B1, Rho'ya özgü nükleotid değiştirici, LARG ile doğrudan etkileşim yoluyla sinyal verir.  Proc. Natl. Acad. bilim ABD  99, 12085-90 .
  • Roberts, EC, Shapiro, PS, Nahreini, TS, Pages, G., Pouyssegur, J. ve Ahn, NG (2002) Somatik hücre mitozunda ERK ve PI3K sinyal yolları için farklı hücre döngüsü zamanlama gereksinimleri. Mol. Hücre. Biol. 22, 7226-41 .
  • Galasinski, SC, Resing, KA, Goodrich, JA ve Ahn, NG (2002) Fosfataz inhibisyonu, histon deasetilaz 1/2 fosforilasyonuna ve yardımcı baskılayıcı etkileşimlerinin bozulmasına yol açar. J. Biol. Kimya  277, 19618-26 .
  • Galasinski S., Louie DF, Gloor, KK, Resing, KA ve Ahn, NG (2002) Çekirdek histonlar üzerinde post-translational modifikasyonların küresel düzenlemesi.  J. Biol. Kimya 277, 2579-88
  • Emrick, MA, Hoofnagle, AN, Miller, AS, Ten Eyck, LF ve Ahn, NG (2001) Sinerjistik nokta mutasyonları ile hücre dışı sinyalle düzenlenen kinaz 2'nin yapıcı aktivasyonu. J. Biol. Kimya  276, 46469-79.
  • Jesch SA, Lewis, TS, Ahn, NG ve Linstedt, AD (2001) Golgi istifleme proteini 55'in mitojenle aktifleştirilmiş protein kinaz ERK2 ile mitotik fosforilasyonu.  Mol. Biol. Hücre  12, 1811-1817.
  • Hoofnagle AN, Resing, KA, Goldsmith,EJ ve Ahn, NG (2001) Hidrojen değişimi ile tespit edildiği gibi, ERK2'nin aktivasyonu üzerine protein konformasyonel hareketliliğinde değişiklikler.  Proc. Natl. Acad. bilim ABD  98, 956-961.
  • Lewis, TS, Hunt, J., Aveline, LD, Jonscher, KR, Louie, DF, Yeh, J., Nahreini TS, Resing, KA ve Ahn, NG (2000) Fonksiyonel proteomik ile yeni MAP kinaz yolu sinyalleme hedeflerinin tanımlanması ve kütle spektrometrisi.  Moleküler Hücre  6, 1343-1354 .
  • Seiwert, S., Nahreini, TS, Aigner, S., Ahn, NG ve Uhlenbeck OC (2000) yola-özgü MAP kinaz inhibitörleri olarak RNA aptamerleri.  Kimya ve Biyoloji  7, 833-843.
  • Prowse, CN, Hagopian, JC, Cobb, MH, Ahn, NG ve Lew J. (2000) Mitojenle aktive olan protein kinaz, ERK2 için katalitik reaksiyon yolu.  Biyokimya,  39:6258-66
  • Rak, J., Mitsuhashi, Y., Sheehan, C., Tamir, A., Viloria-Petit, A., Filmus, J., Mansour, SJ, Ahn, NG, Kerbel, RS (2000) Oncogenes and tümör anjiyogenez : ras ile dönüştürülmüş epitel hücrelerinde ve fibroblastlarda vasküler endotelyal büyüme faktörü yukarı regülasyonunun farklı modları.  Kanser Araş. 60, 490-498.
  • Louie, DF, Gloor, KK, Galasinski, SC, Resing, KA ve Ahn, NG (2000) Kütle spektrometrisi ile analiz edilen yüksek mobilite grubu proteinleri 14 ve 17'nin fosforilasyonu ve hücre içi yeniden dağılımı.  Protein Bilimi. 9, 170-179 .
  • Boeshans, KM, Resing, KA, Hunt, JB, Ahn, NG ve Shabb, JB (1999) Kütle spektrometrisi ile tip I cAMP'ye bağlı protein kinazın membranla ilişkili düzenleyici alt biriminin yapısal karakterizasyonu: Ser81'in in vivo fosforilasyon olarak tanımlanması RIa'nın sitesi.  Protein Bilimi.  8, 1515-1522.
  • Resing, KA, Hoofnagle, AN ve Ahn, NG (1999) İkincil yapıyı araştırmak için pepsin eşleştirmesini kullanarak ERK2'nin döteryum değişim davranışını modelleme.  J. Am. Soc. Kütle Spek.  10, 685-702.
  • Shapiro, PS, Whalen, AM, Tolwinski, NS, Froelich-Ammon, SJ, Garcia, M., Osheroff, N. ve Ahn, NG (1999) ERK, fosforilasyondan bağımsız bir mekanizma yoluyla topoizomeraz IIa'yı aktive eder.  Mol. Hücre. Biol.  19, 3551-3560.
  • Tolwinski, NS, Shapiro, PS, Goueli, S. ve Ahn, NG (1999) MAP kinaz kinaz-1'in nükleer lokalizasyonu, serum stimülasyonu ve G2/M ilerlemesi ile desteklenir. Aktivasyon dudağındaki fosforilasyon gereksinimi ve MKK'nın akış aşağısında sinyalleşme.  J. Biol. Kimya  274, 6168-6174.
  • Resing, KA ve Ahn, NG (1999) Kütle spektrometrisinin sinyal transdüksiyonuna uygulamaları.  prog. Biyofiz. Mol. Biol. 71, 501-523.
  • Shapiro, PS,Vaisberg, E., Hunt, AJ, Tolwinski, NS, Whalen, AM, McIntosh, JR ve Ahn, NG (1998) Somatik hücre mitozu sırasında MKK/ERK yolunun aktivasyonu. Aktif ERK'nin kinetokorlarla doğrudan etkileşimleri ve mitotik 3F3/2 fosfoantijenin düzenlenmesi.  J. Hücre Biol.  142, 1533-1545.
  • Duesbery, NS, Webb, C, Leppla, S, Gordon, VM, Klimpel, KR, Copeland, TD, Ahn, NG, Oskarsson, MK, Fukasawa, K, Paull, KD ve Vande Woude), GF (1998). MAPKK'nın şarbon öldürücü faktör ile proteolitik inaktivasyonu. bilim _ 280, 734–7
  • Lewis, TS, Shapiro, PS ve Ahn, NG (1998) MAP kinaz basamakları yoluyla sinyal iletimi.  reklam Kanser Araş. 74, 49-139.
  • Shapiro, PS ve Ahn, NG (1998) Raf-1 ve mitojenle aktive olan protein kinaz kinaz 1 ve 2'nin MKP-1 fosfataz tarafından geri besleme regülasyonu. J. Biol. Kimya  273, 1788-1793.
  • Resing, KA ve Ahn, NG (1998) Protein kinaz aktivasyonunun bir probu olarak Döteryum değişim kütle spektrometrisi. MAP kinaz kinazın vahşi tip ve yapısal olarak aktif mutantlarının analizi 1. Biochemistry  37, 463-475.
  • Resing, KA ve Ahn, NG (1997) Elektrosprey iyonizasyon kütle spektrometrisi ile protein fosforilasyon analizi. Yöntemler Enzimol.  283, 29-44.
  • Whalen, AM, Galasinski, SC, Shapiro, PS, Nahreini, TS ve Ahn, NG (1997) MAP kinaz kinazın yapısal aktivasyonu ile indüklenen megakaryositik farklılaşma.  Mol. Hücre. Biol.  17, 1947-1958.
  • Mansour, SJ, Candia, JM, Matsuuda, J., Manning, M. ve Ahn, NG (1996) MAP kinaz kinazın enzimatik aktivitesini kontrol eden birbirine bağlı alanlar 1.  Biochemistry  35, 15529-15536.
  • Louie, DF, Resing, KA, Lewis, TS ve Ahn, NG (1996) Rat-1 fibroblastlarından 40S ribozomal proteinlerinin kütle spektrometrik analizi.  J. Biol. Kimya 271, 28189-28198 .
  • Matten, WT, Mansour, SJ, Copeland, T., Ahn, NG ve Vande Woude, GF (1996) Xenopus oosit olgunlaşması sırasında MAPK'dan Mos'a pozitif bir geri besleme sinyali.  geliştirici Biol.  179, 485-492.
  • Choi, T., Rulong, S., Resau, J., Fukasawa, K., Matten, W., Kuriyama, R., Mansour, S., Ahn, N., Vande Woude, GF (1996) Mos/MAP kinaz, MPF'nin yokluğunda erken mayotik fenotipleri indükleyebilir: Mayoz I sırasında iğ oluşumunu analiz etmek için yeni bir sistem,  Proc. Natl. Acad. bilim ABD,  93, 4730-4735.
  • Mansour, SJ, Candia, JM, Gloor, K. ve Ahn, NG (1996) Yapısal olarak aktive edilmiş MAPKK1 ve MAPKK2, benzer transkripsiyonel ve morfolojik tepkilere aracılık eder.  Hücre Büyüme Farkı  7, 243-250.
  • Resing, KA, Mansour, SJ, Hermann, AS, Johnson, RS, Candia, JM, Fukasawa, K., Vande Woude, GF ve Ahn, NG (1995) MAP üzerinde v-Mos katalizli fosforilasyon bölgelerinin ve otofosforilasyon bölgelerinin belirlenmesi ESI/MS ile kinaz kinaz.  Biyokimya  34, 2610-2620.
  • Mansour, SJ, Matten, WT, Hermann, AS, Candia, JM, Rong, S., Fukasawa, K., Vande Woude, GF ve Ahn, NG (1994) MAP kinaz kinazındaki fonksiyon kazanımı mutasyonları memeliyi teşvik eder hücre dönüşümü.  Bilim  265, 966-970.
  • Mansour, SJ, Resing, KA, Candia, JM, Hermann, AS, Gloor, JW, Herskind, KR, Wartmann, M., Davis, RJ ve Ahn, NG (1994) Mitojenle aktive olan protein kinaz fosforilasyonu protein kinaz-kinaz: in vitro  fosforilasyon bölgelerinin analizi . J. Biochem. 116. 304-314 .
  • Posada, J., Yew, N., Ahn, NG, Vande Woude, GF ve Cooper, JA (1993) Mos, Xenopus oositlerinde MAP kinazı uyarır ve in vitro olarak bir MAP kinaz kinazını aktive eder. Mol. Hücre . Biol. 13, 2546-2553.
  • Ahn, NG (1993) MAP kinaz şelalesi. Yeni bir sinyal iletim yolunun keşfi. Mol. Hücre. Biyokimya. 127/128, 201-209.
  • Ahn, NG, Campbell, JS, Seger, R., Jensen, AL, Graves, LM ve Krebs, EG (1993) A431 hücrelerinde mitojenle aktive olan protein kinaz kinazın metabolik etiketlemesi, serin ve treonin kalıntıları üzerinde fosforilasyonu gösterir.  Proc. Natl. Acad. bilim ABD  90, 5143-5147.
  • Ahn, NG, Seger, R. ve Krebs, EG (1992) Mitojenle aktive olan protein kinaz aktivatörü. Kör. Op. Hücre Biol.  4, 992-999.
  • Seger, R., Seger, D., Lozeman, FJ, Ahn, NG, Graves, LM, Campbell, JS, Ericsson, L., Harrylock, M., Jensen, AM ve Krebs, EG (1992) Human T-cell mitojenle aktive olan protein kinaz kinazlar, maya sinyal transdüksiyon kinazları ile ilgilidir.  J. Biol. Kimya  267, 25628-25631.
  • Seger, R., Ahn, NG, Posada, J., Munar, ES, Jensen, AJ, Cooper, JA, Cobb, MH ve Krebs, EG (1992) epidermal büyüme faktörü ile uyarılan A431 hücreleri. J. Biol Chem. 267, 14373-14381.
  • Ahn, NG, Robbins, DJ, Haycock, JW, Seger, R., Cobb, MH ve Krebs, EG (1992) Sinir büyüme faktörü veya bradikinin ile uyarılan PC12 hücrelerinde MAP kinazları ERK1 ve ERK2'nin bir aktivatörünün tanımlanması.  J. Neurochem.,  59, 147-156.
  • Haycock, JW, Ahn, NG, Cobb, MH ve Krebs, EG (1992). İki mikrotübül ilişkili protein 2 kinazı olan ERK1 ve ERK2, in situ serin 31'de tirozin hidroksilazın fosforilasyonuna aracılık eder  .  Proc. Natl. Acad. bilim ABD, 89, 2365-2369.
  • Seger, R., Ahn, NG, Boulton, TG, Yancopoulos, GD, Panayotatos, N., Radziejewska, E., Ericsson, L., Bratlien, RL, Cobb, MH ve Krebs, EG (1991). Mikrotübül ile ilişkili protein 2 kinazlar, ERK1 ve ERK2, hem tirozin hem de treonin kalıntıları üzerinde otofosforilasyona uğrar: Aktivasyon mekanizmaları için çıkarımlar.  Proc. Natl. Acad. bilim ABD, 88, 6142-6146.
  • Ahn, NG, Seger, R., Bratlien, RL ve Krebs, EG (1991). Büyüme faktörü ile uyarılan fosforilasyon basamakları: Büyüme faktörü ile uyarılan MAP kinazın aktivasyonu. CIBA Vakfı  Sempozyumu,  164, 113-131.
  • Ahn, NG, Seger, R., Bratlien, RL, Diltz, CD, Tonks, NK ve Krebs, EG (1991) Bir epidermal büyüme faktörü ile uyarılan protein kinaz kaskadı içinde çoklu bileşenler. Bir MBP/MAP2 kinazın in vitro aktivasyonu. J. Biol. Kimya  256, 4220-4227.
  • Ahn, NG ve Krebs, EG (1990) İsviçre 3T3 hücrelerinde epidermal büyüme faktörü ile uyarılan protein serin/treonin kinaz kaskadı için kanıt. Serin peptit kinaz aktivitesinin in vitro miyelin bazik protein kinazlar tarafından aktivasyonu  .  J. Biol. Kimya  265, 11495-11501.
  • Ahn, NG, Weiel, JE, Chan, CP ve Krebs, EG (1990) İsviçre 3T3 hücrelerinden çoklu epidermal büyüme faktörü ile uyarılan protein serin/treonin kinazlarının tanımlanması.  J. Biol. Kimya  265, 11487-11494.
  • Ahn, NG ve Klinman, JP (1989) Bölümlere ayrılmış bir enzim sisteminde hız sınırlayıcı adımların doğası. Yeniden kapatılmış kromaffin granül hayaletlerinde dopamin taşınması ve hidroksilasyon oranlarının niceliği.  J. Biol. Kimya  264, 12259-12265.
  • Ahn, NG, Teller, DC, Bienkowski, MJ, McMullen, BA, Lipkin, EW ve de Haën, C. (1988) İnsan plasentasından beş lipokortin ile ilişkili fosfolipaz A2 inhibitörünün sedimantasyon denge analizi.  J. Biol. Kimya  263, 18657-18663.
  • Ahn, N. ve Klinman, JP (1987) Yeniden kapatılmış kromaffin granül hayaletlerinde dış ve iç elektron donörleri tarafından dopamin b-monooksijenazın aktivasyonu.  J. Biol. Kimya  262, 1485-1492.
  • Ahn, N. ve Klinman, JP (1983) Başlangıç hızı ve birincil döteryum izotop etkisi çalışmalarından çıkarsanan, pH ve fumarat ile dopamin b-monooksijenaz modülasyonunun mekanizması.  Biyokimya  22, 3096-3106.

Kaynakça

  1. ^ Old (2009). "Functional Proteomics Identifies Targets of Phosphorylation by B-Raf Signaling in Melanoma". Molecular Cell. 34 (1): 115-31. doi:10.1016/j.molcel.2009.03.007. PMC 2735263 $2. PMID 19362540. 
  2. ^ "Finding the Trees in the Proteomic Forest". Genomics & Proteomics. 4 (1): 38-40. January 2004.  Birden fazla yazar-name-list parameters kullanıldı (yardım); Yazar |ad1= eksik |soyadı1= (yardım)
  3. ^ a b c d e "Natalie Ahn". University of Colorado Boulder. 20 Eylül 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Eylül 2018. 
  4. ^ "Natalie G. Ahn, PhD". Howard Hughes Medical Institute. 2 Mayıs 2014 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ocak 2016. 
  5. ^ "National Academy of Sciences Members and Foreign Associates Elected". National Academy of Sciences. 1 Mayıs 2018. 16 Haziran 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 12 Mayıs 2018. 
  6. ^ "Newly Elected Fellows". members.amacad.org. 14 Ocak 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 13 Ocak 2019. 
  7. ^ a b c d e f g h i j k "Feature: Meet Natalie Ahn, ASBMB's incoming president". www.asbmb.org. 4 Temmuz 2016 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 8 Kasım 2016. 
  8. ^ "Molecular Anatomy: X-Ray Crystallography Helps Solve the Mystery of Protein Structure". www.washington.edu. 25 Ağustos 2015 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 8 Kasım 2016. 
  9. ^ "Protein Hydrodynamics" (PDF). JAI. 2: 271-305. 1999. 29 Mayıs 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi (PDF). Erişim tarihi: 10 Ağustos 2022.  Birden fazla yazar-name-list parameters kullanıldı (yardım); Yazar |ad1= eksik |soyadı1= (yardım)
  10. ^ "Natalie Ahn". BioFrontiers Institute. University of Colorado. 16 Mart 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ocak 2016. 
  11. ^ a b "Following the Pathways to Metastatic Melanoma". Colorado Arts and Sciences Magazine. University of Colorado Boulder. 2013. 9 Ağustos 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ocak 2016.  Yazar |ad1= eksik |soyadı1= (yardım)
  12. ^ a b "Natalie G. Ahn". Searle Scholars Program. 26 Mart 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ocak 2016. 
  13. ^ "CU People – September 2009". Coloradan Magazine. September 2009. 30 Mart 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ocak 2016. 
  14. ^ "CU Awarded DARPA Cooperative Agreement to Assess Mechanisms of Drugs and Chemical Agents". Biotech Week. 12 Şubat 2014. 11 Eylül 2016 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ocak 2016 – HighBeam Research vasıtasıyla. 

Dış bağlantılar

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">Protein</span> polipeptitlerin işlevsellik kazanması sonucu oluşan canlıların temel yapı birimi

Proteinler, bir veya daha fazla uzun amino asit artık zincirini içeren büyük biyomoleküller ve makromolekül'lerdir. Proteinler organizmalar içinde, hücrelere yapı ve organizmalar sağlayarak ve molekülleri bir konumdan diğerine taşıyarak metabolik reaksiyonları katalizleme, DNA kopyalama, uyaranlara yanıt verme dahil olmak üzere çok çeşitli işlevler gerçekleştirir. Proteinler, genlerinin nükleotit dizisi tarafından dikte edilen ve genellikle faaliyetini belirleyen özel 3D yapıya protein katlanmasıyla sonuçlanan amino asit dizilimlerinde birbirlerinden farklıdır.

<span class="mw-page-title-main">Golgi aygıtı</span> Proteinleri ihraç için paketleyen hücre organeli

Golgi aygıtı, çoğu ökaryotik hücrede bulunan bir organeldir. 1897'de, Golgi aygıtı isminin kaynağı olan, İtalyan tabip Camillo Golgi tarafından keşfedilmiştir.

<span class="mw-page-title-main">Enzim</span> biyomoleküller

Enzimler, kataliz yapan biyomoleküllerdir. Neredeyse tüm enzimler protein yapılıdır. Enzim tepkimelerinde, bu sürece giren moleküllere substrat denir ve enzim bunları farklı moleküllere, ürünlere dönüştürür. Bir canlı hücredeki tepkimelerin neredeyse tamamı yeterince hızlı olabilmek için enzimlere gerek duyar. Enzimler substratları için son derece seçici oldukları için ve pek çok olası tepkimeden sadece birkaçını hızlandırdıklarından dolayı, bir hücredeki enzimlerin kümesi o hücrede hangi metabolik yolakların bulunduğunu belirler.

Biyolojide sinyal transdüksiyonu bir hücrenin bir cins sinyal veya uyarıyı başka birine dönüştürme sürecidir. Çoğu zaman bu, hücre içinde enzimlerin yürüttüğü biyokimyasal reaksiyonlarla gerçekleşir, bunlar birbirine ikincil habercilerle bağlanıp bir "ikincil haberci yolu" oluştururlar. Bu süreçler genelde hızlı olur, iyon akıları durumunda milisaniyeler mertebesinde, protein ve lipit aracılıklı kinaz çağlayanı (cascade) durumunda dakikalar mertebesinde sürer. Çoğu sinyal transdüksiyonu işleminde sinyal ilk uyarandan ileri doğru yayıldıkça bu olaylara katılan protein ve diğer moleküllerin sayısı da artar ve böylece küçük bir sinyal büyük bir tepki doğurabilir; buna "sinyal kaskadı" denir. Bakteri ve diğer tek hücreli organizmalarda, hücrenin sahip olduğu sinyal trasndüksiyon süreçleri onun çevresine nasıl tepki vereceğini belirler. Çok hücreli organizmalarda organizmanın bir bütün olarak çalışmasını sağlamak için bireysel hücrelerin davranışlarını koordine eden pek çok sinyal transdüksiyon süreci gerekmektedir. Tahmin edileceği üzere, bir organizma ne kadar karmaşıksa organizmanın sahip olduğu sinyal transdüksiyon süreçlerinin repertuvarı da o derece karmaşık olmak durumundadır. Dolasıyla hücresel seviyede hem iç hem de dış çevrenin duyumu sinyal transdüksiyonuna dayalıdır. Çoğu hastalık, örneğin diyabet, ateroskleroz, özbağışıklık (otoimmünite), kanser, sinyal transdüksiyon yollarındaki bozukluklardan kaynaklanır. Bu durum, sinyal transdüksiyonunun biyoloji kadar tıpta da olan önemini ortaya koyar.

Moleküler biyolojide bir transkripsiyon faktörü genlerin transkripsiyonunu düzenlemek için DNA üzerinde belli bir diziye bağlanabilen bir proteindir. Bunlar diziye-özgün DNA bağlanma proteini olarak da adlandırılır. Transkripsiyon faktörleri tek başına veya bir komplekste yer alan başka proteinlerle beraber, RNA polimeraz tarafından bir genin transkripsiyonunu ya kolaylaştırırlar veya engeller.

Kalıp tanıma reseptörleri veya PRRler, mikrobiyal patojenler veya hücresel stresle ilgili molekülleri tanımak için bağışıklık sistemi hücrelerince üretilen proteinlerdir. Örnek, desen veya patern tanıma reseptörleri olarak da adlandırılabilmektedirler.

Yağ asitleri birçok organizma için önemli enerji kaynaklarıdır.Artmış glukoz sıklıkla yağ asidine çevrilerek depo edilmektedir. Trigliserdiler aynı miktardaki karbonhidrat ve proteinlerden yaklaşık 2 kat daha fazla enerji vermektedirler. Tüm hücre zarları iki tabakalı fosfolipitlerden oluşur. Yağ asitleri aynı zamanda protein modifikasyonunda da kullanılırlar. Bu nedenle yağ asidi metabolizması, yağ asitlerinin primer metabolitlerinin ve enerjinin oluştuğu katabolizmalarını ve biyolojik olarak oldukça önemli bileşiklerin sentez edildiği anabolizmalarını kapsar.

Biyokimyada reseptör veya almaç, birbiriyle kısmen örtüşen iki anlama karşılık gelir.

Lizofosfatidilkolin (lizoPC) veya lizolesitin, fosfatidilkolin'in sn-2 konumunda hidrolizi sonucu meydan gelen lipittir. İngilizce lysophosphatidylcholine 'in kısaltması lysoPC veya LPC olarak da bilinir. Lizo- öneki, Yunanca λύσις, lysis sözcüğünden, o da lyein = "ayrılmak"tan türemedir. Fosfolipaz aktivitesine sahip enzimler veya lesitin kolesteril asil transferaz (LCAT) gibi asiltransferaz mekanizmalı bazı enzimler bu lipiti oluşturabilir. Lizofosfatidilkolin oluşumu çeşitli sinyal transdüksiyon yollarının adımlarından biridir.

LDL reseptör ilişkili protein 1 insanda LRP1 geni tarafından kodlanan bir proteindir. LRP1, hücre zarında bulunan bir reseptördür ve reseptör eşlikli endositoz yapar. Pek çok proteinle etkileştiği bilinmektedir, bundan dolayı çok çeşitli işlevleri de vardır.

<span class="mw-page-title-main">Protein fosforilasyonu</span>

Protein fosforilasyonu, bir proteine bir fosfat grubu (PO4) eklenmesidir. Protein fosforilasyonu pek çok hücresel süreçte önemli bir rol oynar.

<span class="mw-page-title-main">G proteini</span>

G proteinleri hücrenin dışından gelen sinyalleri hücre içine ileten ve hücre içinde değişiklikler oluşturan bir protein ailesidir.Birçok hormonlar,nörotransmitterler ve diğer sinyal iletim molekülleri sinyallerini hücre içine bu yolla iletir.

Shelterin telomeraz aktivitesini düzenlediği kadar memeli telomerlerini DNA tamir mekanizmasından koruduğu bilinen bir protein kompleksidir. Memelilerde ve diğer ökaryotlarda, telomerik DNA çift- ve tek-sarmal TTAGGG tekrarlarından ve tek-sarmal bir G çıkıntısından oluşmaktadır. Shelterin’in altbirimleri bu bölgelere bağlanır ve DNA-hasar algılama düzeneğini telomerlerin hatalı onarımından engelleyen bir şapka olan t-loop (düğüm) oluşumuna neden olur. Shelterinin kaybı ya da yokluğu telomer kapağının oluşmamasına neden olur ve bu da homolog-olmayan uç birleşimine, senesense veya apoptoza yol açabilecek hasar sinyal yolağını aktive eder.

<span class="mw-page-title-main">Kütle spektrometrisi</span> Kütle ölçer

Kütle spektrometrisi, İngilizce: Mass spectrometry (MS), kimyasal türleri iyonize edip oluşan iyonları Kütle-yük oranını esas alarak sıralayan bir analitik teknik. Daha basit terimler ile, bir kütle spektrumu bir numunen içindeki kütleleri ölçer. Kütle spektrometrisi birçok farklı alanda kullanılır ve kompleks karışımlara uygulandığı kadar saf numunelere de uygulanır.

<span class="mw-page-title-main">Nekroptoz</span> nekroz veya enflamatuar hücre ölümü için programlanmış bir form

Nekroptoz nekroz veya enflamatuar hücre ölümü için programlanmış bir formdur. Geleneksel olarak nekroz, apoptoz yoluyla düzenli olarak programlanmış hücre ölümünün aksine, hücresel hasar veya patojenlerin infiltrasyonundan kaynaklanan programlanmamış hücre ölümü ile ilişkilidir. Nekroptozun keşfi, hücrelerin nekrozu programlanmış bir şekilde yürütebildiğini ve apoptozun her zaman tercih edilen hücre ölümü formu olmadığını göstermiştir. Ayrıca, nekroptozun immünojenik doğası, bağışıklık sistemi tarafından patojenlere karşı savunmaya yardımcı olmak gibi belirli durumlarda katılımını desteklemektedir. Nekroptoz, virüs replikasyonunu kısıtlamak için viral caspase inhibitörlerinin varlığında hücrenin kaspazdan bağımsız bir şekilde "hücresel intihar" geçirmesine izin veren bir viral savunma mekanizması olarak iyi tanımlanmıştır. Nekroptoz, Crohn hastalığı, pankreatit ve miyokardiyal gibi enflamatuar hastalıkların bir bileşeni olarak karakterize edilmiştir.

<span class="mw-page-title-main">Matthias Mann</span>

Matthias Mann, kütle spektrometrisi ve proteomik alanlarında çalışan bilim insanı.

Roman A. Zubarev, Rus bilim insanı. Karolinska Enstitüsü'ndeki Tıbbi Biyokimya ve Biyofizik Bölümü'nde tıbbi proteomik profesörüdür. Araştırmaları biyoloji ve tıpta kütle spektrometrisinin kullanımına odaklanmaktadır.

Üst-alt proteomik, kütle ölçümü ve ardışık kütle spektrometresi (MS/MS) analizi için izole edilmiş bir protein iyonunu depolamak üzere bir iyon yakalayıcı kütle spektrometresi veya MS/MS ile birlikte iki boyutlu jel elektroforezi gibi diğer protein saflaştırma yöntemlerini kullanan bir protein tanımlama yöntemidir. Üst-alt proteomik, yekpare haldeki proteinlerin analizi yoluyla benzersiz proteoformları tanımlama ve niceleme yeteneğine sahiptir. Kütle spektrometresi sırasında yekpare haldeki proteinler tipik olarak elektrosprey iyonizasyon ile iyonize edilir ve bir Fourier dönüşümü iyon siklotron rezonansı, kuadrupol iyon tuzağı veya Orbitrap kütle spektrometresinde tutulur. Ardışık kütle spektrometresi için parçalanma, elektron yakalama ayrışması veya elektron transfer ayrışması ile gerçekleştirilir. Etkili bir parçalanma, kütle spektrometresi tabanlı proteomikten önce numunenin işleme safyası için kritiktir. Proteom analizi rutin olarak yekpare haldeki proteinlerin sindirilmesini ve ardından kütle spektrometresi (MS) kullanılarak elde edilen protein tanımlamasını içerir. Üst-alt MS (jelsiz) proteomik, protein yapısını, yekpare haldeki bir kütlenin ölçümü ve ardından gaz fazında doğrudan iyon ayrışması yoluyla sorgular.

<span class="mw-page-title-main">Kapiler elektroforez kütle spektrometrisi</span> Kapiler elektroforezin sıvı ayırma işleminin kütle spektrometresi ile birleşiminden oluşan bir analitik kimya tekniğidir

Kapiler elektroforez kütle spektrometrisi (CE-MS), kapiler elektroforezin sıvı ayırma işleminin kütle spektrometresi ile birleşiminden oluşan bir analitik kimya tekniğidir. CE-MS, tek bir analizde yüksek ayırma verimliliği ve moleküler kütle bilgisi sağlamak için hem CE hem de MS'nin avantajlarını birleştirir. Yüksek çözünürlük ve hassasiyete sahiptir, minimum hacim gerektirir ve yüksek hızda analiz yapabilir. İyonlar tipik olarak elektrosprey iyonizasyonla oluşturulur ancak matris destekli lazer desorpsiyon/iyonizasyonu veya diğer iyonizasyon teknikleriyle de oluşturulabilirler. Proteomik ve biyomoleküllerin kantitatif analizinde ve klinik tıpta kullanılmaktadır. 1987'deki tanıtımından bu yana, yeni gelişmeler ve uygulamalar CE-MS'i güçlü bir ayırma ve tanımlama tekniği haline getirmiştir.

<span class="mw-page-title-main">Çubuk hücreleri</span> Photoreceptor cells that can function in lower light better than cone cells

Çubuk hücreleri, gözün retinasında bulunan ve diğer görsel fotoreseptör tipi olan koni hücrelerinden daha düşük ışıkta daha iyi işlev görebilen fotoreseptör hücrelerdir. Çubuklar genellikle retinanın dış kenarlarında konsantre olarak bulunur ve çevresel görüşte kullanılır. Ortalama olarak, insan retinasında yaklaşık 92 milyon çubuk hücre vardır. Çubuk hücreler, koni hücrelerden daha hassastır ve gece görüşünden neredeyse tamamen sorumludur. Bununla birlikte, çubuk hücrelerinin renk görmede çok az rolü vardır, bu da renklerin loş ışıkta daha az belirgin olmasından kaynaklanmaktadır.


Bu sayfa, bu Vikipedi makalesine dayanmaktadır.
Metin, CC BY-SA 4.0 lisansı altında mevcuttur; ek koşullar uygulanabilir.
Görseller, videolar ve sesler kendi lisansları altında mevcuttur.