
Sendai Japonya'nın Miyagi prefektörlüğünün merkezi ve Tōhoku bölgesinin en büyük şehridir. 2013 yılı itibarıyla nüfusu 1 milyon olan kent, ayrıca Japonya'nın 20 belirlenmiş şehrinden biridir. 1600 yılında daimyo Date Masamune tarafından kurulan kent, "ağaçların şehri" adıyla da bilinir.

Kobe, Japonya'nın Hyōgo prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir Kansai bölgesinde, Osaka Körfezi'nin kuzeyinde Osaka'nın 30 km batısında yer almaktadır. 1868 yılı itibarıyla ticari anlamda batıya açılan ilk Japon şehirlerden biridir. Kobe yaklaşık 1,5 milyon nüfusu ile Japonya'nın altıncı büyük şehri olup Osaka ve Kyoto ile birlikte Keihanshin metropol alanını oluşturmaktadır. Bu kozmopolit liman kenti, 100'den fazla ülkeden gelen yaklaşık 45.000 yabancı kişiye ev sahipliği yapmaktadır.

Yokohama, Japonya'nın Kanagawa prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir Tokyo Körfezi'nin batısında ve Tokyo'nun yaklaşık 30 km güneyinde yer almaktadır.

Nagasaki, Japonya'nın Nagasaki prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 406,35 km² olan şehrin nüfusu 1 Ocak 2009 tarihi itibarı ile 446.007'dir.

Nagoya Chūbu bölgesi'nin en büyük şehri, en çok nüfuslu dördüncü şehri ve 2020'de 2.3 milyonluk nüfusuyla Japonya'nın en kalabalık üçüncü kentsel bölgesidir. Ülkenin en büyük adası Honshū'adasının orta-güney kesiminde ve Pasifik Okyanusunun kıyısındadır. Nagoya, Aichi Eyaleti'nin başkenti ve en kalabalık şehridir. Şehir, Tokyo, Osaka, Kobe, Yokohama ve Chiba ve Hakata birlikte Japonya'nın en önemli liman şehirlerinden biridir. Nagoya, 2020'deki 10.11 milyon nüfuslu Japonya'nın en kalabalık üçüncü metropolitan alanı Chūkyō metropolitan alanının ana şehridir.

Okayama, Japonya'nın Okayama prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 789.92 km² olan şehrin nüfusu Ekim 2014 tarihi itibarı ile 714,583'tür.

Nara, Japonya'nın Nara prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir, prefektörlüğün kuzeyinde yer almaktadır. Yüzölçümü 276,84 km² olan şehrin nüfusu 1 Ocak 2010 itibarı ile 368.636'dır. Şehirdeki sekiz tapınak, mabet ve kalıntı olan Tōdai-ji, Saidai-ji, Kōfuku-ji, Kasuga-taisha, Gangō-ji, Yakushi-ji, Tōshōdai-ji ve Heijō Sarayı, Kasugayama Ormanı ile birlikte UNESCO Dünya Mirası olan "Antik Nara'nın Tarihi Anıtları"'nı oluşturmaktadır.

Niigata Japonya'nın Niigata prefektörlüğünin merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 726,09 km² olan şehrin nüfusu 31 Ocak 2012 tarihi itibarı ile nüfusu 804.193'tür.

Şizuoka Japonya'nın Şizuoka prefektörlüğünde merkezi ve ikinci büyük şehridir. Yüzölçümü 1.411,90 km² olan şehrin nüfusu 1 Eylül 2015 tarihi itibarı ile nüfusu 703.393'tür.

Kumamoto, Japonya'nın Kumamoto prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 389.53 km² olan şehrin nüfusu 1 Mart 2010 tarihi itibarı ile 731,286'dır. Kumamoto 1 Nisan 1889 yılında kurulmuş olup 1 Nisan 2012 yılında belirlenmiş şehir statüsü almıştır.

Utsunomiya, Japonya'nın Tochigi prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 416,85 km² olan şehrin nüfusu Şubat 2016 tarihi itibarı ile 519.461'dir.

Hakodate, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Oshima alt prefektörlüğünün merkezi ve Hokkaidō'nun üçüncü büyük şehridir. Yüzölçümü 677.89 km² olan şehrin nüfusu 31 Mayıs 2011 tarihi itibarı ile 279,851'dir.

Nagano, Japonya'nın Nagano prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir, prefektörlüğün kuzeyinde Chikuma ve Sai nehirlerinin birleştiği noktada yer almaktadır. Yüzölçümü 834,85 km² olan şehrin nüfusu 1 Nisan 2011 itibarı ile 387.146'dır.

Mito, Japonya'nın Ibaraki prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 217,32 km² olan şehrin nüfusu Eylül 2015 tarihi itibarıyla 270.953'tür.

Takamatsu, Japonya'nın Kagawa prefektörlüğünin merkezi ve en büyük şehridir. Şehir Shikoku adasında Seto İç Denizi kıyısında yer almaktadır. Yüzölçümü 375,11 km² olan şehrin nüfusu 1 Ekim 2010 tarihi itibarı ile 419.429'dur.

Miyazaki, Japonya'nın Miyazaki prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir 1 Nisan 1924 tarihinde kurulmuştur. Yüzölçümü 286,96 km² olan şehrin nüfusu Kasım 2010 itibarı ile 399.834'tür.

Kōfu, Japonya'nın Yamanashi prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 212,47 km² olan şehrin nüfusu 1 Kasım 2015 tarihi itibarı ile 193.127'dir.

Otaru, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Shiribeshi alt prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Yüzölçümü 243.13 km² olan şehrin nüfusu 31 Temmuz 2011 itibarı ile 131,706'dır. Otaru, pek çok tarihi binaları ile birlikte popüler bir turistik yerdir.

Kagoshima, Japonya'nın Kagoşima prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Yüzölçümü 547,05 km² olan şehrin nüfusu 1 Ocak 2010 itibarı ile 605.855'tir. Şehir resmî olarak 1 Nisan 1889 yılında kurulmuştur.

Kitami, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Ohotsk alt prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Yüzölçümü 1,427.56 km² olan şehrin nüfusu 1 Mart 2012 itibarı ile 124,789'dur.