İçeriğe atla

Moleküler grafik sistemleri listesi

Bu, makromolekülleri görselleştirmek için kullanılan önemli yazılım sistemlerinin bir listesidir.[1]

Ad Veri Lisans Teknoloji Alıntılar Yorumlar
AmiraEM MM MRI Optik SMI XRDTescilli[2]Windows, Linux, Mac [3][]OpenInventor/OpenGL tabanlı; yaşam ve biyomedikal bilimlere odaklanıyor.
Ascalaph Designer MM MD QMTescilli C++[4][]Grafikler, model oluşturma, moleküler mekanik, kuantum kimyası.
Avizo EM MM MRI Optik SMI XRDTescilli[5]Windows, Linux, Mac [6][]Avizo, Amira'dan türetilmiştir ve malzeme bilimine odaklanmaktadır.
Avogadro MM XRD MDÖzgür açık-kaynak, GPL C++, Qt, Python modülleri aracılığıyla genişletilebilir
BALL MD MM NMRLGPL açık-kaynak Bağımsız program [7]
Cn3D Özgür açık-kaynak Bağımsız program [8]NCBI C++ araç setinde
CootXRDÖzgür açık-kaynak
Gabedit XRD MMÖzgür açık-kaynak C [9]
JmolÖzgür açık-kaynak Java (applet veya bağımsız program)
Tarayıcı için dönüştürülmüş HTML5/JavaScript
[10][]Bağımsız hareket, yüzeyler ve moleküler orbitaller, boşluk görselleştirme, kristal simetrisi ile birden fazla molekül yükleme gibi gelişmiş yetenekleri destekler.
MDL Chime Tescilli, ticari olmayan kullanım ücretsiz Sadece Windows için C++ tarayıcı eklentisi[11][]Molekül ve periyodik sistemleri (kristal, yapılar, sıvılar...) oluşturun ve görselleştirin, yörüngeleri canlandırın, moleküler orbitalleri, yoğunluğu, elektrostatik potansiyeli görselleştirin... IR, NMR, dielektrik ve optik tensörler gibi grafikleri görselleştirir.
Mol* MM MD NA SMI XRDÖzgür açık-kaynak (MIT) TypeScript (WebGL, React) [12]Şu anda RCSB-PDB ve EMBL/PDBe tarafından kullanılan görüntüleyici. Bir betik dili içerir.
Molden MM XRDTescilli, akademik kullanım ücretsiz [13]
Molecular Operating Environment (MOE) HM MD MM NA QM SMI XRDTescilli Windows, Linux, OS X; SVL programlama dili Küçük moleküller, makromoleküller, protein-ligand kompleksleri, kristal kafesler, moleküler ve özellik yüzeyleri oluşturun, düzenleyin ve görselleştirin. Kapsamlı moleküler modelleme / ilaç keşfi uygulamaları koleksiyonu için platform.
Molekel MM XRDÖzgür açık-kaynak Java 3D applet veya bağımsız program
PyMOL MM XRD SMI EMAçık-kaynak[14]Python[15][]Yazara göre, bilimsel literatürde 3D protein yapılarının yayınlanan tüm görüntülerinin neredeyse 1/4'ü PyMOL ile yapılmıştır.[]
RasMol Özgür açık-kaynak C bağımsız program [16][17][18][]
SAMSON MM MD SMI MRITescilli, sınırlı ücretsiz sürüm Windows, Linux, Mac. C++ (Qt) [19]Hesaplamalı nanobilim: yaşam bilimleri, malzemeler, vb. Modüler mimari, SAMSON Elemanları olarak adlandırılan modüller.
Sirius Özgür açık-kaynak Java 3D applet veya bağımsız program 2011'den itibaren artık desteklenmemektedir.
Scigress MM QMTescilli[20]Bağımsız program [21]Çeşitli moleküler sistemler üzerinde simülasyonları düzenleme, görselleştirme ve çalıştırma.
SpartanMM QMTescilli[22]Bağımsız program [23]Biyomolekülleri görselleştirin ve düzenleyin, daha fazla hesaplama analizi için PDB dosyalarından bağlı ligandları çıkarın, aerodinamik grafik kullanıcı ara yüzü ile tam moleküler mekanik ve kuantum kimyasal hesaplamalar paketi.
UCSF Chimera XRD SMI EM MDÖzgür açık-kaynak (ticari olmayan kullanım için)[24][25]Python[26][27][]Tek/çoklu sekans görüntüleyici, yapı tabanlı sekans hizalama, entegre analizler için otomatik sekans-yapı karışma içerir.[28]
VMD EM MD MMÖzgür açık-kaynak (ticari olmayan kullanım için)[29]C++[30][31][]
WHAT IF HM XRDTescilli, Akademik kullanım için sharewareFortran, C, OpenGL, bağımsız [32][]Eski moda ara yüz; deneyimli biyo-informatikçiler için çok iyi bir yazılım; yaklaşık 2000 protein yapısıyla ilgili seçenek; 500 sayfalık bir dokümanla birlikte geliyor.
YASARA HM NMR XRCTescilli, sınırlı ücretsiz sürüm C-assembly, Windows, Linux, Mac [33][]Yapı tahmini ve yerleştirme dahil olmak üzere tam özellikli moleküler modelleme ve simülasyon programı. Grafik veya metin modu (kümeler), Python ara yüzü.

Anahtar

Aşağıdaki tablo, her bir sistemde hangi veri türlerinin görselleştirilebileceğini göstermektedir:

Ayrıca bakınız

  • Biyolojik veri görselleştirme
  • Nükleik asit simülasyon yazılımları karşılaştırması
  • Moleküler mekanik modelleme yazılımları karşılaştırması
  • Mikroskopi görselleştirme sistemleri listesi
  • Açık kaynaklı biyoinformatik yazılımları listesi
  • Moleküler grafikler
  • Molekül düzenleyici

Kaynakça

  1. ^ O'Donoghue SI, Goodsell DS, Frangakis AS, Jossinet F, Laskowski RA, Nilges M, ve diğerleri. (Mart 2010). "Visualization of macromolecular structures". Nature Methods. 7 (3 Suppl). ss. S42-55. doi:10.1038/nmeth.1427. PMC 7097155 $2. PMID 20195256. 
  2. ^ "Amira commercial license". 31 Mayıs 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Şubat 2024. 
  3. ^ "Amira for Life & Biomedical Sciences". 28 Şubat 2019. 1 Kasım 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Şubat 2019. 
  4. ^ "Ascalaph". 24 Şubat 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Eylül 2009. 
  5. ^ "Avizo commercial license". 31 Mayıs 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Şubat 2024. 
  6. ^ "Avizo, the 3D Visualization and Analysis Software for Scientific and Industrial Data". 26 Eylül 2018. 29 Ocak 2011 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 5 Ağustos 2010. 
  7. ^ Hildebrandt, Andreas (25 Ekim 2010). "BALL - biochemical algorithms library 1.3". BMC Bioinformatics. Cilt 11. s. 531. doi:10.1186/1471-2105-11-531Özgürce erişilebilir. PMC 2984589 $2. PMID 20973958. 
  8. ^ Wang Y, Geer LY, Chappey C, Kans JA, Bryant SH (Haziran 2000). "Cn3D: sequence and structure views for Entrez". Trends in Biochemical Sciences. 25 (6). ss. 300-2. doi:10.1016/S0968-0004(00)01561-9. PMID 10838572. 
  9. ^ "Gabedit A graphical user interface for computational chemistry packages". 6 Ocak 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Şubat 2024. 
  10. ^ "Jmol: an open-source Java viewer for chemical structures in 3D". 18 Kasım 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Eylül 2009. 
  11. ^ "Chime Pro". Symx. 24 Ocak 2009 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Eylül 2009. []
  12. ^ Sehnal, David; Bittrich, Sebastian; Deshpande, Mandar; Svobodová, Radka; Berka, Karel; Bazgier, Václav; Velankar, Sameer; Burley, Stephen K; Koča, Jaroslav; Rose, Alexander S (2 Temmuz 2021). "Mol* Viewer: modern web app for 3D visualization and analysis of large biomolecular structures". Nucleic Acids Research. 49 (W1). ss. W431-W437. doi:10.1093/nar/gkab314. PMC 8262734 $2. PMID 33956157. 
  13. ^ "Molden a visualization program of molecular and electronic structure". 5 Temmuz 2007 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Şubat 2024. 
  14. ^ "PyMOL License". GitHub. 8 Ocak 2010. 27 Mart 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Mart 2023. 
  15. ^ "PyMOL Molecular Viewer". 17 Eylül 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Eylül 2009. 
  16. ^ Sayle RA, Milner-White EJ (Eylül 1995). "RASMOL: biomolecular graphics for all". Trends in Biochemical Sciences. 20 (9). ss. 374-376. doi:10.1016/S0968-0004(00)89080-5. PMID 7482707. 
  17. ^ Bernstein HJ (Eylül 2000). "Recent changes to RasMol, recombining the variants". Trends in Biochemical Sciences. 25 (9). ss. 453-5. doi:10.1016/S0968-0004(00)01606-6. PMID 10973060. 
  18. ^ "Home Page for RasMol and OpenRasMol". 16 Aralık 2009 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Eylül 2009. 
  19. ^ "SAMSON Connect". 21 Şubat 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Şubat 2024. 
  20. ^ "Scigress commercial license". 5 Aralık 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Şubat 2024. 
  21. ^ "Scigress". fqs.pl. 12 Eylül 2014. 1 Ekim 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Şubat 2024. 
  22. ^ "Spartan webpage". 14 Ekim 2009 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Şubat 2024. 
  23. ^ Spartan Tutorial & User's Guide 18 Haziran 2022 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi. 1-890661-38-4
  24. ^ "UCSF Chimera code repository". www.rbvi.ucsf.edu. 27 Mart 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Mart 2023. 
  25. ^ "UCSF Chimera license". 21 Şubat 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Şubat 2024. 
  26. ^ Pettersen EF, Goddard TD, Huang CC, Couch GS, Greenblatt DM, Meng EC, Ferrin TE (Ekim 2004). "UCSF Chimera--a visualization system for exploratory research and analysis". Journal of Computational Chemistry. 25 (13). ss. 1605-12. CiteSeerX 10.1.1.456.9442 $2. doi:10.1002/jcc.20084. PMID 15264254. 
  27. ^ "UCSF Chimera". 31 Ağustos 2009 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Eylül 2009. 
  28. ^ Meng EC, Pettersen EF, Couch GS, Huang CC, Ferrin TE (Temmuz 2006). "Tools for integrated sequence-structure analysis with UCSF Chimera". BMC Bioinformatics. Cilt 7. s. 339. doi:10.1186/1471-2105-7-339Özgürce erişilebilir. PMC 1570152 $2. PMID 16836757. 
  29. ^ "Visual Molecular Dynamics license". 21 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Şubat 2024. 
  30. ^ Humphrey W, Dalke A, Schulten K (Şubat 1996). "VMD: visual molecular dynamics". Journal of Molecular Graphics. 14 (1). ss. 33-8, 27-8. doi:10.1016/0263-7855(96)00018-5. PMID 8744570. 
  31. ^ "VMD - Visual Molecular Dynamics". 23 Eylül 2009 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Eylül 2009. 
  32. ^ "WHAT IF homepage". 1 Mayıs 2011 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Eylül 2009. 
  33. ^ "YASARA – Yet Another Scientific Artificial Reality Application". 10 Şubat 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Eylül 2009. 

Dış bağlantılar

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">DNA</span> Canlıların genetik bilgilerini barındıran molekül

Deoksiriboz nükleik asit veya kısaca DNA, tüm organizmaların ve bazı virüslerin canlılık işlevleri ve biyolojik gelişmeleri için gerekli olan genetik talimatları taşıyan bir nükleik asittir. DNA'nın başlıca rolü bilgiyi uzun süre saklamasıdır. Protein ve RNA gibi hücrenin diğer bileşenlerinin inşası için gerekli olan bilgileri içermesinden dolayı DNA; bir kalıp, şablon veya reçeteye benzetilir. Bu genetik bilgileri içeren DNA parçaları gen olarak adlandırılır. Bazı DNA dizilerinin yapısal işlevleri vardır, diğerleri ise bu genetik bilginin ne şekilde kullanılacağının düzenlenmesine yararlar.

<span class="mw-page-title-main">Biyofizik</span> Fiziksel bilimlerdeki yöntemleri kullanarak biyolojik sistemlerin incelenmesi

Biyofizik, biyolojik olayları incelemek için fizikte geleneksel olarak kullanılan yaklaşım ve yöntemleri uygulayan disiplinler arası bir bilimdir. Biyofizik, moleküler seviyeden organizma ve popülasyon seviyesine kadar tüm biyolojik organizasyon ölçeklerini kapsar. Biyofiziksel araştırmalar biyokimya, moleküler biyoloji, fizikokimya, fizyoloji, nanoteknoloji, biyomühendislik, hesaplamalı biyoloji, biyomekanik, gelişim biyolojisi ve sistem biyolojisi ile önemli ölçüde örtüşmektedir.

Bir gen bir enzim hipotezi, genlerin enzimler aracılığıyla etkilerini gösterdiği fikridir, öyle ki her gen bir enzimin üretiminden sorumludur, o enzim de metabolik bir yolakta bir adıma etki eder. Bu kavram George Beadle ve Edward Tatum tarafından Neurospora crassa küfündeki genetik mutasyonlar hakkındaki önemli bir makalede ilk defa dile getirilmiş, daha sonra iş arkadaşları Norman Horowitz tarafından "Bir gen bir enzim hipotezi" olarak adlandırılmıştır. Sonraları moleküler biyoloji olarak adlandırılacak bilim dalının ilk önemli buluşu sayılmasına rağmen, bu fikrin kısa süre sonra aşırı basit olduğu anlaşılmıştır. Daha sonradan "bir gen-bir polipeptit" olarak yeniden ifade edildikten sonra dahi günümüzde genler ile proteinler arasındaki ilişkiyi açıklamakta yetersiz sayılmaktadır. Ökaryotlarda alternatif alternatif uçbirleştirme ile bir genden çeşitli proteinlerin üretilebilmesi bir gen-bir polipeptit hipotezi ile uyuşmamaktadır.

<span class="mw-page-title-main">Arthur Harden</span>

Sir Arthur Harden İngiliz biyokimyacı. 1929 yılında, Hans von Euler-Chelpin ile birlikte, "şekerin fermantasyonu ve fermantatif enzimler üzerine araştırmaları için" Nobel Kimya Ödülü'ne nail görülmüştür.

<span class="mw-page-title-main">Elizabeth Blackburn</span> Avustralyalı-Amerikalı araştırmacı

Elizabeth Helen Blackburn Avustralya doğumlu Amerikalı moleküler biyolog. Kromozomların uç kısımlarında bulunan ve kromozomları koruyan telomer isimli yapılarla ilgili çalışmalarıyla bilinir. Telomer yapımında etkin telomeraz enziminin kaşifleri arasındadır. Bu çalışmalarından dolayı 2009 yılında Carol W. Greider ve Jack W. Szostak ile birlikte Nobel Fizyoloji veya Tıp Ödülü'nü kazandı. Tıbbi etik üzerine de çalışmaları vardır.

<span class="mw-page-title-main">François Jacob</span> Fransız biyokimyager (1920-2013)

François Jacob, Fransız biyolog. 1965 yılında Jacques Monod ve André Lwoff ile birlikte Nobel Fizyoloji veya Tıp Ödülü kazanmıştır.

<span class="mw-page-title-main">George Emil Palade</span> Romanyalı biyolog

George Emil Palade, Romanya doğumlu hücre biyoloğu. Şimdiye kadarki "en etkili hücre biyoloğu" olarak tanımlanır. 1974 yılında Nobel Fizyoloji veya Tıp Ödülü'nü Albert Claude ve Christian de Duve ile birlikte kazanmıştır. Ödül kendisine elektron mikroskobu çalışmalarındaki yenilikleri ve hücre yapısıyla ilgili yaptığı çalışmalar sayesinde hücre biyolojisine getirdiği yenilikler nedeniyle verilmiştir. En önemli keşifleri ilk kez 1955 yılında tanımladığı ribozomlar ve endoplazmik retikulum ile ilgili olanlardır.

<span class="mw-page-title-main">Frederick Sanger</span>

Frederick Sanger, İngiliz biyokimyager. 1958 ve 1980 yıllarında 2 kez Nobel Kimya Ödülü kazanmıştır. 1958 yılında "proteinlerin, özellikle de insülinin yapısı üzerine çalışmaları için" Nobel Kimya Ödülü kazanmıştır ve bu ödülü aynı kategoride 2 kez kazanan tek kişidir. 1980 yılında da "nükleik asitlerdeki baz dizilerinin belirlenmesiyle ilgili katkıları nedeniyle" Walter Gilbert ile birlikte bu ödülü kazanmıştır. Aynı yıl ayrıca Paul Berg, "nükleik asitlerin, özellikle de rekombinant DNA'nın biyokimyası üzerine temel çalışmaları için" ödülü kazanan diğer isim olmuştur.

Helyum hidrür iyonu ya da hidrohelyum(1+) katyonu, HeH+, bir protonun gaz hâlindeki bir helyum atomu ile reaksiyona girmesi sonunda oluşan pozitif yüklü bir iyondur. İlk olarak 1925'te keşfedildi ve moleküler hidrojen ile izoelektroniktir. 177,8 kJ/mol proton ilgisi ile bilinen en güçlü asittir. Bu iyon aynı zamanda Helyum hidrür moleküler iyonu olarak da anılır. Doğal olarak yıldızlararası maddede bulunduğu öne sürülmüştür. En basit heteronükleer iyondur ve hidrojen moleküler iyon, H+2 ile karşılaştırılabilir. Ancak H+2'den farklı olarak, spectroskopik karakterizasyonunu kolaylaştıran kalıcı moleküler kutuplaşması vardır.

<span class="mw-page-title-main">Michael Levitt</span>

Michael Levitt, İsrail asıllı Amerikan biyofizikçidir. 2013 yılında Nobel Ödülü kazanmıştır.

İşleme cisimciği ökaryot hücrelerin sitoplazmasındaki mRNA döngüsünde birçok enzim içeren ayrı odaklardır. P cisimciği, omurgalılar ve omurgasızların somatik hücrelerinde, bitkiler ve mantarlarda gözlenmiştir. Bugüne kadar, P cisimciği genel mRNA bozulmasında, anlamsız aracılı mRNA bozulmasında, adenilat üridilat zengin element aracılıklı mRNA bozulması ve microRNA tetikli mRNA susturulmasında önemli rol oynar. P cisimciğine giren bütün mRNAlar sindirilmezler. Bazıları P cisimciğinde kalabilir ve translasyonu yeniden başlatabilirler. Saflaştırılmış P cisimciğindeki mRNAların saflaştırılması ve sekanslanması bu mRNAların çoğunlukla translasyonel olarak bastırıldığını ve 5' mRNA bozulmasından korunduğunu gösterdi.

<span class="mw-page-title-main">Moleküler mekanik</span>

Moleküler mekanik moleküler sistemleri modellemek için klasik mekaniği kullanır. Born-Oppenheimer yaklaşımının geçerli olduğu varsayılır ve tüm sistemlerin potansiyel enerjisi, kuvvet alanları kullanılarak nükleer koordinatların bir fonksiyonu olarak hesaplanır. Moleküler mekanik, boyutu birkaç atom büyüklüğünde olan sistemlerden tutun da milyonlarca atomdan oluşan büyük sistemlere kadar uygulanabilir.

Bu liste, nükleik asit simülasyonları için kullanılan bilgisayar programlarının bir listesidir.

<span class="mw-page-title-main">Neoaves</span>

Neoaves, Paleognathae ve Galloanserae hariç tüm modern kuşları içeren bir kladdır. Bilinen yaklaşık 10.000 modern kuş türünün neredeyse %95'i Neoaves kladına dahildir.

<span class="mw-page-title-main">Sauropsida</span> dört üyeli omurgalılar grubu

Sauropsida, büyük ölçüde Reptilia sınıfına eşdeğer olan bir amniyot grubudur. Sauropsida, memelileri içeren amniyotların kladı olan Synapsida'nın kardeş taksonudur. Erken sinapsidler tarihsel olarak "memeli benzeri sürüngenler" olarak anılsa da, tüm sinapsidler, herhangi bir modern sürüngenden çok memelilerle daha yakından ilişkilidir. Sauropsidler ise memelilerden çok modern sürüngenlerle daha yakından ilişkili tüm amniyotları içerir. Buna, Linnaean taksonomisinde başlangıçta ayrı bir sınıf olarak adlandırılmasına rağmen, şu anda arkosauriyen sürüngenlerinin bir alt grubu olarak tanınan Aves (kuşlar) dahildir.

<span class="mw-page-title-main">Opisthokont</span>

Opisthokontlar, hem hayvan hem de mantar alemlerini içeren geniş bir ökaryot grubudur. Daha önce "Fungi / Metazoa grubu" olarak adlandırılan opisthokontlar, genellikle bir sınıf olarak tanınır. Opisthokontlar, Apusomonadida ve Breviata ile birlikte daha büyük Obazoa kladını oluşturur.

<span class="mw-page-title-main">Viridiplantae</span>

Viridiplantae, yaklaşık 450.000-500.000 tür içeren ve hem karasal hem de sucul ekosistemlerde önemli roller oynayan ökaryotik canlılar grubudur. Öncelikle sucul olan yeşil algler ve içlerinden çıkan kara bitkilerinden oluşurlar. Yeşil algler, geleneksel sınıflandırmada kara bitkilerini içermez ve bu da yeşil algleri parafiletik bir grup yapar. Kara bitkilerinin yeşil alglerin içinden çıktığının anlaşılmasından bu yana, bazı yazarlar bitkileri de yeşil alglere atıyorlar. Hücre duvarlarında selüloz bulunan hücrelere ve klorofil a ve b içeren ve fikobilin içermeyen siyanobakterilerle endosimbiyozdan türetilen birincil kloroplastlara sahiptirler.

<span class="mw-page-title-main">Moleküler tanı</span>

Moleküler tanı, moleküler yöntemlerle hastalıklara tanı koymayı amaçlayan bir disiplindir. Moleküler tanı, genomdaki ve proteomdaki biyolojik belirteçleri ve hücrelerinin genlerini protein olarak nasıl ifade ettiğini, moleküler biyolojiyi tıbbi testlere uygulayarak analiz etmek için kullanılan tekniklerin bir koleksiyonudur. Tıpta hastalığı teşhis etmek ve izlemek, riski tespit etmek ve bireysel hastalar için en iyi hangi tedavilerin işe yarayacağına karar vermek ve tarımsal biyogüvenlikte benzer şekilde mahsul ve hayvan hastalıklarını izlemek, riski tahmin etmek ve hangi karantina önlemlerine karar vermek için kullanılmaktadır.

<span class="mw-page-title-main">Tityridae</span>

Tityridae, Neotropikal biyocoğrafik bölgesinde ormanlarda ve ağaçlık alanlarda yaşayan kuşlardan oluşan, Passeriformes takımında sınıflandırılan bir kuş familyasıdır. Bu familya yer alan 45 tür önceden Tyrannidae, Pipridae ve Cotingidae familyalarında sınıflandırılıyordu. Hepsi küçük ve orta boylarda kuşlardır. Iodopleura pipra türünün boyu 9,5 cm, ağırlığı 10 g. iken Tityra semifasciata türünün boyu 24 cm. ağırlığı da 88 g. civarındadır. Çoğunun kuyruğu görece kısa, kafaları da büyüktür.

<span class="mw-page-title-main">Protein-protein etkileşimi</span>

Protein-protein etkileşimleri (PPE), iki veya daha fazla protein molekülü arasında kurulan yüksek spesifikliğe sahip fiziksel temaslardır. Hidrojen bağı, elektrostatik kuvvetler ve hidrojen bağı gibi etkileşimlerin yönlendirdiği biyokimyasal olaylardır.