İçeriğe atla

Majör bazik protein

PRG2
Uygun yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Başka adlarPRG2, BMPG, proMBP, MBP, MBP1, proteoglikan 2 - kemik iliği (öldürücü hücre aktivatörü, eozinofil granülü majör bazik proteini), proteoglikan 2 - pro-eozinofil major bazik proteini
Dış kimliklerOMIM: 605601 MGI: 103294 HomoloGene: 2044 GeneCards: PRG2
Gen yerleşimi (İnsan)
11. Kromozom (insan)
Krom.11. Kromozom (insan)[1]
11. Kromozom (insan)
PRG2 için genom yerleşimi
PRG2 için genom yerleşimi
Bant11q12.1Başlangıç57,386,780 [1]
Bitiş57,390,650 [1]
RNA ekspresyonu deseni
Daha çok ekspresyon verisi başvurusu
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_002728
NM_001243245
NM_001302926
NM_001302927

NM_008920

RefSeq (protein)

NP_001230174
NP_001289855
NP_001289856
NP_002719

NP_032946

Yerleşim (UCSC)Krom. 11: 57.39 – 57.39 Mbn/a
PubMed araması[2][3]
Vikiveri
İnsan'ı Gör/DüzenleFare'yi Gör/Düzenle

Eozinofil majör bazik proteini veya genellikle kısaltılmış olarak majör bazik protein (MBP; ayrıca Proteoglikan 2 (PRG2) olarak da adlandırılmaktadır), insanlarda PRG2 geni tarafından kodlanmaktadır.[4]

İşlev

Bu gen tarafından kodlanan protein, eozinofil granülünün kristal çekirdeğinin baskın bir bileşenidir. Bu proteinin proformu, plasenta ve gebelik serumunda da yüksek düzeyde bulunur, burada gebelikle ilişkili plazma proteini A (PAPPA), anjiyotensinojen (AGT) ve C3dg de içinde olmak üzere diğer birçok proteinle kompleks halinde bulunur. Bu protein, sitotoksin ve helmint toksini olarak antiparazitik savunma mekanizmalarına ve immün aşırıduyarlılık tepkimelerine girebilir. Alerji hastalıklarında epitelyal hücre hasarı, eksfoliyasyon ve bronkospazm ile doğrudan ilişkilidir.[4]

PRG2, eozinofil granüllerinde baskın olan 117-kalıntı proteinidir. Helmintlere karşı etkili bir enzimdir ve in vitro bakteri ve memeli hücrelerine karşı toksiktir. Eozinofil majör bazik protein ayrıca mast hücrelerinden ve bazofillerden histamin salınmasını sağlar ve nötrofiller ile alveoler makrofajları etkinleştirir.

Yapı

Yapısal olarak majör bazik protein, lektinler (şeker bağlayıcı proteinler) ile benzerdir ve C tipi lektinlerde görülene benzer bir katlantıya sahiptir. Bununla birlikte diğer C tipi lektinlerden (bunlar, kalsiyum varlığında çeşitli karbonhidratları bağlayanlardır) farklı olarak MPB, kalsiyumu veya bu ailenin tanıdığı diğer karbonhidratların hiçbirini bağlamaz.

Bunun yerine MBP, heparan sülfat proteoglikanlarını tanır. MBP'nin iki kristalografik yapısı belirlenmiştir.[5][6]

Etkileşimler

Majör bazik proteinin gebelik ile ilişkili plazma proteini A ile etkileşime girdiği gösterilmiştir.[7][8][9]

Ayrıca bakınız

  • Arilsülfataz

Kaynakça

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000186652 - Ensembl, May 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  3. ^ "Fare PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ a b "Entrez Gene: PRG2 proteoglycan 2, bone marrow (natural killer cell activator, eosinophil granule major basic protein)". 2 Kasım 2008 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  5. ^ PDB: 1h8u​; "Crystal structure of the eosinophil major basic protein at 1.8 A. An atypical lectin with a paradigm shift in specificity". J. Biol. Chem. 276 (28). Temmuz 2001. ss. 26197-26203. 
  6. ^ PDB: 2brs​; "Eosinophil-granule major basic protein, a C-type lectin, binds heparin". Biochemistry. 44 (43). Kasım 2005. ss. 14152-14158. 
  7. ^ Overgaard (Ekim 2000). "Expression of recombinant human pregnancy-associated plasma protein-A and identification of the proform of eosinophil major basic protein as its physiological inhibitor". J. Biol. Chem. 275 (40). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 31128-31133. 
  8. ^ "Complex of pregnancy-associated plasma protein-A and the proform of eosinophil major basic protein. Disulfide structure and carbohydrate attachment". J. Biol. Chem. 278 (4). Amerika Birleşik Devletleri. Ocak 2003. ss. 2106-2117. 
  9. ^ Oxvig (Haziran 1993). "Circulating human pregnancy-associated plasma protein-A is disulfide-bridged to the proform of eosinophil major basic protein". J. Biol. Chem. 268 (17). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 12243-6. 

Konuyla ilgili yayınlar

Dış bağlantılar

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">DNA</span> Canlıların genetik bilgilerini barındıran molekül

Deoksiriboz nükleik asit veya kısaca DNA, tüm organizmaların ve bazı virüslerin canlılık işlevleri ve biyolojik gelişmeleri için gerekli olan genetik talimatları taşıyan bir nükleik asittir. DNA'nın başlıca rolü bilgiyi uzun süre saklamasıdır. Protein ve RNA gibi hücrenin diğer bileşenlerinin inşası için gerekli olan bilgileri içermesinden dolayı DNA; bir kalıp, şablon veya reçeteye benzetilir. Bu genetik bilgileri içeren DNA parçaları gen olarak adlandırılır. Bazı DNA dizilerinin yapısal işlevleri vardır, diğerleri ise bu genetik bilginin ne şekilde kullanılacağının düzenlenmesine yararlar.

<span class="mw-page-title-main">MikroRNA</span> yaklaşık 21-23 nükleotit uzunluğunda tek iplikli RNA molekülü türü

Genetikte, mikroRNA (miRNA) yaklaşık 21-23 nükleotit uzunluğunda tek iplikli RNA molekülü türüdür, gen ifadesinin düzenlenmesinde rol oynar. miRNA'lar kodlamayan RNA'lardandır, yani DNA'dan transkripsiyonu yapılan ama proteine çevirisi yapılmayan genler tarafından kodlanırlar. Pri-miRNA olarak adlandırılan primer transkriptler işlenerek, önce pre-miRNA adlı kısa sap-ilmik yapılarına, sonra da fonksiyonel miRNA'ya dönüşürler. Olgun miRNA moleküller bir veya daha çok mesajcı RNA (mRNA) ile kısmî tamamlayıcıdır ve başlıca işlevleri gen ifadesini aşağı ayarlamaktır. 1993'te Lee ve çalışma arkadaşları tarafından Victor Ambros laboratuvarında keşfedilmişlerdir, ancak mikroRNA terimi ilk 2001'de kullanıma girimiştir.

Hepatik trigliserit lipaz veya hepatik triasilgliserol lipaz, yaygın adıyla da Hepatik lipaz, karaciğer, adrenal bezler ve yumurtalıkta, ayrıca makrofajlarda bulunan bir lipazdır. LIPC geni tarafından kodlanan hepatik lipazın iki işlevi vardır: trigliserit lipaz ve reseptör aracılıklı lipoprotein alımı.

Çöpçü reseptör sınıf B, tip I, çeşitli hücrelerde görülen bir entegral membran proteinidir. Yüksek yoğunluklu lipoproteinlerdeki (HDL) kolesteril esterin karaciğer tarafından alınmasını sağlar. Vücuttaki diğer dokulardan karaciğere doğru, vücuttan atılmak üzere, giden kolesterolün bu hareketi bu süreç sayesinde sürdürülür. Kolesterolün bu gidişi "ters kolesterol taşıması" olarak adlandırılır ve ateroskleroz oluşumuna karşı koruyucu bir mekanizma olarak işler.

<span class="mw-page-title-main">RAD51</span>

RAD51, bir insan genidir, bu genin ürünü olan ve aynı isme sahip olan protein DNA çift iplikçikli kesiklerini tamir eder. Bu protein RAD51 protein ailesinin üyelerinden biridir. RAD51 protein ailesi üyeleri bakteriyel RecA ve maya Rad51 ile homologdur. Protein, mayadan insana kadar çoğu ökaryotta korunmuştur.

<span class="mw-page-title-main">Phillip Allen Sharp</span> Amerikalı biyolog

Phillip Allen Sharp, Amerikan genetikçi ve moleküler biyolog. RNA bağlanmasının kaşiflerinden biridir. Richard J. Roberts ile birlikte ökaryot hücrelerinin DNA dizelerindeki genlerin bitişik sırada olmadığını, aralarda intron denilen okunmayan ve protein sentezine katılmayan bölümlerin olduğunu keşfettiler. Bu sayede mRNA'lar aynı DNA dizesinden bu bölümleri farklı şekilde silmeleri ile farklı proteinleri kodlayabilmektedir. İkili bu keşifleri ile 1993 Nobel Fizyoloji veya Tıp Ödülünü kazanmışlardır.

Moleküler biyolojide 7SK, metazoan'da bol bulunan küçük bir nükleer RNA`dır. Pozitif transkripsiyon uzatma faktörünün P-TEFb kontrol transkripsiyonunu düzenlemede önemli bir rol oynar. 7SK kompleksinin stabilitesi ve fonksiyonunu düzenleyen diğer proteinler küçük bir nükleer ribonükleoprotein kompleksinde (snRNP) bulunur.

TERC olarak da bilinen telomeraz RNA bileşeni ökaryotlarda bulunan ve telomerazın bir bileşeni olan Kodlamayan RNA'dır. TERC, telomeraz ile telomer replikasyonu için bir kalıp görevi görür. Telomeraz RNA'ları dizi ve yapı açısından omurgalılar, siliatlar ve mayalar arasında büyük farklılıklar gösterir, ancak şablon dizisine yakın bir 5 'sahte düğüm yapıyı paylaşmaktadırlar. Omurgalı telomeraz RNA'larının, 3 'H / ACA snoRNA benzeri alanı vardır.

<span class="mw-page-title-main">CD59</span>

CD59 glikoproteini, MAC baskılayıcı protein (MAC-IP), membran reaktif liziz inhibitörü veya protektin olarak da bilinen, insanlarda CD59 geni tarafından ile kodlanan bir proteindir. LY6/uPAR/alfa-nörotoksin protein ailesine aittir.

<span class="mw-page-title-main">ARHGAP1</span> insanlarda bulunan protein kodlama geni

Rho GTPaz etkinleştirici protein 1, insanlarda ARHGAP1 geni tarafından kodlanan bir enzimdir.

<span class="mw-page-title-main">ARL2</span>

ADP-ribozillenme faktörü benzeri protein 2, insanlarda ARL2 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">Arrestin beta 1</span>

Arrestin beta 1 , insanlarda ARRB1 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">CHKA</span>

Kolin kinaz alfa, insanlarda CHKA geni tarafından kodlanan bir enzimdir.

NADPH oksidaz 3, insanlarda NOX3 geni tarafından kodlanan bir enzimdir.

NOX5, insanlarda NOX5 geni ile kodlanan protein.

<span class="mw-page-title-main">Faj gösterimi</span>

Faj gösterimi, proteinleri kodlayan genetik bilgilerle proteinleri birbirine bağlamak için bakteriyofajları kullanan protein-protein, protein-peptit ve protein-DNA etkileşimlerinin incelenmesi için bir laboratuvar tekniğidir. Bu teknikte, ilgilenilen bir proteini kodlayan bir gen, bir faj kapsit proteini genine eklenir. Bu durumda faj, proteinin genini içeride barındırırken, proteini dış tarafında da "gösterir". Böylece genotip ile fenotip arasında bir bağlantı kurulmuş olur. Proteini görüntüleyen fajlar daha sonra, görüntülenen protein ile diğer moleküller arasındaki etkileşimi saptamak için diğer proteinlere, peptidlere veya DNA dizilerine karşı taranabilir. Bu şekilde, büyük protein kütüphaneleri, doğal seçilim ile benzer olan in vitro seçilim adı verilen bir süreçte taranabilir ve çoğaltılabilir.

<span class="mw-page-title-main">Amilin</span>

Amilin veya adacık amiloid polipeptidi (IAPP), 37 kalıntılı peptit hormonudur. Pankreasın β hücrelerinden yaklaşık 100:1 (insülin:amilin) oranında insülin ile eşgüdümlü olarak salgılanmaktadır. Amilin, mide boşalmasını yavaşlatarak ve tokluğu artırarak glisemik düzenlemede rol oynamaktadır, böylelikle yemek sonrasında kan şekeri düzeylerindeki ani artışları önlemektedir.

<span class="mw-page-title-main">40S ribozomal protein S3</span>

40S ribozomal protein S3, insanların 11. kromozomunda yer alan RPS3 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">40S ribozomal protein S2</span>

40S ribozomal protein S2, insanların 11. kromozomunda yer alan RPS2 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">CD81</span>

CD81 molekülü, ayrıca 81. Başkalaşım Kümesi olarak da bilinir, insanların 11. kromozomunda yer alan CD81 geni tarafından kodlanan bir proteindir.