Utsunomiya, Japonya'nın Tochigi prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 416,85 km² olan şehrin nüfusu Şubat 2016 tarihi itibarı ile 519.461'dir.
Asahikawa, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Kamikawa alt prefektörlüğünün merkezi ve Hokkaidō'nun ikinci büyük şehridir. Yüzölçümü 747.6 km² olan şehrin nüfusu 30 Temmuz 2011 tarihi itibarı ile 352.105'tir.
Morioka, Japonya'nın Iwate prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 886,47 km² olan şehrin nüfusu 1 Şubat 2021 tarihi itibarı ile tahmini nüfusu 290.700'dür ve nüfus yoğunluğu kilometrekarede 328'dir.
Japonya'nın bölgeleri, Japonya'nın coğrafi bölgeleridir. Resmî bir idari bölüm olmayıp geleneksel olarak birçok bağlamda bölgesel bölümler olarak kullanılmıştır. Örneğin, harita ve coğrafya ders kitapları ülkeyi sekiz bölgeye ayırmakta, hava durumu raporlarında hava durumu genellikle bölgelere göre verilmekte ve birçok işletme ve kurum bulundukları bölgenin adını kendi adlarında kullanmaktadırlar.
Yokosuka, Japonya'nın Kanagawa prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir, prefektörlüğün güneydoğusunda, Miura Yarımadası'nın ortasında ve Tokyo ve Sagami körfezlerinin arasında yer almaktadır. Yüzölçümü 100.7 km² olan şehrin nüfusu 1 Haziran 2012 itibarı ile 414,960'tır.
Toyohashi, Japonya'nın Aichi prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir prefektörlüğün güneydoğusunda, Atsumi Yarımadası'nın girişinde ve Mikawa Körfezi kıyısında yer almakta olup Shizuoka prefektörlüğü ile komşudur. Yüzölçümü 261.86 km² olan şehrin nüfusu 1 Ocak 2010 itibarı ile 372,710'dur. Toyohashi, 1 Ağustos 1906 tarihinde kurulmuştur.
Nishinomiya, Japonya'nın Hyōgo prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Yüzölçümü 99.96 km² olan şehrin nüfusu 1 Ekim 2010 tarihi itibarı ile 483.598'dir.
Kurashiki, Japonya'nın Okayama prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir, Seto İç Denizi kıyısında ve Takahashi Nehri'nin üzerinde yer almaktadır. Yüzölçümü 354.71 km² olan şehrin nüfusu Kasım 2012 tarihi itibarı ile 477,983'tür.
Ichinomiya, Japonya'nın Aichi prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir prefektörlüğün kuzeybatısında yer almaktadır. Yüzölçümü 113.82 km² olan şehrin nüfusu Mart 2015 tarihi itibarı ile 378,829'dur.
Hirakata, Japonya'nın Osaka prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir prefektörlüğün kuzeydoğusunda, Osaka ile Kyoto'nun arasında ve Yodo Nehri'nin kıyısında yer almaktadır. Yüzölçümü 65.08 km² olan şehrin nüfusu 1 Ağustos 2011 tarihi itibarı ile 407,465'tir.
Kiyosu, Japonya'nın Aichi prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir prefektörlüğün batısında yer almaktadır. Yüzölçümü 17.32 km² olan şehrin nüfusu 1 Ocak 2010 itibarı ile 65,680'dir.
Okazaki, Japonya'nın Aichi prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir prefektörlüğün güneydoğusunda yer almaktadır. Yüzölçümü 387.24 km² olan şehrin nüfusu Mayıs 2015 tarihi itibarı ile 376,912'dir.
Suita, Japonya'nın Osaka prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir 1 Nisan 1940 tarihinde kurulmuştur. Yüzölçümü 36.11 km² olan şehrin nüfusu 1 Ağustos 2011 tarihi itibarı ile 356,751'dir.
Japonya'nın şehirleri, Japonya'nın yerel idari bölümlerinden biridir. Şehirler, kasaba ve köyler ile birlikte belediye düzeyinde idari bölümlerdir ancak ilçelere bağlı değildirler. Şehirler diğer idari bölümler gibi 1947 Yerel Özerklik Kanunu ile tanımlanırlar.
Chitose, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Ishikari alt prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir 1 Temmuz 1958 tarihinde kurulmuştur. Yüzölçümü 594.95 km² olan şehrin nüfusu Mart 2008 tarihi itibarı ile 92,323'tür.
Takikawa, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Sorachi alt prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Yüzölçümü 115.82 km² olan şehrin nüfusu 31 Ocak 2012 tarihi itibarı ile 43,270'tir. Takikawa 1 Temmuz 1958 tarihinde şehir statüsü almıştır.
Yamato, Japonya'nın Kanagawa prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir prefektörlüğün kuzey orta kesiminde yer almaktadır. Yüzölçümü 27.06 km² olan şehrin nüfusu 1 Temmuz 2012 tarihi itibarı ile 230,709'dur.
Japonya'nın kasabaları, Japonya'nın yerel idari bölümlerinden biridir. Coğrafi olarak kasabalar prefektörlüklere bağlıdır. Kasabalar idari olarak şehir ve köy arasında belediyelerdir.
Chigasaki, Japonya'nın Kanagawa prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Şehir prefektörlüğün güney orta kısmında Sagami Nehri'nin doğu kıyısında yer almaktadır. Yüzölçümü 35.71 km² olan şehrin nüfusu 1 Haziran 2012 tarihi itibarı ile 236,177'dir. Chigasaki 1 Ekim 1947 tarihinde kurulmuştur.
Japonya'nın prefektörlükleri, Japonya'nın birinci düzey idari bölümleridir. Ülkede 47 adet prefektörlük bulunmaktadır. Prefektörlüklerin 43 tanesi normal prefektörlük , ikisi kentsel prefektörlük , biri bölge ve biri metropoldür . Prefektörlükler ilk defa 1868 yılında Meiji Restorasyonu sırasında kurulmuşlardır.