Sendai Japonya'nın Miyagi prefektörlüğünün merkezi ve Tōhoku bölgesinin en büyük şehridir. 2013 yılı itibarıyla nüfusu 1 milyon olan kent, ayrıca Japonya'nın 20 belirlenmiş şehrinden biridir. 1600 yılında daimyo Date Masamune tarafından kurulan kent, "ağaçların şehri" adıyla da bilinir.
Sapporo, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğünün merkezi ve bölgenin en büyük şehridir.
Yokohama, Japonya'nın Kanagawa prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir Tokyo Körfezi'nin batısında ve Tokyo'nun yaklaşık 30 km güneyinde yer almaktadır.
Fukuşima, Japonya'nın Fukuşima prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Şehir prefektörlüğün kuzeyinde Nakadōri bölgesinde, başkent Tokyo'nun yaklaşık 250 km güneyinde ve Abukuma Nehri'nin yakınında yer almaktadır. Yüzölçümü 746.43 km² olan şehrin nüfusu 1 Mayıs 2011 tarihi itibarı ile 290,064'tür.
Nara, Japonya'nın Nara prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir, prefektörlüğün kuzeyinde yer almaktadır. Yüzölçümü 276,84 km² olan şehrin nüfusu 1 Ocak 2010 itibarı ile 368.636'dır. Şehirdeki sekiz tapınak, mabet ve kalıntı olan Tōdai-ji, Saidai-ji, Kōfuku-ji, Kasuga-taisha, Gangō-ji, Yakushi-ji, Tōshōdai-ji ve Heijō Sarayı, Kasugayama Ormanı ile birlikte UNESCO Dünya Mirası olan "Antik Nara'nın Tarihi Anıtları"'nı oluşturmaktadır.
Fukuoka, Japonya'nın Fukuoka prefektörlüğünün merkezi ve Kyūshū bölgesinin en büyük şehridir.
Niigata Japonya'nın Niigata prefektörlüğünin merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 726,09 km² olan şehrin nüfusu 31 Ocak 2012 tarihi itibarı ile nüfusu 804.193'tür.
Kumamoto, Japonya'nın Kumamoto prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 389.53 km² olan şehrin nüfusu 1 Mart 2010 tarihi itibarı ile 731,286'dır. Kumamoto 1 Nisan 1889 yılında kurulmuş olup 1 Nisan 2012 yılında belirlenmiş şehir statüsü almıştır.
Toyama, Japonya'nın Toyama prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 1.241,85 km² olan şehrin nüfusu 31 Mayıs 2011 tarihi itibarı ile 417.324'tür.
Nagano, Japonya'nın Nagano prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir, prefektörlüğün kuzeyinde Chikuma ve Sai nehirlerinin birleştiği noktada yer almaktadır. Yüzölçümü 834,85 km² olan şehrin nüfusu 1 Nisan 2011 itibarı ile 387.146'dır.
Maebashi, Japonya'nın Gunma prefektörlüğünün merkezi ve ikinci büyük şehridir. Yüzölçümü 311,64 km² olan şehrin nüfusu 1 Ekim 2014 tarihi itibarı ile 335.327'dir.
Kanazawa, Japonya'nın Ishikawa prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 467,77 km² olan şehrin nüfusu 2010 yılı itibarı ile 462.478'dir.
Matsue, Japonya'nın Shimane prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 573.01 km² olan şehrin nüfusu 2014 yılı itibarı ile 207,774'tür.
Kagoshima, Japonya'nın Kagoşima prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Yüzölçümü 547,05 km² olan şehrin nüfusu 1 Ocak 2010 itibarı ile 605.855'tir. Şehir resmî olarak 1 Nisan 1889 yılında kurulmuştur.
Sakurajima, Japonya'nın Kagoshima prefektörlüğünde bulunan aktif bir yanardağ. Eskiden Kagoshima Körfezi'nde bir ada olup, 1914 yılında gerçekleşen bir yanardağ patlaması sonucu lavlar ile Ōsumi Yarımadası'yla birleşmiştir. Bu aynı zamanda Japonya tarihinin en büyük yanardağ patlaması olmuştur.
Japonya Savunma Bakanlığı, Japonya'da hükûmetin savunma politikalarını belirlemekten sorumlu bakanlıktır. 9 Ocak 2007 tarihinde kurulmuş olup Savunma Ajansı'nın yerini almıştır. Bakanlık Tokyo'nun Shinjuku semtine bağlı Ichigaya semtinde yer almaktadır. Ek olarak Japonya Öz Savunma Kuvvetleri Savunma Bakanlığı'na karşı sorumludur.
Japonya Arazi, Altyapı, Ulaştırma ve Turizm Bakanlığı veya kısaca MLIT, Japonya'da arazi yönetimi, altyapı, ulaşım ve turizmden sorumlu bakanlıktır. 6 Ocak 2001 tarihinde Ulaştırma Bakanlığı, İnşaat Bakanlığı, Hokkaido Kalkınma Ajansı ile Ulusal Arazi Ajansı'nın birleşmesiyle kurulmuştur. Bakanlık Tokyo'nun Chiyoda semtine bağlı Kasumigaseki semtinde yer almaktadır.
Kültür İşleri Ajansı, Japonya'da kültür ve sanat işlerinden sorumlu ajanstır. Kültür İşleri Ajansı, 15 Haziran 1968 tarihinde kurulmuş olup Eğitim, Kültür, Spor, Bilim ve Teknoloji Bakanlığı'na bağlıdır. Ajans, Kyoto'nun Kamigyō semtinde yer almaktadır.
Kamu Güvenliği İstihbarat Ajansı (PSIA), Japonya'nın ulusal İstihbarat teşkilatıdır. 21 Temmuz 1952 tarihinde kurulmuş olup Adalet Bakanlığı'na bağlıdır ve Japon ulusal güvenliğine yönelik tehditlere karşı iç güvenlik ve casuslukla görevlendirilmiştir. Merkezi Tokyo'nun Chiyoda semtinde yer almaktadır.
Kusatsu Shirane Dağı, Japonya'nın Gunma prefektörlüğünde bulunan bir stratovolkandır. Dağ, Kusatsu kasabası yakınlarında yer almaktadır ve Japonya'nın 100 Ünlü Dağı'ndan biridir.