İçeriğe atla

Holomycota

Holomycota

Nuclearia

Biyolojik sınıflandırma

(sırasız):	Opisthokonta
(sırasız):	Holomycota Liu et al., 2009

Alt gruplar^[1]

Cristidiscoidea
Alem Fungi
- Aphelida
- Gerçek mantarlar
- Rozellida

Nucletmycea Brown et al. 2009^[2]
Holofungi
Fungida

Holomycota veya Nucletmycea, Holozoa'nın kardeş grubu olan temel bir Opisthokont klanıdır. Cristidiscoidea ve mantar (fungi) aleminden oluşur. Holomycota'nın en eski soyu olarak nükleeriidlerin, tek hücreli serbest yaşayan fagotrofik amiplerin^[3] konumu, hayvanların ve mantarların bağımsız olarak ortak bir tek hücreli atadan karmaşık çok hücreliliği edindiğini ve ozmotrofik yaşam tarzının (mantar ayırt edici özelliklerinden biri) daha sonra ortaya çıktığını göstermektedir. bu ökaryotik soyun ayrışmasında. Opisthosporidians, aphelidleri,^[4] Microsporidia ve Cryptomycota, üç endoparazit grubunu içeren yakın zamanda önerilen bir taksonomik gruptur.^[5]

Rozella (Cryptomycota), kitinin en azından yaşam döngüsünün bazı aşamalarında gözlemlendiği en eski mantar cinsidir^[5] kitinli hücre duvarı (bir başka mantar özelliği) ve ozmotrofi, Blastocladiomycota ve Chytridiomycota'nın ortak bir atasından kaynaklanmıştır, hâlâ zoosporik aşamadaki flagellum gibi bazı atalara ait özellikleri içerir.^[6] Mantar gruplarına özel olan hif büyüme Zoopagomycota, Mucuromycotina ve Dikarya, ortak bir atadan ~ 700 myö kaynaklanmıştır. Zoopagomycota çoğunlukla hayvanların veya diğer mantarların patojenleridir, Mucuromycotina, parazitler, saprotroflar veya ektomikorizal dahil olmak üzere daha çeşitli bir gruptur. Dikarya , tanımlanan mantar türlerinin ~%98'ini oluşturan Ascomycota ve Basidiomycota'yı kapsayan gruptur. Bu zengin çeşitlilik nedeniye Dikarya, hif veya tek hücreli mayalardan (örneğin Saccharomyces cerevisiae model organizması) popüler olarak mantar olarak bilinen karmaşık çok hücreli mantarlara kadar morfolojik olarak oldukça farklı grupları içerir. Karmaşık çok hücreli hayvanlar ve kara bitkilerinin aksine, çıkarsanan filogenetik ilişkiler, mantarların Ascomycota ve Basidiomycota evrimi boyunca çok hücreliliği birçok kez kazandığını ve kaybettiğini gösterir.^[7]

Filogeni

Filogenetik ağaç^[8] ve "The Mycota: A Comprehensive Treatise on Fungi as Experimental Systems for Basic and Applied Research" adlı çalışmasına dayanarak mantarları ve diğer organizmalarla yakın ilişkilerini tasvir eder.^[9]^[10] Tedersoo ve ark. Tarafından oluşturulmuş holomycota ağacı.^[11]^[12]

Holomycota

Cristidiscoidea

	Fonticulida

	Nucleariida

 

Fungi/

 

BCG2

 

 

 

	True Fungi

	Aphelida

 

 

 

BCG1

 

Rozellomyceta/

 

Rozella

 

 

 

Namako-37

 

Microsporidia

	Metchnikovellea

	Microsporea

 

 

Cryptomycota

 

 

Opisthosporidia

 

 

Ichthyosporea

 

 

Pluriformea

	Corallochytrium

	Syssomonas

 

 

 

Choanozoa

	Choanoflagellatea

	Animalia

 

 

 

 

 

Kaynakça

^ Adl, Sina M.; Simpson, Alastair G. B.; Lane, Christopher E.; Lukeš, Julius; Bass, David; Bowser, Samuel S.; Brown, Matthew W.; Burki, Fabien; Dunthorn, Micah; Hampl, Vladimir; Heiss, Aaron; Hoppenrath, Mona; Lara, Enrique; Le Gall, Line; Lynn, Denis H.; McManus, Hilary; Mitchell, Edward A. D.; Mozley-Stanridge, Sharon E.; Parfrey, Laura W.; Pawlowski, Jan; Rueckert, Sonja; Shadwick, Laura; Schoch, Conrad L.; Smirnov, Alexey; Spiegel, Frederick W. (2012). "The Revised Classification of Eukaryotes". Journal of Eukaryotic Microbiology. 59 (5): 429-514. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872 $2. PMID 23020233.
^ Brown MW, Spiegel FW, Silberman JD (December 2009). "Phylogeny of the "forgotten" cellular slime mold, Fonticula alba, reveals a key evolutionary branch within Opisthokonta". Mol. Biol. Evol. 26 (12): 2699-709. doi:10.1093/molbev/msp185 . PMID 19692665.
^ López‐Escardó (12 Ağustos 2017). "Parvularia atlantis gen. et sp. nov., a Nucleariid Filose Amoeba (Holomycota, Opisthokonta)". Journal of Eukaryotic Microbiology. 65 (2): 170-179. doi:10.1111/jeu.12450. ISSN 1550-7408. PMC 5708529 $2. PMID 28741861.
^ Karpov (2014). "Morphology, phylogeny, and ecology of the aphelids (Aphelidea, Opisthokonta) and proposal for the new superphylum Opisthosporidia". Frontiers in Microbiology. 5: 112. doi:10.3389/fmicb.2014.00112. PMC 3975115 $2. PMID 24734027.
^ ^a ^b Berbee (8 Eylül 2017). "Early Diverging Fungi: Diversity and Impact at the Dawn of Terrestrial Life". Annual Review of Microbiology. 71 (1): 41-60. doi:10.1146/annurev-micro-030117-020324. PMID 28525299.
^ Stajich (29 Eylül 2009). "The Fungi". Current Biology. 19 (18): R840-R845. doi:10.1016/j.cub.2009.07.004. PMC 2913116 $2. PMID 19788875.
^ Nguyen (8 Şubat 2017). "Innovation and constraint leading to complex multicellularity in the Ascomycota". Nature Communications. 8: ncomms14444. doi:10.1038/ncomms14444. PMC 5309816 $2. PMID 28176784.
^ Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes. HAL. 2016. s. 462. ISBN 978-2-9555841-0-1. 2 Temmuz 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 12 Temmuz 2021.
^ The Mycota VII A: Systematics and Evolution (2nd ed.). Springer. 2014. s. 461. ISBN 978-3-642-55317-2. 6 Mayıs 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 12 Temmuz 2021.
^ Bass (28 Nisan 2018). "Clarifying the Relationships between Microsporidia and Cryptomycota". Journal of Eukaryotic Microbiology (İngilizce). 65 (6): 773-782. doi:10.1111/jeu.12519. ISSN 1066-5234. PMC 6282948 $2. PMID 29603494.
^ Tedersoo (2018). "High-level classification of the Fungi and a tool for evolutionary ecological analyses". Fungal Diversity (İngilizce). 90 (1): 135-159. doi:10.1007/s13225-018-0401-0. ISSN 1560-2745.
^ Lopez-Garcia (17 Ağustos 2018). "The aphelid-like phagotrophic origins of fungi". bioRxiv (İngilizce): 233882. doi:10.1101/233882. 12 Temmuz 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 12 Temmuz 2021.

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">Protistler</span> bitki, hayvan ve mantar olmayan tüm ökaryotlar

Protistler, ayrışık (heterojen) bir canlı grubudur ve hayvan, bitki ya da mantar olarak değerlendirilemeyen ökaryot canlılardan oluşur. Protistler bilimsel sınıflandırma açısından âlem olarak değerlendirilse de tek soylu (monophyletic) değil, kısmi soylu (paraphyletic) bir gruptur. Protistler içinde değerlendirilen canlıların da görece basit yapılı ya da ileri düzeyde özelleşmiş dokuları olmayan olmak dışında ortak özellikleri pek yoktur.

<span class="mw-page-title-main">Ökaryot</span> hücrelerinde bir çekirdek ve genellikle organeller içeren canlılar

Ökaryotlar, hücrelerinde bir çekirdek ve –genellikle– organeller içeren bir canlılar grubu olup, bilimsel sınıflandırmada arkeler ve bakterilerle beraber tüm canlıları kapsayan üç ana gruptan biridir.

<span class="mw-page-title-main">Maya (biyoloji)</span> gayriresmi mantar grubu

Mayalar ökaryot, tek hücreli, fungi (mantarlar) alemi içerisinde sınıflandırılan mikroorganizmalardır. Kökenleri 300 milyon yıl öncesine kadar uzanmaktadır ve bilinen en az 1500 türü bulunmaktadır. Tanımlanmış tüm mantar türlerinin tahminen %1'i mayalardır. Mayalar çok hücreli atalardan evrimleşmiş, tek hücreli organizmalardır, fakat bazı türleri, pseudohif olarak bilinen, birbirine zincirleme eklenen tomurcuklanmış hücre dizileri oluşturarak, çok hücreli organizma benzeri özellikler gösterme yeteneğine sahiptirler. Maya hücreleri, türe ve çevresel ortama göre, genellikle 3–4 µm (mikrometre) olsalar da, 40 µm'ye kadar varan farklı boyutlarda olabilirler.

<span class="mw-page-title-main">Archaeplastida</span>

Archaeplastida, kırmızı algler (Rhodophyta), yeşil algler ve kara bitkilerini ve glokofitler gibi bazı küçük grupları içeren önemli bir ökaryot grubudur. Archaeplastida'nın tüm soyları, fotosentetik olmayan ökaryotrofik bir kamçılı olan Rhodophyta'nın kardeş taksonu Rhodelphidia dışında fotoototrofiktir. Archaeplastida üyeleri, iki zarla çevrili kloroplastlara sahiptir, bu özellikleri bu canlıların bir siyanobakteri ile beslenerek endosimbiyoz olayı yoluyla doğrudan elde edildiğini düşündürür. Amoeboid Paulinella chromatophora'nın yanı sıra kloroplastlara sahip diğer tüm gruplar, ikincil olarak kırmızı veya yeşil alglerden elde edildiklerini düşündüren üç veya dört zarla çevrili kloroplastlara sahiptir. Kırmızı ve yeşil alglerin aksine, glokofitler hiçbir zaman ikincil endosimbiyoz olaylarına dahil olmamıştır.

<span class="mw-page-title-main">Ecdysozoa</span>

Ecdysozoa, bir protostom hayvan grubu olup Arthropoda'nın da içinde bulunduğu, Nematoda ile birkaç küçük şubeyi içerir. İlk olarak Aguinaldo ve ark. 1997'de, esas olarak 18S ribozomal RNA genleri kullanılarak inşa edilen filogenetik ağaçlara dayanıyordu. Dunn ve ark. tarafından 2008'de yapılan büyük bir çalışma, Ecdysozoa'yı bir klad, yani ortak bir atadan ve onun tüm soyundan gelen bir grup olarak güçlü bir şekilde destekledi.

<span class="mw-page-title-main">Unikonta</span>

Amorphea veya Unikonta, Amoebozoa ve Obazoa'yı içeren taksonomik bir grupdur. Bu sınıfın üyelerinin taksonomik yakınlıkları ilk olarak 2002 yılında Thomas Cavalier-Smith tarafından açıklanmıştır.

<span class="mw-page-title-main">Opisthokont</span>

Opisthokontlar, hem hayvan hem de mantar alemlerini içeren geniş bir ökaryot grubudur. Daha önce "Fungi / Metazoa grubu" olarak adlandırılan opisthokontlar, genellikle bir sınıf olarak tanınır. Opisthokontlar, Apusomonadida ve Breviata ile birlikte daha büyük Obazoa kladını oluşturur.

<span class="mw-page-title-main">Viridiplantae</span>

Viridiplantae, yaklaşık 450.000-500.000 tür içeren ve hem karasal hem de sucul ekosistemlerde önemli roller oynayan ökaryotik canlılar grubudur. Öncelikle sucul olan yeşil algler ve içlerinden çıkan kara bitkilerinden oluşurlar. Yeşil algler, geleneksel sınıflandırmada kara bitkilerini içermez ve bu da yeşil algleri parafiletik bir grup yapar. Kara bitkilerinin yeşil alglerin içinden çıktığının anlaşılmasından bu yana, bazı yazarlar bitkileri de yeşil alglere atıyorlar. Hücre duvarlarında selüloz bulunan hücrelere ve klorofil a ve b içeren ve fikobilin içermeyen siyanobakterilerle endosimbiyozdan türetilen birincil kloroplastlara sahiptirler.

<span class="mw-page-title-main">Holozoa</span>

Holozoa, hayvanları ve en yakın tek hücreli akrabalarını içeren ancak mantarları hariç tutan bir canlı grubudur. Holozoa ayrıca tunik cinsi Distaplia için kullanılan eski bir isimdir.

<span class="mw-page-title-main">Filozoa</span>

Filozoa, Opisthokonta içindeki monofiletik bir gruptur. Bunlar hayvanları ve onların en yakın tek hücreli akrabalarını içerir.

<span class="mw-page-title-main">Filasterea</span>

Filasterea, Ministeria ve Capsaspora'yı içeren önerilen bir bazal Filozoan kladıdır. Choanoflagellatea ve Hayvanların grubu olan Choanozoa'nın kardeş grubudur. İlk 2008'de olarak Shalchian-Tabrizi ve diğerleri tarafından, düzinelerce gen ile filogenomik bir analize dayanarak önerilmiştir. Filasterea'nın Opisthokonta'da Metazoa ve Choanoflagellata'dan oluşan klanın kardeş grubu olduğu bulundu; bu bulgu, ek, daha fazla takson açısından zengin, filogenetik analizlerle daha da doğrulandı.

<span class="mw-page-title-main">Mantarların evrimi</span>

Mantarların evrimi, DNA analizine göre, yaklaşık 1,5 milyar yıl önce, mantarların atasal soyunun ökaryotlardan ayrılmasından beri devam etmektedir. DNA analizlerine göre yaklaşık 570 milyon yıl önce Glomerales takımı "yüksek mantarlardan" (dikaryanlar) dallanmıştır. Mantarlar muhtemelen 500 milyon yıl önce Kambriyen döneminde ve 635 milyon yıl önce Ediyakaran döneminde karayı işgal etmeye başladılar. Ancak karasal mantar fosilleri, yalnızca 400 milyon yıl önceki Devoniyen dönemde varlığı tartışmasız ve yaygın hale gelmeye başlar.

<span class="mw-page-title-main">Proteoarchaeota</span> önerilmiş bir arke alemi

Proteoarchaeota, Ökaryotlarla yakından ilişkili olduğu düşünülen bir arke alemidir.

<span class="mw-page-title-main">SAR</span>

SAR veya Harosa; Stramenopiles, Alveolata ve Rhizaria'dan oluşan ve Bikonta kladına bağlı bir kladdır. SAR ismi Stramenopiles, Alveolata, Rhizarianın kısaltmasıdır.

<span class="mw-page-title-main">Aspergillus ustus</span>

.

<span class="mw-page-title-main">Çok hücreli canlı</span> birden fazla hücreden oluşan organizma

Çok hücreli canlı, tek hücreli bir canlının aksine birden fazla hücreden oluşan bir canlıdır.

<span class="mw-page-title-main">Üç üst âlem sistemi</span> Yaşamın sınıflandırılmasına ilişkin hipotez

Üç üst âlem sistemi, Carl Woese, Otto Kandler ve Mark Wheelis tarafından 1990 yılında tanıtılan ve hücreli canlıları Arkeler, Bakteriler ve Ökaryotlar olmak üzere üç üst âleme ayıran biyolojik bir sınıflandırmadır. İki üst âlem sistemi ve beş âlem sınıflandırması gibi daha önceki sınıflandırmalardan temel ayrımı, arkelerin bütünüyle bakterilerden ayrılmış olmasıdır. Üç üst âlem sisteminin bilimsel anlamdaki rakibi, Ökaryotları bir arke grubu olarak kabul ederek, canlıları yalnızca Bakteriler ve Arkeler olarak ayıran "iki üst âlem sistemi"dir (en).

<span class="mw-page-title-main">Excavata</span>

Excavata, Ökaryot üst alemine ait eski bir tek hücreli organizma üst grubudur. İlk olarak 1999'da Simpson ve Patterson tarafından önerilmiş ve 2002'de Thomas Cavalier-Smith tarafından resmi bir takson olarak tanıtılmıştır. Çeşitli serbest yaşayan ve simbiyotik formlar içerir ve Giardia ve Trichomonas gibi bazı önemli insan parazitlerini de içinde barındırır. Daha önce artık modası geçmiş Protista krallığına dahil olduğu düşünülüyordu. Kamçılı yapılarına göre sınıflandırıldılar ve en temel kamçılı soy olarak kabul edildiler.

<span class="mw-page-title-main">Chromista</span>

Chromista, Plastit adı verilen fotosentetik organellerinde benzer özellikleri paylaşan tek ve çok hücreli ökaryotik türlerden oluşan, görünüşte polifilik ileri sürülen biyolojik bir alemdir. Bazı algler, diyatomlar, oomycetes ve protozoanlar gibi plastidleri klorofil içeren tüm protistayı içerir. Üyeleri muhtemelen son ökaryotik ortak atadan ayrı evrimsel gruplar olarak bağımsız olarak ortaya çıktı. O atada zaten kırmızı alg kökenli kloroplastlara sahip olduğu varsayıldığından, fotosentetik olmayan formlar, fotosentez yapabilen atalardan evrimleşmiştir. Plastidleri dört zarla çevrilidir ve tek bir endosimbiyoz olayıyla kırmızı bir algden elde edildiğine inanılır.

<span class="mw-page-title-main">Stramenopile</span>

Heterokontlar olarak da adlandırılan Stramenopile, sert üçlü dış tüylerin varlığıyla ayırt edilen bir organizma kladıdır. Çoğu türde tüyler kamçıya bağlıdır, bazılarında hücre yüzeyinin diğer bölgelerine bağlıdır ve bazılarında ise kaybolmuştur. Stramenopile, Alveolata ve Rhizaria ile birlikte SAR süper grubundaki üç ana soydan birini temsil eder.

Bu sayfa, bu Vikipedi makalesine dayanmaktadır.
Metin, CC BY-SA 4.0 lisansı altında mevcuttur; ek koşullar uygulanabilir.
Görseller, videolar ve sesler kendi lisansları altında mevcuttur.