İçeriğe atla

Filasterea

Filasterea
Biyolojik sınıflandırma Bu sınıflandırmayı düzenle
(sırasız):Filozoa
Sınıf:Filasterea
Salchian-Tabrizi, 2008
Alt gruplar
  • Pigoraptor
  • Capsasporidae
    • Capsaspora
  • Ministeriidae
    • Ministeria

Filasterea, Ministeria ve Capsaspora'yı içeren önerilen bir bazal Filozoan kladıdır.[1] Choanoflagellatea ve Hayvanların grubu olan Choanozoa'nın kardeş grubudur. İlk 2008'de olarak Shalchian-Tabrizi ve diğerleri tarafından, düzinelerce gen ile filogenomik bir analize dayanarak önerilmiştir. Filasterea'nın Opisthokonta'da Metazoa ve Choanoflagellata'dan oluşan klanın kardeş grubu olduğu bulundu; bu bulgu, ek, daha fazla takson açısından zengin, filogenetik analizlerle daha da doğrulandı.[2][3][4]

Etimoloji

" Latincede "iplik" anlamıma gelen filum'un ve "yıldız" anlamına gelen Yunanca asterden, tüm bütünleştiricileri tarafından paylaşılan ana morfolojik özellikleri gösterir: filopodia olarak bilinen uzun ve yayılan hücre çıkıntılarıyla kaplı tek çekirdekli bir hücresel gövdeye sahip küçük, yuvarlak amipoidler. Bu filopodia, substrat yapışmasına ve avın yakalanmasına dahil olabilir.

Uygulamalar

Şu anda iki filaster türünden kültürler var: Capsaspora owczarzaki ve Ministeria vibrans, ilki bir tatlı su salyangozunun içinden izole edilmiş, ikincisi ise denizde, serbest yaşayan bir bakteri yiyicidir. C. owczarzaki'nin tam genom dizisi elde edildi[5] ve M. vibrans'ın genom dizisi dizileniyor. Karşılaştırmalı analizler, Filasterea'nın hayvanların tek hücreli atalarının genetik repertuvarını çözmenin ve Metazoa'nın kökenine ilişkin içgörü sağlamanın anahtarı olduğunu göstermiştir. Deniz ortamlarında 18S ribozomal RNA'nın metabarkodlama analizleri, diğer filaster temsilcilerini kurtaramadı[6][7] bu, grubun, özellikle doğal ekosistemlerde bol olmayabileceğini düşündürmektedir.

Taksonomi

  • Sınıf Filasterea Shalchian-Tabrizi vd. 2008[8][9][10]
    • Takım Ministeriida Cavalier-Smith 1997[11][12]
      • Aile Ministeriidae Cavalier-Smith 2008[1]
        • Cins Ministeria Patterson ve ark. 1993
          • Ministeria marisola Patterson ve ark. 1993
          • Ministeria, Tong 1997'yi titretir
      • Aile Capsasporidae Cavalier-Smith 2008
        • Cins Capsaspora Hertel ve ark. 2002
          • Capsaspora owczarzaki Hertel et al. 2002
        • Cins Pigoraptor Tikhonenkov ve ark. 2017
          • Pigoraptor chileana Tikhonenkov ve ark. 2017
          • Pigoraptor vietnamica Tikhonenkov ve ark. 2017

Dış sistematik

Opisthokonta
Holomycota
Cristidiscoidea

Fonticulida

Nucleariida

Fungi/

BCG2

Gerçek Mantarlar

Aphelida

BCG1

Rozellomyceta/

Rozella

Namako-37

Microsporidia

Cryptomycota
Opisthosporidia
Holozoa

Ichthyosporea

Pluriformea

Syssomonas

Corallochytrium

Filozoa

Filasterea

Choanozoa

Choanoflagellatea

Animalia

950 myö
1100 myö
1300 myö

Bazı araştırmalarda Capsaspora'nın, Ministeria'dan çok Choanozoa ile daha yakından ilişkili olduğu bulunmuştur.[13]

Kaynakça

  1. ^ a b "Multigene phylogeny of choanozoa and the origin of animals". PLoS ONE. 3 (5): e2098. 7 Mayıs 2008. doi:10.1371/journal.pone.0002098. PMC 2346548 $2. PMID 18461162. 
  2. ^ Torruella, Guifré; Derelle, Romain; Paps, Jordi; Lang, B. Franz; Roger, Andrew J.; Shalchian-Tabrizi, Kamran; Ruiz-Trillo, Iñaki (Şubat 2012). "Phylogenetic Relationships within the Opisthokonta Based on Phylogenomic Analyses of Conserved Single-Copy Protein Domains". Molecular Biology and Evolution. 29 (2): 531-544. doi:10.1093/molbev/msr185. ISSN 0737-4038. PMC 3350318 $2. PMID 21771718. 12 Kasım 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Haziran 2021. 
  3. ^ Hehenberger, Elisabeth; Tikhonenkov, Denis V.; Kolisko, Martin; del Campo, Javier; Esaulov, Anton S.; Mylnikov, Alexander P.; Keeling, Patrick J. (Temmuz 2017). "Novel Predators Reshape Holozoan Phylogeny and Reveal the Presence of a Two-Component Signaling System in the Ancestor of Animals". Current Biology. 27 (13): 2043-2050.e6. doi:10.1016/j.cub.2017.06.006. ISSN 0960-9822. 
  4. ^ Torruella, Guifré; de Mendoza, Alex; Grau-Bové, Xavier; Antó, Meritxell; Chaplin, Mark A.; del Campo, Javier; Eme, Laura; Pérez-Cordón, Gregorio; Whipps, Christopher M.; Nichols, Krista M.; Paley, Richard (Eylül 2015). "Phylogenomics Reveals Convergent Evolution of Lifestyles in Close Relatives of Animals and Fungi". Current Biology. 25 (18): 2404-2410. doi:10.1016/j.cub.2015.07.053. ISSN 0960-9822. 
  5. ^ Suga (14 Ağustos 2013). "The Capsaspora genome reveals a complex unicellular prehistory of animals". Nature Communications (İngilizce). 4: ncomms3325. doi:10.1038/ncomms3325. PMC 3753549 $2. PMID 23942320. 
  6. ^ del Campo (1 Nisan 2013). "Environmental Survey Meta-analysis Reveals Hidden Diversity among Unicellular Opisthokonts". Molecular Biology and Evolution (İngilizce). 30 (4): 802-805. doi:10.1093/molbev/mst006. ISSN 0737-4038. PMC 3603316 $2. PMID 23329685. 
  7. ^ Del Campo (September 2015). "Diversity and distribution of unicellular opisthokonts along the European coast analysed using high-throughput sequencing". Environmental Microbiology. 17 (9): 3195-3207. doi:10.1111/1462-2920.12759. ISSN 1462-2920. PMC 4500835 $2. PMID 25556908. 
  8. ^ "The Revised Classification of Eukaryotes" (PDF), Journal of Eukaryotic Microbiology, 59 (5), 28 Eylül 2012, ss. 429-493, doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x, PMC 3483872 $2, PMID 23020233, 16 Aralık 2013 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi 
  9. ^ "Protistes Eucaryotes : Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes", HAL Archives-ouvertes, 2016, ss. 1-462, 13 Mayıs 2016 tarihinde kaynağından arşivlendi, erişim tarihi: 21 Haziran 2021 
  10. ^ Hehenberger (2017). "Novel Predators Reshape Holozoan Phylogeny and Reveal the Presence of a Two-Component Signaling System in the Ancestor of Animals". Current Biology. 27 (13): 2043-2050.e6. doi:10.1016/j.cub.2017.06.006. PMID 28648822. 
  11. ^ "Ministeria", BioLib.cz, 1999, 24 Haziran 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi, erişim tarihi: 21 Nisan 2016 
  12. ^ "A Higher Level Classification of All Living Organisms", PLoS ONE, 10 (4), 29 Nisan 2015, ss. e0119248, doi:10.1371/journal.pone.0119248, PMC 4418965 $2, PMID 25923521 
  13. ^ Reynolds (2017). "Resolving relationships at the animal-fungal divergence: A molecular phylogenetic study of the protist trichomycetes (Ichthyosporea, Eccrinida)". Molecular Phylogenetics and Evolution. 109: 447-464. doi:10.1016/j.ympev.2017.02.007. ISSN 1055-7903. PMID 28219758. 

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">Palaeognathae</span>

Palaeognathae kuşlar sınıfının ana alt sınıflarından birisidir. Struthioniformes, Rheiformes, Tinamiformes, Casuariiformes ve Apterygiformes takımlarını bir araya getirir. Bu alt sınıf içinde yaşayan 60 tür ile 5 familya ve 14 cinsi kapsar. Deve kuşları haricindeki diğer tüm takımlar Notopalaeognathae kladı içinde sınıflandırılır. Deve kuşları ise kendi alt kladlarına sahiptir.

<span class="mw-page-title-main">Michael Levitt</span>

Michael Levitt, İsrail asıllı Amerikan biyofizikçidir. 2013 yılında Nobel Ödülü kazanmıştır.

<span class="mw-page-title-main">Archaeplastida</span>

Archaeplastida, kırmızı algler (Rhodophyta), yeşil algler ve kara bitkilerini ve glokofitler gibi bazı küçük grupları içeren önemli bir ökaryot grubudur. Archaeplastida'nın tüm soyları, fotosentetik olmayan ökaryotrofik bir kamçılı olan Rhodophyta'nın kardeş taksonu Rhodelphidia dışında fotoototrofiktir. Archaeplastida üyeleri, iki zarla çevrili kloroplastlara sahiptir, bu özellikleri bu canlıların bir siyanobakteri ile beslenerek endosimbiyoz olayı yoluyla doğrudan elde edildiğini düşündürür. Amoeboid Paulinella chromatophora'nın yanı sıra kloroplastlara sahip diğer tüm gruplar, ikincil olarak kırmızı veya yeşil alglerden elde edildiklerini düşündüren üç veya dört zarla çevrili kloroplastlara sahiptir. Kırmızı ve yeşil alglerin aksine, glokofitler hiçbir zaman ikincil endosimbiyoz olaylarına dahil olmamıştır.

<span class="mw-page-title-main">Neoaves</span>

Neoaves, Paleognathae ve Galloanserae hariç tüm modern kuşları içeren bir kladdır. Bilinen yaklaşık 10.000 modern kuş türünün neredeyse %95'i Neoaves kladına dahildir.

<span class="mw-page-title-main">Ecdysozoa</span>

Ecdysozoa, bir protostom hayvan grubu olup Arthropoda'nın da içinde bulunduğu, Nematoda ile birkaç küçük şubeyi içerir. İlk olarak Aguinaldo ve ark. 1997'de, esas olarak 18S ribozomal RNA genleri kullanılarak inşa edilen filogenetik ağaçlara dayanıyordu. Dunn ve ark. tarafından 2008'de yapılan büyük bir çalışma, Ecdysozoa'yı bir klad, yani ortak bir atadan ve onun tüm soyundan gelen bir grup olarak güçlü bir şekilde destekledi.

<span class="mw-page-title-main">Sauropsida</span> dört üyeli omurgalılar grubu

Sauropsida, büyük ölçüde Reptilia sınıfına eşdeğer olan bir amniyot grubudur. Sauropsida, memelileri içeren amniyotların kladı olan Synapsida'nın kardeş taksonudur. Erken sinapsidler tarihsel olarak "memeli benzeri sürüngenler" olarak anılsa da, tüm sinapsidler, herhangi bir modern sürüngenden çok memelilerle daha yakından ilişkilidir. Sauropsidler ise memelilerden çok modern sürüngenlerle daha yakından ilişkili tüm amniyotları içerir. Buna, Linnaean taksonomisinde başlangıçta ayrı bir sınıf olarak adlandırılmasına rağmen, şu anda arkosauriyen sürüngenlerinin bir alt grubu olarak tanınan Aves (kuşlar) dahildir.

<span class="mw-page-title-main">Unikonta</span>

Amorphea veya Unikonta, Amoebozoa ve Obazoa'yı içeren taksonomik bir grupdur. Bu sınıfın üyelerinin taksonomik yakınlıkları ilk olarak 2002 yılında Thomas Cavalier-Smith tarafından açıklanmıştır.

<span class="mw-page-title-main">Opisthokont</span>

Opisthokontlar, hem hayvan hem de mantar alemlerini içeren geniş bir ökaryot grubudur. Daha önce "Fungi / Metazoa grubu" olarak adlandırılan opisthokontlar, genellikle bir sınıf olarak tanınır. Opisthokontlar, Apusomonadida ve Breviata ile birlikte daha büyük Obazoa kladını oluşturur.

<span class="mw-page-title-main">Viridiplantae</span>

Viridiplantae, yaklaşık 450.000-500.000 tür içeren ve hem karasal hem de sucul ekosistemlerde önemli roller oynayan ökaryotik canlılar grubudur. Öncelikle sucul olan yeşil algler ve içlerinden çıkan kara bitkilerinden oluşurlar. Yeşil algler, geleneksel sınıflandırmada kara bitkilerini içermez ve bu da yeşil algleri parafiletik bir grup yapar. Kara bitkilerinin yeşil alglerin içinden çıktığının anlaşılmasından bu yana, bazı yazarlar bitkileri de yeşil alglere atıyorlar. Hücre duvarlarında selüloz bulunan hücrelere ve klorofil a ve b içeren ve fikobilin içermeyen siyanobakterilerle endosimbiyozdan türetilen birincil kloroplastlara sahiptirler.

<span class="mw-page-title-main">Ferae</span> memeli kladı

Ferae, Carnivora ve Pholidota takımlarından oluşan bir memeli kladıdır. Carnivora ve Pholidota'nın bir grubu için alternatif bir isim olan Ostentoria da önerildi. Moleküler genetik çalışmalarca, günümüze kadar gelen Ferae'nin son ortak atasının yaklaşık olarak 78.9 milyon yıl önce yaşadığı tahmin edilmiştir. Creodonta gibi soyu tükenmiş birkaç takım da Ferae'nin üyeleridir.

<span class="mw-page-title-main">Holozoa</span>

Holozoa, hayvanları ve en yakın tek hücreli akrabalarını içeren ancak mantarları hariç tutan bir canlı grubudur. Holozoa ayrıca tunik cinsi Distaplia için kullanılan eski bir isimdir.

<span class="mw-page-title-main">Filozoa</span>

Filozoa, Opisthokonta içindeki monofiletik bir gruptur. Bunlar hayvanları ve onların en yakın tek hücreli akrabalarını içerir.

<span class="mw-page-title-main">Holomycota</span>

Holomycota veya Nucletmycea, Holozoa'nın kardeş grubu olan temel bir Opisthokont klanıdır. Cristidiscoidea ve mantar (fungi) aleminden oluşur. Holomycota'nın en eski soyu olarak nükleeriidlerin, tek hücreli serbest yaşayan fagotrofik amiplerin konumu, hayvanların ve mantarların bağımsız olarak ortak bir tek hücreli atadan karmaşık çok hücreliliği edindiğini ve ozmotrofik yaşam tarzının daha sonra ortaya çıktığını göstermektedir. bu ökaryotik soyun ayrışmasında. Opisthosporidians, aphelidleri, Microsporidia ve Cryptomycota, üç endoparazit grubunu içeren yakın zamanda önerilen bir taksonomik gruptur.

<span class="mw-page-title-main">Parahoxozoa</span> klad

ParaHoxozoa, Bilateria, Placozoa ve Cnidaria'dan oluşan bir hayvan kladıdır. Bu kladın diğer iki hayvan soyu olan Ctenophora ve Porifera ile ilişkisi tartışmalıdır. Bazı filogenomik çalışmalar, Ctenophora'nın Parahoxozoa'nın kardeş grubu, Porifera'nın da diğer hayvanlarla kardeş grubu olduğunu destekleyen kanıtlar sunmuştur (örn.). Bazı araştırmalar, Porifera'nın Parahoxozoa'nın ve Ctenophora'nın diğer hayvanların kardeş grubu olduğunu destekleyen kanıtlar sunmuştur (örn.).

<span class="mw-page-title-main">Laurasiatheria</span> memeli üst takımı

Laurasiatheria, Eulipotyphla takımı ile Scrotifera kladını içeren bir plasentalı memeliler üst takımıdır. Kardeş grubu Euarchontoglires ile birlikte Boreoeutheria magna takımını oluşturur. Laurasiatheria taksonu içinde sınıflandırılan hayvanların benzer gen dizilimlerine dayanarak keşfedildi. Grubu birleştirmek için ortak anatomik özellikler henüz ortaya konmadı. Laurasiatheria kladı DNA dizilim analizleri ve retrotranspozon varlık/yokluk verilerine göre temellendirildi. Üst takım, Pangea bölünmeye başladıktan sonra Gondvana'dan ayrılan Lavrasya süperkıtasında ortaya çıktı. En son ortak atasının yaklaşık olarak 76 ila 90 milyon yıl önce soyunun ayrıldığı varsayılmaktadır.

<span class="mw-page-title-main">SAR</span>

SAR veya Harosa; Stramenopiles, Alveolata ve Rhizaria'dan oluşan ve Bikonta kladına bağlı bir kladdır. SAR ismi Stramenopiles, Alveolata, Rhizarianın kısaltmasıdır.

<span class="mw-page-title-main">Paleoproterozoyik</span>

Paleoproterozoyik, 2,5 milyar yıl öncesinden, 1,6 milyar yıl öncesine uzanan, Proterozoyik Üst Zaman'ın üç bölümünden ilki olan jeolojik zamandır. Paleoproterozoyik yerkürenin jeolojik tarihindeki en uzun zamandır. Kıtalar ilk kez bu zamanda stabilize oldu.

<span class="mw-page-title-main">Lophotrochozoa</span>

Lophotrochozoa, Spiralia'daki bir protostom hayvan sınıfıdır. Taksonu moleküler kanıtlara dayalı olarak monofiletik bir grup olarak kurulmuştur. Sınıf: annelidler, yumuşakçalar, bryozoanlar, brachiopodlar ve platyhelminthes gibi hayvanları içerir.

<span class="mw-page-title-main">Chromista</span>

Chromista, Plastit adı verilen fotosentetik organellerinde benzer özellikleri paylaşan tek ve çok hücreli ökaryotik türlerden oluşan, görünüşte polifilik ileri sürülen biyolojik bir alemdir. Bazı algler, diyatomlar, oomycetes ve protozoanlar gibi plastidleri klorofil içeren tüm protistayı içerir. Üyeleri muhtemelen son ökaryotik ortak atadan ayrı evrimsel gruplar olarak bağımsız olarak ortaya çıktı. O atada zaten kırmızı alg kökenli kloroplastlara sahip olduğu varsayıldığından, fotosentetik olmayan formlar, fotosentez yapabilen atalardan evrimleşmiştir. Plastidleri dört zarla çevrilidir ve tek bir endosimbiyoz olayıyla kırmızı bir algden elde edildiğine inanılır.

Charophyta; charophytes olarak da adlandırılan bir tatlı su yeşil alg grubudur. Bazen bir bölüm olarak ele alınır ancak aynı zamanda bir süper bölüm veya sıralanmamış bir klad olarak da gösterilmektedir. Karasal bitkiler Charophyta'dan, muhtemelen karasal tek hücreli charophyte'lerden kardeş grup olarak Zygnematophyceae sınıfıyla birlikte ortaya çıktı.