İçeriğe atla

Enterobacter

Enterobacter
Triptik soy agar besiyerinde Enterobacter cloacae kolonileri
Biyolojik sınıflandırma Bu sınıflandırmayı düzenle
Üst âlem:Bacteria
Şube:Proteobacteria
Sınıf:Gammaproteobacteria
Takım:Enterobacteriales
Familya:Enterobacteriaceae
Cins:Enterobacter
Hormaeche & Edwards 1960[2]
Türler[1]
  • E. asburiae
  • E. bugadensis
  • E. cancerogenous
  • E. chengduensis
  • E. chuandaensis
  • E. cloacae
  • E. hormaechei
  • E. huaxiensis
  • E. kobei
  • E. ludwigii
  • E. mori
  • E. oligotrophicus
  • E. quasihormaechei
  • E. quasimori
  • E. quasiroggenkampii
  • E. roggenkampii
  • E. siamensis
  • E. sichuanensis
  • E. soli
  • E. wuhouensis

Enterobacter Gram negatif, fakültatif anaerobik, çubuk şeklinde, spor oluşturmayan, Enterobacteriaceae familyasına ait bakteri cinsidir. Enterobacterales takımının tip özelliklerini taşıyan cinsidir.[3] 20 türü bulunmaktadır.[1] Yakın zamanlı çalışmalarla bu cinse ait bazı türler farklı cinsler altında sınıflandırılmıştır, örneğin E. aerogenes, Klebsiella aerogenes olarak değiştirilmiştir.[4] Bu cinsin klinik öneme sahip tek türü E. cloacae'dir.

Bu cinse ait bakterilerin bazı suşları patojeniktir ve bağışıklığı baskılanmış (genellikle hastanede yatan) kişilerde ve özellikle mekanik ventilasyon hastalarında fırsatçı enfeksiyonlara neden olurlar. En sık enfeksiyona neden oldukları organlar, idrar ve solunum yollarıdır. Enterobacter cinsi, koliform bakteriler grubunun bir üyesidir. Grubun en bilinen üyesi olan Escherichia coli'nin aksine fekal koliform (veya termotolerant koliformlar) değildirler. Bazıları quorum sensing özelliği gösterirler.[5][6]

Araştırmacılar 2018'de Uluslararası Uzay İstasyonunda (ISS) nonpatojen Enterobacter bugandensis bakteri suşları tespit ettiler ve astronotlara sağlıklı bir ortam sağlamak için ISS üzerinde bu mikroorganizmaların dikkatle izlenmesi gerektiğini bildirdiler.[7][8]

Biyokimyasal özellikler

Enterobacter cinsi bakteriler, safra tuzları içeren besiyerinde, 35-37 °C'de 48 s. inkübasyon ile laktozu fermente ederek gaz oluştururlar. Oksidaz ve indol testleri negatif, üreaz ise değişkendir.[5][9]

Tedavi

Tedavi, antibiyotik direnci durumuna göre düzenlenir. Enterobacter huaxiensis ve Enterobacter chuandaensis, özellikle antibiyotiklere direnç gösterebilen, yakın zamanda keşfedilmiş iki türdür.[10]

Β-Laktam antibiyotik grubundan, dördüncü nesil bir sefalosporin olan Cefepime ve karbapenem grubundan Imipenem genellikle tercih edilen antibiyotiklerdir.[7] Amikasin gibi aminoglikositlerin de çok etkili olduğu bulunmuştur.[7] Kinolonlar da etkili bir alternatif olabilirler.[7]

Şişmanlık ile ilişkisi

Yakın zamanda yapılan bir araştırma, morbid obez bir bireyin bağırsaklarında bulunan Enterobacter cloacae B29 suşunun, hastanın obezitesine katkıda bulunmuş olabileceğini göstermiştir. Hastanın bağırsaklarındaki E.cloacae B29 bakteri yükünün % 35''ten, tespit edilemeyecek seviyelere düşürülmesi, paralel olarak endotoksin yükünde azalma ve buna eşlik eden önemli seviyede kilo kaybı ile ilişkilendirilmiştir.[11] Ayrıca, hastadan izole edilen aynı bakteri suşunun, yüksek yağlı bir diyetle beslenen C57BL/6J farelerinde obezite ve insülin direncini arttırdığı gösterilmiştir. Araştırmacılar, E. cloacae B29'un, endotoksin kaynaklı ve enflamasyon ilişkili bir mekanizma yoluyla, insanlarda obeziteye katkıda bulunabileceğini öne sürmektedir.[11]

Kaynakça

  1. ^ a b "Genus: Enterobacter". lpsn.dsmz.de. 30 Eylül 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 19 Nisan 2021. 
  2. ^ Hormaeche E, Edwards PR (1960). "A proposed genus Enterobacter". International Bulletin of Bacteriological Nomenclature and Taxonomy. 10: 71-74. 
  3. ^ Adeolu, Mobolaji; Alnajar, Seema; Naushad, Sohail; S. Gupta, RadheyYR 2016. "Genome-based phylogeny and taxonomy of the 'Enterobacteriales': proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology,. 66 (12): 5575-5599. doi:10.1099/ijsem.0.001485. ISSN 1466-5034. 1 Kasım 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Nisan 2021. 
  4. ^ Tindall, B. J.; Sutton, G.; Garrity, G. M. (2017). "Enterobacter aerogenes Hormaeche and Edwards 1960 (Approved Lists 1980) and Klebsiella mobilis Bascomb et al. 1971 (Approved Lists 1980) share the same nomenclatural type (ATCC 13048) on the Approved Lists and are homotypic synonyms, with consequences for the name Klebsiella mobilis Bascomb et al. 1971 (Approved Lists 1980)". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 67 (2): 502-504. doi:10.1099/ijsem.0.001572. ISSN 1466-5034. PMID 27902205. 21 Nisan 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Nisan 2021. 
  5. ^ a b Cabral, João P. S. (15 Ekim 2010). "Water Microbiology. Bacterial Pathogens and Water". International Journal of Environmental Research and Public Health (İngilizce). 7 (10): 3657-3703. doi:10.3390/ijerph7103657. ISSN 1660-4601. PMC 2996186 $2. PMID 21139855. 15 Ağustos 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Nisan 2021. 
  6. ^ Tan, Wen-Si; Yunos, Nina; Tan, Pui-Wan; Mohamad, Nur; Adrian, Tan-Guan-Sheng; Yin, Wai-Fong; Chan, Kok-Gan (13 Haziran 2014). "Freshwater-Borne Bacteria Isolated from a Malaysian Rainforest Waterfall Exhibiting Quorum Sensing Properties". Sensors (İngilizce). 14 (6): 10527-10537. doi:10.3390/s140610527. ISSN 1424-8220. PMC 4118381 $2. PMID 24932870. 3 Haziran 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Nisan 2021. 
  7. ^ a b c d "ISS microbes should be monitored to avoid threat to astronaut health". EurekAlert!. 22 Kasım 2018. 23 Kasım 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 25 Kasım 2018. 
  8. ^ Singh, Nitin K.; Bezdan, Daniela; Checinska Sielaff, Aleksandra; Wheeler, Kevin; Mason, Christopher E.; Venkateswaran, Kasthuri (2018). "Multi-drug resistant Enterobacter bugandensis species isolated from the International Space Station and comparative genomic analyses with human pathogenic strains". BMC Microbiology (İngilizce). 18 (1): 175. doi:10.1186/s12866-018-1325-2. ISSN 1471-2180. PMC 6251167 $2. PMID 30466389. 22 Mart 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Nisan 2021. 
  9. ^ Thomas A. Russo; James R. Johnson. "Chapter 156: Diseases Caused by Gram-Negative Enteric Bacilli". J. Larry Jameson, Anthony S. Fauci, Dennis L. Kasper, Stephen L. Hauser, Dan L. Longo, Joseph Loscalzo (Ed.). Harrison's Principles of Internal Medicine, 20e (İngilizce). McGraw-Hill Education. 21 Nisan 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 19 Nisan 2021. 
  10. ^ Wu, Wenjing; Wei, Li; Feng, Yu; Kang, Mei; Zong, ZhiyongYR 2019. "Enterobacter huaxiensis sp. nov. and Enterobacter chuandaensis sp. nov., recovered from human blood". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology,. 69 (3): 708-714. doi:10.1099/ijsem.0.003207. ISSN 1466-5034. 21 Nisan 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Nisan 2021. 
  11. ^ a b Fei, Na; Zhao, Liping (2013). "An opportunistic pathogen isolated from the gut of an obese human causes obesity in germfree mice". The ISME Journal (İngilizce). 7 (4): 880-884. doi:10.1038/ismej.2012.153. ISSN 1751-7370. PMC 3603399 $2. PMID 23235292. 16 Şubat 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Nisan 2021. 



İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">Antibiyotik</span> bakteriyel enfeksiyonların tedavisinde ve önlenmesinde kullanılan ilaç

Antibiyotik, bakterilere karşı aktif olan bir tür antimikrobiyal maddedir. Bakteriyel enfeksiyonlarla savaşmak için en önemli antibakteriyel ajan türüdür ve antibiyotik ilaçlar bu tür enfeksiyonların tedavisinde ve önlenmesinde yaygın olarak kullanılmaktadır. Bakterileri öldürebilir ya da büyümelerini engelleyebilirler. Sınırlı sayıda antibiyotik de antiprotozoal aktiviteye sahiptir. Antibiyotikler soğuk algınlığı veya gribe neden olan virüsler gibi virüslere karşı etkili değildir; virüslerin büyümesini engelleyen ilaçlar antibiyotik yerine antiviral ilaçlar veya antiviraller olarak adlandırılır. Mantarlara karşı da etkili değildirler; mantarların büyümesini engelleyen ilaçlara antifungal ilaçlar denir.

<i>Escherichia coli</i> enterik, çubuk şeklinde, gram-negatif bakteri

Escherichia coli (E.coli), Enterobacteriaceae familyasının bir üyesi olup memeli canlıların kalın bağırsağında yaşadığı için bu adı alan bir bakteri türüdür. E.coli çubuk şeklindedir ve gram negatif bakteri olduğundan endospor oluşturmaz. E. coli yaklaşık 2,0 μm uzunluğunda ve 0,5 μm çapındadır. E.coli ilk olarak 1885 yılında Theodor Escherich tarafından bebek dışkısından izole edilmiş ve özellikleri belirlenmiştir. "E. coli, doğumdan birkaç saat sonra bebeklerin mide ve bağırsak sisteminde kolonize olur ve burada yaşar." E.coli suşları insan vücudunda herhangi bir olumsuz etki olmaksızın bir arada bulunur. Bununla birlikte, E. coli gastrointestinal bariyerleri aşınmış ve/ya da bağışıklığı baskılanmış konakçılarda hastalığa neden olabilir. Özellikle bir kısım E. coli, dünya genelinde insanlarda ve hayvanlarda bağırsakta ve bağırsak dışında çeşitli hastalıklara aracılık eder. İnsanlardan izole edilen E. coli suşları ishale ve bir takım bağırsak dışı hastalıklara neden olmaktadır.

<i>Legionella</i>

Legionella, lejyoner hastalığına sebep olan bakterilerin yer aldığı bakteri cinsidir. Legionellaceae familyası sadece Legionella cinsinden ibarettir ve bu cinse ait bugüne kadar bildirilmiş 62 tür bulunmaktadır. En iyi bilinen türü olan Legionella pneumophila, gram negatif, kokobasil formunda, optimum üreme sıcaklığı 20-42 °C olan bir bakteridir. Ribozomal RNA analizi çalışmaları Legionellaceae familyasının Gamma Proteobacteria şubesine dahil olduğunu göstermiştir.

<i>Chlamydia trachomatis</i> bakteri türü

Chlamydia trachomatis, Chlamydiaceae familyasında yer alan, gram-negatif, sadece konak hücre içerisinde çoğalabilen zorunlu parazit bir bakteri türüdür. İnsanlarda trahom, lenfogranüloma venereum, non-gonokokkal üretrit, servisit, pelvik inflamatuar hastalık gibi enfeksiyonlarına neden olur. C. trachomatis körlüğe en çok sebep olan enfeksiyon etkenidir ve cinsel yolla en fazla bulaşan bakteridir.

<span class="mw-page-title-main">Enterobacterales</span>

Enterobacterales, enterik bakterileri içeren 7 adet familyadan oluşan, Proteobacteria şubesi, Gammaproteobacteria sınıfının içinde yer alan bakteri takımıdır. Takıma ait tipik özellikleri taşıyan familyası Enterobacteriaceae'dir

<i>Staphylococcus aureus</i> Bakteri türü

Staphylococcus aureus, Staphylococcaceae familyasından bakteri türüdür. Gram pozitiflerdendir. Yaklaşık 20 türü bulunur. Nozokomiyal etkenidir. İnsan cilt florasında kommensal olarak da bulunur. Staphylococcus aureus' un oksasilin'e dirençli olup olmaması onun tanımlanmasında etkilidir. Örneğin bu antibiyotiğe hassas olan bir S. aureus, MSSA adını alırken, buna dirençli olan suş, MRSA adını alır. Koyun kanlı agarda altın sarısı koloniler üretir. Bu yüzden tür adı, altın anlamına gelen Latince aureus'dan türetilmiştir. Bu bakterinin katalaz testi olumludur. Clumping factor ve tüp koagülaz testi pozitif sonuç verir. Çeşitli yüzeylerde glikokaliks denen oluşumlar üretir. Bakterinin bunu yayılma ve bulaşma için kullandığı düşünülmektedir. Bağışıklık sistemi zayıflamış kişilerde, asıl enfeksiyon etkeniyle beraber görülmesi, iyileşmeyi geciktirir. Stafilokoklar içerisinde sadece Stafilokok Aureus koagülaz pozitif sonuç verir. Streptokok türünden ayırt etmek için katalaz testi uygulanır.

Naylonla beslenen bakteri, bazı naylon yan ürünlerini sindirebilen bir Paenarthrobacter ureafaciens suşudur. Naylonu sindirebilmek için naylonaz olarak bilinen bir grup enzimi kullanır.

<i>Alkalihalobacillus clausii</i> bakteri türü

Alkalihalobacillus clausii(Sinonim: Bacillus clausii); toprakta yaşayan, çubuk şeklinde, gram-pozitif, hareketli ve spor forma sahip bir bakteridir. Bakteri türü 2020 yılında Alkalihalobacillus cinsine taşınmış ve B.clausii ismi sinonim olarak kalmıştır.

Paenarthrobacter ureafaciens, Paenarthrobacter cinsine ait bir bakteri türü. Bu türün polar lipid profili hakkında bilgi mevcut değildir.

Paeniglutamicibacter cryotolerans, Aktinobakteriler sınıfından bir bakteri türüdür. Psikrotolerant, halotolerant, Gram-pozitif, hareketli ve fakültatif anaerobiktir. Bir basil-kok döngüsüne sahiptir.

Falsarthrobacter nasiphocae, yaygın fokun burun boşluğundan izole edilmiş Arthrobacter cinsinden Gram pozitif, zorunlu aerobik ve çubuk şeklinde bir bakteri türü.

Pseudoglutamicibacter cumminsii, Gram pozitif bir bakteri türüdür.

Mycoplasma buccale, Mycoplasma adı verilen bir bakteri cinsinden olan bir türdür. Bu bakteri cinsi, kendi hücre zarlarını çevreleyen bir hücre duvarından yoksundur. Hücre duvarı olmadan, penisilin veya hücre duvarı üretimini hedefleyen diğer beta-laktam antibiyotikler gibi yaygın antibiyotiklerin birçoğundan etkilenmez. Mikoplazmalar; henüz keşfedilmiş en küçük bakteri hücreleridir, oksijen olmaksızın hayatta kalabilir ve genellikle yaklaşık 0.1 µm çapındadır.

Mycoplasma arginini, Mycoplasmataceae ailesinin üyesi olan bir bakteri türüdür. Bu bakteri cinsi, kendi hücre zarlarını çevreleyen bir hücre duvarından yoksundur. Hücre duvarı olmadan, penisilin veya hücre duvarı üretimini hedefleyen diğer beta-laktam antibiyotikler gibi yaygın antibiyotiklerin birçoğundan etkilenmez. Mikoplazmalar; henüz keşfedilmiş en küçük bakteri hücreleridir, oksijen olmaksızın hayatta kalabilir ve genellikle yaklaşık 0,1 µm çapındadır.

Mycoplasma anatis, Mycoplasmataceae ailesinin üyesi olan bir bakteri türüdür.

<span class="mw-page-title-main">Su mikrobiyolojisi</span>

Su Mikrobiyolojisi suda yaşayan mikroorganizmaları tüm biyolojik yönleriyle inceleyen bilim dalıdır. Fakat su mikrobiyolojisi terimi daha çok insani tüketim amacıyla kullanılan veya insan sağlığı için önem arz eden sularda bulunan mikroorganizmaların özellikleri, tespit edilmesi ve dezenfeksiyonu çalışmaları için kullanılmaktadır. Doğada tatlı sular, nehir ağızları, okyanuslar gibi sucul ortamlardaki mikroorganizmaları ayrıntılı inceleyen bilim dalı ise aquatik mikrobiyolojidir. Yaşamın başlangıç noktası olan sucul ortamlar virüsler, arkeler, bakteriler, protozoalar, funguslar ve algler başta olmak üzere pek çok mikroorganizma barındırırlar.

<i>Enterococcus</i>

Enterococcus gram pozitif, kok şeklinde, çok fazla tür içeren bir bakteri cinsidir. Firmicutes şubesinde, Lactobacillales takımında yer alır. Enterokoklar veya eski isimleriyle Fekal Streptokoklar olarak da bilinirler. Genellikle diplokok veya kısa zincirler halinde bulurlar. Sadece fiziksel özellikleri kullanılarak streptokoklardan ayırt edilmeleri zordur. İki türünün, E.faecalis ve E.faecium, insan bağırsaklarında kommensal olarak yaşadığı ve fırsatçı enfeksiyonlara neden olabildikleri bilinmektedir. Ayrıca E. casseliflavus, E. gallinarum ve E. raffinosus gibi diğer türleri de nadiren enfeksiyonlara sebep olabilirler.

<i>Enterococcus faecalis</i>

Enterococcus faecalis, insanların gastrointestinal sistemlerinde yaşayan Gram-pozitif, kommensal birbakteridir. Enterococcus cinsindeki diğer türler gibi, E. faecalis de sağlıklı bireylerde doğal olarak bulunur ve probiyotik olarak kullanılabilir. Symbioflor1 ve EF-2001 gibi probiyotik suşlar, ilaç direnci ve patogenez ile ilgili çeşitli genlerden yoksundurlar. Fırsatçı bir patojen olan E. faecalis, özellikle nozokomiyal - hastane kaynaklı yaşamı tehdit eden enfeksiyonlara neden olabilir ve bakteride yüksek seviyede bulunabilen doğal antibiyotik direnci, patojenitesine katkıda bulunmaktadır. Kanal tedavisi sonrası yeniden enfekte olmuş vakalarda % 30 ila % 90 oranında E. faecalis tespit edilmiştir. Bu oran, primer enfeksiyon vakalarındaki bulunma oranından yaklaşık dokuz kat daha fazladır.

<span class="mw-page-title-main">Burkholderia pseudomallei</span>

.

<span class="mw-page-title-main">Klebsiella oxytoca</span>

.