İçeriğe atla

Corynebacterium

Corynebacterium
C. glutamicum faz-kontrast mikroskop görüntüsü
Biyolojik sınıflandırma Bu sınıflandırmayı düzenle
Üst âlem:Bacteria
Şube:Actinobacteria
Takım:Actinomycetales
Familya:Corynebacteriaceae
Cins:Corynebacterium
Lehmann and Neumann 1896[1]
Tip tür
Corynebacterium diphtheriae
(Kruse 1886) Lehmann and Neumann 1896
Türler
  • C. accolens
  • C. afermentans
  • C. alimapuense
  • C. ammoniagenes
  • C. amycolatum
  • C. anserum
  • C. appendicis
  • C. aquatimens
  • C. aquilae
  • C. argentoratense
  • C. atrinae
  • C. atypicum
  • C. aurimucosum
  • C. auris
  • C. auriscanis
  • C. belfantii
  • C. beticola
  • C. bovis
  • C. callunae
  • C. camporealensis
  • C. canis
  • C. capitovis
  • C. casei
  • C. caspium
  • C. choanae
  • C. ciconiae
  • C. confusum
  • C. coyleae
  • C. crudilactis
  • C. cystitidis
  • C. deserti
  • C. diphtheriae
  • C. doosanense
  • C. durum
  • C. efficiens
  • C. endometrii
  • C. epidermidicanis
  • C. faecale
  • C. falsenii
  • C. felinum
  • C. flavescens
  • C. fournieri
  • C. frankenforstense
  • C. freiburgense
  • C. freneyi
  • C. gerontici
  • C. glaucum
  • C. glucuronolyticum
  • C. glutamicum
  • C. glyciniphilum
  • C. gottingense
  • C. guangdongense
  • C. halotolerans
  • C. hansenii
  • C. humireducens
  • C. ilicis
  • C. imitans
  • C. jeddahense
  • C. jeikeium
  • C. kroppenstedtii
  • C. kutscheri
  • C. lactis
  • C. liangguodongii
  • C. lipophiloflavum
  • C. lizhenjunii
  • C. lowii
  • C. lubricantis
  • C. macginleyi
  • C. marinum
  • C. maris
  • C. massiliense
  • C. mastitidis
  • C. matruchotii
  • C. minutissimum
  • C. mucifaciens
  • C. mustelae
  • C. mycetoides
  • C. nasicanis
  • C. nuruki
  • C. oculi
  • C. otitidis
  • C. pelargi
  • C. phocae
  • C. pilbarense
  • C. pilosum
  • C. pollutisoli
  • C. propinquum
  • C. pseudodiphtheriticum
  • C. pseudopelargi
  • C. pseudotuberculosis
  • C. pyruviciproducens
  • C. qintianiae
  • C. renale
  • C. resistens
  • C. riegelii
  • C. rouxii
  • C. sanguinis
  • C. silvaticum
  • C. simulans
  • C. singulare
  • C. sphenisci
  • C. spheniscorum
  • C. sputi
  • C. stationis
  • C. striatum
  • C. suicordis
  • C. sundsvallense
  • C. suranareeae
  • C. tapiri
  • C. terpenotabidum
  • C. testudinoris
  • C. thomssenii
  • C. timonense
  • C. trachiae
  • C. tuberculostearicum
  • C. tuscaniense
  • C. ulcerans
  • C. ulceribovis
  • C. urealyticum
  • C. ureicelerivorans
  • C. urinipleomorphum
  • C. urogenitale
  • C. uropygiale
  • C. uterequi
  • C. variabile
  • C. vitaeruminis
  • C. xerosis
  • C. yudongzhengii

Corynebacterium, Gram-pozitif ve aerobik bir bakteri cinsi. Bunlar basildir (çubuk şeklinde) ve yaşamın bazı evrelerinde, cins ismine ilham veren sopa şeklindeler (coryneform "sopa şeklindeki" anlamına gelir).

Doğada hayvanların mikrobiyotasında (insan mikrobiyotası da dahil) yaygın olarak dağılırlar ve çoğunlukla zararsızdırlar, yaygın olarak konakçıları ile kommensal ilişkilerde bulunurlar. Bazıları, C. glutamicum gibi, endüstriyel ortamlarda yararlıdır. Diğerleri ise, C. diphtheriae' nin difteriye sebep olduğu gibi insan hastalıklarına neden olabilir. Çeşitli mikrobiyota türlerinde olduğu gibi (Arcanobacterium ve Trueperella cinsindeki kuzenleri de dahil olmak üzere), bunlar genellikle patojen değildir, ancak zaman zaman fırsatçı olarak dokulara atipik erişimden (yaralar yoluyla) veya zayıflamış konukçu savunma sistemlerinden yararlanabilirler .

Taksonomi

Corynebacterium cinsi, 1896'da Lehmann ve Neumann tarafından difteri oluşumuna neden olan bakteri çubuklarını içeren bir taksonomik grup olarak yaratılmıştır vemorfolojik özelliklerine göre tanımlandı.

Türler

  • Corynebacterium efficiens

Corynebacteria türlerinin çoğu lipofilik değildir. []

Lipofilik olmayanlar

Lipofilik olmayan bakteriler fermentatif ve fermentatif olmayan olarak sınıflandırılabilir:

  • Fermentatif corynebacteria türleri
  • Fermentatif olmayan corynebacteria türleri
    • Corynebacterium afermentans subsp. afermentans
    • Corynebacterium auris
    • Corynebacterium pseudodiphtheriticum
    • Corynebacterium propinquum[2]

Lipofilikler

  • Corynebacterium uropygiale
  • Corynebacterium jeikeium
  • Corynebacterium urealyticum
  • Corynebacterium afermentans subsp. lipophilum
  • Corynebacterium accolens
  • Corynebacterium macginleyi
  • CDC coryneform groups F-1 and G
  • Corynebacterium bovis[2]

Mikolik asit içermeyen yeni corynebacteria türleri

  • Corynebacterium kroppenstedtii[3]

Konuyla ilgili yayınlar

  • Burkovski, Andreas, (Ed.) (2008). Corynebacteria: Genomics and Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-30-1. 17 Eylül 2008 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 14 Kasım 2019. 
  • Ryan KJ; Ray CG (editors) (2004). Sherris Medical Microbiology (4.4yayıncı=McGraw Hill bas.). ISBN 978-0-8385-8529-0. 
  • Database of Corynebacterial Transcription Factors and Regulatory Networks 24 Şubat 2016 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
  • Rollins, David M. University of Maryland: Pathogentic Microbiology: Corynebacterium [1] 28 Mayıs 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
  • A. Khamis, D. Raoult, B. La Scola. 2004. rpoB gene sequencing for identification of Corynebacterium species. Journal of Clinical Microbiology. 42(9):3925–3931.
  • A. Poetsch, U. Haußmann, A. Burkovski. 2011. Proteomics of corynebacteria: From biotechnology workhorses to pathogens. Proteomics 2011(11):3244–3255. Available from: https://doi.org/10.1002/pmic.201000786
  • D. Goldenberger et al. 2014. Extended characterization of Corynebacterium pyruviciproducens based on clinical strains from Canada and Switzerland. Journal of Clinical Microbiology. 52(9), 3180–3183.
  • E. Hacker et al. 2015. Colonization of human epithelial cell lines by Corynebacterium ulcerans from human and animal sources. [Internet]. Microbiology (United Kingdom). 161(8):1582–1591. Available from: https://doi.org/10.1099/mic.0.000121
  • K. A. Bernard, C. Munro, D. Wiebe, E. Ongsanso. 2002., Characteristics of rare or recently described Corynebacterium species recovered from human clinical material in Canada. Journal of Clinical Microbiology. 40(11):4375–4381.
  • M. Bittel, S. Gastiger, B. Amin, J. Hofmann, A. Burkovski. 2018. Surface and Extracellular Proteome of the Emerging Pathogen Corynebacterium ulcerans. Proteomes. 6(2):18. Available from: https://doi.org/10.3390/proteomes6020018
  • M. Ventura et al. 2007. Genomics of Actinobacteria: Tracing the Evolutionary History of an Ancient Phylum. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 71(3):495-548.
  • N. Hansmeier, T. C. Chao, J. Kalinowski, A. Pühler, A. Tauch. 2006. Mapping and comprehensive analysis of the extracellular and cell surface proteome of the human pathogen Corynebacterium diphtheriae. [Internet] Proteomics 2006(6):2465–2476. Available from: https://doi.org/10.1002/pmic.200500360
  • P. Riegel, R. Ruimy, R. Christen, H. Monteil. 1996. Species identities and antimicrobial susceptibilities of Corynebacteria isolated from various clinical sources. European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. 15(8), 657–662.
  • Riegel P, Ruimy R, Christen R, Monteil H. 1996. Species identities and antimicrobial susceptibilities of corynebacteria isolated from various clinical sources. [Internet] European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases: Official Publication of the European Society of Clinical Microbiology. 15(8):657-62. Available from: https://search.proquest.com/docview/78481820?accountid=10355 22 Ekim 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
  • V. Carfora et al. 2018. Non-toxigenic Corynebacterium ulcerans sequence types 325 and 339 isolated from two dogs with ulcerative lesions in Italy. [Internet] Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. 30(3):447–450. Available from: https://doi.org/10.1177%2F1040638718764786
  • Y. Nishio et al. 2007. Evolutionary process of amino acid biosynthesis in Corynebacterium at the whole genome level. [Internet]. Molecular Biology and Evolution. 21(9):1683–1691. Available from: https://doi.org/10.1093/molbev/msh175

Kaynakça

  1. ^ Lehmann KB, Neumann R. (1896). Atlas und Grundriss der Bakteriologie und Lehrbuch der speziellen bakteriologischen Diagnostik, 1st ed. J.F. Lehmann, München,. 
  2. ^ a b c Funke, G; von Graevenitz, A; Clarridge Je, 3rd; Bernard, K. A. (1997). "Clinical microbiology of coryneform bacteria". Clinical Microbiology Reviews. 10 (1). ss. 125-59. doi:10.1128/CMR.10.1.125. PMC 172946 $2. PMID 8993861. 
  3. ^ Collins, M. D.; Falsen, E.; Akervall, E.; Sjoden, B.; Alvarez, A. (1998). "Note: Corynebacterium kroppenstedtii sp. nov., a novel corynebacterium that does not contain mycolic acids". International Journal of Systematic Bacteriology. 48 (4). ss. 1449-54. doi:10.1099/00207713-48-4-1449. PMID 9828448. 

İlgili Araştırma Makaleleri

<i>Neisseria</i> Bakteri cinsi

Neisseria, Proteobacteria şubesine dahil, gram negatif, aerob, diplokok bir bakteri cinsidir. Mikroskopla incelendiğinde kahve tanesine benzer bir yapıda olduğu gözlemlenmektedir.

<i>Legionella</i>

Legionella, lejyoner hastalığına sebep olan bakterilerin yer aldığı bakteri cinsidir. Legionellaceae familyası sadece Legionella cinsinden ibarettir ve bu cinse ait bugüne kadar bildirilmiş 62 tür bulunmaktadır. En iyi bilinen türü olan Legionella pneumophila, gram negatif, kokobasil formunda, optimum üreme sıcaklığı 20-42 °C olan bir bakteridir. Ribozomal RNA analizi çalışmaları Legionellaceae familyasının Gamma Proteobacteria şubesine dahil olduğunu göstermiştir.

<i>Corynebacterium diphtheriae</i>

Corynebacterium diphtheriae, Corynebacteriaceae familyasına ait, difteri hastalığı etkeni olan bir bakteri türü. İlk olarak 1884 yılında Alman bakteriyologlar Edwin Klebs (1834–1912) ve Friedrich Loeffler (1852–1915) tarafından keşfedildiğinden dolayı, Klebs–Löffler basili olarak da bilinir.

<i>Cutibacterium acnes</i> Bakteri

Cutibacterium acnes, gram-pozitif, yavaş çoğalan, cildin normal florasında da bulunan bir bakteri türüdür. Akne oluşumunda rol oynadığı bilinmektedir.

<i>Homo rhodesiensis</i> soyu tükenmiş hominid türü

Homo rhodesiensis, Arthur Smith Woodward (1921) tarafından Zambiya Broken Hill'deki bir mağaradan çıkarılan bir Orta Taş Devri fosili olan Kabwe 1'i sınıflandırmak için önerilen tür adıdır. 2020'de kafatası 324.000 ila 274.000 yıl öncesine tarihlendirildi. Türe ait diğer benzer yaşlı örnekler de mevcuttur.

Kristalin, anatomide göz merceği ile korneada bulunan, bu yapının şeffaflığını sağlayan ve suda eriyebilen yapısal bir proteindir. Kristalin, aynı zamanda kalp ve meme kanseri tümörleri içinde de tespit edilmiştir. Göz merceği yaralanmalarının sinir yenilenmelerini teşvik ettiği saptandığından beri kristalin nörolojide sinirsel bir araştırma alanı olmuştur. Şimdiye dek gösterilebildiği kadar, kristalin β b2 (crybb2) nöriti teşvik eden bir faktör olabilir.

Mycobactin Mycobacteri hücrelerinde hücre dışı serbest demir iyonlarını yakalamak için Mycobacterium cinsi üyeleri tarafından kullanılan bir siderofor. Patojen M. tuberculosis bu amaç doğrultusunda kendi micobactinini üretebilir. Ancak M. avium altçeşiti paratuberculosis gibi Mycobacteriumlar siderofor üretemezler ve bundan dolayı bu organizmalar laboratuvarda üretilmek zorundadırlar.

Arthrobacter castelli, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Vibrio lentus deniz ortamında bulunan bir gram negatif bakteri türüdür. İlk defa Akdeniz istiridyesinden izole edilmiştir. Ahtapotlara patojenik olan bu tür, deri lezyonları, kas maruziyetlerine ve bazen ölüme sebep olur.

Paeniglutamicibacter cryotolerans, Aktinobakteriler sınıfından bir bakteri türüdür. Psikrotolerant, halotolerant, Gram-pozitif, hareketli ve fakültatif anaerobiktir. Bir basil-kok döngüsüne sahiptir.

Arthrobacter gyeryongensis, Gynostemma pentaphyllum bitkileri olan bir tarladan topraktan izole edilen Arthrobacter cinsinden Gram pozitif ve çubuk şeklindeki bir bakteri türüdür.

Arthrobacter luteolus, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Kütle spektrometresi yazılımı, kütle spektrometresinde veri toplama, analizi veya temsil için kullanılan bir yazılımdır.

<span class="mw-page-title-main">Proteomik</span>

Proteomik, proteinlerin büyük ölçekli bir çalışmasıdır. Proteinler, canlı organizmaların birçok işlevi olan hayati parçalarıdır. Proteom, bir organizma veya sistem tarafından üretilen veya modifiye edilen proteinlerin tamamıdır. Proteomik, giderek artan sayıda proteinin tanımlanmasını sağlamıştır. Proteom, zamana ve bir hücrenin veya organizmanın maruz kaldığı farklı gereksinimlere veya streslere göre değişir. Proteomik, İnsan Genom Projesi de dahil olmak üzere çeşitli genom projelerinin genetik bilgilerinden büyük ölçüde yararlanan disiplinler arası bir alandır. Proteomik, proteomların genel protein bileşimi, yapısı ve aktivitesi seviyesinden araştırılmasını kapsar. Fonksiyonel genomik branşının önemli bir bileşenidir.

Üst-alt proteomik, kütle ölçümü ve ardışık kütle spektrometresi (MS/MS) analizi için izole edilmiş bir protein iyonunu depolamak üzere bir iyon yakalayıcı kütle spektrometresi veya MS/MS ile birlikte iki boyutlu jel elektroforezi gibi diğer protein saflaştırma yöntemlerini kullanan bir protein tanımlama yöntemidir. Üst-alt proteomik, yekpare haldeki proteinlerin analizi yoluyla benzersiz proteoformları tanımlama ve niceleme yeteneğine sahiptir. Kütle spektrometresi sırasında yekpare haldeki proteinler tipik olarak elektrosprey iyonizasyon ile iyonize edilir ve bir Fourier dönüşümü iyon siklotron rezonansı, kuadrupol iyon tuzağı veya Orbitrap kütle spektrometresinde tutulur. Ardışık kütle spektrometresi için parçalanma, elektron yakalama ayrışması veya elektron transfer ayrışması ile gerçekleştirilir. Etkili bir parçalanma, kütle spektrometresi tabanlı proteomikten önce numunenin işleme safyası için kritiktir. Proteom analizi rutin olarak yekpare haldeki proteinlerin sindirilmesini ve ardından kütle spektrometresi (MS) kullanılarak elde edilen protein tanımlamasını içerir. Üst-alt MS (jelsiz) proteomik, protein yapısını, yekpare haldeki bir kütlenin ölçümü ve ardından gaz fazında doğrudan iyon ayrışması yoluyla sorgular.

Enterococcus hirae, Enterococcus'ün bir türüdür. Tip suşu NCDO 1258'dir. Genç tavuklar ile endokarditte görülen büyüme depresyonunda, insanlarda ise sepsiste rol oynar.

<i>Enterobacter</i> Bakteri cinsi

Enterobacter Gram negatif, fakültatif anaerobik, çubuk şeklinde, spor oluşturmayan, Enterobacteriaceae familyasına ait bakteri cinsidir. Enterobacterales takımının tip özelliklerini taşıyan cinsidir. 20 türü bulunmaktadır. Yakın zamanlı çalışmalarla bu cinse ait bazı türler farklı cinsler altında sınıflandırılmıştır, örneğin E. aerogenes, Klebsiella aerogenes olarak değiştirilmiştir. Bu cinsin klinik öneme sahip tek türü E. cloacae'dir.

Droperidol, antiemetik ve antipsikotik olarak kullanılan bir antidopaminerjik ilaçtır. Droperidol ayrıca, yoğun bakım tedavisinde ve "ajitasyon saldırganlığı veya şiddetli davranış"ın mevcut olduğu durumlarda sıklıkla hızlı bir yatıştırıcı olarak kullanılır.

Pleomorfizm mikrobiyolojide bazı mikroorganizmaların çevresel koşullara tepki olarak morfolojilerini, biyolojik işlevlerini veya üreme modlarını değiştirme yeteneğidir. Deinococcaceae bakteri ailesinin bazı üyelerinde pleomorfizm gözlenmiştir. Bakteriyoloji bağlamında pleomorfizmin modern tanımı daha önce sanıldığı gibi bu karakterlerin kalıtsal bir değişikliğinden ziyade tek tek hücrelerin morfolojisinin veya fonksiyonel işlevlerinin varyasyonuna dayanmaktadır.

<span class="mw-page-title-main">Malassezia</span>

Malassezia bir mantar cinsidir. Malasseziales takımının tek familyası olan Malasseziaceae'nin tek cinsidir ve Malasseziomycetes sınıfının tek üyesidir. Malassezia türleri, insanlar da dahil olmak üzere birçok hayvanın derisinde doğal olarak bulunur. Ara sıra fırsatçı enfeksiyonlarda bazı türler insanlarda hipopigmentasyon veya hiperpigmentasyona neden olabilir. Bu mantarlar için alerji testleri mevcuttur.