İçeriğe atla

CKAP5

CKAP5
Uygun yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Başka adlarCKAP5, CHTOG, MSPS, TOG, TOGp, ch-TOG, hücre iskeleti ilişkili protein 5
Dış kimliklerOMIM: 611142 MGI: 1923036 HomoloGene: 8844 GeneCards: CKAP5
Gen yerleşimi (İnsan)
11. Kromozom (insan)
Krom.11. Kromozom (insan)[1]
11. Kromozom (insan)
CKAP5 için genom yerleşimi
CKAP5 için genom yerleşimi
Bant11p11.2Başlangıç46,743,048 [1]
Bitiş46,846,308 [1]
RNA ekspresyonu deseni
Daha çok ekspresyon verisi başvurusu
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_014756
NM_001008938

NM_001165989
NM_029437

RefSeq (protein)

NP_001008938
NP_055571

NP_001159461
NP_083713

Yerleşim (UCSC)Krom. 11: 46.74 – 46.85 Mbn/a
PubMed araması[2][3]
Vikiveri
İnsan'ı Gör/DüzenleFare'yi Gör/Düzenle

Hücre iskeletine bağlı protein 5, insanlarda CKAP5 geni tarafından kodlanan mikrotübüle bağlı bir proteindir.[4][5][6] Xenopus'un XMAP215 proteininin[7] homologudur ve ch-Tog olarak da bilinir.

Bunun, en az iki farklı rollere sahiptir iğ ipliği oluşumunda en az iki ayrı rolü vardır: MCAK (KIF2C) aracılığıyla depolimerizasyondan kinetokor mikrotübüllerini korur ve MCAK etkinliğinden bağımsız bir işlev olan sentrozomal mikrotübül birleştiriminde cH-Tog önemli bir rol oynar.[8]

Etkileşimler

CKAP5'in TACC1 ile etkileşime girdiği gösterilmiştir.[9][10]

Kaynakça

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000175216 - Ensembl, May 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  3. ^ "Fare PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. III. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0081-KIAA0120) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1". DNA Res. 2 (1). Jul 1995. ss. 37-43. 
  5. ^ "Characterization of the cDNA and pattern of expression of a new gene over-expressed in human hepatomas and colonic tumors". Eur. J. Biochem. 234 (2). Feb 1996. ss. 406-13. 
  6. ^ "Entrez Gene: CKAP5 cytoskeleton associated protein 5". 5 Aralık 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  7. ^ "TOGp, the human homolog of XMAP215/Dis1, is required for centrosome integrity, spindle pole organization, and bipolar spindle assembly". Mol. Biol. Cell. 15 (4). 2004. ss. 1580-90. 
  8. ^ "MCAK-independent functions of ch-Tog/XMAP215 in microtubule plus-end dynamics". Mol. Cell. Biol. 28 (23). 2008. ss. 7199-211. 
  9. ^ "TACC1-chTOG-Aurora A protein complex in breast cancer". Oncogene. 22 (50). Nov 2003. ss. 8102-16. 
  10. ^ "Interaction of the transforming acidic coiled-coil 1 (TACC1) protein with ch-TOG and GAS41/NuBI1 suggests multiple TACC1-containing protein complexes in human cells". Biochem. J. 363 (Pt 1). Apr 2002. ss. 195-200. 

Dış bağlantılar

Konuyla ilgili yayınlar

  • Basto R, Gergely F, Draviam VM, Ohkura H, Liley K, Raff JW (2007). "Hsp90 is required to localise cyclin B and Msps/ch-TOG to the mitotic spindle in Drosophila and humans". J. Cell Sci. 120 (Pt 7). ss. 1278-87. doi:10.1242/jcs.000604. PMID 17376965. 
  • Kosturko LD, Maggipinto MJ, D'Sa C, Carson JH, Barbarese E (2005). "The microtubule-associated protein tumor overexpressed gene binds to the RNA trafficking protein heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2". Mol. Biol. Cell. 16 (4). ss. 1938-47. doi:10.1091/mbc.E04-08-0709. PMC 1073673 $2. PMID 15703215. 
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). "Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (33). ss. 12130-5. doi:10.1073/pnas.0404720101. PMC 514446 $2. PMID 15302935. 
  • Cassimeris L, Morabito J (2004). "TOGp, the human homolog of XMAP215/Dis1, is required for centrosome integrity, spindle pole organization, and bipolar spindle assembly". Mol. Biol. Cell. 15 (4). ss. 1580-90. doi:10.1091/mbc.E03-07-0544. PMC 379257 $2. PMID 14718566. 
  • Conte N, Delaval B, Ginestier C, Ferrand A, Isnardon D, Larroque C, Prigent C, Séraphin B, Jacquemier J, Birnbaum D (2003). "TACC1-chTOG-Aurora A protein complex in breast cancer". Oncogene. 22 (50). ss. 8102-16. doi:10.1038/sj.onc.1206972. PMID 14603251. 
  • Gergely F, Draviam VM, Raff JW (2003). "The ch-TOG/XMAP215 protein is essential for spindle pole organization in human somatic cells". Genes Dev. 17 (3). ss. 336-41. doi:10.1101/gad.245603. PMC 195983 $2. PMID 12569123. 
  • Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2002). "Protein-protein interactions between large proteins: two-hybrid screening using a functionally classified library composed of long cDNAs". Genome Res. 12 (11). ss. 1773-84. doi:10.1101/gr.406902. PMC 187542 $2. PMID 12421765. 
  • Lauffart B, Howell SJ, Tasch JE, Cowell JK, Still IH (2002). "Interaction of the transforming acidic coiled-coil 1 (TACC1) protein with ch-TOG and GAS41/NuBI1 suggests multiple TACC1-containing protein complexes in human cells". Biochem. J. 363 (Pt 1). ss. 195-200. doi:10.1042/0264-6021.3630195. PMC 1222467 $2. PMID 11903063. 
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. 6 (9). ss. 791-806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548. 
  • Nakamura S, Grigoriev I, Nogi T, Hamaji T, Cassimeris L, Mimori-Kiyosue Y (2012). "Dissecting the nanoscale distributions and functions of microtubule-end-binding proteins EB1 and ch-TOG in interphase HeLa cells". PLoS ONE. 7 (12). ss. e51442. doi:10.1371/journal.pone.0051442. PMC 3520847 $2. PMID 23251535. 
  • Zanic M, Widlund PO, Hyman AA, Howard J (2013). "Synergy between XMAP215 and EB1 increases microtubule growth rates to physiological levels". Nat. Cell Biol. 15 (6). ss. 688-93. doi:10.1038/ncb2744. PMID 23666085. 

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">DNA</span> Canlıların genetik bilgilerini barındıran molekül

Deoksiriboz nükleik asit veya kısaca DNA, tüm organizmaların ve bazı virüslerin canlılık işlevleri ve biyolojik gelişmeleri için gerekli olan genetik talimatları taşıyan bir nükleik asittir. DNA'nın başlıca rolü bilgiyi uzun süre saklamasıdır. Protein ve RNA gibi hücrenin diğer bileşenlerinin inşası için gerekli olan bilgileri içermesinden dolayı DNA; bir kalıp, şablon veya reçeteye benzetilir. Bu genetik bilgileri içeren DNA parçaları gen olarak adlandırılır. Bazı DNA dizilerinin yapısal işlevleri vardır, diğerleri ise bu genetik bilginin ne şekilde kullanılacağının düzenlenmesine yararlar.

<span class="mw-page-title-main">Homolog rekombinasyon</span>

Homolog rekombinasyon, benzer veya aynı dizilere sahip DNA iplikleri arasında nükleotit dizilerinin birbiriyle yer değiştirdiği bir genetik rekombinasyon tipidir. Bu süreç sırasında DNA birkaç kere kesilir, sonra da birleştirilir. Homolog rekombinasyon, DNA'daki çift iplikli kırıkların hatasız tamirinde kullanılmanın yanı sıra, mayoz sırasında krosover yoluyla yeni DNA dizi bileşimlerinin (kombinezonlarının) oluşumunu da sağlar. DNA'daki yeni bileşimler genetik varyasyonlar oluşturur. Genetik varyasyonlar yeni, bir olasılıkla yararlı olabilecek alel kombinasyonlarıdır, bunların üreyen canlı topluluklarda oluşmaları, bu değişiklikleri taşıyan bireylerin değişen çevresel şartlara evrimsel adaptasyon göstermelerini sağlar.

<span class="mw-page-title-main">RAD51</span>

RAD51, bir insan genidir, bu genin ürünü olan ve aynı isme sahip olan protein DNA çift iplikçikli kesiklerini tamir eder. Bu protein RAD51 protein ailesinin üyelerinden biridir. RAD51 protein ailesi üyeleri bakteriyel RecA ve maya Rad51 ile homologdur. Protein, mayadan insana kadar çoğu ökaryotta korunmuştur.

<span class="mw-page-title-main">Phillip Allen Sharp</span> Amerikalı biyolog

Phillip Allen Sharp, Amerikan genetikçi ve moleküler biyolog. RNA bağlanmasının kaşiflerinden biridir. Richard J. Roberts ile birlikte ökaryot hücrelerinin DNA dizelerindeki genlerin bitişik sırada olmadığını, aralarda intron denilen okunmayan ve protein sentezine katılmayan bölümlerin olduğunu keşfettiler. Bu sayede mRNA'lar aynı DNA dizesinden bu bölümleri farklı şekilde silmeleri ile farklı proteinleri kodlayabilmektedir. İkili bu keşifleri ile 1993 Nobel Fizyoloji veya Tıp Ödülünü kazanmışlardır.

TERC olarak da bilinen telomeraz RNA bileşeni ökaryotlarda bulunan ve telomerazın bir bileşeni olan Kodlamayan RNA'dır. TERC, telomeraz ile telomer replikasyonu için bir kalıp görevi görür. Telomeraz RNA'ları dizi ve yapı açısından omurgalılar, siliatlar ve mayalar arasında büyük farklılıklar gösterir, ancak şablon dizisine yakın bir 5 'sahte düğüm yapıyı paylaşmaktadırlar. Omurgalı telomeraz RNA'larının, 3 'H / ACA snoRNA benzeri alanı vardır.

<span class="mw-page-title-main">CD3D</span>

T hücresi yüzey glikoproteini CD3 delta zinciri, CD3D geni tarafından kodlanan bir insan proteinidir.

<span class="mw-page-title-main">CD59</span>

CD59 glikoproteini, MAC baskılayıcı protein (MAC-IP), membran reaktif liziz inhibitörü veya protektin olarak da bilinen, insanlarda CD59 geni tarafından ile kodlanan bir proteindir. LY6/uPAR/alfa-nörotoksin protein ailesine aittir.

<span class="mw-page-title-main">ARL2</span>

ADP-ribozillenme faktörü benzeri protein 2, insanlarda ARL2 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">CHST1</span>

Karbonhidrat sülfotransferaz 1, insanlarda 11. kromozomun kısa kolunda bulunan CHST1 geni tarafından kodlanan bir proteindir. Proteinin polipeptit zincirinin uzunluğu 411 amino asittir ve molekül ağırlığı 46715'tir.

<span class="mw-page-title-main">CHKA</span>

Kolin kinaz alfa, insanlarda CHKA geni tarafından kodlanan bir enzimdir.

<span class="mw-page-title-main">Osteokalsin</span>

Osteokalsin, başka bir adla kemik gama-karboksiglutamik asit içeren protein (BGLAP), kemik ve dentinde bulunan ve ilk olarak civciv kemiğinde kalsiyum bağlayıcı protein olarak tanımlanan küçük (49-amino-asit) kollajenöz olmayan protein yapılı bir hormonudur.

NADPH oksidaz 3, insanlarda NOX3 geni tarafından kodlanan bir enzimdir.

NADPH oxidaz 4, insanlarda NOX4 ile kodlanan ve NADPH oksidazların NOX ailesine üye enzim.

<span class="mw-page-title-main">Amilin</span>

Amilin veya adacık amiloid polipeptidi (IAPP), 37 kalıntılı peptit hormonudur. Pankreasın β hücrelerinden yaklaşık 100:1 (insülin:amilin) oranında insülin ile eşgüdümlü olarak salgılanmaktadır. Amilin, mide boşalmasını yavaşlatarak ve tokluğu artırarak glisemik düzenlemede rol oynamaktadır, böylelikle yemek sonrasında kan şekeri düzeylerindeki ani artışları önlemektedir.

Transkripsiyon faktörü SOX18 SOX18 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">ACRV1</span>

Akrozomal protein SP-10, insanların 11. kromozomunda yer alan ACRV1 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">40S ribozomal protein S3</span>

40S ribozomal protein S3, insanların 11. kromozomunda yer alan RPS3 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">40S ribozomal protein S2</span>

40S ribozomal protein S2, insanların 11. kromozomunda yer alan RPS2 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">CD81</span>

CD81 molekülü, ayrıca 81. Başkalaşım Kümesi olarak da bilinir, insanların 11. kromozomunda yer alan CD81 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">DAZ1</span>

DAZ1, insan Y kromozomunda yer alan DAZ1 geni tarafından kodlanan bir proteindir.