Sapporo, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğünün merkezi ve bölgenin en büyük şehridir.
Shikoku, Japonya'nın dört büyük adası ve sekiz bölgesinden biridir. Shikoku, Honshū'nun güneyinde ve Kyūshū'nun doğusunda yer almaktadır. Yüzölçümü ve nüfus bakımından Japonya'nın en küçük adası ve bölgesidir. Shikoku, Tokushima, Kagawa, Ehime ve Kōchi prefektörlüklerinden oluşmaktadır.
Kyūshū, Japonya'nın dört büyük adası ve sekiz bölgesinden biridir. Kyūshū, Honshū'nun güneybatısında ve Shikoku'nun batısında yer almaktadır ve Honshū'dan Kanmon Boğazı ile ayrılmaktadır. Kyūshū, Fukuoka, Saga, Nagasaki, Kumamoto, Ōita, Miyazaki ve Kagoshima prefektörlüklerinden oluşmaktadır. Ek olarak Ryūkyū Adaları ile Okinawa prefektörlüğü de Kyūshū Bölgesi'ne dahil edilmektedir.
Fuji Dağı , Honshu adasında bulunan, 3.766 m yüksekliğiyle Japonya’daki en yüksek dağdır. Asya adalarında bulunan ikinci en yüksek yanardağdır ve dünya üzerindeki en yüksek yedinci ada doruğunu oluşturur. Fuji Dağı aktif bir startovolkan olmakla beraber, en son 1707-1708 yılları arasında patladı. Dağ, Tokyo şehrinin 100 km güneybatısında bulunur ve açık havalı günlerde şehirden rahatça görülebilir. Fuji Dağı'nın beş ay boyunca karlı olan simetrik konisi, Japonya'nın kültürel ikonu haline gelmiş, özellikle de sanat ve fotoğrafçılıkta betimlenir; ayrıca turist ve dağcıların sıkça ziyaret ettiği bir doğa harikasıdır.
Gifu, Japonya'nın Gifu prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 202,89 km² olan şehrin nüfusu Haziran 2011 tarihi itibarı ile 412.895'tir.
Morioka, Japonya'nın Iwate prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 886,47 km² olan şehrin nüfusu 1 Şubat 2021 tarihi itibarı ile tahmini nüfusu 290.700'dür ve nüfus yoğunluğu kilometrekarede 328'dir.
Japon Alpleri, Japonya'nın Honshu Adası'nın ortasında yer alan sıradağlardır. Dağlar Kuzey (Hida), Orta (Kiso) ve Güney (Akaishi) Alplerden oluşmaktadır.
Ontake Dağı veya Kiso Ontake Dağı, Japonya'da Hida Dağları'nda bulunan aktif bir yanardağdır. Dağ 3.067 m yüksekliği ile Japonya'nın ikinci yüksek yanardağıdır.
Sakurajima, Japonya'nın Kagoshima prefektörlüğünde bulunan aktif bir yanardağ. Eskiden Kagoshima Körfezi'nde bir ada olup, 1914 yılında gerçekleşen bir yanardağ patlaması sonucu lavlar ile Ōsumi Yarımadası'yla birleşmiştir. Bu aynı zamanda Japonya tarihinin en büyük yanardağ patlaması olmuştur.
Unzen Dağı, Japonya'nın Kyūshū bölgesinde bulunan bir aktif yanardağdır.
Haku Dağı, Japonya'nın Chūbu bölgesinin batısında bulunan potansiyel bir aktif yanardağdır. Dağ Gifu, Fukui, Ishikawa prefektörlükleri arasında yer almaktadır. Haku Dağı Tate ve Fuji dağları ile birlikte Japonya'nın "Üç Kutsal Dağı"'ndan biridir.
Kuchinoerabujima, Japonya'nın Kagoshima prefektörlüğüne bağlı Ōsumi Adaları'na ait bir volkanik adadır. Ada idari olarak Kagoshima prefektörlüğüne bağlıdır.
Akagi Dağı, Japonya'da Gunma prefektörlüğünda bulunan bir dağdır. Dağ, Myōgi ve Haruna dağları ile birlikte Jōmō'nun Üç Dağı (上毛三山) olarak kabul edilir ve Japonya'nın 100 Ünlü Dağı'ndan biridir.
Yōtei Dağı, Japonya'nın Hokkaidō adasında bulunan bir yanardağdır. Dağ, Shikotsu-Toya Millî Parkı'nda yer almakta olup Fuji Dağı'nı andırdığından Ezo Fuji (蝦夷富士) olarak da bilinir. Dağ, Japonya'nın 100 Ünlü Dağı'ndan biridir.
Aso Dağı, Japonya'nın Kumamoto prefektörlüğünde bulunan bir aktif yanardağdır. Dağ, 1,592 metre yüksekliği ile Japonya'nın ve dünyanın en büyük aktif yanardağıdır ve Aso Kujū Millî Parkı sınırları içerisinde yer almaktadır.
Tokachi Dağı, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğünde bulunan bir aktif stratovolkandır. Dağ, adanın ortasında yer almakta olup Daisetsuzan Millî Parkı'nın bir parçasıdır.
Kusatsu Shirane Dağı, Japonya'nın Gunma prefektörlüğünde bulunan bir stratovolkandır. Dağ, Kusatsu kasabası yakınlarında yer almaktadır ve Japonya'nın 100 Ünlü Dağı'ndan biridir.
Nikkō-Shirane Dağı, Japonya'nın Gunma ve Tochigi prefektörlüklerinde bulunan bir stratovolkandır. Dağ, Honshū'nun ortasında yer almakta olup Nikkō Millî Parkı'nın bir parçasıdır.
Mihara Dağı, Japonya'nın Izu Ōshima adasında bulunan bir stratovolkandır. Dağ, ağırlıklı olarak bazaltik olmasına rağmen, 100-150 yıllık aralıklarla büyük patlamalar meydana gelmiştir.
Rausu Dağı Japonya'nın Hokkaidō kentindeki Shiretoko Yarımadası'nda bulunan bir stratovolkandır. Shari ve Rausu kasabaları arasındaki sınırda bulunmaktadır. Rausu Dağı, Hokkaidō'nun en kuzeydoğusundaki Holosen yanardağıdır. Japonya'nın 100 Ünlü Dağı'ndan birisidir.