Sendai Japonya'nın Miyagi prefektörlüğünün merkezi ve Tōhoku bölgesinin en büyük şehridir. 2013 yılı itibarıyla nüfusu 1 milyon olan kent, ayrıca Japonya'nın 20 belirlenmiş şehrinden biridir. 1600 yılında daimyo Date Masamune tarafından kurulan kent, "ağaçların şehri" adıyla da bilinir.
Sapporo, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğünün merkezi ve bölgenin en büyük şehridir.
Okayama, Japonya'nın Okayama prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 789.92 km² olan şehrin nüfusu Ekim 2014 tarihi itibarı ile 714,583'tür.
Nara, Japonya'nın Nara prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir, prefektörlüğün kuzeyinde yer almaktadır. Yüzölçümü 276,84 km² olan şehrin nüfusu 1 Ocak 2010 itibarı ile 368.636'dır. Şehirdeki sekiz tapınak, mabet ve kalıntı olan Tōdai-ji, Saidai-ji, Kōfuku-ji, Kasuga-taisha, Gangō-ji, Yakushi-ji, Tōshōdai-ji ve Heijō Sarayı, Kasugayama Ormanı ile birlikte UNESCO Dünya Mirası olan "Antik Nara'nın Tarihi Anıtları"'nı oluşturmaktadır.
Niigata Japonya'nın Niigata prefektörlüğünin merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 726,09 km² olan şehrin nüfusu 31 Ocak 2012 tarihi itibarı ile nüfusu 804.193'tür.
Aomori Japonya'nın Aomori prefektörlüğünin merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 824.54 km² olan şehrin nüfusu Eylül 2013 tarihi itibarı ile nüfusu 293.442'dir.
Kumamoto, Japonya'nın Kumamoto prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 389.53 km² olan şehrin nüfusu 1 Mart 2010 tarihi itibarı ile 731,286'dır. Kumamoto 1 Nisan 1889 yılında kurulmuş olup 1 Nisan 2012 yılında belirlenmiş şehir statüsü almıştır.
Toyama, Japonya'nın Toyama prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 1.241,85 km² olan şehrin nüfusu 31 Mayıs 2011 tarihi itibarı ile 417.324'tür.
Hakodate, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Oshima alt prefektörlüğünün merkezi ve Hokkaidō'nun üçüncü büyük şehridir. Yüzölçümü 677.89 km² olan şehrin nüfusu 31 Mayıs 2011 tarihi itibarı ile 279,851'dir.
Wakkanai, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Sōya alt prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Yüzölçümü 760.80 km² olan şehrin nüfusu Ekim 2013 itibarı ile 37,011'dir. Wakkanai Japonya'nın en kuzeyindeki şehir olup Rusya'ya bağlı olan Sahalin Adası şehirden görülebilmektedir.
Nagano, Japonya'nın Nagano prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir, prefektörlüğün kuzeyinde Chikuma ve Sai nehirlerinin birleştiği noktada yer almaktadır. Yüzölçümü 834,85 km² olan şehrin nüfusu 1 Nisan 2011 itibarı ile 387.146'dır.
Takamatsu, Japonya'nın Kagawa prefektörlüğünin merkezi ve en büyük şehridir. Şehir Shikoku adasında Seto İç Denizi kıyısında yer almaktadır. Yüzölçümü 375,11 km² olan şehrin nüfusu 1 Ekim 2010 tarihi itibarı ile 419.429'dur.
Miyazaki, Japonya'nın Miyazaki prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Şehir 1 Nisan 1924 tarihinde kurulmuştur. Yüzölçümü 286,96 km² olan şehrin nüfusu Kasım 2010 itibarı ile 399.834'tür.
Kōfu, Japonya'nın Yamanashi prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 212,47 km² olan şehrin nüfusu 1 Kasım 2015 tarihi itibarı ile 193.127'dir.
Otaru, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Shiribeshi alt prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Yüzölçümü 243.13 km² olan şehrin nüfusu 31 Temmuz 2011 itibarı ile 131,706'dır. Otaru, pek çok tarihi binaları ile birlikte popüler bir turistik yerdir.
Kushiro, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Kushiro alt prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Yüzölçümü 1362,75 km² olan şehrin nüfusu 31 Ağustos 2011 itibarı ile 183.757'dir. Kushiro, Doğu Hokkaido'nun en büyük şehridir.
Obihiro, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Tokachi alt prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Yüzölçümü 618,94 km² olan şehrin nüfusu 31 Ağustos 2011 tarihi itibarı ile 168.546'dır.
Kitami, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Ohotsk alt prefektörlüğünde bulunan bir şehirdir. Yüzölçümü 1,427.56 km² olan şehrin nüfusu 1 Mart 2012 itibarı ile 124,789'dur.
Muroran, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı Iburi alt prefektörlüğünün merkezi olan şehirdir. Yüzölçümü 80.65 km² olan şehrin nüfusu 29 Şubat 2012 tarihi itibarı ile 93,716'dır.
Hokuto, Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğünde bulunan şehir. Şehir Oshima alt prefektörlüğünün ortasında yer almaktadır. Yüzölçümü 397.29 km² olan şehrin nüfusu 31 Mart 2008 tarihi itibarı ile 49,452'dir. Hokuto 1 Şubat 2006 tarihinde kurulmuştur.