İçeriğe atla

Arthrobacter agilis

Arthrobacter agilis
Korunma durumu
Değerlendirilmedi (IUCN 3.1)
Biyolojik sınıflandırma Bu sınıflandırmayı düzenle
Üst âlem:Bacteria
Şube:Actinobacteria
Takım:Actinomycetales
Familya:Micrococcaceae
Cins:Arthrobacter
Tür: A. agilis
İkili adlandırma
Arthrobacter agilis
Koch et al. 1995
Sinonimler
Micrococcus agilis[1][2]

Arthrobacter agilis, Arthrobacter cinsine bağlı fizokrotrofik bir bakteri türüdür.[3] Anktarktik deniz buzlarında ve göl sularında bulunur.[4][5][6][7][8] Arthrobacter agilis dimetilhekzadesilamin ve karotenoid üretir.[9]

Hindistan Himalayalar' da bulunan bir buzaltı gölü olan Pangong Gölü'nde izole edilmiştir.[10] Genom anlizleri canlının metablik çok yönlülüğünü gösteren genlerin ortaya çıkmasını sağladı. Bu genler arasında soğuk şoku adaptasyonu, çeşitli yapısal ve, bitki temelli karbon polimerleri gibi, deposal polisakkaridlerin biyosentezi ve kullanımını gösteren genler vardır. Arthrobacter agilis suş L77 genomu 3,608,439 baz çifti (3.60 Mb) boyutunda bir dairesel kromozomdan ibarettir. of a circular chromosome. Genom 3316 protein kodlayan gen, 74 RNA geni, 725 hipotetik gen, 25 yalancı gen ve 1404 eşsiz gen içerir.[11] Hidrolitik enzimleri ve soğuk şok proteinleri adayları genomda tespit edilmiştir. Arthrobacter agilis suş L77 gelecek vadeden biyolojik projelerde antifriz proteinlerin, işlevsel enzimlerin ve diğer biyoaktif moleküllerin bir kaynağı olarak hizmet edecektir.[12]

Konuyla ilgili yayınlar

  • George M. Garrity (2012). Bergey's manual of systematic bacteriology (2.2yer=New York bas.). Springer Science + Business Media. ISBN 0387682333. 
  • Naveen Kumar Arora (2013). Plant microbe symbiosis : fundamentals and advances. New Delhi: Springer. ISBN 8132212878. 
  • Koki Horikoshi (2011). Extremophiles handbook. Tokyo: Springer. ISBN 4431538976. 

Dış bağlantılar

Kaynakça

  1. ^ Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen [1] 15 Ağustos 2018 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
  2. ^ "ATCC". 15 Ağustos 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ağustos 2018. 
  3. ^ "ITIS". 30 Ekim 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 2 Haziran 2022. 
  4. ^ Ulber, vol. ed. Yves Le Gal ; Roldand (2005). Marine biotechnology ([Standing order]. bas.). Berlin: Springer. ISBN 3-540-25669-5. 
  5. ^ Miller, edited by Robert V.; Whyte, Lyle G. (2012). Polar microbiology : life in a deep freeze. Washington, DC: ASM Press. ISBN 1-55581-604-5. CS1 maint: Extra text: authors list (link)
  6. ^ editors, Antonio Ventosa, Aharon Oren, Yanhe Ma, (2011). Halophiles and hypersaline environments current research and future trends. Berlin: Springer. ISBN 3-642-20198-9. 
  7. ^ Atlas, edited by Asim K. Bej, Jackie Aislabie, Ronald M. (2010). Polar microbiology the ecology, biodiversity, and bioremediation potential of microorganisms in extremely cold environments. Boca Raton: Taylor & Francis. ISBN 1-4200-8388-0. CS1 maint: Extra text: authors list (link)
  8. ^ "UniProt". 15 Ağustos 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ağustos 2018. 
  9. ^ Velázquez-Becerra, C; Macías-Rodríguez, LI; López-Bucio, J; Flores-Cortez, I; Santoyo, G; Hernández-Soberano, C; Valencia-Cantero, E (Aralık 2013). "The rhizobacterium Arthrobacter agilis produces dimethylhexadecylamine, a compound that inhibits growth of phytopathogenic fungi in vitro". Protoplasma. 250 (6). ss. 1251-62. doi:10.1007/s00709-013-0506-y. PMID 23674267. 
  10. ^ Yadav, Ajar Nath; Sachan, Shashwati Ghosh; Verma, Priyanka; Tyagi, Satya Prakash; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil K. (5 Kasım 2014). "Culturable diversity and functional annotation of psychrotrophic bacteria from cold desert of Leh Ladakh (India)". World Journal of Microbiology and Biotechnology (İngilizce). 31 (1). ss. 95-108. doi:10.1007/s11274-014-1768-z. ISSN 0959-3993. 15 Ağustos 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ağustos 2018. 
  11. ^ Singh, Ram N.; Gaba, Sonam; Yadav, Ajar N.; Gaur, Prakhar; Gulati, Sneha; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil K. (1 Ocak 2016). "First high quality draft genome sequence of a plant growth promoting and cold active enzyme producing psychrotrophic Arthrobacter agilis strain L77". Standards in Genomic Sciences. Cilt 11. s. 54. doi:10.1186/s40793-016-0176-4. ISSN 1944-3277. PMC 5000428 $2. PMID 27570579.  This content is available under the Creative Commons Attribution License 4.0.
  12. ^ "Bacterial diversity of cold deserts and mining of genes for low temperature tolerance (PDF Download Available)". ResearchGate (İngilizce). doi:10.13140/rg.2.1.2948.1283/2. []

İlgili Araştırma Makaleleri

Naylonla beslenen bakteri, bazı naylon yan ürünlerini sindirebilen bir Paenarthrobacter ureafaciens suşudur. Naylonu sindirebilmek için naylonaz olarak bilinen bir grup enzimi kullanır.

<i>Paenarthrobacter nicotinovorans</i> Paenarthrobacter cinsine ait aerobik bir Gram-pozitif bakteri

Paenarthrobacter nicotinovorans, Paenarthrobacter cinsine ait aerobik bir Gram-pozitif bakteri türüdür. Arthrobacter oxydans 2016' dan önce Arthrobacter cinsi içinde sınıflandırılan bu tür, 2016 yılında Paenarthrobacter cinsi içinde sınıflandırılarak Paenarthrobacter nicotinovorans ismini almıştır. Bu bakteri türü atrazin, nikotin ve kreatin sindirebilme yeteneğine sahiptir ve nikotin dehidrogenaz üretir.

Paenarthrobacter aurescens,, Paenarthrobactercinsine ait bir bakteri türüdür. Paenarthrobacter aurescens nitrilaz ve L-N-carbamoilaz üretir. Paenarthrobacter aurescens düşük GC içeriğine sahiptir ve anethol adındaki maddeyi metabolize edebilme yeteneğine sahiptir.

Paenarthrobacter histidinolovorans,, Paenarthrobacter cinsine ait bakteri türlerinden birisidir. Topraktan izole edilmiştir. Paenarthrobacter histidinolovorans histidinol dehidrogenaz adında bir enzim üretir.

Paenarthrobacter nitroguajacolicus, Paenarthrobacter cinsine ait bir bakteri türü. Çekya'da topraktan izole edilmiştir. Arthrobacter nitroguajacolicus 4-nitroguayiyakol isimli maddeyi sindirme yeteneğine sahiptir.

Arthrobacter alpinus, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter bambusae bir Gram-pozitif, aerobik ve çubuk şeklinde olan bir Arthrobacter cinsi üyesi. Kore'de bir bambu koruluğunda izole edilmiştir. Açık gri bir renge sahiptir.

Arthrobacter castelli, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter tumbae, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Paeniglutamicibacter cryotolerans, Aktinobakteriler sınıfından bir bakteri türüdür. Psikrotolerant, halotolerant, Gram-pozitif, hareketli ve fakültatif anaerobiktir. Bir basil-kok döngüsüne sahiptir.

Arthrobacter crystallopoietes, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter koreensis, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter oryzae, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter psychrolactophilus, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter methylotrophus, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Falsarthrobacter nasiphocae, yaygın fokun burun boşluğundan izole edilmiş Arthrobacter cinsinden Gram pozitif, zorunlu aerobik ve çubuk şeklinde bir bakteri türü.

Arthrobacter humicola, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter parietis, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter globiformis, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter luteolus, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.