
Ogasawara Millî Parkı, Japonya'nın başkenti Tokyo'nun yaklaşık bin kilometre güneyinde, Ogasawara Adaları'nda bulunan bir millî park. Park, Tokyo metropolünün bir parçası olarak Ogasawara belediyesi içerisinde 16 Ekim 1972 yılında kurulmuştur. 2011 yılında, Ogasawara Adaları UNESCO Dünya Mirası listesine dahil edildi.

Shiretoko Millî Parkı, Japonya'nın Hokkaidō Adası'nın kuzeydoğu ucundaki Shiretoko Yarımadası'nda bulunan bir millî parktır. Shiroteko, Aynu dilinde "yerin çıktığı yer" anlamına gelen "sir etok" sözcüğünden türemiştir.

Akan Millî Parkı, Japonya'nın Hokkaidō Adası'nda bulunan bir millî parktır. Park, 4 Aralık 1934 tarihinde kurulmuş olup Daisetsuzan Millî Parkı ile birlikte Hokkaidō'nun en eski millî parklarından biridir.

Japonya'daki millî parklar listesi, Japonya'da bulunan millî parkları içerir.

Amami Ōshima, Japonya'nın Satsunan Adaları'na bağlı bir adadır. Ada idari olarak Kagoshima prefektörlüğünde yer almakta olup Amami şehri, Tatsugō ve Setouchi kasabaları ile Uken ve Yamato köyleri olmak üzere beş belediyeye ayrılmaktadır. Adanın çoğu Amami Guntō Yarı-Milli Parkı sınırları içerisindedir.

Fuji-Hakone-Izu Millî Parkı, Japonya'nın Yamanashi, Shizuoka ve Kanagawa prefektörlükleri ile Tokyo metropolünün batısında bulunan bir millî parktır. Park, Fuji Dağı, Beş Fuji Gölü, Hakone, Izu Yarımadası ve Izu Adaları'ndan oluşmaktadır. Fuji-Hakone-Izu Millî Parkı, 1,227 km²'lik bir alanı kapsamaktadır. Tokyo'ya olan yakınlığı ve ulaşım kolaylığı nedeniyle Japonya'nın en çok ziyaret edilen milli parkıdır.

Oze Millî Parkı, Japonya'nın Fukuşima, Tochigi, Gunma ve Niigata prefektörlüklerinde bulunan bir millî parktır. Park, 372 km²'lik bir alanı kapsamaktadır ve ülkenin 29. millî parkıdır.

Daisetsuzan Millî Parkı, Japonya'nın Hokkaidō Adası'nın kuzeyinde bulunan bir millî parktır. Park, Kamikawa ve Tokachi alt prefektörlüklerinde yer almakta olup Japonya'nın en büyük millî parkıdır. Daisetsuzan Millî Parkı, 2,267.64 km²'lik bir alanı kapsamaktadır ve yaklaşık olarak Kanagawa prefektörlüğü ile aynı büyüklüktedir. Daisetsuzan Millî Parkı, 4 Aralık 1934 tarihinde kuruldu.

Nikkō Millî Parkı, Japonya'nın Fukuşima, Tochigi, Gunma ve Niigata prefektörlüklerinde bulunan bir millî parktır. Park, 1,147.53 km²'lik bir alanı kapsamaktadır. Nikkō Millî Parkı, 4 Aralık 1934 tarihinde kuruldu.

Towada-Hachimantai Millî Parkı, Japonya'nın Tōhoku bölgesinin kuzeyinde bulunan bir millî parktır. 1 Şubat 1936 tarihinde kurulmuş olup 854 km²'lik alana sahiptir ve Akita, Aomori ve Iwate prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Sanriku Fukkō Millî Parkı, Japonya'nın Tōhoku bölgesinin kuzeydoğusunda bulunan bir millî parktır. 24 Mayıs 2013 tarihinde kurulmuş olup 285,37 km²'lik alana sahiptir ve Sanriku Sahili boyunca Aomori, Iwate, Miyagi prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Bandai-Asahi Millî Parkı, Japonya'nın Tōhoku bölgesinin ortasında bulunan bir millî parktır. 5 Eylül 1950 tarihinde kurulmuş olup 1.870,41 km²'lik alanı ile Japonya'nın üçüncü büyük millî parkıdır ve Fukuşima, Niigata, Yamagata prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.
Güney Japon Alpleri Millî Parkı, Japonya'nın Chūbu bölgesinin ortasında bulunan bir millî parktır. 1 Haziran 1964 tarihinde kurulmuş olup 357,52 km²'lik alana sahiptir ve Nagano, Şizuoka ve Yamanashi prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Chūbu-Sangaku Millî Parkı, Japonya'nın Chūbu bölgesinin ortasında bulunan bir millî parktır. 4 Aralık 1934 tarihinde kurulmuş olup 1.743,23 km²'lik alana sahiptir ve Gifu, Nagano, Niigata ve Toyama prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Ise-Shima Millî Parkı, Japonya'nın Mie prefektörlüğünde bulunan bir millî parktır. 20 Kasım 1946 tarihinde kurulmuş olup 555,49 km²'lik alana sahiptir.

Setonaikai Millî Parkı, Japonya'nın Seto İç Denizi çevresinde bulunan bir millî parktır. 16 Mart 1934 tarihinde kurulmuş olup 669,34 km²'lik alana sahiptir.

Ashizuri-Uwakai Millî Parkı, Japonya'nın Shikoku bölgesinde bulunan bir millî parktır. 10 Kasım 1972 tarihinde kurulmuş olup 111,66 km²'lik alana sahiptir ve Ehime ve Kōchi prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Iriomote-Ishigaki Millî Parkı, Japonya'nın Okinawa prefektörlüğünde bulunan bir millî parktır. 15 Mayıs 1972 tarihinde kurulmuş olup 205,69 km²'lik alana sahiptir ve Doğu Çin Denizi'ndeki Yaeyama Adaları içerisinde yer almaktadır.

Aso-Kujū Millî Parkı, Japonya'nın Kyūshū bölgesinde bulunan bir millî parktır. 4 Aralık 1934 tarihinde kurulmuş olup 726,78 km²'lik alana sahiptir ve Kumamoto ve Ōita prefektörlüklerinin sınırları içerisinde yer almaktadır.

Yakushima Millî Parkı, Japonya'nın Kagoshima prefektörlüğünde bulunan bir millî parktır. 16 Mart 2012 tarihinde Kirishima-Yaku Millî Parkı'nın ikiye ayrılması sonucu kurulmuş olup 325,53 km²'lik alana sahiptir ve Yakushima ve Ōsumi Adaları'nın bir kısmında yer almaktadır.