İçeriğe atla

Alphaproteobacteria

Alphaproteobacteria
Bir böcek hücresi içindeki Wolbachia'nın TEM mikrografisi.
Credit:Public Library of Science / Scott O'Neill
Methylobacterium symbioticum kolonileri
Biyolojik sınıflandırma Bu sınıflandırmayı düzenle
Üst âlem:Bacteria
Şube:Proteobacteria
Sınıf:Alphaproteobacteria
Garrity et al. 2006[2]
Takımlar [1]
  • Caulobacterales Henrici and Johnson 1935 (Approved Lists 1980)
  • Emcibacterales Iino et al. 2016
  • Holosporales Szokoli et al. 2020
  • Hyphomicrobiales Douglas 1957
  • Iodidimonadales Iino et al. 2016
  • Kordiimonadales Kwon et al. 2005
  • Magnetococcales Bazylinski et al. 2013
  • Micropepsales Harbison et al. 2017
  • Minwuiales Sun et al. 2018
  • Rhodobacterales Garrity et al. 2006
  • Rhodospirillales Pfennig and Trüper 1971
  • Rhodothalassiales Venkata Ramana et al. 2014
  • Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939
  • Sneathiellales Kurahashi et al. 2008
Sinonimler [1]
  • Caulobacteria Cavalier-Smith 2020
  • Anoxyphotobacteria (Gibbons and Murray 1978) Murray 1988
  • Photobacteria Gibbons and Murray 1978 (Approved Lists 1980)
  • Alphabacteria Cavalier-Smith 2002

Alphaproteobacteria, Proteobacteria şubesinde bir bakteri sınıfıdır.[3] Üyeleri son derece çeşitlidir ve çok az benzerliğe sahiptir ancak yine de ortak bir atadandırlar. Tüm Proteobakteriler gibi, üyeleri gram-negatiftir fakat bazı hücre içi parazit üyeleri peptidoglikandan yoksundur ve bu nedenle gram değişkendir.[1][3]

Özellikleri

Alphaproteobacteria çeşitli bir taksondur ve birkaç fototrofik cins, birkaç C1-bileşiği metabolize edici cins (örn. Methylobacterium türleri), bitkilerin simbiyontları (örn. Rhizobium türleri), Eklembacaklıların endosimbiyontları (Wolbachia) ve hücre içi patojenleri (örn. Rickettsia) içerir. Ayrıca, sınıf (soyu tükenmiş bir üye olarak), ökaryotik bir ata tarafından yutulan ve ökaryotik hücrelerde mitokondri organelinin atası olan protomitokondri bakterisini içerir (Bakınız endosimbiyoz teorisi). Rhizobium radiobacter (eski adıyla Agrobacterium tumefaciens) teknolojik bir ilgi alanıdır: bilim adamları bu türü sıklıkla yabancı DNA'yı bitki genomlarına aktarmak için kullanırlar. Pelagibacter ubique gibi aerobik anoksijenik fototrofik bakteriler, yaygın olarak dağılmış ve açık okyanus mikrobiyal topluluğunun % 10'undan fazlasını oluşturabilen alfaproteobakterilerdir.

Taksonomik Alt Gruplar

Taksonomik alt gruplar listesi LPSN'ye göre hazırlanmıştır, sinonim isimlere ve geçerli olarak yayınlanmamış taksonlara yer verilmemiştir.[1]

TakımlarFamilyalarÖnemli Cinsler & Türler
Caulobacterales CaulobacteraceaeCaulobacter
Hyphomonadaceae Hyphomonas
Maricaulaceae Maricaulis
Emcibacterales Emcibacteraceae Emcibacter
Holosporales Holosporaceae Holospora
Hyphomicrobiales Aestuariivirgaceae Aestuariivirga
Afifellaceae Afifella
Ahrensiaceae Ahrensia
Alsobacteraceae Alsobacter
Amorphaceae Amorphus
Ancalomicrobiaceae Ancalomicrobium
AurantimonadaceaeAurantimonas
BartonellaceaeBartonella (B. henselae)
BeijerinckiaceaeBeijerinckia
Blastochloridaceae Blastochloris
Boseaceae Bosea
Breoghaniaceae Breoghania
BrucellaceaeBrucella (B. melitensis)
Chelatococcaceae Chelatococcus
CohaesibacteraceaeCohaesibacter
Devosiaceae Devosia
HyphomicrobiaceaeHyphomicrobium (H. vulgare)
Kaistiaceae Kaistia
Lichenibacteriaceae Lichenibacterium
Lichenihabitantaceae Lichenihabitans
MethylobacteriaceaeMethylobacterium
MethylocystaceaeMethylocystis
Nitrobacteraceae Nitrobacter
Notoacmeibacteraceae Notoacmeibacter
Parvibaculaceae Parvibaculum
Phreatobacteraceae Phreatobacter
PhyllobacteriaceaePhyllobacterium
Pleomorphomonadaceae Pleomorphomonas
Pseudoxanthobacteraceae Pseudoxanthobacter
Rhabdaerophilaceae Rhabdaerophilum
RhizobiaceaeRhizobium, Agrobacterium (A. tumefaciens)
RhodobiaceaeRhodobium
Roseiarcaceae Roseiarcus
Salinarimonadaceae Salinarimonas
Segnochrobactraceae Segnochrobactrum
Stappiaceae Stappia
Tepidamorphaceae Tepidamorphus
XanthobacteraceaeXanthobacter
Iodidimonadales Iodidimonadaceae Iodidimonas
Kordiimonadales Temperatibacteraceae Kordiimonas
Magnetococcales Magnetococcaceae Magnetococcus
Micropepsales Micropepsaceae Rhizomicrobium
Minwuiales Minwuiaceae Minwuia
Rhodobacterales Neomegalonemataceae Meganema
RhodobacteraceaeRhodobacter (R. capsulatus)
Rhodospirillales Acetobacteraceae Acetobacter (A. aceti)
Azospirillaceae Azospirillum
Geminicoccaceae Geminicoccus
Kiloniellaceae Kiloniella
Reyranellaceae Reyranellaceae
Rhodospirillaceae Rhodospira
Rhodovibrionaceae Rhodovibrio
Stellaceae Stella
Terasakiellaceae Terasakiella
Thalassobaculaceae Thalassobaculum
Thalassospiraceae Thalassospira
Zavarziniaceae Zavarzinia
Rhodothalassiales Rhodothalassiaceae Rhodothalassium
Rickettsiales Ehrlichiaceae Ehrlichia, Wolbachia
Rickettsiaceae Rickettsia (R. rickettsii, R. typhi, R. conorii)
Sneathiellales Sneathiellaceae Sneathiella

Ayrıca bakınız

  • Endosimbiyoz teorisi

Kaynakça

  1. ^ a b c d "Class: Alphaproteobacteria". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). 25 Şubat 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 25 Haziran 2021. 
  2. ^ Garrity GM, Bell JA, Lilburn T. (2005). "Class I. Alphaproteobacteria class. nov.". In: Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM, (Ed.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd edn, vol. 2 (The Proteobacteria), part C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria),. Springer, New York,. 
  3. ^ a b Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T. (26 Temmuz 2005) [1984(Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (Ed.). The Proteobacteria. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 2C (2. bas.). New York: Springer. ss. 1388. ISBN 978-0-387-24145-6. British Library no. GBA561951. 

Dış bağlantılar

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">Bacillaceae</span>

Bacillaceae Bacillales takımına bağlı bir bakteri familyasıdır. Gıda mikrobiyolojisi açısından önemli bir bakteridir.Endospor oluşturmaları ve sıcaklık uygulamarına dayanıklı olmalarından dolayı diğer bakterilerden belirgin bir şekilde ayrılırlar. Spor oluşturmalarının yanı sıra enzimleri nedeniyle proteinlerin parçalanmasına neden olurlar. Bu familya içerisinde aerob özellikteki Bacillus ve anaerob Clostridium cinsleri ile beraber 106 farklı cins yer almaktadır. Hareketli türlerinde peritriş flagella karakteristik olarak bulunur. Çoğu patojenik değildir, fakat Bacillus ve Clostridium türleri insanlarda hastalık yaparlar.

<span class="mw-page-title-main">Proteobakteriler</span>

Proteobakteriler (Proteobacteria), bakteriler üstaleminin ana gruplarından birisini meydana getiren ve önemli cins ve türleri içeren şubesidir. Çeşitli hastalık etmenleri ve başka çok bilinen cinsler bu gruba dahildir. Ayrıca doğada serbest yaşayan türleri ve azot fiksasyonundan sorumlu pek çok bakteri türünü de içerir. Bu grup ribozomal RNA (rRNA) dizinlerine göre tanımlanmıştır. Bakteri biçimlerinin çeşitliliğinden dolayı grup, ismini Yunan mitolojisinde yer alan, her şekle girebilen tanrı Proteus'tan almıştır.

<span class="mw-page-title-main">Euryarchaeota</span>

Euryarchaeota, Archaea âlemine bağlı bir algae şubesidir. Bu grup metanogenleri, halo bakterileri, bazı ekstrem termofilik aerobları ve ekstrem termofilik anaerobları içermektedir. Metanogenler metan üreten archaeonlar olup çoğu bağırsaklarda bulunmaktadır. Halobacteria sınıfına ait türler ekstrem tuz konsantrasyonlarında yaşayan archaeonlardır. Bu archaeonlar diğerlerinden rRNA sekans benzerlik ve farklılıklarına bakılarak ayrılmıştır.

<span class="mw-page-title-main">Caulobacteraceae</span>

Caulobacteraceae Proteobacteria şubesinden bir bakteri familyasıdır. Diğer Proteobakteriler gibi, Caulobacteraceae familyası üyeleri de gram negatiftirler. Familyanın karakteristik özellikleri bakımından tip cinsi olan Caulobacter, ismini Caulobacterales takımına ve yakın zamanda oluşturulan Caulobacteridae altsınıfına da vermiştir.

Pseudomonadales Gammaproteobakteriler sınıfının bir takımıdır. Pseudomonadales 16S rRNA dizilerine göre tanımlanmıştır.

<span class="mw-page-title-main">Lactobacillales</span>

Lactobacillales, laktik asit bakterilerini kapsayan gram-pozitif bir bakteri takımıdır.

<i>Spirillum</i>

Spirillum, Proteobacteria şubesinden, sarmal şeklinde kıvrılmış hücre morfolojisine sahip bir bakteri cinsidir. Bu hücre morfolojisi tipi, bakteriler için, koklar ve basiller ile birlikte üçüncü belirgin hücre tipidir. Spirillum türleri mikroaerofildirler ve organik madde bakımından zengin, durgun, tatlı sularda bol bulunurlar.

Chrysiogenaceae, monotipik Chyrsiogenetes sınıfının monotipik Chyrsiogenales takımında sınıflandırılan bakteri familyasıdır.

Arthrobacter koreensis, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter methylotrophus, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter gandavensis, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

Arthrobacter luteolus, Arthrobacter cinsine bağlı bir bakteri türüdür.

<i>Campylobacter</i>

Campylobacter, genellikle spiral ve s harfi şeklinde, ince ve uzun bir yapıya sahip gram negatif bakteri cinsidir. Kampilobakterler bulaşıcı ishal hastalıklarına yol açabilirler. İnsanlarda en çok hastalık yapan türleri C. jejuni ve C. coli'dir. Ancak, daha az görülse de, C. lari ve C. upsaliensis türleri de hastalığa yol açabilir. Kampilobakter semptomları ilk olarak Theodor Escherich tarafından 1886'da tanımlanmıştır. Doğrulanmış 34 türü bulunmaktadır.

Rhodobacter, taksonomide Alphaproteobacteria sınıfında Rhodobacteraceae familyasına ait bir bakteri cinsidir. Rhodobacterin en ünlü türleri, bakteriyel fotosentezi incelemek için örnek organizmalar olarak kullanılan Rhodobacter sphaeroides ve Rhodobacter capsulatustur.

David Hendricks Bergey, Amerikalı bakteriyologdur. 1907'de Actinomyces bakterisini insandan izole eden ilk doktordur.

<span class="mw-page-title-main">Thermoanaerobacterales</span>

Thermoanaerobacterales Clostridia sınıfına bağlı bir bakteri takımdır.

<span class="mw-page-title-main">Enterococcaceae</span>

Enterococcaceae Lactobacillales takımına bağlı bir bakteri familyasıdır.

<span class="mw-page-title-main">Flavobacteriaceae</span>

Flavobacteriaceae Flavobacteriales takımına bağlı bir bakteri familyasıdır.

Schleiferiaceae Flavobacteriales takımına bağlı bir bakteri familyasıdır.

<span class="mw-page-title-main">Gammaproteobacteria</span>

Gammaproteobacteria, Pseudomonadota şubesinde yer alan bir bakteri sınıfıdır. Yaklaşık 250 cins içerir ve böylece Prokaryotların cins açısından en zengin taksonunu oluşturur. Tıbbi, ekolojik ve bilimsel açıdan önemli birçok bakteri grubu bu sınıfta yer alır. Tümü Gram-negatif bakterilerden oluşur ve filogenetik ve fizyolojik olarak en çeşitli Proteobacteria sınıfıdır.