İçeriğe atla

ARL2

ARL2
Uygun yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Başka adlarARL2
Dış kimliklerOMIM: 601175 MGI: 1928393 HomoloGene: 1260 GeneCards: ARL2
Gen yerleşimi (İnsan)
11. Kromozom (insan)
Krom.11. Kromozom (insan)[1]
11. Kromozom (insan)
ARL2 için genom yerleşimi
ARL2 için genom yerleşimi
Bant11q13.1Başlangıç65,014,160 [1]
Bitiş65,022,184 [1]
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001667
NM_001199745

NM_019722

RefSeq (protein)

NP_001186674
NP_001658

NP_062696

Yerleşim (UCSC)Krom. 11: 65.01 – 65.02 Mbn/a
PubMed araması[2][3]
Vikiveri
İnsan'ı Gör/DüzenleFare'yi Gör/Düzenle

ADP-ribozillenme faktörü benzeri protein 2, insanlarda ARL2 geni tarafından kodlanan bir proteindir.[4][5][6]

İşlev

ADP-ribozillenme faktörü (ARF) genleri, RAS süper ailesinin küçük GTP bağlayıcı proteinleridir. ARL2, ARF benzeri genlerin işlevsel olarak farklı bir grubunun bir üyesidir.[6]

Etkileşimler

ARL2'nin Unc-119,[7] TBCD[8][9] ve PDE6D ile etkileşime girdiği gösterilmiştir.[10][11]

Kaynakça

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000213465 - Ensembl, May 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  3. ^ "Fare PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ "Selective amplification of additional members of the ADP-ribosylation factor (ARF) family: cloning of additional human and Drosophila ARF-like genes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90 (19). Kasım 1993. ss. 8952-6. 
  5. ^ "A transcript map for the 2.8-Mb region containing the multiple endocrine neoplasia type 1 locus". Genome Res. 7 (7). Eylül 1997. ss. 725-35. 
  6. ^ a b "Entrez Gene: ARL2 ADP-ribosylation factor-like 2". 5 Aralık 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  7. ^ "Photoreceptor synaptic protein HRG4 (UNC119) interacts with ARL2 via a putative conserved domain". FEBS Lett. 534 (1-3). Ocak 2003. ss. 26-32. 
  8. ^ "Cytosolic Arl2 is complexed with cofactor D and protein phosphatase 2A". J. Biol. Chem. 278 (42). Ekim 2003. ss. 40829-36. 
  9. ^ "ADP ribosylation factor-like protein 2 (Arl2) regulates the interaction of tubulin-folding cofactor D with native tubulin". J. Cell Biol. 149 (5). Mayıs 2000. ss. 1087-96. 
  10. ^ "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062). Ekim 2005. ss. 1173-8. 
  11. ^ "The complex of Arl2-GTP and PDE delta: from structure to function". EMBO J. 21 (9). Mayıs 2002. ss. 2095-106. 

Dış bağlantılar

Konuyla ilgili yayınlar

  • Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1-2). ss. 171-4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. 
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1-2). ss. 149-56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. 
  • Bhamidipati A, Lewis SA, Cowan NJ (2000). "ADP ribosylation factor-like protein 2 (Arl2) regulates the interaction of tubulin-folding cofactor D with native tubulin". J. Cell Biol. 149 (5). ss. 1087-96. doi:10.1083/jcb.149.5.1087. PMC 2174823 $2. PMID 10831612. 
  • Sharer JD, Shern JF, Van Valkenburgh H, Wallace DC, Kahn RA (2002). "ARL2 and BART enter mitochondria and bind the adenine nucleotide transporter". Mol. Biol. Cell. 13 (1). ss. 71-83. doi:10.1091/mbc.01-05-0245. PMC 65073 $2. PMID 11809823. 
  • Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (2002). "The complex of Arl2-GTP and PDE delta: from structure to function". EMBO J. 21 (9). ss. 2095-106. doi:10.1093/emboj/21.9.2095. PMC 125981 $2. PMID 11980706. 
  • Antoshechkin I, Han M (2002). "The C. elegans evl-20 gene is a homolog of the small GTPase ARL2 and regulates cytoskeleton dynamics during cytokinesis and morphogenesis". Dev. Cell. 2 (5). ss. 579-91. doi:10.1016/S1534-5807(02)00146-6. PMID 12015966. 
  • Kobayashi A, Kubota S, Mori N, McLaren MJ, Inana G (2003). "Photoreceptor synaptic protein HRG4 (UNC119) interacts with ARL2 via a putative conserved domain". FEBS Lett. 534 (1-3). ss. 26-32. doi:10.1016/S0014-5793(02)03766-3. PMID 12527357. 
  • Shern JF, Sharer JD, Pallas DC, Bartolini F, Cowan NJ, Reed MS, Pohl J, Kahn RA (2003). "Cytosolic Arl2 is complexed with cofactor D and protein phosphatase 2A". J. Biol. Chem. 278 (42). ss. 40829-36. doi:10.1074/jbc.M308678200. PMID 12912990. 
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062). ss. 1173-8. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. 
  • Zhou C, Cunningham L, Marcus AI, Li Y, Kahn RA (2006). "Arl2 and Arl3 regulate different microtubule-dependent processes". Mol. Biol. Cell. 17 (5). ss. 2476-87. doi:10.1091/mbc.E05-10-0929. PMC 1446103 $2. PMID 16525022. 
  • Beghin A, Honore S, Messana C, Matera EL, Aim J, Burlinchon S, Braguer D, Dumontet C (2007). "ADP ribosylation factor like 2 (Arl2) protein influences microtubule dynamics in breast cancer cells". Exp. Cell Res. 313 (3). ss. 473-85. doi:10.1016/j.yexcr.2006.10.024. PMID 17188265. 

İlgili Araştırma Makaleleri

<span class="mw-page-title-main">MikroRNA</span> yaklaşık 21-23 nükleotit uzunluğunda tek iplikli RNA molekülü türü

Genetikte, mikroRNA (miRNA) yaklaşık 21-23 nükleotit uzunluğunda tek iplikli RNA molekülü türüdür, gen ifadesinin düzenlenmesinde rol oynar. miRNA'lar kodlamayan RNA'lardandır, yani DNA'dan transkripsiyonu yapılan ama proteine çevirisi yapılmayan genler tarafından kodlanırlar. Pri-miRNA olarak adlandırılan primer transkriptler işlenerek, önce pre-miRNA adlı kısa sap-ilmik yapılarına, sonra da fonksiyonel miRNA'ya dönüşürler. Olgun miRNA moleküller bir veya daha çok mesajcı RNA (mRNA) ile kısmî tamamlayıcıdır ve başlıca işlevleri gen ifadesini aşağı ayarlamaktır. 1993'te Lee ve çalışma arkadaşları tarafından Victor Ambros laboratuvarında keşfedilmişlerdir, ancak mikroRNA terimi ilk 2001'de kullanıma girimiştir.

<span class="mw-page-title-main">Çevrim sonrası değişim</span> Biyolojik süreç

Çevrim sonrası değişim, bir proteinin çevriminden (translasyonundan) sonra kimyasal değişime uğramasıdır. Çoğu protein için bu değişimler, protein biyosentezinin son adımlarındandır.

LDL reseptör ilişkili protein 1 insanda LRP1 geni tarafından kodlanan bir proteindir. LRP1, hücre zarında bulunan bir reseptördür ve reseptör eşlikli endositoz yapar. Pek çok proteinle etkileştiği bilinmektedir, bundan dolayı çok çeşitli işlevleri de vardır.

<span class="mw-page-title-main">RAD51</span>

RAD51, bir insan genidir, bu genin ürünü olan ve aynı isme sahip olan protein DNA çift iplikçikli kesiklerini tamir eder. Bu protein RAD51 protein ailesinin üyelerinden biridir. RAD51 protein ailesi üyeleri bakteriyel RecA ve maya Rad51 ile homologdur. Protein, mayadan insana kadar çoğu ökaryotta korunmuştur.

Faktör VIII (FVIII), anti-hemofilik Faktör (AHF) olarak da bilinen önemli bir kan pıhtılaşma faktörüdür. İnsanlarda, Faktör VIII F8 geni ile birlikte kodlanır. Faktör VIII geni X kromozomu üzerinde yer almaktadır.

<span class="mw-page-title-main">Phillip Allen Sharp</span> Amerikalı biyolog

Phillip Allen Sharp, Amerikan genetikçi ve moleküler biyolog. RNA bağlanmasının kaşiflerinden biridir. Richard J. Roberts ile birlikte ökaryot hücrelerinin DNA dizelerindeki genlerin bitişik sırada olmadığını, aralarda intron denilen okunmayan ve protein sentezine katılmayan bölümlerin olduğunu keşfettiler. Bu sayede mRNA'lar aynı DNA dizesinden bu bölümleri farklı şekilde silmeleri ile farklı proteinleri kodlayabilmektedir. İkili bu keşifleri ile 1993 Nobel Fizyoloji veya Tıp Ödülünü kazanmışlardır.

<span class="mw-page-title-main">CD59</span>

CD59 glikoproteini, MAC baskılayıcı protein (MAC-IP), membran reaktif liziz inhibitörü veya protektin olarak da bilinen, insanlarda CD59 geni tarafından ile kodlanan bir proteindir. LY6/uPAR/alfa-nörotoksin protein ailesine aittir.

<span class="mw-page-title-main">ARFIP2</span> Homo sapiens türünde protein kodlayıcı gen

Arfaptin 2, insanlarda ARFIP2 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">ARHGAP1</span> insanlarda bulunan protein kodlama geni

Rho GTPaz etkinleştirici protein 1, insanlarda ARHGAP1 geni tarafından kodlanan bir enzimdir.

<span class="mw-page-title-main">CHST1</span>

Karbonhidrat sülfotransferaz 1, insanlarda 11. kromozomun kısa kolunda bulunan CHST1 geni tarafından kodlanan bir proteindir. Proteinin polipeptit zincirinin uzunluğu 411 amino asittir ve molekül ağırlığı 46715'tir.

<span class="mw-page-title-main">Arrestin beta 1</span>

Arrestin beta 1 , insanlarda ARRB1 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">CKAP5</span> Homo sapiens türünde protein kodlayıcı gen

Hücre iskeletine bağlı protein 5, insanlarda CKAP5 geni tarafından kodlanan mikrotübüle bağlı bir proteindir. Xenopus'un XMAP215 proteininin homologudur ve ch-Tog olarak da bilinir.

<span class="mw-page-title-main">Tümör nekroz faktörü alfa</span>

Tümör nekroz faktörü ; sistemik inflamasyonda yer alan bir hücre sinyal proteinidir (sitokindir) ve akut faz reaksiyonunu oluşturan sitokinlerden biridir. CD4+ lenfositler, NK hücreleri, nötrofiller, mast hücreleri, eozinofiller ve nöronlar gibi diğer birçok hücre tipi tarafından üretilebilmesine karşın, esas olarak aktif makrofajlarca üretilir. TNF, homolog bir TNF alanına sahip çeşitli transmembran proteinlerden oluşan TNF süper ailesinin bir üyesidir.

<span class="mw-page-title-main">Osteokalsin</span>

Osteokalsin, başka bir adla kemik gama-karboksiglutamik asit içeren protein (BGLAP), kemik ve dentinde bulunan ve ilk olarak civciv kemiğinde kalsiyum bağlayıcı protein olarak tanımlanan küçük (49-amino-asit) kollajenöz olmayan protein yapılı bir hormonudur.

<span class="mw-page-title-main">Majör bazik protein</span>

Eozinofil majör bazik proteini veya genellikle kısaltılmış olarak majör bazik protein, insanlarda PRG2 geni tarafından kodlanmaktadır.

NADPH oxidaz 4, insanlarda NOX4 ile kodlanan ve NADPH oksidazların NOX ailesine üye enzim.

<span class="mw-page-title-main">Faj gösterimi</span>

Faj gösterimi, proteinleri kodlayan genetik bilgilerle proteinleri birbirine bağlamak için bakteriyofajları kullanan protein-protein, protein-peptit ve protein-DNA etkileşimlerinin incelenmesi için bir laboratuvar tekniğidir. Bu teknikte, ilgilenilen bir proteini kodlayan bir gen, bir faj kapsit proteini genine eklenir. Bu durumda faj, proteinin genini içeride barındırırken, proteini dış tarafında da "gösterir". Böylece genotip ile fenotip arasında bir bağlantı kurulmuş olur. Proteini görüntüleyen fajlar daha sonra, görüntülenen protein ile diğer moleküller arasındaki etkileşimi saptamak için diğer proteinlere, peptidlere veya DNA dizilerine karşı taranabilir. Bu şekilde, büyük protein kütüphaneleri, doğal seçilim ile benzer olan in vitro seçilim adı verilen bir süreçte taranabilir ve çoğaltılabilir.

Transkripsiyon faktörü SOX18 SOX18 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">40S ribozomal protein S3</span>

40S ribozomal protein S3, insanların 11. kromozomunda yer alan RPS3 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">40S ribozomal protein S2</span>

40S ribozomal protein S2, insanların 11. kromozomunda yer alan RPS2 geni tarafından kodlanan bir proteindir.