İçeriğe atla

ARHGAP1

ARHGAP1
Uygun yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Başka adlarARHGAP1
Dış kimliklerOMIM: 602732 MGI: 2445003 HomoloGene: 20909 GeneCards: ARHGAP1
Gen yerleşimi (İnsan)
11. Kromozom (insan)
Krom.11. Kromozom (insan)[1]
11. Kromozom (insan)
ARHGAP1 için genom yerleşimi
ARHGAP1 için genom yerleşimi
Bant11p11.2Başlangıç46,677,080 [1]
Bitiş46,700,619 [1]
RNA ekspresyonu deseni


Daha çok ekspresyon verisi başvurusu
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_004308

NM_001145902
NM_146124
NM_001359970

RefSeq (protein)

NP_004299

NP_001139374
NP_666236
NP_001346899

Yerleşim (UCSC)Krom. 11: 46.68 – 46.7 Mbn/a
PubMed araması[2][3]
Vikiveri
İnsan'ı Gör/DüzenleFare'yi Gör/Düzenle

Rho GTPaz etkinleştirici protein 1, insanlarda ARHGAP1 geni tarafından kodlanan bir enzimdir.[4][5]

Etkileşimler

Aşağıdakilerin ARHGAP1 ile etkileşime girdiği gösterilmiştir:

Konuyla ilgili yayınlar

  • Diekmann D, Brill S, Garrett MD, Totty N, Hsuan J, Monfries C, Hall C, Lim L, Hall A (1991). "Bcr encodes a GTPase-activating protein for p21rac". Nature. 351 (6325). ss. 400-2. doi:10.1038/351400a0. PMID 1903516. 
  • Garrett MD, Major GN, Totty N, Hall A (1991). "Purification and N-terminal sequence of the p21rho GTPase-activating protein, rho GAP". Biochem. J. 276 (Pt 3) (3). ss. 833-6. PMC 1151079 $2. PMID 1905930. 
  • Barfod ET, Zheng Y, Kuang WJ, Hart MJ, Evans T, Cerione RA, Ashkenazi A (1993). "Cloning and expression of a human CDC42 GTPase-activating protein reveals a functional SH3-binding domain". J. Biol. Chem. 268 (35). ss. 26059-62. PMID 8253717. 
  • Aspenström P, Lindberg U, Hall A (1996). "Two GTPases, Cdc42 and Rac, bind directly to a protein implicated in the immunodeficiency disorder Wiskott-Aldrich syndrome". Curr. Biol. 6 (1). ss. 70-5. doi:10.1016/S0960-9822(02)00423-2. PMID 8805223. 
  • Barrett T, Xiao B, Dodson EJ, Dodson G, Ludbrook SB, Nurmahomed K, Gamblin SJ, Musacchio A, Smerdon SJ, Eccleston JF (1997). "The structure of the GTPase-activating domain from p50rhoGAP". Nature. 385 (6615). ss. 458-61. doi:10.1038/385458a0. PMID 9009196. 
  • Hu KQ, Settleman J (1997). "Tandem SH2 binding sites mediate the RasGAP-RhoGAP interaction: a conformational mechanism for SH3 domain regulation". EMBO J. 16 (3). ss. 473-83. doi:10.1093/emboj/16.3.473. PMC 1169651 $2. PMID 9034330. 
  • Rittinger K, Walker PA, Eccleston JF, Nurmahomed K, Owen D, Laue E, Gamblin SJ, Smerdon SJ (1997). "Crystal structure of a small G protein in complex with the GTPase-activating protein rhoGAP". Nature. 388 (6643). ss. 693-7. doi:10.1038/41805. PMID 9262406. 
  • Zhang B, Wang ZX, Zheng Y (1997). "Characterization of the interactions between the small GTPase Cdc42 and its GTPase-activating proteins and putative effectors. Comparison of kinetic properties of Cdc42 binding to the Cdc42-interactive domains". J. Biol. Chem. 272 (35). ss. 21999-2007. doi:10.1074/jbc.272.35.21999. PMID 9268338. 
  • Li R, Zhang B, Zheng Y (1997). "Structural determinants required for the interaction between Rho GTPase and the GTPase-activating domain of p190". J. Biol. Chem. 272 (52). ss. 32830-5. doi:10.1074/jbc.272.52.32830. PMID 9407060. 
  • Zhang B, Zheng Y (1998). "Regulation of RhoA GTP hydrolysis by the GTPase-activating proteins p190, p50RhoGAP, Bcr, and 3BP-1". Biochemistry. 37 (15). ss. 5249-57. doi:10.1021/bi9718447. PMID 9548756. 
  • Low BC, Lim YP, Lim J, Wong ES, Guy GR (1999). "Tyrosine phosphorylation of the Bcl-2-associated protein BNIP-2 by fibroblast growth factor receptor-1 prevents its binding to Cdc42GAP and Cdc42". J. Biol. Chem. 274 (46). ss. 33123-30. doi:10.1074/jbc.274.46.33123. PMID 10551883. 
  • Graham DL, Eccleston JF, Chung CW, Lowe PN (1999). "Magnesium fluoride-dependent binding of small G proteins to their GTPase-activating proteins". Biochemistry. 38 (45). ss. 14981-7. doi:10.1021/bi991358e. PMID 10555980. 
  • Low BC, Seow KT, Guy GR (2000). "Evidence for a novel Cdc42GAP domain at the carboxyl terminus of BNIP-2". J. Biol. Chem. 275 (19). ss. 14415-22. doi:10.1074/jbc.275.19.14415. PMID 10799524. 
  • Low BC, Seow KT, Guy GR (2000). "The BNIP-2 and Cdc42GAP homology domain of BNIP-2 mediates its homophilic association and heterophilic interaction with Cdc42GAP". J. Biol. Chem. 275 (48). ss. 37742-51. doi:10.1074/jbc.M004897200. PMID 10954711. 
  • Zhou YT, Soh UJ, Shang X, Guy GR, Low BC (2002). "The BNIP-2 and Cdc42GAP homology/Sec14p-like domain of BNIP-Salpha is a novel apoptosis-inducing sequence". J. Biol. Chem. 277 (9). ss. 7483-92. doi:10.1074/jbc.M109459200. PMID 11741952. 
  • Fidyk NJ, Cerione RA (2002). "Understanding the catalytic mechanism of GTPase-activating proteins: demonstration of the importance of switch domain stabilization in the stimulation of GTP hydrolysis". Biochemistry. 41 (52). ss. 15644-53. doi:10.1021/bi026413p. PMID 12501193. 
  • Qin W, Hu J, Guo M, Xu J, Li J, Yao G, Zhou X, Jiang H, Zhang P, Shen L, Wan D, Gu J (2003). "BNIPL-2, a novel homologue of BNIP-2, interacts with Bcl-2 and Cdc42GAP in apoptosis". Biochem. Biophys. Res. Commun. 308 (2). ss. 379-85. doi:10.1016/S0006-291X(03)01387-1. PMID 12901880. 
  • Shang X, Zhou YT, Low BC (2003). "Concerted regulation of cell dynamics by BNIP-2 and Cdc42GAP homology/Sec14p-like, proline-rich, and GTPase-activating protein domains of a novel Rho GTPase-activating protein, BPGAP1". J. Biol. Chem. 278 (46). ss. 45903-14. doi:10.1074/jbc.M304514200. PMID 12944407. 

Dış bağlantılar

Kaynakça

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000175220 - Ensembl, May 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  3. ^ "Fare PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ "Characterization of rhoGAP. A GTPase-activating protein for rho-related small GTPases". J. Biol. Chem. 269 (2). Şubat 1994. ss. 1137-42. 
  5. ^ "Entrez Gene: ARHGAP1 Rho GTPase activating protein 1". 5 Aralık 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  6. ^ "The BNIP-2 and Cdc42GAP homology domain of BNIP-2 mediates its homophilic association and heterophilic interaction with Cdc42GAP". J. Biol. Chem. 275 (48). Aralık 2000. ss. 37742-51. 
  7. ^ "Tyrosine phosphorylation of the Bcl-2-associated protein BNIP-2 by fibroblast growth factor receptor-1 prevents its binding to Cdc42GAP and Cdc42". J. Biol. Chem. 274 (46). Kasım 1999. ss. 33123-30. 
  8. ^ "The MAP kinase kinase kinase MLK2 co-localizes with activated JNK along microtubules and associates with kinesin superfamily motor KIF3". EMBO J. 17 (1). Ocak 1998. ss. 149-58. 
  9. ^ "Structural determinants required for the interaction between Rho GTPase and the GTPase-activating domain of p190". J. Biol. Chem. 272 (52). Aralık 1997. ss. 32830-5. 
  10. ^ "Interaction of Rac1 with GTPase-activating proteins and putative effectors. A comparison with Cdc42 and RhoA". J. Biol. Chem. 273 (15). Nisan 1998. ss. 8776-82. 
  11. ^ "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062). Ekim 2005. ss. 1173-8. 
  12. ^ "Regulation of RhoA GTP hydrolysis by the GTPase-activating proteins p190, p50RhoGAP, Bcr, and 3BP-1". Biochemistry. 37 (15). Nisan 1998. ss. 5249-57. 

İlgili Araştırma Makaleleri

LDL reseptör ilişkili protein 1 insanda LRP1 geni tarafından kodlanan bir proteindir. LRP1, hücre zarında bulunan bir reseptördür ve reseptör eşlikli endositoz yapar. Pek çok proteinle etkileştiği bilinmektedir, bundan dolayı çok çeşitli işlevleri de vardır.

<span class="mw-page-title-main">RAD51</span>

RAD51, bir insan genidir, bu genin ürünü olan ve aynı isme sahip olan protein DNA çift iplikçikli kesiklerini tamir eder. Bu protein RAD51 protein ailesinin üyelerinden biridir. RAD51 protein ailesi üyeleri bakteriyel RecA ve maya Rad51 ile homologdur. Protein, mayadan insana kadar çoğu ökaryotta korunmuştur.

Telomer bağlanıcı proteinler kromozomların telomer bölgelerine bağlanan proteinlerdir. Telomer uçlarına bağlanan bu proteinler hücrenin DNA uçlarını kopuk olarak algılamasına engel olur, böylece hücre bölünmesi inhibe olmaz ve hücre intihar etmez. Bu proteinler çift iplikli ve tek iplikli DNA'ya bağlanıcı olmak üzere iki grup oluştururlar.

Dönüş, polipeptit zincirinin doğrultusunu ters çevirdiği bir protein ikincil yapı elemanıdır.

Başkalaşım kümesi 80 ; T hücrelerinin uyarımı ve yaşaması için yardımcı uyarıcı bir uyartı sağlayan, B hücreleri ile monositlerde bulunan bir proteindir. T lenfositinin yüzeyinde bulunan iki ayrı protein için liganddır, bu proteinler ise CD28 ve CTLA-4 proteinleridir. CD80 başlıca T hücrelerine CD86 ile birlikte çalışır.

<span class="mw-page-title-main">CD59</span>

CD59 glikoproteini, MAC baskılayıcı protein (MAC-IP), membran reaktif liziz inhibitörü veya protektin olarak da bilinen, insanlarda CD59 geni tarafından ile kodlanan bir proteindir. LY6/uPAR/alfa-nörotoksin protein ailesine aittir.

<span class="mw-page-title-main">ARL2</span>

ADP-ribozillenme faktörü benzeri protein 2, insanlarda ARL2 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">Arrestin beta 1</span>

Arrestin beta 1 , insanlarda ARRB1 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">Majör bazik protein</span>

Eozinofil majör bazik proteini veya genellikle kısaltılmış olarak majör bazik protein, insanlarda PRG2 geni tarafından kodlanmaktadır.

NADPH oksidaz 1, insanlarda NOX1 geni tarafından kodlanan bir enzimdir.

NADPH oksidaz 2 veya sitokrom b(558) alt-birimi beta veya Sitokrom B-245 ağır zincir, insanlarda NOX2 geni tarafından kodlanan bir proteindir. Bu protein, reaktif oksijen türlerini (ROS) oluşturan süper oksiti üreten bir enzimdir.

NADPH oksidaz 3, insanlarda NOX3 geni tarafından kodlanan bir enzimdir.

NADPH oxidaz 4, insanlarda NOX4 ile kodlanan ve NADPH oksidazların NOX ailesine üye enzim.

NOX5, insanlarda NOX5 geni ile kodlanan protein.

<span class="mw-page-title-main">Faj gösterimi</span>

Faj gösterimi, proteinleri kodlayan genetik bilgilerle proteinleri birbirine bağlamak için bakteriyofajları kullanan protein-protein, protein-peptit ve protein-DNA etkileşimlerinin incelenmesi için bir laboratuvar tekniğidir. Bu teknikte, ilgilenilen bir proteini kodlayan bir gen, bir faj kapsit proteini genine eklenir. Bu durumda faj, proteinin genini içeride barındırırken, proteini dış tarafında da "gösterir". Böylece genotip ile fenotip arasında bir bağlantı kurulmuş olur. Proteini görüntüleyen fajlar daha sonra, görüntülenen protein ile diğer moleküller arasındaki etkileşimi saptamak için diğer proteinlere, peptidlere veya DNA dizilerine karşı taranabilir. Bu şekilde, büyük protein kütüphaneleri, doğal seçilim ile benzer olan in vitro seçilim adı verilen bir süreçte taranabilir ve çoğaltılabilir.

İnsülin benzeri büyüme faktörü 1 (IGF-1) reseptörü, insan hücre membranında bulunan bir proteindir. İnsülin benzeri büyüme faktörü 1 (IGF-1) adı verilen bir hormon ve IGF-2 adı verilen ilişkili bir hormon tarafından aktive edilen bir transmembran reseptörüdür. Tirozin kinaz reseptörleri sınıfına aittir. Bu reseptör, moleküler yapı olarak insüline benzeyen bir polipeptit protein hormonu olan IGF-1'in etkilerine aracılık eder. IGF-1 büyümede önemli bir rol oynar ve yetişkinlerde de anabolik etkilere sahiptir, yani iskelet kası ve diğer hedef dokuların hipertrofisini indükleyebilir. IGF-1 reseptöründen yoksun olan fareler, gelişimlerinin sonlarında ölürler ve vücut kütlelerinde çarpıcı bir azalma gösterirler. Bu, reseptörün güçlü büyüme teşvik edici etkisini gösterir.

<span class="mw-page-title-main">Nefrin (protein)</span>

Nefrin, glomerüler filtrasyon bariyerinin düzgün işlev göstermesi için gerekli olan bir proteindir. Glomerüler filtrasyon bariyeri; fenestre endotel hücrelerini, glomerüler bazal membranını ve epitel hücrelerin podositlerini içerir. Nefrin, slit diyaframın yapısal bir bileşeni olan bir transmembran proteindir. Bu proteinler, podositlerin ucunda bir karmaşık ağ şeklinde bulunur ve Bowman boşluğuna protein geçişini engelleyen güçlü eksi yüke sahiptir.

<span class="mw-page-title-main">40S ribozomal protein S3</span>

40S ribozomal protein S3, insanların 11. kromozomunda yer alan RPS3 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">40S ribozomal protein S2</span>

40S ribozomal protein S2, insanların 11. kromozomunda yer alan RPS2 geni tarafından kodlanan bir proteindir.

<span class="mw-page-title-main">CD81</span>

CD81 molekülü, ayrıca 81. Başkalaşım Kümesi olarak da bilinir, insanların 11. kromozomunda yer alan CD81 geni tarafından kodlanan bir proteindir.